Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07727
• Subject: NM_001310612.1
• Aligned Length: 1123
• Identities: 751
• Gaps: 263

Alignment

Query    1  ATGTCTCTACGCTGCGGGGATGCAGCCCGCACCCTGGGGCCCCGGGTATTTGGGAGATATTTTTGCAGCCCAGT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CAGACCGTTAAGCTCCTTGCCAGATAAAAAAAAGGAACTCCTACAGAATGGACCAGACCTTCAAGATTTTGTAT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CTGGTGATCTTGCAGACAGGAGCACCTGGGATGAATATAAAGGAAACCTAAAACGCCAGAAAGGAGAAAGGTTA  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  AGACTACCTCCATGGCTAAAGACAGAGATTCCCATGGGGAAAAATTACAATAAACTGAAAAATACTTTGCGGAA  296
                                             |||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct    1  ---------------------------------ATGGGTAAAAACTACAATAAACTGAAAAATACATTGCGGAA  41

Query  297  TTTAAATCTCCATACAGTATGTGAGGAAGCTCGATGTCCCAATATTGGAGAGTGTTGGGGAGGTGGAGAATATG  370
            |||||.||||||.|||||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct   42  TTTAAGTCTCCACACAGTGTGTGAGGAAGCCCGGTGCCCCAACATTGGAGAGTGTTGGGGAGGTGGGGAATATG  115

Query  371  CCACCGCCACAGCCACGATCATGTTGATGGGTGACACATGTACAAGAGGTTGCAGATTTTGTTCTGTTAAGACT  444
            ||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct  116  CCACAGCCACAGCCACGATCATGTTGATGGGGGACACATGCACAAGAGGTTGCAGATTTTGTTCCGTTAAGACC  189

Query  445  GCAAGAAATCCTCCTCCACTGGATGCCAGTGAGCCCTACAATACTGCAAAGGCAATTGCAGAATGGGGTCTGGA  518
            |||||||||||.||||||.|||||||||.|||||||.|||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct  190  GCAAGAAATCCCCCTCCATTGGATGCCAATGAGCCCGACAATACGGCCAAAGCAATTGCAGAGTGGGGTCTGGA  263

Query  519  TTATGTTGTCCTGACATCTGTGGATCGAGATGATATGCCTGATGGGGGAGCTGAACACATTGCAAAGACCGTAT  592
            |||||||||||||||.||.|||||||||||||||.||.|.||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.|
Sbjct  264  TTATGTTGTCCTGACGTCGGTGGATCGAGATGATGTGGCCGACGGGGGAGCTGAGCACATCGCCAAGACCGTGT  337

Query  593  CATATTTAAAGGAAAGGAATCCAAAAATCCTTGTGGAGTGTCTTACTCCTGATTTTCGAGGTGATCTCAAAGCA  666
            |||..||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||.||.||.|||||||||||.|.||||
Sbjct  338  CATGCTTGAAGGAAAGGAATCCAAAAATCCTCGTGGAATGCCTCACCCCAGACTTCCGAGGTGATCTGAGAGCA  411

Query  667  ATAGAAAAAGTTGCTCTGTCAGGATTAGATGTGTATGCACATAATGTAGAAACAGTCCCGGAATTACAGAGTAA  740
            .|.||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.||.||||||||.||
Sbjct  412  GTGGAGAAGGTGGCTCTGTCTGGATTAGATGTGTATGCACACAATGTGGAGACTGTCCCCGAGTTACAGAGGAA  485

Query  741  GGTTCGTGATCCTCGGGTCAATTTTGATCAGTCCCTACGTGTACTGAAACATGCCAAGAAGGTTCAGCCTGATG  814
            .|||||||||||.||||.|||||||||.|||||.||.||||||||||.||||||||||.||||.||||||||||
Sbjct  486  AGTTCGTGATCCCCGGGCCAATTTTGACCAGTCTCTTCGTGTACTGAGACATGCCAAGGAGGTCCAGCCTGATG  559

Query  815  TTATTTCTAAAACATCTATAATGTTGGGTTTAGGCGAGAATGATGAGCAAGTATATGCAACAATGAAAGCACTT  888
            ||.||||.||||||||.||||||.||||..|.||.||||..||.||||||||.|||||.|||.|||||||.||.
Sbjct  560  TTGTTTCCAAAACATCGATAATGCTGGGCCTTGGTGAGACAGACGAGCAAGTCTATGCCACACTGAAAGCTCTC  633

Query  889  CGTGAGGCAGATGTAGACTGCTTGACTTTAGGACAATATATGCAGCCAACAAGGCGTCACCTTAAGGTTGAAGA  962
            ||||.|||.||.||.|||||.||.|||.||||.||.||.|||||||||||.|.|||.|||||||||||||||||
Sbjct  634  CGTGCGGCCGACGTGGACTGTTTAACTCTAGGGCAGTACATGCAGCCAACGAAGCGCCACCTTAAGGTTGAAGA  707

Query  963  ATATATTACTCCTGAAAAATTCAAATACTGGGAAAAAGTAGGAAATGAACTTGGATTTCATTATACTGCAAGTG  1036
            ||||.||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||..|||||.|||||||
Sbjct  708  ATATGTTACTCCTGAGAAGTTCAAATACTGGGAAAAAGTAGGGAATGAACTTGGATTTCTCTATACGGCAAGTG  781

Query 1037  GCCCTTTGGTGCGTTCTTCATATAAAGCAGGTGAATTTTTCCTGAAAAATCTAGTGGCTAAAAGAAAAACAAAA  1110
            |.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  782  GTCCTTTGGTGCGATCTTCATATAAAGCAGGTGAATTTTTCCTGAAAAATCTAGTGGCTAGAAGAAAAACAAAA  855

Query 1111  GACCTC-------  1116
            | |.||       
Sbjct  856  G-CTTCTAAAGTG  867