Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07746
- Subject:
- NM_019069.4
- Aligned Length:
- 1009
- Identities:
- 805
- Gaps:
- 26
Alignment
Query 1 ATGGCGACGGAGGAG--AAGAAGCCCGAGACCGAGGCCGCCAGAGCACAGCCAACCCCTTCGTCATCCGCCACT 72
|||||.||..||||| |||| |.|||||.|||||||....|||..||.|||||.||||.|
Sbjct 1 ATGGCAACCAAGGAGTCAAGA--------------GACGCCAAAGCACAGTTGGCCCTCTCCTCATCGGCCAAT 60
Query 73 CAGAGCAAGCCTACA----CCTGTGAAGCCAAACTATGCTCTAAAGTTCACCCTTGCTGGCCACACCAAAGCAG 142
||||||||| .| ||||..||.||||||||||||||.||.|..||.||||..||.|||||..||||||
Sbjct 61 CAGAGCAAG----GAAGTGCCTGAAAACCCAAACTATGCTCTCAAATGTACTCTTGTGGGACACACGGAAGCAG 130
Query 143 TGTCCTCCGTGAAATTCAGCCCGAATGGAGAGTGGCTGGCAAGTTCATCTGCTGATAAACTTATTAAAATTTGG 216
||||.||.||.||.||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||||..||.||.|.|||||||
Sbjct 131 TGTCATCAGTTAAGTTTAGTCCTAATGGAGAATGGCTAGCAAGTTCTTCTGCTGATAGGCTAATCATAATTTGG 204
Query 217 GGCGCGTATGATGGGAAATTTGAGAAAACCATATCTGGTCACAAGCTGGGAATATCCGATGTAGCCTGGTCGTC 290
||.||.||||||||.||||.|||||||||..|.|.||||||.||..|||.||||||.|||||.||||||||.||
Sbjct 205 GGAGCATATGATGGAAAATATGAGAAAACACTCTATGGTCATAATTTGGAAATATCGGATGTTGCCTGGTCATC 278
Query 291 AGATTCTAACCTTCTTGTTTCTGCCTCAGATGACAAAACCTTGAAGATATGGGACGTGAGCTCGGGCAAGTGTC 364
||||||.|..|.|||||||||||||||||||||.|||||..|.||..|||||||.|||||.||.||.||.|||.
Sbjct 279 AGATTCCAGTCGTCTTGTTTCTGCCTCAGATGATAAAACTCTAAAATTATGGGATGTGAGATCTGGAAAATGTT 352
Query 365 TGAAAACCCTGAAGGGACACAGTAATTATGTCTTTTGCTGCAACTTCAATCC-CCAGTCCAACCTTATTGTCTC 437
|||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||| ||| |||||||||||..||||
Sbjct 353 TGAAAACACTGAAGGGGCACAGTAATTATGTCTTTTGTTGTAACTTCAATCCGCCA-TCCAACCTTATAATCTC 425
Query 438 AGGATCCTTTGACGAAAGCGTGAGGATATGGGATGTGAAAACAGGGAAGTGCCTCAAGACTTTGCCAGCTCACT 511
.|||||.|||||.||.|..||.|..||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||.|.|||||.|
Sbjct 426 GGGATCTTTTGATGAGACTGTAAAAATATGGGAGGTGAAAACAGGAAAGTGTCTCAAGACTTTGTCTGCTCATT 499
Query 512 CGGATCCAGTCTCGGCCGTTCATTTTAATCGTGATGGATCCTTGATAGTTTCAAGTAGCTATGATGGTCTCTGT 585
|.||.|||||.||.||.||||||||||||.||..|||.|||||||||||.|||.|||||||||||||.||||||
Sbjct 500 CTGACCCAGTTTCTGCTGTTCATTTTAATTGTAGTGGGTCCTTGATAGTGTCAGGTAGCTATGATGGCCTCTGT 573
Query 586 CGCATCTGGGACACCGCCTCGGGCCAGTGCCTGAAGACGCTCATCGATGACGACAACCCCCCCGTGTCTTTTGT 659
.|.||||||||..|.||.||.||.|||||..|.||.||||||.|.||||||||.|||||.||.||.||||||||
Sbjct 574 AGAATCTGGGATGCTGCATCAGGTCAGTGTTTAAAAACGCTCGTTGATGACGATAACCCTCCTGTCTCTTTTGT 647
Query 660 GAAGTTCTCCCCGAACGGCAAATACATCCTGGCCGCCACGCTGGACAACACTCTGAAGCTCTGGGACTACAGCA 733
.||.||.||.||.||.||.||||||||.||..|.||.||..|||||||||||||.||.||.|||||.||.||||
Sbjct 648 AAAATTTTCTCCAAATGGTAAATACATTCTCACTGCAACTTTGGACAACACTCTTAAACTATGGGATTATAGCA 721
Query 734 AGGGGAAGTGCCTGAAGACGTACACTGGCCACAAGAATGAGAAATACTGCATATTTGCCAATTTCTCTGTTACT 807
..||.|.|||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 722 GAGGCAGGTGCCTGAAAACATACACTGGTCATAAGAATGAGAAATATTGCATATTTGCCAATTTTTCAGTTACT 795
Query 808 GGTGGGAAGTGGATTGTGTCTGGCTCAGAGGATAACCTTGTTTACATCTGGAACCTTCAGACGAAAGAGATTGT 881
|||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 796 GGTGGAAAGTGGATTGTGTCTGGTTCCGAGGATAACCTGGTTTACATTTGGAACCTTCAGACTAAAGAGATTGT 869
Query 882 ACAGAAACTACAAGGCCACACAGATGTCGTGATCTCAACAGCTTGTCACCCAACAGAAAACATCATCGCCTCTG 955
.||||||.||||||||||.||||||||.|||||||||.||||||||||.||.|||||||||.|||||||.||.|
Sbjct 870 GCAGAAATTACAAGGCCATACAGATGTTGTGATCTCAGCAGCTTGTCATCCTACAGAAAACCTCATCGCATCAG 943
Query 956 CTGCGCTAGAAAATGACAAAACAATTAAACTGTGGAAGAGTGACTGC 1002
|.||..||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||..|
Sbjct 944 CAGCATTAGAAAATGACAAAACAATTAAACTGTGGATGAGTAACCAC 990