Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07792
- Subject:
- NM_001161521.1
- Aligned Length:
- 1793
- Identities:
- 1770
- Gaps:
- 16
Alignment
Query 1 -----ATGG-----AG-ACGCCGCCGCTGCCTCCC---GCATGCACAAAGCAGGGTCATCAGAAGCCTCTCGAT 60
|||| || ||| |||.|.|..||.| |.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGTATGGTTGGAAGCACG--GCCCCAGATTCTCTTTGTATGCACAAAGCAGGGTCATCAGAAGCCTCTCGAT 72
Query 61 TCAAAAGATGATAATACCGAAAAACACTGCCCAGTGACAGTGAATCCTTGGCATATGAAGAAAGCTTTCAAAGT 134
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 73 TCAAAAGATGATAATACCGAAAAACACTGCCCAGTGACAGTGAATCCTTGGCATATGAAGAAAGCTTTCAAAGT 146
Query 135 CATGAACGAATTAAGAAGTCAAAATTTGCTGTGCGATGTCACAATTGTGGCAGAAGACATGGAAATTTCTGCTC 208
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 147 CATGAACGAATTAAGAAGTCAAAATTTGCTGTGCGATGTCACAATTGTGGCAGAAGACATGGAAATTTCTGCTC 220
Query 209 ATAGAGTGGTGCTGGCCGCCTGTAGTCCTTATTTTCATGCCATGTTTACAGGTGAGATGAGTGAGAGCCGAGCA 282
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 221 ATAGAGTGGTGCTGGCCGCCTGTAGTCCTTATTTTCATGCCATGTTTACAGGTGAGATGAGTGAGAGCCGAGCA 294
Query 283 AAGAGAGTTAGAATAAAAGAGGTAGATGGCTGGACCCTGAGGATGCTAATTGATTATGTTTACACTGCAGAAAT 356
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 295 AAGAGAGTTAGAATAAAAGAGGTAGATGGCTGGACCCTGAGGATGCTAATTGATTATGTTTACACTGCAGAAAT 368
Query 357 TCAGGTTACAGAAGAAAATGTACAGGTACTTCTCCCAGCAGCTGGTCTCTTACAGTTACAGGATGTGAAGAAGA 430
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 369 TCAGGTTACAGAAGAAAATGTACAGGTACTTCTCCCAGCAGCTGGTCTCTTACAGTTACAGGATGTGAAGAAGA 442
Query 431 CTTGTTGTGAATTTTTGGAATCCCAGCTTCACCCTGTCAACTGCTTAGGAATCCGGGCTTTTGCTGATATGCAT 504
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 443 CTTGTTGTGAATTTTTGGAATCCCAGCTTCACCCTGTCAACTGCTTAGGAATCCGGGCTTTTGCTGATATGCAT 516
Query 505 GCATGTACCGACCTTCTGAACAAGGCCAACACCTATGCAGAGCAACATTTTGCAGATGTTGTACTTAGTGAAGA 578
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 517 GCATGTACCGACCTTCTGAACAAGGCCAACACCTATGCAGAGCAACATTTTGCAGATGTTGTACTTAGTGAAGA 590
Query 579 ATTTCTCAATCTTGGCATCGAACAAGTGTGCAGCTTAATCTCAAGTGACAAACTTACCATTTCTTCAGAAGAGA 652
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 591 ATTTCTCAATCTTGGCATCGAACAAGTGTGCAGCTTAATCTCAAGTGACAAACTTACCATTTCTTCAGAAGAGA 664
Query 653 AGGTATTTGAAGCAGTAATAGCATGGGTGAACCATGACAAGGATGTGAGGCAAGAGTTTATGGCCCGACTGATG 726
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 665 AGGTATTTGAAGCAGTAATAGCATGGGTGAACCATGACAAGGATGTGAGGCAAGAGTTTATGGCCCGACTGATG 738
Query 727 GAACATGTACGGTTACCTTTGCTTCCTCGGGAATATTTAGTTCAGAGGGTTGAAGAGGAAGCATTGGTCAAGAA 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 739 GAACATGTACGGTTACCTTTGCTTCCTCGGGAATATTTAGTTCAGAGGGTTGAAGAGGAAGCATTGGTCAAGAA 812
Query 801 TAGCAGTGCTTGCAAAGATTACCTCATTGAAGCAATGAAGTACCATTTGCTGCCAACAGAGCAGCGTATATTAA 874
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 813 TAGCAGTGCTTGCAAAGATTACCTCATTGAAGCAATGAAGTACCATTTGCTGCCAACAGAGCAGCGTATATTAA 886
Query 875 TGAAGAGTGTCCGGACCCGGCTGAGGACACCCATGAACCTTCCCAAATTGATGGTGGTGGTTGGGGGCCAAGCA 948
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 887 TGAAGAGTGTCCGGACCCGGCTGAGGACACCCATGAACCTTCCCAAATTGATGGTGGTGGTTGGGGGCCAAGCA 960
Query 949 CCAAAGGCTATCCGGAGTGTGGAATGCTATGACTTTAAAGAAGAAAGGTGGCACCAAGTAGCAGAGTTGCCTTC 1022
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 CCAAAGGCTATCCGGAGTGTGGAATGCTATGACTTTAAAGAAGAAAGGTGGCACCAAGTAGCAGAGTTGCCTTC 1034
Query 1023 CGGGAGGTGCAGGGCAGGCATGGTCTACATGGCTGGACTTGTTTTTGCTGTTGGTGGCTTTAATGGCTCATTAA 1096
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1035 CAGGAGGTGCAGGGCAGGCATGGTCTACATGGCTGGACTTGTTTTTGCTGTTGGTGGCTTTAATGGCTCATTAA 1108
Query 1097 GAGTTCGCACTGTAGATTCCTACGACCCTGTGAAGGACCAGTGGACCAGCGTTGCTAACATGAGAGACCGGAGA 1170
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1109 GAGTTCGCACTGTAGATTCCTACGACCCTGTGAAGGACCAGTGGACCAGCGTTGCTAACATGAGAGACCGGAGA 1182
Query 1171 AGCACTTTGGGAGCTGCTGTGTTAAATGGATTATTATACGCTGTGGGAGGCTTTGATGGGAGTACAGGTTTGTC 1244
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1183 AGCACTTTGGGAGCTGCTGTGTTAAATGGATTATTATACGCTGTGGGAGGCTTTGATGGGAGTACAGGTTTGTC 1256
Query 1245 ATCTGTGGAAGCATACAACATAAAGTCTAATGAGTGGTTTCATGTAGCTCCCATGAATACAAGGAGGAGCAGTG 1318
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1257 ATCTGTGGAAGCATACAACATAAAGTCTAATGAGTGGTTTCATGTAGCTCCCATGAATACAAGGAGGAGCAGTG 1330
Query 1319 TTGGTGTGGGTGTTGTTGGAGGTTTGCTCTATGCTGTAGGAGGTTATGATGGAGCATCACGTCAGTGTCTTAGC 1392
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1331 TTGGTGTGGGTGTTGTTGGAGGTTTGCTCTATGCTGTAGGAGGTTATGATGGAGCATCACGTCAGTGTCTTAGC 1404
Query 1393 ACAGTAGAATGCTATAATGCTACAACAAATGAGTGGACCTATATAGCAGAAATGAGCACCAGGCGGAGTGGAGC 1466
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1405 ACAGTAGAATGCTATAATGCTACAACAAATGAGTGGACCTATATAGCAGAAATGAGCACCAGGCGGAGTGGAGC 1478
Query 1467 AGGTGTTGGTGTGTTAAACAATTTATTGTATGCTGTAGGAGGTCATGATGGCCCTTTAGTACGAAAAAGTGTTG 1540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1479 AGGTGTTGGTGTGTTAAACAATTTATTGTATGCTGTAGGAGGTCATGATGGCCCTTTAGTACGAAAAAGTGTTG 1552
Query 1541 AAGTATATGATCCCACCACTAACGCATGGAGACAGGTTGCAGATATGAACATGTGCAGAAGAAATGCAGGAGTT 1614
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1553 AAGTATATGATCCCACCACTAACGCATGGAGACAGGTTGCAGATATGAACATGTGCAGAAGAAATGCAGGAGTT 1626
Query 1615 TGTGCAGTTAATGGTCTGTTATATGTTGTTGGAGGGGATGATGGTTCCTGTAACTTGGCGTCAGTAGAATATTA 1688
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1627 TGTGCAGTTAATGGTCTGTTATATGTTGTTGGAGGGGATGATGGTTCCTGTAACTTGGCGTCAGTAGAATATTA 1700
Query 1689 TAACCCAACAACCGATAAATGGACAGTTGTGTCATCGTGTATGAGCACAGGGAGAAGTTATGCAGGGGTCACAG 1762
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1701 TAACCCAACAACCGATAAATGGACAGTTGTGTCATCGTGTATGAGCACAGGGAGAAGTTATGCAGGGGTCACAG 1774
Query 1763 TTATTGATAAACCATTA 1779
|||||||||||||||||
Sbjct 1775 TTATTGATAAACCATTA 1791