Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07792
• Subject: XM_011531572.2
• Aligned Length: 1899
• Identities: 1778
• Gaps: 120

Alignment

Query    1  ATGGAGACGCCGCCGCTGCCTCCCGCATGCACAAAGCAGGGTCATCAGAAGCCTCTCGATTCAAAAGATGATAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGACGCCGCCGCTGCCTCCCGCATGCACAAAGCAGGGTCATCAGAAGCCTCTCGATTCAAAAGATGATAA  74

Query   75  TACCGAAAAACACTGCCCAGTGACAGTGAATCCTTGGCATATGAAGAAAGCTTTCAAAGTCATGAACGAATTAA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TACCGAAAAACACTGCCCAGTGACAGTGAATCCTTGGCATATGAAGAAAGCTTTCAAAGTCATGAACGAATTAA  148

Query  149  GA------------------------------------------------------------------------  150
            ||                                                                        
Sbjct  149  GAAGACAATCTCACTCTGCCACCCAGGCTGGAATGCAGTGGCGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGACTCCT  222

Query  151  ------------------------------------------------AGTCAAAATTTGCTGTGCGATGTCAC  176
                                                            ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGGTTCAAGCGATTGTCCCACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGTCAAAATTTGCTGTGCGATGTCAC  296

Query  177  AATTGTGGCAGAAGACATGGAAATTTCTGCTCATAGAGTGGTGCTGGCCGCCTGTAGTCCTTATTTTCATGCCA  250
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AATTGTGGCAGAAGACATGGAAATTTCTGCTCATAGAGTGGTGCTGGCCGCCTGTAGTCCTTATTTTCATGCCA  370

Query  251  TGTTTACAGGTGAGATGAGTGAGAGCCGAGCAAAGAGAGTTAGAATAAAAGAGGTAGATGGCTGGACCCTGAGG  324
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGTTTACAGGTGAGATGAGTGAGAGCCGAGCAAAGAGAGTTAGAATAAAAGAGGTAGATGGCTGGACCCTGAGG  444

Query  325  ATGCTAATTGATTATGTTTACACTGCAGAAATTCAGGTTACAGAAGAAAATGTACAGGTACTTCTCCCAGCAGC  398
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATGCTAATTGATTATGTTTACACTGCAGAAATTCAGGTTACAGAAGAAAATGTACAGGTACTTCTCCCAGCAGC  518

Query  399  TGGTCTCTTACAGTTACAGGATGTGAAGAAGACTTGTTGTGAATTTTTGGAATCCCAGCTTCACCCTGTCAACT  472
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGGTCTCTTACAGTTACAGGATGTGAAGAAGACTTGTTGTGAATTTTTGGAATCCCAGCTTCACCCTGTCAACT  592

Query  473  GCTTAGGAATCCGGGCTTTTGCTGATATGCATGCATGTACCGACCTTCTGAACAAGGCCAACACCTATGCAGAG  546
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCTTAGGAATCCGGGCTTTTGCTGATATGCATGCATGTACCGACCTTCTGAACAAGGCCAACACCTATGCAGAG  666

Query  547  CAACATTTTGCAGATGTTGTACTTAGTGAAGAATTTCTCAATCTTGGCATCGAACAAGTGTGCAGCTTAATCTC  620
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAACATTTTGCAGATGTTGTACTTAGTGAAGAATTTCTCAATCTTGGCATCGAACAAGTGTGCAGCTTAATCTC  740

Query  621  AAGTGACAAACTTACCATTTCTTCAGAAGAGAAGGTATTTGAAGCAGTAATAGCATGGGTGAACCATGACAAGG  694
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AAGTGACAAACTTACCATTTCTTCAGAAGAGAAGGTATTTGAAGCAGTAATAGCATGGGTGAACCATGACAAGG  814

Query  695  ATGTGAGGCAAGAGTTTATGGCCCGACTGATGGAACATGTACGGTTACCTTTGCTTCCTCGGGAATATTTAGTT  768
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATGTGAGGCAAGAGTTTATGGCCCGACTGATGGAACATGTACGGTTACCTTTGCTTCCTCGGGAATATTTAGTT  888

Query  769  CAGAGGGTTGAAGAGGAAGCATTGGTCAAGAATAGCAGTGCTTGCAAAGATTACCTCATTGAAGCAATGAAGTA  842
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CAGAGGGTTGAAGAGGAAGCATTGGTCAAGAATAGCAGTGCTTGCAAAGATTACCTCATTGAAGCAATGAAGTA  962

Query  843  CCATTTGCTGCCAACAGAGCAGCGTATATTAATGAAGAGTGTCCGGACCCGGCTGAGGACACCCATGAACCTTC  916
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCATTTGCTGCCAACAGAGCAGCGTATATTAATGAAGAGTGTCCGGACCCGGCTGAGGACACCCATGAACCTTC  1036

Query  917  CCAAATTGATGGTGGTGGTTGGGGGCCAAGCACCAAAGGCTATCCGGAGTGTGGAATGCTATGACTTTAAAGAA  990
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCAAATTGATGGTGGTGGTTGGGGGCCAAGCACCAAAGGCTATCCGGAGTGTGGAATGCTATGACTTTAAAGAA  1110

Query  991  GAAAGGTGGCACCAAGTAGCAGAGTTGCCTTCCGGGAGGTGCAGGGCAGGCATGGTCTACATGGCTGGACTTGT  1064
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAAAGGTGGCACCAAGTAGCAGAGTTGCCTTCCAGGAGGTGCAGGGCAGGCATGGTCTACATGGCTGGACTTGT  1184

Query 1065  TTTTGCTGTTGGTGGCTTTAATGGCTCATTAAGAGTTCGCACTGTAGATTCCTACGACCCTGTGAAGGACCAGT  1138
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TTTTGCTGTTGGTGGCTTTAATGGCTCATTAAGAGTTCGCACTGTAGATTCCTACGACCCTGTGAAGGACCAGT  1258

Query 1139  GGACCAGCGTTGCTAACATGAGAGACCGGAGAAGCACTTTGGGAGCTGCTGTGTTAAATGGATTATTATACGCT  1212
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GGACCAGCGTTGCTAACATGAGAGACCGGAGAAGCACTTTGGGAGCTGCTGTGTTAAATGGATTATTATACGCT  1332

Query 1213  GTGGGAGGCTTTGATGGGAGTACAGGTTTGTCATCTGTGGAAGCATACAACATAAAGTCTAATGAGTGGTTTCA  1286
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GTGGGAGGCTTTGATGGGAGTACAGGTTTGTCATCTGTGGAAGCATACAACATAAAGTCTAATGAGTGGTTTCA  1406

Query 1287  TGTAGCTCCCATGAATACAAGGAGGAGCAGTGTTGGTGTGGGTGTTGTTGGAGGTTTGCTCTATGCTGTAGGAG  1360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGTAGCTCCCATGAATACAAGGAGGAGCAGTGTTGGTGTGGGTGTTGTTGGAGGTTTGCTCTATGCTGTAGGAG  1480

Query 1361  GTTATGATGGAGCATCACGTCAGTGTCTTAGCACAGTAGAATGCTATAATGCTACAACAAATGAGTGGACCTAT  1434
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GTTATGATGGAGCATCACGTCAGTGTCTTAGCACAGTAGAATGCTATAATGCTACAACAAATGAGTGGACCTAT  1554

Query 1435  ATAGCAGAAATGAGCACCAGGCGGAGTGGAGCAGGTGTTGGTGTGTTAAACAATTTATTGTATGCTGTAGGAGG  1508
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ATAGCAGAAATGAGCACCAGGCGGAGTGGAGCAGGTGTTGGTGTGTTAAACAATTTATTGTATGCTGTAGGAGG  1628

Query 1509  TCATGATGGCCCTTTAGTACGAAAAAGTGTTGAAGTATATGATCCCACCACTAACGCATGGAGACAGGTTGCAG  1582
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TCATGATGGCCCTTTAGTACGAAAAAGTGTTGAAGTATATGATCCCACCACTAACGCATGGAGACAGGTTGCAG  1702

Query 1583  ATATGAACATGTGCAGAAGAAATGCAGGAGTTTGTGCAGTTAATGGTCTGTTATATGTTGTTGGAGGGGATGAT  1656
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ATATGAACATGTGCAGAAGAAATGCAGGAGTTTGTGCAGTTAATGGTCTGTTATATGTTGTTGGAGGGGATGAT  1776

Query 1657  GGTTCCTGTAACTTGGCGTCAGTAGAATATTATAACCCAACAACCGATAAATGGACAGTTGTGTCATCGTGTAT  1730
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GGTTCCTGTAACTTGGCGTCAGTAGAATATTATAACCCAACAACCGATAAATGGACAGTTGTGTCATCGTGTAT  1850

Query 1731  GAGCACAGGGAGAAGTTATGCAGGGGTCACAGTTATTGATAAACCATTA  1779
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GAGCACAGGGAGAAGTTATGCAGGGGTCACAGTTATTGATAAACCATTA  1899