Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07729
• Subject: XM_017026192.1
• Aligned Length: 1478
• Identities: 1207
• Gaps: 163

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAGAAGAAGGACCCAGCCTCCGATTGGCCACACTCTGTGTGTCTCTCTATCCTGCCAGCACCGAGGGCTCAT  74

Query    1  ----------------------------------ATGACCTCCATCCTCACGGTCCTGATCTGTCTCGGGCTGA  40
                                              ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCATCCACAGAGCAGGGCAGTGGGAGGAGACGCCATGACCCCCATCCTCACGGTCCTGATCTGTCTCGGGCTGA  148

Query   41  GCCTGGACCCCAGGACCCACGTGCAGGCAGGGCCCCTCCCCAAGCCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTG  114
            |.||||.||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  149  GTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGCACCTCCCCAAGCCCACCCTCTGGGCTGAACCAGGCTCTGTG  222

Query  115  ATCACCCAAGGGAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTCAGGGGAGCCTGGAGACGCAGGAGTACCATCTATATAGAGA  188
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||.||||||||||.||||||||||||
Sbjct  223  ATCACCCAGGGGAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTCAGGGGGGCCAGGAGACCCAGGAGTACCGTCTATATAGAGA  296

Query  189  AAAGAAAACAGCACTCTGGATTACACGGATCCCACAGGAGCTTGTGAAGAAGGGCCAGTTCCCCATCCTATCCA  262
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  297  AAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCACAGGAGCTTGTGAAGAAGGGCCAGTTCCCCATCCCATCCA  370

Query  263  TCACCTGGGAACATGCAGGGCGGTATTGCTGTATCTATGGCAGCCACACTGTAGGCCTCTCAGAGAGCAGTGAC  336
            |||||||||||||..|||||||||||.|||||..||||||.|||.||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct  371  TCACCTGGGAACACACAGGGCGGTATCGCTGTTACTATGGTAGCGACACTGCAGGCCGCTCAGAGAGCAGTGAC  444

Query  337  CCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACAGCAAACCCACCCTCTCAGCTCTGCCCAGCCCTGTGGTGACCTC  410
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|.|||||||||.|||||||.|||
Sbjct  445  CCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACATCAAACCCACCCTCTCAGCCCAGCCCAGCCCCGTGGTGAACTC  518

Query  411  AGGAGGGAATGTGACCATCCAGTGTGACTCACAGGTGGCATTTGATGGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAG  484
            ||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGGAGGGAATGTAACCCTCCAGTGTGACTCACAGGTGGCATTTGATGGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAG  592

Query  485  ATGAACACCCACAATGCCTGAACTCCCATTCCCATGCCCGTGGGTCATCCCGGGCCATCTTCTCCGTGGGCCCC  558
            ||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGAACACCCACAATGCCTGAACTCCCAGCCCCATGCCCGTGGGTCGTCCCGCGCCATCTTCTCCGTGGGCCCC  666

Query  559  GTGAGCCCAAGTCGCAGGTGGTCGTACAGGTGCTATGGTTATGACTCGCGCGCTCCCTATGTGTGGTCTCTACC  632
            ||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||..|.|||||||||.||||||||||||
Sbjct  667  GTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTGGTACAGGTGCTATGCTTATGACTCGAACTCTCCCTATGAGTGGTCTCTACC  740

Query  633  CAGTGATCTCCTGGGGCTCCTGGTCCCAGGTGTTTCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCGGGTCCTGTCG  706
            ||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||
Sbjct  741  CAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCTAGGTGTTTCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATCG  814

Query  707  TGGCCCCTGGGGAGAAGCTGACCTTCCAGTGTGGCTCTGATGCCGGCTACGACAGATTTGTTCTGTACAAGGAG  780
            |||||||||.|||||..|||||..|.|||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||.|||||.
Sbjct  815  TGGCCCCTGAGGAGACCCTGACTCTGCAGTGTGGCTCTGATGCTGGCTACAACAGATTTGTTCTGTATAAGGAC  888

Query  781  TGGGGACGTGACTTCCTCCAGCGCCCTGGCCGGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGG  854
            .|||.||||||||||||.||||.|.|||||...|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGGGAACGTGACTTCCTTCAGCTCGCTGGCGCACAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGG  962

Query  855  CCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACACATGCTCCGGTGCATACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCC  928
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGATGCTACGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCC  1036

Query  929  CCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCACAGGACAGATCCGTGCCAGACCCTTCCTCTCCGTGCGGCCGGGCCCC  1002
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||..||.||||..||.||||||.||||.||||||||||
Sbjct 1037  CCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCGCAGGACAGTTCTATGACAGAGTCTCCCTCTCGGTGCAGCCGGGCCCC  1110

Query 1003  ACAGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCACAGGGAGGGATGCACACTTTCCTTTTGACCAA  1076
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||.|||||||
Sbjct 1111  ACGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCACAGGGATGGATGCAAACTTTCCTTCTGACCAA  1184

Query 1077  GGAGGGGGCAGCTGATTCCCCGCTGCGTCTAAAATCAAAGCGCCAATCTCATAAGTACCAGGCTGAATTCCCCA  1150
            ||||||||||||||||..|||...||||||||.|||||.|..|||||||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGAGGGGGCAGCTGATGACCCATGGCGTCTAAGATCAACGTACCAATCTCAAAAATACCAGGCTGAATTCCCCA  1258

Query 1151  TGAGTCCTGTGACCTCGGCCCACGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCACTCAGCTCCAACCCCTACCTGCTG  1224
            ||.|||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||..||||||||.||||||||||||
Sbjct 1259  TGGGTCCTGTGACCTCAGCCCATGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCACAGAGCTCCAAACCCTACCTGCTG  1332

Query 1225  ACTCACCCCAGTGACCCCCTGGAGCTCGTGGTCTCAGGAGCAGCTGAGACCCTCAGC-CCACCACAAAACAAGT  1297
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|..|||.|..||.|||| ||.|.||  ||||.|.
Sbjct 1333  ACTCACCCCAGTGACCCCCTGGAGCTCGTGGTCTCAGGACCGTCTGGGGGCCCCAGCTCCCCGAC--AACAGGC  1404

Query 1298  CCGA-CTCCA-------AGGC--------------------------------------------TGGTGAG  1317
            ||.| |||||       ||||                                            |||||||
Sbjct 1405  CCCACCTCCACATCTGCAGGCCCTGAGGACCAGCCCCTCACCCCCACCGGGTCGGATCCCCAGAGTGGTGAG  1476