Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07799
• Subject: XM_017322124.1
• Aligned Length: 1425
• Identities: 1004
• Gaps: 324

Alignment

Query    1  ATGTCGGACTTCGACGAGTTCGAGCGGCAGCTCAACGAGAATAAACAAGAGCGGGACAAGGAGAACCGGCATCG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GAAGCGCAGCCACAGCCGCTCTCGGAGCCGGGACCGCAAACGCCGGAGCCGGAGCCGCGACCGGCGCAACCGGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ACCAGCGGAGCGCCTCCCGGGACAGGCGACGACGCAGCAAACCTTTGACCAGAGGCGCTAAAGAGGAGCACGGT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GGACTGATTCGTTCCCCCCGCCACGAGAAGAAGAAGAAGGTCCGTAAATACTGGGACGTGCCACCCCCAGGCTT  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  TGAGCACATCACCCCAATGCAGTACAAGGCCATGCAAGCTGCGGGTCAGATTCCAGCCACTGCTCTTCTCCCCA  370
                            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct    1  ----------------ATGCAGTACAAGGCCATGCAAGCTGCGGGTCAGATTCCAGCCACTGCCCTTCTCCCGA  58

Query  371  CCATGACCCCTGACGGTCTGGCTGTGACCCCAACGCCGGTGCCCGTGGTCGGGAGCCAGATGACCAGACAAGCC  444
            |||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct   59  CCATGACTCCTGATGGTCTGGCTGTGACCCCAACGCCAGTGCCTGTGGTTGGGAGCCAGATGACCAGACAGGCC  132

Query  445  CGGCGCCTCTACGTGGGCAACATCCCCTTTGGCATCACTGAGGAGGCCATGATGGATTTCTTCAACGCCCAGAT  518
            .|.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  133  AGACGTCTCTACGTGGGCAACATCCCTTTTGGCATTACTGAGGAGGCTATGATGGACTTCTTCAACGCCCAGAT  206

Query  519  GCGCCTGGGGGGGCTGACCCAGGCCCCTGGCAACCCAGTGTTGGCTGTGCAGATTAACCAGGACAAGAATTTTG  592
            ||||.||||.|||.||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||||
Sbjct  207  GCGCTTGGGAGGGTTGACTCAGGCCCCTGGCAACCCAGTCTTGGCTGTGCAGATAAATCAAGACAAGAATTTTG  280

Query  593  CCTTTTTGGAGTTCCGCTCAGTGGACGAGACTACCCAGGCTATGGCCTTTGATGGCATCATCTTCCAGGGCCAG  666
            ||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  281  CCTTTTTGGAGTTCCGGTCAGTGGATGAGACGACCCAGGCCATGGCATTTGATGGCATCATCTTCCAGGGCCAG  354

Query  667  TCACTAAAGATCCGCAGGCCTCACGACTACCAGCCGCTTCCTGGCATGTCAGAGAACCCCTCCGTCTATGTGCC  740
            |||.|.|||||.||.||||||||.|||||.|||||..|.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct  355  TCATTGAAGATTCGAAGGCCTCATGACTATCAGCCATTGCCTGGCATGTCAGAGAACCCCTCTGTTTATGTGCC  428

Query  741  TGGGGTTGTGTCCACTGTGGTCCCCGACTCTGCCCACAAGCTGTTCATCGGGGGCTTACCCAACTACCTGAACG  814
            |||.|||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.|
Sbjct  429  TGGAGTTGTATCCACTGTAGTCCCAGATTCTGCCCACAAGCTGTTCATCGGGGGTTTGCCCAATTACCTAAATG  502

Query  815  ATGACCAGGTCAAAGAGCTGCTGACATCCTTTGGGCCCCTCAAGGCCTTCAACCTGGTCAAGGACAGTGCCACG  888
            ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||.|||||.||||||||.
Sbjct  503  ATGACCAGGTAAAAGAGCTGCTGACATCCTTTGGGCCTCTCAAGGCCTTCAACTTGGTTAAGGATAGTGCCACA  576

Query  889  GGGCTCTCCAAGGGCTACGCCTTCTGTGAGTACGTGGACATCAACGTCACGGATCAGGCCATTGCGGGGCTGAA  962
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  577  GGGCTCTCCAAGGGCTATGCCTTCTGTGAGTACGTGGACATCAACGTCACAGATCAGGCCATTGCGGGGCTGAA  650

Query  963  CGGCATGCAGCTGGGGGATAAGAAGCTGCTGGTCCAGAGGGCGAGTGTGGGAGCCAAGAATGCCACGCT-----  1031
            .||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
Sbjct  651  TGGGATGCAGCTAGGGGACAAGAAGCTGCTTGTCCAGAGGGCGAGTGTGGGAGCCAAGAATGCCACGCTGGTGA  724

Query 1032  -------GAGCACCATCAATCAGACGCCTGTGACCCTGCAAGTGCCGGGCTTGATGAGCTCCCAGGTGCAGATG  1098
                   ||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||.||||||||||.||||||||||||
Sbjct  725  GCCTCCCGAGCACCATCAATCAGACACCTGTGACCCTTCAAGTGCCCGGCCTGATGAGCTCTCAGGTGCAGATG  798

Query 1099  GGCGGCCACCCGACTGAGGTCCTGTGCCTCATGAACATGGTGCTGCCTGAGGAGCTGCTGGACGACGAGGAGTA  1172
            |||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  799  GGCGGTCACCCAACTGAGGTCCTGTGCCTCATGAACATGGTGCTGCCTGAGGAGCTGCTGGACGATGAGGAGTA  872

Query 1173  TGAGGAGATCGTGGAGGATGTGCGGGACGAGTGCAGCAAGTACGGGCTTGTCAAGTCCATCGAGATCCCCCGGC  1246
            |||||||||.||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.|||.|.|||||.|||||.||.||.|||||.|
Sbjct  873  TGAGGAGATTGTAGAGGACGTACGAGACGAGTGCAGCAAGTATGGGTTGGTCAAATCCATTGAAATTCCCCGCC  946

Query 1247  CTGTGGACGGCGTCGAGGTGCCCGGCTGCGGAAAGATCTTTGTGGAGTTCACCTCTGTGTTTGACTGCCAGAAA  1320
            |.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  947  CCGTGGACGGCGTCGAGGTGCCTGGCTGTGGAAAGATCTTCGTGGAGTTCACCTCTGTGTTTGACTGCCAGAAA  1020

Query 1321  GCCATGCAGGGCCTGACGGGCCGCAAGTTCGCCAACAGAGTGGTTGTCACAAAATACTGTGACCCCGACTCTTA  1394
            |||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1021  GCCATGCAGGGTCTAACCGGTCGCAAGTTCGCCAACAGAGTGGTGGTCACAAAATACTGTGACCCTGATTCTTA  1094

Query 1395  TCACCGCCGGGATTTCTGG  1413
            .|||||.|||||.||||||
Sbjct 1095  CCACCGTCGGGACTTCTGG  1113