Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07687
• Subject: XM_017018719.1
• Aligned Length: 1536
• Identities: 1523
• Gaps: 12

Alignment

Query    1  ATGGGTAGCTGTTGTAGCTGTCCAGATAAAGACACTGTCCCAGATAACCATCGGAACAAGTTTAAGGTCATTAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGTAGCTGTTGTAGCTGTCCAGATAAAGACACTGTCCCAGATAACCATCGGAACAAGTTTAAGGTCATTAA  74

Query   75  TGTGGATGATGATGGGAATGAGTTAGGTTCTGGCATAATGGAACTTACAGACACAGAACTGATTTTATACACCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGTGGATGATGATGGGAATGAGTTAGGTTCTGGCATAATGGAACTTACAGACACAGAACTGATTTTATACACCC  148

Query  149  GCAAACGTGACTCAGTAAAATGGCACTACCTCTGCCTGCGACGCTATGGCTATGACTCGAATCTCTTTTCTTTT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCAAACGTGACTCAGTAAAATGGCACTACCTCTGCCTGCGACGCTATGGCTATGACTCGAATCTCTTTTCTTTT  222

Query  223  GAAAGTGGTCGAAGGTGTCAAACTGGACAAGGAATCTTTGCCTTTAAGTGTGCCCGTGCAGAAGAATTATTTAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAAAGTGGTCGAAGGTGTCAAACTGGACAAGGAATCTTTGCCTTTAAGTGTGCCCGTGCAGAAGAATTATTTAA  296

Query  297  CATGTTGCAAGAGATTATGCAAAATAATAGTATAAATGTGGTGGAAGAGCCAGTTGTAGAAAGAAATAATCATC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CATGTTGCAAGAGATTATGCAAAATAATAGTATAAATGTGGTGGAAGAGCCAGTTGTAGAAAGAAATAATCATC  370

Query  371  AGACAGAATTGGAAGTCCCTAGAACACCTCGAACACCTACAACTCCAGGATTTGCTGCTCAGAACTTACCTAAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGACAGAATTGGAAGTCCCTAGAACACCTCGAACACCTACAACTCCAGGATTTGCTGCTCAGAACTTACCTAAT  444

Query  445  GGATATCCCCGATATCCCTCATTTGGAGATGCTTCATCCCATCCGTCAAGCAGACATCCTTCTGTGGGAAGTGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGATATCCCCGATATCCCTCATTTGGAGATGCTTCATCCCATCCGTCAAGCAGACATCCTTCTGTGGGAAGTGC  518

Query  519  TCGCCTGCCTTCAGTAGGGGAAGAATCTACACATCCTTTGCTTGTGGCTGAGGAACAAGTACATACCTATGTCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCGCCTGCCTTCAGTAGGGGAAGAATCTACACATCCTTTGCTTGTGGCTGAGGAACAAGTACATACCTATGTCA  592

Query  593  ACACTACAGGTGTGCAAGAAGAGCGGAAAAACCGCACAAGTGTGCATGTTCCATTGGAGGCAAGGGTTTCTAAC  666
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  593  ACACTACAGGTGTGCAAGAAGAGCGGAAAAACCGCACAAGTGTGCATGTTCCATTGGAGGCGAGGGTTTCTAAC  666

Query  667  GCTGAAAGCAGCACACCAAAAGAAGAACCAAGTAGTATTGAGGACAGGGATCCTCAGATTCTTCTTGAACCTGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCTGAAAGCAGCACACCAAAAGAAGAACCAAGTAGTATTGAGGACAGGGATCCTCAGATTCTTCTTGAACCTGA  740

Query  741  AGGAGTCAAATTTGTTTTAGGGCCAACCCCTGTTCAAAAGCAGTTAATGGAAAAAGAGAAACTGGAGCAACTTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGGAGTCAAATTTGTTTTAGGGCCAACCCCTGTTCAAAAGCAGTTAATGGAAAAAGAGAAACTGGAGCAACTTG  814

Query  815  GAAGAGATCAAGTTAGTGGAAGTGGAGCAAATAACACAGAATGGGACACTGGCTATGACAGTGATGAACGAAGA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GAAGAGATCAAGTTAGTGGAAGTGGAGCAAATAACACAGAATGGGACACTGGCTATGACAGTGATGAACGAAGA  888

Query  889  GATGCACCCTCTGTTAACAAACTGGTGTATGAAAATATAAATGGGCTATCTATCCCTAGTGCCTCAGGGGTCAG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GATGCACCCTCTGTTAACAAACTGGTGTATGAAAATATAAATGGGCTATCTATCCCTAGTGCCTCAGGGGTCAG  962

Query  963  GAGAGGTCGTCTGACATCCACCAGTACCTCAGATACCCAGAATATCAACAACTCAGCTCAGAGAAGAACTGCAT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GAGAGGTCGTCTGACATCCACCAGTACCTCAGATACCCAGAATATCAACAACTCAGCTCAGAGAAGAACTGCAT  1036

Query 1037  TATTAAACTATGAAAATCTACCATCTTTGCCTCCTGTTTGGGAAGCCCGCAAGCTAAGTAGGGATGAAGATGAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TATTAAACTATGAAAATCTACCATCTTTGCCTCCTGTTTGGGAAGCCCGCAAGCTAAGTAGGGATGAAGATGAC  1110

Query 1111  AATTTAGGACCAAAGACCCCATCTCTAAATGGCTACCATAATAATCTAGATCCAATGCATAACTATGTAAATAC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AATTTAGGACCAAAGACCCCATCTCTAAATGGCTACCATAATAATCTAGATCCAATGCATAACTATGTAAATAC  1184

Query 1185  AGAGAATGTAACAGTGCCAGCAAGTGCTCACAAAATAGAATATTCAAGGCGTCGGGACTGTACACCAACAGTCT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGAGAATGTAACAGTGCCAGCAAGTGCTCACAAAATAGAATATTCAAGGCGTCGGGACTGTACACCAACAGTCT  1258

Query 1259  TTAACTTTGATATCAGACGCCCAAGTTTAGAACACAGGCAGCTTAATTACATACAGGTTGACTTGGAAGGTGGC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TTAACTTTGATATCAGACGCCCAAGTTTAGAACACAGGCAGCTTAATTACATACAGGTTGACTTGGAAGGTGGC  1332

Query 1333  AGTGACTCTGACAACCCTCAGACTCCAAAAACGCCTACAACTCCCCTTCCACAAACCCCTACCAGGCGCACAGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AGTGACTCTGACAACCCTCAGACTCCAAAAACGCCTACAACTCCCCTTCCACAAACCCCTACCAGGCGCACAGA  1406

Query 1407  GCTGTATGCCGTGATAGACATCGAGAGAACTGCTGCTATGTCAAATTTGCAGAAAGCACTGCCACGAGATGATG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GCTGTATGCCGTGATAGACATCGAGAGAACTGCTGCTATGTCAAATTTGCAGAAAGCACTGCCACGAGATGATG  1480

Query 1481  GTACATCTAGGAAAACTAGACACAATAGTACTGATCTGCCCATGTTAGCCTGGAAA  1536
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
Sbjct 1481  GTACATCTAGGAAAACTAGACACAATAGTACTGATCTGCCCATG------------  1524