Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07799
- Subject:
- NM_001205231.1
- Aligned Length:
- 1425
- Identities:
- 1289
- Gaps:
- 12
Alignment
Query 1 ATGTCGGACTTCGACGAGTTCGAGCGGCAGCTCAACGAGAATAAACAAGAGCGGGACAAGGAGAACCGGCATCG 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||..|
Sbjct 1 ATGTCGGACTTCGACGAGTTCGAGCGGCAGCTCAACGAGAATAAACAAGAGCGGGACAAGGAGAATCGGCACAG 74
Query 75 GAAGCGCAGCCACAGCCGCTCTCGGAGCCGGGACCGCAAACGCCGGAGCCGGAGCCGCGACCGGCGCAACCGGG 148
||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||.||.||.|||.|||||.|||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 75 GAAGCGTAGTCACAGTCGCTCTCGAAGCCGAGATCGAAAGCGCAGGAGCAGGAGCCGAGATCGGCGCAACCGGG 148
Query 149 ACCAGCGGAGCGCCTCCCGGGACAGGCGACGACGCAGCAAACCTTTGACCAGAGGCGCTAAAGAGGAGCACGGT 222
|||||||.||.|||||.|||||.|||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ACCAGCGCAGTGCCTCTCGGGATAGGAGACGACGAAGCAAACCTTTGACCAGAGGCGCTAAAGAGGAGCACGGT 222
Query 223 GGACTGATTCGTTCCCCCCGCCACGAGAAGAAGAAGAAGGTCCGTAAATACTGGGACGTGCCACCCCCAGGCTT 296
|||.||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 223 GGATTGATTCGTTCTCCCCGCCATGAGAAGAAGAAGAAGGTGCGTAAATACTGGGACGTGCCACCGCCTGGCTT 296
Query 297 TGAGCACATCACCCCAATGCAGTACAAGGCCATGCAAGCTGCGGGTCAGATTCCAGCCACTGCTCTTCTCCCCA 370
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 297 TGAGCACATCACCCCAATGCAGTACAAGGCCATGCAAGCTGCGGGTCAGATTCCAGCCACTGCCCTTCTCCCGA 370
Query 371 CCATGACCCCTGACGGTCTGGCTGTGACCCCAACGCCGGTGCCCGTGGTCGGGAGCCAGATGACCAGACAAGCC 444
|||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 371 CCATGACTCCTGATGGTCTGGCTGTGACCCCAACGCCAGTGCCTGTGGTTGGGAGCCAGATGACCAGACAGGCC 444
Query 445 CGGCGCCTCTACGTGGGCAACATCCCCTTTGGCATCACTGAGGAGGCCATGATGGATTTCTTCAACGCCCAGAT 518
.|.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 445 AGACGTCTCTACGTGGGCAACATCCCTTTTGGCATTACTGAGGAGGCTATGATGGACTTCTTCAACGCCCAGAT 518
Query 519 GCGCCTGGGGGGGCTGACCCAGGCCCCTGGCAACCCAGTGTTGGCTGTGCAGATTAACCAGGACAAGAATTTTG 592
||||.||||.|||.||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||||
Sbjct 519 GCGCTTGGGAGGGTTGACTCAGGCCCCTGGCAACCCAGTCTTGGCTGTGCAGATAAATCAAGACAAGAATTTTG 592
Query 593 CCTTTTTGGAGTTCCGCTCAGTGGACGAGACTACCCAGGCTATGGCCTTTGATGGCATCATCTTCCAGGGCCAG 666
||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCTTTTTGGAGTTCCGGTCAGTGGATGAGACGACCCAGGCCATGGCATTTGATGGCATCATCTTCCAGGGCCAG 666
Query 667 TCACTAAAGATCCGCAGGCCTCACGACTACCAGCCGCTTCCTGGCATGTCAGAGAACCCCTCCGTCTATGTGCC 740
|||.|.|||||.||.||||||||.|||||.|||||..|.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct 667 TCATTGAAGATTCGAAGGCCTCATGACTATCAGCCATTGCCTGGCATGTCAGAGAACCCCTCTGTTTATGTGCC 740
Query 741 TGGGGTTGTGTCCACTGTGGTCCCCGACTCTGCCCACAAGCTGTTCATCGGGGGCTTACCCAACTACCTGAACG 814
|||.|||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.|
Sbjct 741 TGGAGTTGTATCCACTGTAGTCCCAGATTCTGCCCACAAGCTGTTCATCGGGGGTTTGCCCAATTACCTAAATG 814
Query 815 ATGACCAGGTCAAAGAGCTGCTGACATCCTTTGGGCCCCTCAAGGCCTTCAACCTGGTCAAGGACAGTGCCACG 888
||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||.|||||.||||||||.
Sbjct 815 ATGACCAGGTAAAAGAGCTGCTGACATCCTTTGGGCCTCTCAAGGCCTTCAACTTGGTTAAGGATAGTGCCACA 888
Query 889 GGGCTCTCCAAGGGCTACGCCTTCTGTGAGTACGTGGACATCAACGTCACGGATCAGGCCATTGCGGGGCTGAA 962
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GGGCTCTCCAAGGGCTATGCCTTCTGTGAGTACGTGGACATCAACGTCACAGATCAGGCCATTGCGGGGCTGAA 962
Query 963 CGGCATGCAGCTGGGGGATAAGAAGCTGCTGGTCCAGAGGGCGAGTGTGGGAGCCAAGAATGCCACGCT----- 1031
.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGGGATGCAGCTAGGGGACAAGAAGCTGCTTGTCCAGAGGGCGAGTGTGGGAGCCAAGAATGCCACGCTGGTGA 1036
Query 1032 -------GAGCACCATCAATCAGACGCCTGTGACCCTGCAAGTGCCGGGCTTGATGAGCTCCCAGGTGCAGATG 1098
||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||.||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1037 GCCTCCCGAGCACCATCAATCAGACACCTGTGACCCTTCAAGTGCCCGGCCTGATGAGCTCTCAGGTGCAGATG 1110
Query 1099 GGCGGCCACCCGACTGAGGTCCTGTGCCTCATGAACATGGTGCTGCCTGAGGAGCTGCTGGACGACGAGGAGTA 1172
|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1111 GGCGGTCACCCAACTGAGGTCCTGTGCCTCATGAACATGGTGCTGCCTGAGGAGCTGCTGGACGATGAGGAGTA 1184
Query 1173 TGAGGAGATCGTGGAGGATGTGCGGGACGAGTGCAGCAAGTACGGGCTTGTCAAGTCCATCGAGATCCCCCGGC 1246
|||||||||.||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.|||.|.|||||.|||||.||.||.|||||.|
Sbjct 1185 TGAGGAGATTGTAGAGGACGTACGAGACGAGTGCAGCAAGTATGGGTTGGTCAAATCCATTGAAATTCCCCGCC 1258
Query 1247 CTGTGGACGGCGTCGAGGTGCCCGGCTGCGGAAAGATCTTTGTGGAGTTCACCTCTGTGTTTGACTGCCAGAAA 1320
|.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CCGTGGACGGCGTCGAGGTGCCTGGCTGTGGAAAGATCTTCGTGGAGTTCACCTCTGTGTTTGACTGCCAGAAA 1332
Query 1321 GCCATGCAGGGCCTGACGGGCCGCAAGTTCGCCAACAGAGTGGTTGTCACAAAATACTGTGACCCCGACTCTTA 1394
|||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1333 GCCATGCAGGGTCTAACCGGTCGCAAGTTCGCCAACAGAGTGGTGGTCACAAAATACTGTGACCCTGATTCTTA 1406
Query 1395 TCACCGCCGGGATTTCTGG 1413
.|||||.|||||.||||||
Sbjct 1407 CCACCGTCGGGACTTCTGG 1425