Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07648
• Subject: XM_006501740.1
• Aligned Length: 2186
• Identities: 1557
• Gaps: 415

Alignment

Query    1  ATGAGCAACTACAGTGTGTCACTGGTTGGCCCAGCTCCTTGGGGTTTCCGGCTGCAGGGCGGTAAGGATTTCAA  74
            |||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||
Sbjct    1  ATGAGCAACTACAGTGTGTCATTGGTCGGCCCAGCTCCTTGGGGTTTCCGGCTCCAAGGTGGCAAGGATTTCAA  74

Query   75  CATGCCTCTGACAATCTCTAGTCTAAAAGATGGCGGCAAGGCAGCCCAGGCAAATGTAAGAATAGGCGATGTGG  148
            ||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||.|.||||||.||||.||||||||.||.||||
Sbjct   75  CATGCCTCTGACAATCTCTAGTCTGAAGGATGGTGGCAAGGCATCTCAGGCACATGTCAGAATAGGGGACGTGG  148

Query  149  TTCTCAGCATTGATGGAATAAATGCACAAGGAATGACTCATCTTGAAGCCCAGAATAAGATTAAGGGTTGTACA  222
            ||||||||||.|||||.||.|.||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||.||||||.
Sbjct  149  TTCTCAGCATCGATGGGATCAGTGCACAGGGAATGACGCATCTTGAAGCCCAGAACAAGATTAAGGCTTGTACG  222

Query  223  GGCTCTTTGAATATGACTCTGCAAAGAGCATCTGCTGCACCCAAGCCTGAGCCGGTTCCTGTTCAAAAGGGAGA  296
            |||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||.|||||..||||||||||.|.||.||.|||||.||
Sbjct  223  GGCTCCTTGAATATGACTCTACAAAGAGCTTCAGCTGCAGCCAAGAGTGAGCCGGTTTCCGTCCAGAAGGGTGA  296

Query  297  ACCTAAAGAAGTAGTTAAACCTGTGCCCATTACATCTCCTGCTGTGTCCAAAGTCACTTCCACAAACAACATGG  370
            ||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|.||||||||
Sbjct  297  ACCTAAGGAAGTAGTTAAGCCTGTGCCCATTACATCTCCTGCTGTATCCAAAGTCACTTCCACTACCAACATGG  370

Query  371  CCTACAATAAGGCACCACGGCCTTTTGGTTCTGTGTCTTCACCAAAAGTCACATCCATCCCATCACCATCGTCT  444
            ||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCTACAATAAAGCACCACGGCCCTTTGGTTCTGTGTCTTCACCAAAAGTCACATCCATCCCATCACCATCGTCT  444

Query  445  GCCTTCACCCCAGCCCATGCGACCACCTCATCACATGCTTCCCCTTCACCCGTGGCTGCCGTCACTCCTCCCCT  518
            ||.|||||||||||||||||..||||.|||||||||||||||||..||||.|||||.||.|.||||||.|.||.
Sbjct  445  GCGTTCACCCCAGCCCATGCCGCCACTTCATCACATGCTTCCCCCACACCTGTGGCCGCTGCCACTCCCCTCCA  518

Query  519  GTTCGCTGCATCTGGACTGCATGCTAATGCCAATCTTAGTGCTGACCAGTCTCCATCTGCACTGAGCGCTGGTA  592
            ..||.|||||||.||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|.|||||.|||.||.|.||||||
Sbjct  519  CCTCTCTGCATCCGGACTGCATGTTAGTGCCAATCTTAGTGCTGACCAGTGTTCATCTCCACCGAACACTGGTA  592

Query  593  AAACTGCAGTTAATGTCCCACGGCAGCCCACAGTCACCAGCGTGTGTTCCGAGACTTCTCAGGAGCTAGCAGAG  666
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  593  AACCTGCAGTTAATGTCCCACGGCAGCCCACAGTCACCAGCGTGTGTTCCGAGTCTGCTCAGGAGCTAGCAGAG  666

Query  667  GGACAGAGAAGAGGATCCCAGGGTGACAGTAAACAGCAAAATGGCCCACCAAGAAAACACATTGTGGAGCGCTA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  667  GGACAGAGAAGAGGATCCCAGGGTGACATTAAGCAGCAAAATGGCCCACCAAGAAAACACATTGTGGAGCGCAA  740

Query  741  TACAGAGTTTTATCATGTACCCACTCACAGTGATGCCAGCAAGAAGAGACTGATTGAGGATACTGAAGACTGGC  814
            .||.|||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||..|.|||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct  741  CACGGAGTTTTATCACATACCCACTCACAGTGATGCCAGCAAGAAACGGCTGATTGAGGACACTGAGGACTGGC  814

Query  815  GTCCAAGGACTGGAACAACTCAGTCTCGCTCTTTCCGAATCCTTGCCCAGATCACTGGGACTGAACATTTGAAA  888
            |.||..||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||.|||.|
Sbjct  815  GCCCCCGGACTGGAACGACTCAGTCTCGTTCTTTCCGGATCCTTGCCCAGATCACTGGGACTGAGCATCTGACA  888

Query  889  GAATCTGAAGCCGATAATACAAAGAAGGCAAA---TAAC---TCTCAGGA-----GCCTT--------------  937
            |||||||||...||.|||||.|||||||||||   |.||   ||||.|||     .||||              
Sbjct  889  GAATCTGAAAATGACAATACGAAGAAGGCAAAGTTTTACAGTTCTCTGGAAGACCCCCTTAAGAACGGACCACA  962

Query  938  -----------CTCCGCAG-------------------------------------------------------  945
                       ||||.|||                                                       
Sbjct  963  CCCACCTGCAGCTCCCCAGCTGTTAAAAGTTCATAGTCAAGTAGCCATAGTTTCTAAGGAAGCAGCCACTTACT  1036

Query  946  --------------------------------------TTGG----------------------CTTC------  953
                                                  ||||                      ||||      
Sbjct 1037  CTAGTGTAAGCAGGTCTACAAGAACTGTAGAAGGTGCTTTGGAAGGCTTTGGAAACTTTCCTGCCTTCTCCCCT  1110

Query  954  ----CTCGGTA-------------------------GCTTCCAC-------------------------AC--G  971
                ||.|.||                         |||.||||                         ||  |
Sbjct 1111  CCTACTAGATACAGTGCTGTAGTCGTCAGTGATGCGGCTGCCACTGTGTCTGCTGCTCTCGCTGCGAAAACCAG  1184

Query  972  GAGCAT--GCCC-GAGAGC------------CTGGA------------CAG-------CCCAA-----------  1000
            |..|.|  |||| ||.|.|            |||||            |||       |||||           
Sbjct 1185  GCTCTTCGGCCCTGAAAACTCCCAGTCTCTTCTGGATGCACTGTGCATCAGCACTGTCCCCAAGCCTCTAGCTC  1258

Query 1001  ---------------CCTCTG---------------------------------GCAG-----ACCAGGGG--T  1019
                           ||||||                                 ||||     .|||||.|  |
Sbjct 1259  TTTCCTGTCTTCAGTCCTCTGAGGAGTCGAGTGGCTCTGTCCACGTTAAGAAGAGCAGTAGCACCCAGGAGCCT  1332

Query 1020  T-------ACCAGCCTCA----------CAACT-----------------------------------------  1035
            |       |||.||.|||          ||.||                                         
Sbjct 1333  TCTCAGCAACCGGCGTCATCTGGAGCTTCACCTCTGAGCGCGTCTGAGGGCCCCGAGAGCCCAGGTTCCAGCAG  1406

Query 1036  -------------------------GCAGCTGCCTTCAAGCCTGTAGGATCCACTGGCGTCATCAAGTCACCAA  1084
                                     ||.|||||.||||||||||||||||||||..|||   ||||||||||.|
Sbjct 1407  GCCCTCGGTGGCTGGCCTCCGCTCCGCTGCTGCTTTCAAGCCTGTAGGATCCACCAGCG---TCAAGTCACCTA  1477

Query 1085  GCTGGCAACGGCCAAACCAAGGAGTACCTTCCACTGGAAGAATCTCAAACAGCGCTGCTTACTCAGGATCAGTG  1158
            |||||||.||.||||||||||.||.||||||.|||||.|||||.|||||||..||...||..|||||..|||.|
Sbjct 1478  GCTGGCAGCGTCCAAACCAAGCAGCACCTTCTACTGGGAGAATTTCAAACAATGCACGTTCTTCAGGTACAGGG  1551

Query 1159  GCACCAGCCAACTCAG-CTTTGGGACAAACCCAGCCAAGTGACCAGGACACTTTAGTGCAAAGAGCTGAGCACA  1231
            ||             | ||.||||.|...||||||||||||||||.|||||..|.|||||.|||||.||.||||
Sbjct 1552  GC-------------GTCTGTGGGGCCTCCCCAGCCAAGTGACCAAGACACACTTGTGCAGAGAGCGGAACACA  1612

Query 1232  TTCCAGCAGGGAAACGAACTCCGATGTGCGCCCATTGTAACCAGGTCATCAGAGGACC-ATTCTTAGTGGCACT  1304
            |||||||.||.||.||.||.||.|||||.|||||.||.|||||.||.|||||.||||| .||||| |||||.||
Sbjct 1613  TTCCAGCGGGCAAGCGGACCCCCATGTGTGCCCACTGCAACCAAGTTATCAGGGGACCTTTTCTT-GTGGCTCT  1685

Query 1305  GGGGAAATCTTGGCACCCAGAAGAATTCAACTGCGCTCACTGCAAAAATACAATGGCCTACATTGGATTTGTAG  1378
            ||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 1686  GGGGAAGTCCTGGCATCCAGAAGAATTTAACTGTGCTCATTGCAAAAACACAATGGCCTACATAGGCTTTGTAG  1759

Query 1379  AGGAGAAAGGAGCCCTGTATTGTGAGCTGTGCTATGAGAAATTCTTTGCCCCTGAATGTGGTCGATGCCAAAGG  1452
            |||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1760  AGGAGAAGGGAGCACTGTACTGTGAGCTATGCTATGAGAAGTTCTTTGCTCCTGAATGTGGCCGGTGCCAAAGG  1833

Query 1453  AAGATCCTTGGAGAAGTCATCAATGCGTTGAAACAAACTTGGCATGTTTCCTGTTTTGTGTGTGTAGCCTGTGG  1526
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1834  AAGATCCTTGGAGAAGTCATCAATGCTTTGAAGCAGACCTGGCATGTGTCCTGTTTTGTGTGTGTGGCCTGTGG  1907

Query 1527  AAAGCCCATTCGGAACAATGTTTTTCACTTGGAGGATGGTGAACCCTACTGTGAGACTGATTATTATGCCCTCT  1600
            |||.||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||.||.||.|||||.|
Sbjct 1908  AAAACCCATTCGTAATAATGTTTTCCACTTGGAAGATGGCGAGCCCTACTGTGAGACAGACTACTACGCCCTTT  1981

Query 1601  TTGGTACTATATGCCATGGATGTGAATTTCCCATAGAAGCTGGTGACATGTTCCTGGAAGCTCTGGGCTACACC  1674
            ||||.||.|||||.|.||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1982  TTGGAACAATATGTCGTGGATGTGAATTCCCCATAGAGGCTGGTGACATGTTCCTGGAAGCTCTGGGATACACT  2055

Query 1675  TGGCATGACACTTGCTTTGTATGCTCAGTGTGTTGTGAAAGTTTGGAAGGTCAGACCTTTTTCTCCAAGAAGGA  1748
            ||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 2056  TGGCATGATACTTGCTTTGTGTGCTCTGTGTGTTGTGAAAGTTTGGAAGGGCAGACATTTTTCTCCAAGAAGGA  2129

Query 1749  CAAGCCCCTGTGTAAGAAACATGCTCATTCTGTGAATTTT  1788
            ||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2130  CAAGCCACTTTGCAAAAAACATGCTCATTCTGTGAATTTT  2169