Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07648
- Subject:
- XM_006501739.1
- Aligned Length:
- 2204
- Identities:
- 1557
- Gaps:
- 433
Alignment
Query 1 ATGAGCAACTACAGTGTGTCACTGGTTGGCCCAGCTCCTTGGGGTTTCCGGCTGCAGGGCGGTAAGGATTTCAA 74
|||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||
Sbjct 1 ATGAGCAACTACAGTGTGTCATTGGTCGGCCCAGCTCCTTGGGGTTTCCGGCTCCAAGGTGGCAAGGATTTCAA 74
Query 75 CATGCCTCTGACAATCTCTAGTCTAAAAGATGGCGGCAAGGCAGCCCAGGCAAATGTAAGAATAGGCGATGTGG 148
||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||.|.||||||.||||.||||||||.||.||||
Sbjct 75 CATGCCTCTGACAATCTCTAGTCTGAAGGATGGTGGCAAGGCATCTCAGGCACATGTCAGAATAGGGGACGTGG 148
Query 149 TTCTCAGCATTGATGGAATAAATGCACAAGGAATGACTCATCTTGAAGCCCAGAATAAGATTAAGGGTTGTACA 222
||||||||||.|||||.||.|.||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||.||||||.
Sbjct 149 TTCTCAGCATCGATGGGATCAGTGCACAGGGAATGACGCATCTTGAAGCCCAGAACAAGATTAAGGCTTGTACG 222
Query 223 GGCTCTTTGAATATGACTCTGCAAAGAGCATCTGCTGCACCCAAGCCTGAGCCGGTTCCTGTTCAAAAGGGAGA 296
|||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||.|||||..||||||||||.|.||.||.|||||.||
Sbjct 223 GGCTCCTTGAATATGACTCTACAAAGAGCTTCAGCTGCAGCCAAGAGTGAGCCGGTTTCCGTCCAGAAGGGTGA 296
Query 297 ACCTAAAGAAGTAGTTAAACCTGTGCCCATTACATCTCCTGCTGTGTCCAAAGTCACTTCCACAAACAACATGG 370
||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|.||||||||
Sbjct 297 ACCTAAGGAAGTAGTTAAGCCTGTGCCCATTACATCTCCTGCTGTATCCAAAGTCACTTCCACTACCAACATGG 370
Query 371 CCTACAATAAGGCACCACGGCCTTTTGGTTCTGTGTCTTCACCAAAAGTCACATCCATCCCATCACCATCGTCT 444
||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CCTACAATAAAGCACCACGGCCCTTTGGTTCTGTGTCTTCACCAAAAGTCACATCCATCCCATCACCATCGTCT 444
Query 445 GCCTTCACCCCAGCCCATGCGACCACCTCATCACATGCTTCCCCTTCACCCGTGGCTGCCGTCACTCCTCCCCT 518
||.|||||||||||||||||..||||.|||||||||||||||||..||||.|||||.||.|.||||||.|.||.
Sbjct 445 GCGTTCACCCCAGCCCATGCCGCCACTTCATCACATGCTTCCCCCACACCTGTGGCCGCTGCCACTCCCCTCCA 518
Query 519 GTTCGCTGCATCTGGACTGCATGCTAATGCCAATCTTAGTGCTGACCAGTCTCCATCTGCACTGAGCGCTGGTA 592
..||.|||||||.||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|.|||||.|||.||.|.||||||
Sbjct 519 CCTCTCTGCATCCGGACTGCATGTTAGTGCCAATCTTAGTGCTGACCAGTGTTCATCTCCACCGAACACTGGTA 592
Query 593 AAACTGCAGTTAATGTCCCACGGCAGCCCACAGTCACCAGCGTGTGTTCCGAGACTTCTCAGGAGCTAGCAGAG 666
||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 593 AACCTGCAGTTAATGTCCCACGGCAGCCCACAGTCACCAGCGTGTGTTCCGAGTCTGCTCAGGAGCTAGCAGAG 666
Query 667 GGACAGAGAAGAGGATCCCAGGGTGACAGTAAACAGCAAAATG------------------GCCCACCAAGAAA 722
||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||| |||||||||||||
Sbjct 667 GGACAGAGAAGAGGATCCCAGGGTGACATTAAGCAGCAAAATGGGAAAATTCCACCTAAACGCCCACCAAGAAA 740
Query 723 ACACATTGTGGAGCGCTATACAGAGTTTTATCATGTACCCACTCACAGTGATGCCAGCAAGAAGAGACTGATTG 796
||||||||||||||||.|.||.|||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||..|.|||||||
Sbjct 741 ACACATTGTGGAGCGCAACACGGAGTTTTATCACATACCCACTCACAGTGATGCCAGCAAGAAACGGCTGATTG 814
Query 797 AGGATACTGAAGACTGGCGTCCAAGGACTGGAACAACTCAGTCTCGCTCTTTCCGAATCCTTGCCCAGATCACT 870
||||.|||||.||||||||.||..||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 815 AGGACACTGAGGACTGGCGCCCCCGGACTGGAACGACTCAGTCTCGTTCTTTCCGGATCCTTGCCCAGATCACT 888
Query 871 GGGACTGAACATTTGAAAGAATCTGAAGCCGATAATACAAAGAAGGCAAA---TAAC---TCTCAGGA-----G 933
||||||||.|||.|||.||||||||||...||.|||||.||||||||||| |.|| ||||.||| .
Sbjct 889 GGGACTGAGCATCTGACAGAATCTGAAAATGACAATACGAAGAAGGCAAAGTTTTACAGTTCTCTGGAAGACCC 962
Query 934 CCTT-------------------------CTCCGCAG------------------------------------- 945
|||| ||||.|||
Sbjct 963 CCTTAAGAACGGACCACACCCACCTGCAGCTCCCCAGCTGTTAAAAGTTCATAGTCAAGTAGCCATAGTTTCTA 1036
Query 946 --------------------------------------------------------TTGG-------------- 949
||||
Sbjct 1037 AGGAAGCAGCCACTTACTCTAGTGTAAGCAGGTCTACAAGAACTGTAGAAGGTGCTTTGGAAGGCTTTGGAAAC 1110
Query 950 --------CTTC----------CTCGGTA-------------------------GCTTCCAC------------ 968
|||| ||.|.|| |||.||||
Sbjct 1111 TTTCCTGCCTTCTCCCCTCCTACTAGATACAGTGCTGTAGTCGTCAGTGATGCGGCTGCCACTGTGTCTGCTGC 1184
Query 969 -------------AC--GGAGCAT--GCCC-GAGAGC------------CTGGA------------CAG----- 995
|| ||..|.| |||| ||.|.| ||||| |||
Sbjct 1185 TCTCGCTGCGAAAACCAGGCTCTTCGGCCCTGAAAACTCCCAGTCTCTTCTGGATGCACTGTGCATCAGCACTG 1258
Query 996 --CCCAA--------------------------CCTCTG---------------------------------GC 1008
||||| |||||| ||
Sbjct 1259 TCCCCAAGCCTCTAGCTCTTTCCTGTCTTCAGTCCTCTGAGGAGTCGAGTGGCTCTGTCCACGTTAAGAAGAGC 1332
Query 1009 AG-----ACCAGGGG--TT-------ACCAGCCTCA----------CAACT----------------------- 1035
|| .|||||.| || |||.||.||| ||.||
Sbjct 1333 AGTAGCACCCAGGAGCCTTCTCAGCAACCGGCGTCATCTGGAGCTTCACCTCTGAGCGCGTCTGAGGGCCCCGA 1406
Query 1036 -------------------------------------------GCAGCTGCCTTCAAGCCTGTAGGATCCACTG 1066
||.|||||.||||||||||||||||||||..
Sbjct 1407 GAGCCCAGGTTCCAGCAGGCCCTCGGTGGCTGGCCTCCGCTCCGCTGCTGCTTTCAAGCCTGTAGGATCCACCA 1480
Query 1067 GCGTCATCAAGTCACCAAGCTGGCAACGGCCAAACCAAGGAGTACCTTCCACTGGAAGAATCTCAAACAGCGCT 1140
||| ||||||||||.||||||||.||.||||||||||.||.||||||.|||||.|||||.|||||||..||.
Sbjct 1481 GCG---TCAAGTCACCTAGCTGGCAGCGTCCAAACCAAGCAGCACCTTCTACTGGGAGAATTTCAAACAATGCA 1551
Query 1141 GCTTACTCAGGATCAGTGGCACCAGCCAACTCAG-CTTTGGGACAAACCCAGCCAAGTGACCAGGACACTTTAG 1213
..||..|||||..|||.||| | ||.||||.|...||||||||||||||||.|||||..|.|
Sbjct 1552 CGTTCTTCAGGTACAGGGGC-------------GTCTGTGGGGCCTCCCCAGCCAAGTGACCAAGACACACTTG 1612
Query 1214 TGCAAAGAGCTGAGCACATTCCAGCAGGGAAACGAACTCCGATGTGCGCCCATTGTAACCAGGTCATCAGAGGA 1287
||||.|||||.||.|||||||||||.||.||.||.||.||.|||||.|||||.||.|||||.||.|||||.|||
Sbjct 1613 TGCAGAGAGCGGAACACATTCCAGCGGGCAAGCGGACCCCCATGTGTGCCCACTGCAACCAAGTTATCAGGGGA 1686
Query 1288 CC-ATTCTTAGTGGCACTGGGGAAATCTTGGCACCCAGAAGAATTCAACTGCGCTCACTGCAAAAATACAATGG 1360
|| .||||| |||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||
Sbjct 1687 CCTTTTCTT-GTGGCTCTGGGGAAGTCCTGGCATCCAGAAGAATTTAACTGTGCTCATTGCAAAAACACAATGG 1759
Query 1361 CCTACATTGGATTTGTAGAGGAGAAAGGAGCCCTGTATTGTGAGCTGTGCTATGAGAAATTCTTTGCCCCTGAA 1434
|||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 1760 CCTACATAGGCTTTGTAGAGGAGAAGGGAGCACTGTACTGTGAGCTATGCTATGAGAAGTTCTTTGCTCCTGAA 1833
Query 1435 TGTGGTCGATGCCAAAGGAAGATCCTTGGAGAAGTCATCAATGCGTTGAAACAAACTTGGCATGTTTCCTGTTT 1508
|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||.||||||||
Sbjct 1834 TGTGGCCGGTGCCAAAGGAAGATCCTTGGAGAAGTCATCAATGCTTTGAAGCAGACCTGGCATGTGTCCTGTTT 1907
Query 1509 TGTGTGTGTAGCCTGTGGAAAGCCCATTCGGAACAATGTTTTTCACTTGGAGGATGGTGAACCCTACTGTGAGA 1582
|||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||
Sbjct 1908 TGTGTGTGTGGCCTGTGGAAAACCCATTCGTAATAATGTTTTCCACTTGGAAGATGGCGAGCCCTACTGTGAGA 1981
Query 1583 CTGATTATTATGCCCTCTTTGGTACTATATGCCATGGATGTGAATTTCCCATAGAAGCTGGTGACATGTTCCTG 1656
|.||.||.||.|||||.|||||.||.|||||.|.||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1982 CAGACTACTACGCCCTTTTTGGAACAATATGTCGTGGATGTGAATTCCCCATAGAGGCTGGTGACATGTTCCTG 2055
Query 1657 GAAGCTCTGGGCTACACCTGGCATGACACTTGCTTTGTATGCTCAGTGTGTTGTGAAAGTTTGGAAGGTCAGAC 1730
|||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 2056 GAAGCTCTGGGATACACTTGGCATGATACTTGCTTTGTGTGCTCTGTGTGTTGTGAAAGTTTGGAAGGGCAGAC 2129
Query 1731 CTTTTTCTCCAAGAAGGACAAGCCCCTGTGTAAGAAACATGCTCATTCTGTGAATTTT 1788
.|||||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2130 ATTTTTCTCCAAGAAGGACAAGCCACTTTGCAAAAAACATGCTCATTCTGTGAATTTT 2187