Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07670
- Subject:
- XM_017011683.2
- Aligned Length:
- 3718
- Identities:
- 3670
- Gaps:
- 44
Alignment
Query 1 ATGTCTTCCCCGTTGCAAAGAGCTGTGGGAGATACCAAGAGGGCCTTTTCTGCATCTTCTAGTTCCTCTGCCAG 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCTTCCCCGTTGCAAAGAGCTGTGGGAGATACCAAGAGGGCCTTGTCTGCATCTTCTAGTTCCTCTGCCAG 74
Query 75 TCTACCCTTTGATGACAGGGACTCAAACCATCCCTCAGAGGGGAATGGCGACTCTTTGTTAGCTGATGAAGACA 148
|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TCTACCCTTTGATGACAGGGACTCAAACCATACCTCAGAGGGGAATGGCGACTCTTTGTTAGCTGATGAAGACA 148
Query 149 CTGACTTTGAAGACAGCTTGAATCGCAATGTGAAGAAGAGAGCAGCAAAACGACCACCGAAAACAACACCGGTG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CTGACTTTGAAGACAGCTTGAATCGCAATGTGAAGAAGAGAGCAGCAAAACGACCACCGAAAACAACACCGGTG 222
Query 223 GCAAAACATCCAAAGAAAGGGTCCCGAGTGGTACATCGTCATAGCCGGAAACAGTCAGAGCCACCAGCCAATGA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GCAAAACATCCAAAGAAAGGGTCCCGAGTGGTACATCGTCATAGCCGGAAACAGTCAGAGCCACCAGCCAATGA 296
Query 297 TCTTTTCAATGCTGTGAAAGCCGCCAAAAGTGACATGCAGTCTTTGGTAGATGAGTGGCTGGATAGCTACAAGC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TCTTTTCAATGCTGTGAAAGCCGCCAAAAGTGACATGCAGTCTTTGGTAGATGAGTGGCTGGATAGCTACAAGC 370
Query 371 AAGACCAGGATGCAGGATTTCTGGAGCTTGTTAACTTTTTCATCCAATCTTGCGGATGTAAAGGCATTGTGACC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AAGACCAGGATGCAGGATTTCTGGAGCTTGTTAACTTTTTCATCCAATCTTGCGGATGTAAAGGCATTGTGACC 444
Query 445 CCTGAGATGTTCAAGAAGATGTCCAACTCAGAGATCATCCAGCACCTAACAGAGCAGTTTAATGAGGACTCGGG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CCTGAGATGTTCAAGAAGATGTCCAACTCAGAGATCATCCAGCACCTAACAGAGCAGTTTAATGAGGACTCGGG 518
Query 519 GGACTACCCTCTCATAGCTCCAGGTCCATCCTGGAAGAAGTTCCAGGGCAGCTTCTGTGAATTTGTGAGGACAT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GGACTACCCTCTCATAGCTCCAGGTCCATCCTGGAAGAAGTTCCAGGGCAGCTTCTGTGAATTTGTGAGGACAT 592
Query 593 TGGTCTGTCAGTGCCAGTACAGCCTCCTCTATGATGGCTTCCCTATGGACGACCTCATCTCCCTGCTCACTGGC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGGTCTGTCAGTGCCAGTACAGCCTCCTCTATGATGGCTTCCCTATGGACGACCTCATCTCCCTGCTCACTGGC 666
Query 667 CTCTCAGACTCACAAGTCCGCGCCTTCCGTCACACTAGCACCCTGGCTGCTATGAAACTGATGACCTCCCTGGT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CTCTCAGACTCACAAGTCCGCGCCTTCCGTCACACTAGCACCCTGGCTGCTATGAAACTGATGACCTCCCTGGT 740
Query 741 AAAAGTTGCCCTCCAACTGAGTGTGCACCAAGATAACAATCAGCGTCAGTATGAGGCTGAAAGAAACAAGGGGC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AAAAGTTGCCCTCCAACTGAGTGTGCACCAAGATAACAATCAGCGTCAGTATGAGGCTGAAAGAAACAAGGGGC 814
Query 815 CAGGGCAGAGGGCACCTGAGCGGCTGGAGAGCCTGTTGGAGAAACGCAAAGAGCTCCAAGAGCATCAAGAGGAG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CAGGGCAGAGGGCACCTGAGCGGCTGGAGAGCCTGTTGGAGAAACGCAAAGAGCTCCAAGAGCATCAAGAGGAG 888
Query 889 ATTGAGGGGATGATGAATGCCCTCTTCAGGGGTGTCTTTGTTCATCGGTACAGGGATGTCCTTCCTGAGATCCG 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ATTGAGGGGATGATGAATGCCCTCTTCAGGGGTGTCTTTGTTCATCGGTACAGGGATGTCCTTCCTGAGATCCG 962
Query 963 TGCTATCTGCATTGAGGAAATTGGGTGTTGGATGCAAAGCTACAGCACGTCTTTCCTCACCGACAGCTATTTAA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGCTATCTGCATTGAGGAAATTGGGTGTTGGATGCAAAGCTACAGCACGTCTTTCCTCACCGACAGCTATTTAA 1036
Query 1037 AATATATTGGTTGGACTCTGCATGATAAGCACCGAGAAGTCCGCCTGAAGTGTGTGAAGGCCCTGAAAGGGCTG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AATATATTGGTTGGACTCTGCATGATAAGCACCGAGAAGTCCGCCTGAAGTGTGTGAAGGCCCTGAAAGGGCTG 1110
Query 1111 TACGGTAACCGGGACCTGACCACACGCCTGGAGCTCTTCACCAGCCGCTTCAAGGACCGGATGGTTTCCATGGT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TACGGTAACCGGGACCTGACCACACGCCTGGAGCTCTTCACCAGCCGCTTCAAGGACCGGATGGTTTCCATGGT 1184
Query 1185 CATGGACAGAGAGTATGATGTGGCAGTGGAGGCTGTCAGATTACTGATACTTATCCTTAAGAACATGGAAGGGG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CATGGACAGAGAGTATGATGTGGCAGTGGAGGCTGTCAGATTACTGATACTTATCCTTAAGAACATGGAAGGGG 1258
Query 1259 TGCTGACGGACGCGGATTGTGAGAGCGTCTACCCCGTTGTGTATGCCTCTCATCGAGGCCTGGCCTCTGCCGCA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TGCTGACGGACGCGGATTGTGAGAGCGTCTACCCAGTTGTGTATGCCTCTCATCGAGGCCTGGCCTCTGCCGCA 1332
Query 1333 GGCGAATTTCTGTACTGGAAACTCTTCTACCCTGAGTGCGAGATAAGAATGATGGGTGGAAGAGAGCAACGCCA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GGCGAATTTCTGTACTGGAAACTCTTCTACCCTGAGTGCGAGATAAGAATGATGGGTGGAAGAGAGCAACGCCA 1406
Query 1407 GAGCCCAGGCGCCCAGAGGACTTTCTTCCAGCTTCTGCTGTCCTTCTTTGTGGAGAGCGAGCTCCATGACCACG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GAGCCCAGGCGCCCAGAGGACTTTCTTCCAGCTTCTGCTGTCCTTCTTTGTGGAGAGCGAGCTCCATGACCACG 1480
Query 1481 CTGCTTACTTAGTAGACAGTCTGTGGGACTGTGCAGGGGCTCGGCTGAAGGACTGGGAGGGTCTGACAAGCCTG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CTGCTTACTTAGTAGACAGTCTGTGGGACTGTGCAGGGGCTCGGCTGAAGGACTGGGAGGGTCTGACAAGCCTG 1554
Query 1555 CTGCTGGAGAAGGACCAGAACCTGGGTGATGTGCAGGAGAGCACACTGATAGAAATCCTTGTGTCCAGTGCCCG 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CTGCTGGAGAAGGACCAGAACCTGGGTGATGTGCAGGAGAGCACACTGATAGAAATCCTTGTGTCCAGTGCCCG 1628
Query 1629 GCAAGCTTCAGAGGGGCACCCGCCTGTGGGCCGGGTCACTGGGAGGAAGGGCTTAACCTCTAAGGAGCGCAAGA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GCAAGCTTCAGAGGGGCACCCGCCTGTGGGCCGGGTCACTGGGAGGAAGGGCTTAACCTCTAAGGAGCGCAAGA 1702
Query 1703 CCCAAGCCGATGACAGGGTGAAGTTGACTGAGCACCTCATCCCCCTGCTGCCCCAGCTCCTGGCCAAGTTCTCA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CCCAAGCCGATGACAGGGTGAAGTTGACTGAGCACCTCATCCCCCTGCTGCCCCAGCTCCTGGCCAAGTTCTCA 1776
Query 1777 GCTGATGCAGAGAAGGTCACTCCCCTGCTCCAGCTTCTCAGCTGCTTTGACCTCCACATCTACTGCACTGGGCG 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GCTGATGCAGAGAAGGTCACTCCCCTGCTCCAGCTTCTCAGCTGCTTTGACCTCCACATCTACTGCACTGGGCG 1850
Query 1851 CTTGGAGAAGCACCTGGAGCTGTTCCTGCAGCAACTCCAGGAGGTGGTGGTGAAGCATGCAGAGCCAGCGGTGC 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CTTGGAGAAGCACCTGGAGCTGTTCCTGCAGCAACTCCAGGAGGTGGTGGTGAAGCATGCAGAGCCAGCGGTGC 1924
Query 1925 TTGAGGCTGGGGCGCATGCCCTCTACCTGCTCTGTAATCCCGAATTCACTTTCTTCAGCCGGGCGGACTTTGCC 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 TTGAGGCTGGGGCGCATGCCCTCTACCTGCTCTGTAATCCCGAATTCACTTTCTTCAGCCGGGCGGACTTTGCC 1998
Query 1999 CGCAGCCAGCTAGTAGATTTGCTGACTGACCGCTTCCAGCAGGAGCTTGAAGAGCTGTTACAGTCGTCCTTCCT 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CGCAGCCAGCTAGTAGATTTGCTGACTGACCGCTTCCAGCAGGAGCTTGAAGAGCTGTTACAGTCGTCCTTCCT 2072
Query 2073 AGATGAGGATGAGGTATATAATCTGGCAGCCACTCTGAAACGCCTCTCTGCCTTCTACAACACTCATGACCTGA 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 AGATGAGGATGAGGTATATAATCTGGCAGCCACTCTGAAACGCCTCTCTGCCTTCTACAACACTCATGACCTGA 2146
Query 2147 CTCGCTGGGAGCTCTATGAGCCATGTTGCCAACTCCTGCAGAAGGCTGTGGACACAGGAGAGGTTCCTCACCAG 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 CTCGCTGGGAGCTCTATGAGCCATGTTGCCAACTCCTGCAGAAGGCTGTGGACACAGGAGAGGTTCCTCACCAG 2220
Query 2221 GTTATCCTGCCAGCCTTGACTCTTGTCTATTTTTCCATTCTCTGGACACTAACCCACATTTCTAAATCAGATGC 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 GTTATCCTGCCAGCCTTGACTCTTGTCTATTTTTCCATTCTCTGGACACTAACCCACATTTCTAAATCAGATGC 2294
Query 2295 TTCCCAGAAGCAGCTGTCGAGTTTGAGGGACAGAATGGTGGCCTTCTGTGAACTCTGCCAGAGTTGCCTCTCAG 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 TTCCCAGAAGCAGCTGTCGAGTTTGAGGGACAGAATGGTGGCCTTCTGTGAACTCTGCCAGAGTTGCCTCTCAG 2368
Query 2369 ATGTGGATACTGAGATCCAGGAGCAGGCTTTTGTCTTATTAAGTGATCTACTTCTCATCTTTAGCCCTCAGATG 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 ATGTGGATACTGAGATCCAGGAGCAGGCTTTTGTCTTATTAAGTGATCTACTTCTCATCTTTAGCCCTCAGATG 2442
Query 2443 ATTGTTGGGGGCCGTGATTTCCTTAGGCCACTTGTCTTTTTTCCTGAAGCTACTCTCCAGTCTGAGCTAGCCAG 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 ATTGTTGGGGGCCGTGATTTCCTTAGGCCACTTGTCTTTTTTCCTGAAGCTACTCTCCAGTCTGAGCTAGCCAG 2516
Query 2517 CTTCCTCATGGACCACGTCTTCATCCAGCCGGGAGACCTGGGCAGTGGTGATTCCCAGGAGGATCATTTACAGA 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 CTTCCTCATGGACCACGTCTTCATCCAGCCGGGAGACCTGGGCAGTGGTGATTCCCAGGAGGATCATTTACAGA 2590
Query 2591 TAGAGCGGCTACACCAGCGGCGCCGCCTCCTAGCCGGGTTCTGCAAGCTGTTGCTTTATGGGGTGCTGGAGATG 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 TAGAGCGGCTACACCAGCGGCGCCGCCTCCTAGCCGGGTTCTGCAAGCTGTTGCTTTATGGGGTGCTGGAGATG 2664
Query 2665 GATGCAGCCTCAGATGTTTTCAAACACTACAACAAGTTCTACAATGACTATGGTGACATTATCAAGGAAACATT 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 GATGCAGCCTCAGATGTTTTCAAACACTACAACAAGTTCTACAATGACTATGGTGACATTATCAAGGAAACATT 2738
Query 2739 AACTAGAGCAAGGCAGATTGACCGAAGTCATTGTTCCCGAATCCTGCTGCTGAGCCTCAAGCAGCTGTACACAG 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 AACTAGAGCAAGGCAGATTGACCGAAGTCATTGTTCCCGAATCCTGCTGCTGAGCCTCAAGCAGCTGTACACAG 2812
Query 2813 AACTGCTGCAGGAGCATGGGCCCCAGGGCCTGAATGAGCTTCCTGCCTTCATCGAGATGAGGGACCTGGCCCGG 2886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 AACTGCTGCAGGAGCATGGGCCCCAGGGCCTGAATGAGCTTCCTGCCTTCATCGAGATGAGGGACCTGGCCCGG 2886
Query 2887 AGGTTTGCCTTGAGTTTTGGACCCCAGCAGCTGCAGAACCGTGACCTCGTGGTCATGCTACACAAGGAAGGCAT 2960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 AGGTTTGCCTTGAGTTTTGGACCCCAGCAGCTGCAGAACCGTGACCTCGTGGTCATGCTACACAAGGAAGGCAT 2960
Query 2961 CCAGTTCTCCTTGTCTGAGCTTCCTCCAGCTGGCTCCTCCAATCAGCCTCCAAATCTGGCATTCCTGGAGCTCC 3034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 CCAGTTCTCCTTGTCTGAGCTTCCTCCAGCTGGCTCCTCCAATCAGCCTCCAAATCTGGCATTCCTGGAGCTCC 3034
Query 3035 TTTCAGAGTTTTCCCCCCGACTCTTCCATCAGGACAAGCAGCTTTTACTGTCCTATCTAGAAAAGTGCCTGCAG 3108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 TTTCAGAGTTTTCCCCCCGACTCTTCCATCAGGACAAGCAGCTTTTACTGTCCTATCTAGAAAAGTGCCTGCAG 3108
Query 3109 CATGTCTCCCAGGCACCTGGCCATCCCTGGGGCCCAGTCACCACCTACTGCCACTCCCTCAGCCCTGTGGAGAA 3182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 CATGTCTCCCAGGCACCTGGCCATCCCTGGGGCCCAGTCACCACCTACTGCCACTCCCTCAGCCCTGTGGAGAA 3182
Query 3183 CACAGCAGAGACCAGCCCTCAGGTCCTCCCCAGCTCCAAGAGGAGGCGCGTTGAAGGGCCTGCCAAGCCTAACA 3256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183 CACAGCAGAGACCAGCCCTCAGGTCCTCCCCAGCTCCAAGAGGAGGCGCGTTGAAGGGCCTGCCAAGCCTAACA 3256
Query 3257 GAGAGGACGTCTCCTCGTCCCAGGAAGAAAGTCTGCAGCTGAACAGCATCCCGCCCACGCCCACCCTCACCTCC 3330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257 GAGAGGACGTCTCCTCGTCCCAGGAAGAAAGTCTGCAGCTGAACAGCATCCCGCCCACGCCCACCCTCACCTCC 3330
Query 3331 ACAGCTGTGAAGAGCAGGCAGCCCCTGTGGGGGTTGAAAGAGATGGAGGAAGAAGATGGCTCAGAGTTGGATTT 3404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331 ACAGCTGTGAAGAGCAGGCAGCCCCTGTGGGGGTTGAAAGAGATGGAGGAAGAAGATGGCTCAGAGTTGGATTT 3404
Query 3405 TGCCCAGG---GTCAGCCCGTCGCAGGCACCGAGAGGTCAAGGTTCTTGGGTCCACAATATTTCCAGACTCCAC 3475
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405 TGCCCAGGGCAGTCAGCCCGTCGCAGGCACCGAGAGGTCAAGGTTCTTGGGTCCACAATATTTCCAGACTCCAC 3478
Query 3476 ACAACCCTTCAGGTCCTGGCCTGGGCAACCAGCTGATGCGACTCAGCCTTATGGAAGAGGACGAGGAAGAAGAG 3549
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479 ACAACCCTTCAGGTCCTGGCCTGGGCAACCAGCTGATGCGACTCAGCCTTATGGAAGAGGACGAGGAAGAAGAG 3552
Query 3550 TTAGAAATCCAGGATGAGTCAAATGAAGAACGGCAGGATACAGACATGCAAGCAAGTAGCTACTCTTCCACCAG 3623
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3553 TTAGAAATCCAGGATGAGTCAAATGAAGAACGGCAGGATACAGACATGCAAGCAAGTAGCTACTCTTCCACCAG 3626
Query 3624 TGAGCGCGGGCTGGACCTCTTAGATTCTACAGAGCTGGATATTGAGGATTTC---------------------- 3675
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||.|
Sbjct 3627 TGAGCGCGGGCTGGACCTCTTAGATTCTACAGAGCTGGATATTGA-GATTACTGAGAGTCTTCCGTTACTAGGG 3699
Query 3676 ------------------ 3675
Sbjct 3700 CAGAGGACTGCTGTTTGC 3717