Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07792
- Subject:
- XM_017007676.1
- Aligned Length:
- 1779
- Identities:
- 1514
- Gaps:
- 264
Alignment
Query 1 ATGGAGACGCCGCCGCTGCCTCCCGCATGCACAAAGCAGGGTCATCAGAAGCCTCTCGATTCAAAAGATGATAA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TACCGAAAAACACTGCCCAGTGACAGTGAATCCTTGGCATATGAAGAAAGCTTTCAAAGTCATGAACGAATTAA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 GAAGTCAAAATTTGCTGTGCGATGTCACAATTGTGGCAGAAGACATGGAAATTTCTGCTCATAGAGTGGTGCTG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GCCGCCTGTAGTCCTTATTTTCATGCCATGTTTACAGGTGAGATGAGTGAGAGCCGAGCAAAGAGAGTTAGAAT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ------------------------------------------ATGAGTGAGAGCCGAGCAAAGAGAGTTAGAAT 32
Query 297 AAAAGAGGTAGATGGCTGGACCCTGAGGATGCTAATTGATTATGTTTACACTGCAGAAATTCAGGTTACAGAAG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 33 AAAAGAGGTAGATGGCTGGACCCTGAGGATGCTAATTGATTATGTTTACACTGCAGAAATTCAGGTTACAGAAG 106
Query 371 AAAATGTACAGGTACTTCTCCCAGCAGCTGGTCTCTTACAGTTACAGGATGTGAAGAAGACTTGTTGTGAATTT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 107 AAAATGTACAGGTACTTCTCCCAGCAGCTGGTCTCTTACAGTTACAGGATGTGAAGAAGACTTGTTGTGAATTT 180
Query 445 TTGGAATCCCAGCTTCACCCTGTCAACTGCTTAGGAATCCGGGCTTTTGCTGATATGCATGCATGTACCGACCT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 TTGGAATCCCAGCTTCACCCTGTCAACTGCTTAGGAATCCGGGCTTTTGCTGATATGCATGCATGTACCGACCT 254
Query 519 TCTGAACAAGGCCAACACCTATGCAGAGCAACATTTTGCAGATGTTGTACTTAGTGAAGAATTTCTCAATCTTG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 255 TCTGAACAAGGCCAACACCTATGCAGAGCAACATTTTGCAGATGTTGTACTTAGTGAAGAATTTCTCAATCTTG 328
Query 593 GCATCGAACAAGTGTGCAGCTTAATCTCAAGTGACAAACTTACCATTTCTTCAGAAGAGAAGGTATTTGAAGCA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 329 GCATCGAACAAGTGTGCAGCTTAATCTCAAGTGACAAACTTACCATTTCTTCAGAAGAGAAGGTATTTGAAGCA 402
Query 667 GTAATAGCATGGGTGAACCATGACAAGGATGTGAGGCAAGAGTTTATGGCCCGACTGATGGAACATGTACGGTT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 403 GTAATAGCATGGGTGAACCATGACAAGGATGTGAGGCAAGAGTTTATGGCCCGACTGATGGAACATGTACGGTT 476
Query 741 ACCTTTGCTTCCTCGGGAATATTTAGTTCAGAGGGTTGAAGAGGAAGCATTGGTCAAGAATAGCAGTGCTTGCA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 477 ACCTTTGCTTCCTCGGGAATATTTAGTTCAGAGGGTTGAAGAGGAAGCATTGGTCAAGAATAGCAGTGCTTGCA 550
Query 815 AAGATTACCTCATTGAAGCAATGAAGTACCATTTGCTGCCAACAGAGCAGCGTATATTAATGAAGAGTGTCCGG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 551 AAGATTACCTCATTGAAGCAATGAAGTACCATTTGCTGCCAACAGAGCAGCGTATATTAATGAAGAGTGTCCGG 624
Query 889 ACCCGGCTGAGGACACCCATGAACCTTCCCAAATTGATGGTGGTGGTTGGGGGCCAAGCACCAAAGGCTATCCG 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 625 ACCCGGCTGAGGACACCCATGAACCTTCCCAAATTGATGGTGGTGGTTGGGGGCCAAGCACCAAAGGCTATCCG 698
Query 963 GAGTGTGGAATGCTATGACTTTAAAGAAGAAAGGTGGCACCAAGTAGCAGAGTTGCCTTCCGGGAGGTGCAGGG 1036
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 699 GAGTGTGGAATGCTATGACTTTAAAGAAGAAAGGTGGCACCAAGTAGCAGAGTTGCCTTCCAGGAGGTGCAGGG 772
Query 1037 CAGGCATGGTCTACATGGCTGGACTTGTTTTTGCTGTTGGTGGCTTTAATGGCTCATTAAGAGTTCGCACTGTA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 773 CAGGCATGGTCTACATGGCTGGACTTGTTTTTGCTGTTGGTGGCTTTAATGGCTCATTAAGAGTTCGCACTGTA 846
Query 1111 GATTCCTACGACCCTGTGAAGGACCAGTGGACCAGCGTTGCTAACATGAGAGACCGGAGAAGCACTTTGGGAGC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 847 GATTCCTACGACCCTGTGAAGGACCAGTGGACCAGCGTTGCTAACATGAGAGACCGGAGAAGCACTTTGGGAGC 920
Query 1185 TGCTGTGTTAAATGGATTATTATACGCTGTGGGAGGCTTTGATGGGAGTACAGGTTTGTCATCTGTGGAAGCAT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 921 TGCTGTGTTAAATGGATTATTATACGCTGTGGGAGGCTTTGATGGGAGTACAGGTTTGTCATCTGTGGAAGCAT 994
Query 1259 ACAACATAAAGTCTAATGAGTGGTTTCATGTAGCTCCCATGAATACAAGGAGGAGCAGTGTTGGTGTGGGTGTT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 995 ACAACATAAAGTCTAATGAGTGGTTTCATGTAGCTCCCATGAATACAAGGAGGAGCAGTGTTGGTGTGGGTGTT 1068
Query 1333 GTTGGAGGTTTGCTCTATGCTGTAGGAGGTTATGATGGAGCATCACGTCAGTGTCTTAGCACAGTAGAATGCTA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1069 GTTGGAGGTTTGCTCTATGCTGTAGGAGGTTATGATGGAGCATCACGTCAGTGTCTTAGCACAGTAGAATGCTA 1142
Query 1407 TAATGCTACAACAAATGAGTGGACCTATATAGCAGAAATGAGCACCAGGCGGAGTGGAGCAGGTGTTGGTGTGT 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1143 TAATGCTACAACAAATGAGTGGACCTATATAGCAGAAATGAGCACCAGGCGGAGTGGAGCAGGTGTTGGTGTGT 1216
Query 1481 TAAACAATTTATTGTATGCTGTAGGAGGTCATGATGGCCCTTTAGTACGAAAAAGTGTTGAAGTATATGATCCC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1217 TAAACAATTTATTGTATGCTGTAGGAGGTCATGATGGCCCTTTAGTACGAAAAAGTGTTGAAGTATATGATCCC 1290
Query 1555 ACCACTAACGCATGGAGACAGGTTGCAGATATGAACATGTGCAGAAGAAATGCAGGAGTTTGTGCAGTTAATGG 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1291 ACCACTAACGCATGGAGACAGGTTGCAGATATGAACATGTGCAGAAGAAATGCAGGAGTTTGTGCAGTTAATGG 1364
Query 1629 TCTGTTATATGTTGTTGGAGGGGATGATGGTTCCTGTAACTTGGCGTCAGTAGAATATTATAACCCAACAACCG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1365 TCTGTTATATGTTGTTGGAGGGGATGATGGTTCCTGTAACTTGGCGTCAGTAGAATATTATAACCCAACAACCG 1438
Query 1703 ATAAATGGACAGTTGTGTCATCGTGTATGAGCACAGGGAGAAGTTATGCAGGGGTCACAGTTATTGATAAACCA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1439 ATAAATGGACAGTTGTGTCATCGTGTATGAGCACAGGGAGAAGTTATGCAGGGGTCACAGTTATTGATAAACCA 1512
Query 1777 TTA 1779
|||
Sbjct 1513 TTA 1515