Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07730
• Subject: NM_001278399.2
• Aligned Length: 1440
• Identities: 1197
• Gaps: 114

Alignment

Query    1  ATGACCCCCATCCTCACGGTCCTGATCTGTCTCGGGCTGAGTCTGGGCCCCAGGACCCACGTGCAGGCAGGGCA  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACCCCCATCCTCACGGTCCTGATCTGTCTCGGGCTGAGTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGCA  74

Query   75  CCTCCCCAAGCCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCATCCAGGGAAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTC  148
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTCCCCAAGCCCACCCTCTGGGCTGAACCAGGCTCTGTGATCACCCAGGGGAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTC  148

Query  149  AGGGGAGCCTTCAGGCTGAGGAGTACCATCTATATAGGGAAAACAAATCAGCATCCTGGGTTAGACGGAT---A  219
            |||||.|||...||.|..|||||||||.|||||||||.|||||.|||.|||||.|||||.|||.||||||   |
Sbjct  149  AGGGGGGCCAGGAGACCCAGGAGTACCGTCTATATAGAGAAAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCA  222

Query  220  CAAGAGCCTGGGAAGAATGGCCAGTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACGCAGGGCGGTATCACTGTCA  293
            ||.||||.||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||  
Sbjct  223  CAGGAGCTTGTGAAGAAGGGCCAGTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACACAGGGCGGTATCGCTGT--  294

Query  294  GTACTA---CAGCCACAATCACT-CA------TCAGAGTACAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCC  357
             |||||   .|||.|    |||| ||      ||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  295  -TACTATGGTAGCGA----CACTGCAGGCCGCTCAGAGAGCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCC  363

Query  358  TACAGCAAACCCACCCTCTCAGCTCTGCCCAGCCCTGTGGTGACCTTAGGAGGGAACGTGACCCTCCAGTGTGT  431
            ||||.||||||||||||||||||.|.|||||||||.|||||||.||.|||||||||.||.|||||||||||||.
Sbjct  364  TACATCAAACCCACCCTCTCAGCCCAGCCCAGCCCCGTGGTGAACTCAGGAGGGAATGTAACCCTCCAGTGTGA  437

Query  432  CTCACAGGTGGCATTTGACGGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAACGCCTGAACTCCC  505
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  438  CTCACAGGTGGCATTTGATGGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCCC  511

Query  506  ATTCCCATGCCCGTGGGTGGTCCTGGGCCATCTTCTCCGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTCGTAC  579
            |..|||||||||||||||.||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  512  AGCCCCATGCCCGTGGGTCGTCCCGCGCCATCTTCTCCGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTGGTAC  585

Query  580  AGGTGCTATGCTTATGACTCGAACTCTCCCTATGTGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCC  653
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  586  AGGTGCTATGCTTATGACTCGAACTCTCCCTATGAGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCT  659

Query  654  AGGTGTTTCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATGGTGGCCCCTGGGGAGAGCCTGACCCTCC  727
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.||||||.||.|
Sbjct  660  AGGTGTTTCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATCGTGGCCCCTGAGGAGACCCTGACTCTGC  733

Query  728  AGTGTGTCTCTGATGTCGGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGAGAACGTGACTTCCTCCAGCGCCCT  801
            ||||||.||||||||..||||||.||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||.|.||
Sbjct  734  AGTGTGGCTCTGATGCTGGCTACAACAGATTTGTTCTGTATAAGGACGGGGAACGTGACTTCCTTCAGCTCGCT  807

Query  802  GGTTGGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCCCTCCCACGGGGGCCA  875
            ||....||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||
Sbjct  808  GGCGCACAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCA  881

Query  876  GTACAGATGCTACAGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGTGACCCCCTGGACATCCTGATCA  949
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.
Sbjct  882  GTACAGATGCTACGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCG  955

Query  950  CAGGACAGTTCTATGACAGACCCTCTCTCTCGGTGCAGCCGGTCCCCACAGTAGCCCCAGGAAAGAACGTGACC  1023
            ||||||||||||||||||||..|||.||||||||||||||||.||||||.||.|||.|||||.|||||||||||
Sbjct  956  CAGGACAGTTCTATGACAGAGTCTCCCTCTCGGTGCAGCCGGGCCCCACGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACC  1029

Query 1024  CTGCTGTGTCAGTCACGGGGGCAGTTCCACACTTTCCTTCTGACCAAGGAGGGGGCAGGCCATCCCCCACTGCA  1097
            ||||||||||||||||.|||...|.|.||.||||||||||||||||||||||||||||...||..||||..||.
Sbjct 1030  CTGCTGTGTCAGTCACAGGGATGGATGCAAACTTTCCTTCTGACCAAGGAGGGGGCAGCTGATGACCCATGGCG  1103

Query 1098  TCTGAGATCAGAGCACCAAGCTCAGCAGAACCAGGCTGAATTCCGCATGGGTCCTGTGACCTCAGCCCACGTGG  1171
            |||.||||||..|.|||||.||||..|..|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|.||
Sbjct 1104  TCTAAGATCAACGTACCAATCTCAAAAATACCAGGCTGAATTCCCCATGGGTCCTGTGACCTCAGCCCATGCGG  1177

Query 1172  GGACCTACAGATGCTACAGCTCACTCAGCTCCAACCCCTACCTGCTGTCTCTCCCCAGTGACCCCCTGGAGCTC  1245
            ||||||||||.||||||.||||||..||||||||.||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1178  GGACCTACAGGTGCTACGGCTCACAGAGCTCCAAACCCTACCTGCTGACTCACCCCAGTGACCCCCTGGAGCTC  1251

Query 1246  GTGGTCTCAGCATCC--CTAGG----CCAACACCCC--CAGGATTACACAGTGGAGAATCTCATCCGCATGGGT  1311
            ||||||||||.| ||  ||.||    |||.|.||||  ||       ||||    |...|.|.|||.|||    
Sbjct 1252  GTGGTCTCAGGA-CCGTCTGGGGGCCCCAGCTCCCCGACA-------ACAG----GCCCCACCTCCACAT----  1309

Query 1312  GTGGCTGGCTTGGTCCTGGTGGTCCTCGGGATTCTGCTATTTGAGGCTCAG-----------CACAG-------  1367
                           |||..||.||                |||||..|||           |||.|       
Sbjct 1310  ---------------CTGCAGGCCC----------------TGAGGACCAGCCCCTCACCCCCACCGGGTCGGA  1352

Query 1368  ---CCAGAGAAGCCTACAAGATGCAGCCGGGAGG  1398
               ||||||            ||     |.||| 
Sbjct 1353  TCCCCAGAG------------TG-----GTGAG-  1368