Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07805
• Subject: NM_001286188.1
• Aligned Length: 4047
• Identities: 3811
• Gaps: 234

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCCGCAGCCGCTGCTGCCAGCGCTTCCTCCTCTGTCTTCGCCGAGCGGGGCTGGTTCCTGCGGCCCGAGCGG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CGGGGAGGTGAAACAGGAGCCCGTCGGAGGAAGGGGCAGAAGGGAGTGGAGAGTCGCCCCCTCCTCGCGGCCAC  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  GCAGCAGCCCGCGTCTCGCTCTCCCCACCCAGTGCAGTGGCCGCCGCCTCTTCCGCCGCCGGGCTCGGGGCCTC  222

Query    1  ------------ATGGAGGCCGTGAAGACCTTCAATAGCGAGTTGTATTCCCTGAATGACTATAAACCACCCAT  62
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGCAGCGACAACATGGAGGCCGTGAAGACCTTCAATAGCGAGTTGTATTCCCTGAATGACTATAAACCACCCAT  296

Query   63  TTCGAAAGCGAAAATGACCCAAATTACTAAGGCAGCCATCAAAGCTATTAAGTTCTATAAACATGTGGTACAGA  136
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TTCGAAAGCGAAAATGACCCAAATTACTAAGGCAGCCATCAAAGCTATTAAGTTCTATAAACATGTGGTACAGA  370

Query  137  GTGTTGAGAAGTTTATTCAGAAATGTAAACCAGAATACAAAGTACCTGGACTTTATGTTATTGACTCCATTGTG  210
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GTGTTGAGAAGTTTATTCAGAAATGTAAACCAGAATACAAAGTACCTGGACTTTATGTTATTGACTCCATTGTG  444

Query  211  CGACAATCCCGACATCAGTTTGGTCAAGAAAAGGATGTGTTTGCACCCAGATTTAGTAATAACATCATTAGCAC  284
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CGACAATCCCGACATCAGTTTGGTCAAGAAAAGGATGTGTTTGCACCCAGATTTAGTAATAACATCATTAGCAC  518

Query  285  TTTCCAGAATTTATATCGTTGCCCTGGGGATGACAAGAGTAAAATAGTGAGAGTACTAAACTTATGGCAGAAGA  358
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TTTCCAGAATTTATATCGTTGCCCTGGGGATGACAAGAGTAAAATAGTGAGAGTACTAAACTTATGGCAGAAGA  592

Query  359  ATAATGTATTTAAGAGTGAGATTATTCAGCCCCTTTTGGATATGGCAGCCGGGATTCCGCCTCCAGTTGTCACA  432
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATAATGTATTTAAGAGTGAGATTATTCAGCCCCTTTTGGATATGGCAGCCGGGATTCCGCCTCCAGTTGTCACA  666

Query  433  CCTGTTTTGGCCAGCACTACCACTGCTATGAGCAATACTCCAGGAACTCCTGTGACACCTGTTACTCCGGCCAA  506
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCTGTTTTGGCCAGCACTACCACTGCTATGAGCAATACTCCAGGAACTCCTGTGACACCTGTTACTCCGGCCAA  740

Query  507  TGTGGTCCAAGGCTTACCTGATCCGTGGGTATCTCAGATAACAAATACAGATACACTTGCGGCTGTAGCTCAGA  580
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGTGGTCCAAGGCTTACCTGATCCGTGGGTATCTCAGATAACAAATACAGATACACTTGCGGCTGTAGCTCAGA  814

Query  581  TCTTGCAAAGTCCTCAAGGCCAGCAGCTTCAACAATTAATACAAACCTTACAGATACAACAACAGAAGCCCCAG  654
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCTTGCAAAGTCCTCAAGGCCAGCAGCTTCAACAATTAATACAAACCTTACAGATACAACAACAGAAGCCCCAG  888

Query  655  CCTTCCATTCTGCAGGCCCTAGATGCTGGTCTTGTTGTTCAGTTGCAAGCTCTTACGGCACAACTTACAGCTGC  728
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCTTCCATTCTGCAGGCCCTAGATGCTGGTCTTGTTGTTCAGTTGCAAGCTCTTACGGCACAACTTACAGCTGC  962

Query  729  AGCTGCAGCTGCCAACACTCTTACTCCCTTAGAACAGGGAGTCTCCTTTAACAAGAAGTTGATGGATAGGTTTG  802
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGCTGCAGCTGCCAACACTCTTACTCCCTTAGAACAGGGAGTCTCCTTTAACAAGAAGTTGATGGATAGGTTTG  1036

Query  803  ATTTTGGGGAAGACTCTGAGCATAGTGAAGAACCCAAAAAGGAAATTCCAGCTTCACAACTTTCTCACGTTTCA  876
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATTTTGGGGAAGACTCTGAGCATAGTGAAGAACCCAAAAAGGAAATTCCAGCTTCACAACTTTCTCACGTTTCA  1110

Query  877  GAATCTGTGAACATTTCCATTTTTCATCAGATAGCAGAACAACTACAACAGCAAAACCTAGAACATCTCAGACA  950
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAATCTGTGAACAATTCCATTTTTCATCAGATAGCAGAACAACTACAACAGCAAAACCTAGAACATCTCAGACA  1184

Query  951  GCAGCTCTTGGAGCAGCAACAGCCTCAAAAGGCCACTCCTCAGGATAGTCAGGAAGGAACCTTTGGGTCAGAGC  1024
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCAGCTCTTGGAGCAGCAACAGCCTCAAAAGGCCACTCCTCAGGATAGTCAGGAAGGAACCTTTGGGTCAGAGC  1258

Query 1025  ATTCAGCGTCACCATCACAAGGGAGTAGTCAGCAGCATTTTCTTGAACCTGAAGTCAATTTGGATGATTCCATA  1098
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATTCAGCGTCACCATCACAAGGGAGTAGTCAGCAGCATTTTCTTGAACCTGAAGTCAATTTGGATGATTCCATA  1332

Query 1099  GATATTCAGCAACAGGATATGGATATAGATGAAGGGCAAGATGGAGTGGAAGAGGAGGTCTTTGAACAAGAAGC  1172
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GATATTCAGCAACAGGATATGGATATAGATGAAGGGCAAGATGGAGTGGAAGAGGAGGTCTTTGAACAAGAAGC  1406

Query 1173  TAAGAAAGTGGCGGTTCGCTCAAGATCAAGAACACATTCACGATCTCGTTCAAGATCACCAAGAAAACGAAGGT  1246
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TAAGAAAGTGGCGGTTCGCTCAAGATCAAGAACACATTCACGATCTCGTTCAAGATCACCAAGAAAACGAAGGT  1480

Query 1247  CTAGGTCACGGTCTGGCTCTAGAAAGCGTAAACACAGAAAGCGATCACGCTCCCGCTCAAGAGAAAGAAAGAGG  1320
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CTAGGTCACGGTCTGGCTCTAGAAAGCGTAAACACAGAAAGCGATCACGCTCCCGCTCAAGAGAAAGAAAGAGG  1554

Query 1321  AAATCATCACGGTCGTATTCAAGTGAAAGGAGAGCCAGAGAAAGGGAGAAAGAACGACAGAAAAAGGGATTACC  1394
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AAATCATCACGGTCGTATTCAAGTGAAAGGAGAGCCAGAGAAAGGGAGAAAGAACGACAGAAAAAGGGATTACC  1628

Query 1395  TCCAATTAGATCTAAAACACTAAGTGTATGTAGTACTACTCTCTGGGTTGGGCAAGTGGACAAGAAGGCAACAC  1468
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TCCAATTAGATCTAAAACACTAAGTGTATGTAGTACTACTCTCTGGGTTGGGCAAGTGGACAAGAAGGCAACAC  1702

Query 1469  AGCAAGACTTAACCAACCTGTTTGAAGAGTTTGGACAGATTGAATCCATTAATATGATTCCTCCCCGGGGCTGT  1542
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AGCAAGACTTAACCAACCTGTTTGAAGAGTTTGGACAGATTGAATCCATTAATATGATTCCTCCCCGGGGCTGT  1776

Query 1543  GCTTATGTCTGCATGGTTCATCGACAAGATGCATTTCGAGCTCTTCAGAAACTCAGTTCTGGATCATATAAAAT  1616
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GCTTATGTCTGCATGGTTCATCGACAAGATGCATTTCGAGCTCTTCAGAAACTCAGTTCTGGATCATATAAAAT  1850

Query 1617  TGGGTCCAAGGTCATTAAGATCGCTTGGGCTTTAAACAAAGGTGTAAAAACAGAATACAAACAATTCTGGGATG  1690
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TGGGTCCAAGGTCATTAAGATCGCTTGGGCTTTAAACAAAGGTGTAAAAACAGAATACAAACAATTCTGGGATG  1924

Query 1691  TGGATCTTGGAGTTACATATATACCATGGGAAAAAGTTAAAGTGGATGACTTGGAAGGTTTTGCAGAAGGAGGC  1764
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TGGATCTTGGAGTTACATATATACCATGGGAAAAAGTTAAAGTGGATGACTTGGAAGGTTTTGCAGAAGGAGGC  1998

Query 1765  ATGATTGATCAGGAGACTGTAAATACTGAGTGGGAAACTGTGAAAAGCTCAGAACCTGTTAAAGAGACGGTCCA  1838
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  ATGATTGATCAGGAGACTGTAAATACTGAGTGGGAAACTGTGAAAAGCTCAGAACCTGTTAAAGAGACGGTCCA  2072

Query 1839  GACAACTCAGAGCCCAACTCCAGTTGAAAAGGAGACAGTGGTCACAACCCAGGCAGAGGTTTTCCCTCCTCCTG  1912
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GACAACTCAGAGCCCAACTCCAGTTGAAAAGGAGACAGTGGTCACAACCCAGGCAGAGGTTTTCCCTCCTCCTG  2146

Query 1913  TTGCTATGTTGCAGATTCCAGTGGCGCCAGCCGTGCCTACAGTTAGTTTAGTCCCACCAGCATTTCCTGTGTCG  1986
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TTGCTATGTTGCAGATTCCAGTGGCGCCAGCCGTGCCTACAGTTAGTTTAGTCCCACCAGCATTTCCTGTGTCG  2220

Query 1987  ATGCCGGTTCCTCCTCCTGGATTCAGTCCAATCCCTCCACCTCCTTTTTTAAGAGCAAGTTTTAACCCTTCACA  2060
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  ATGCCGGTTCCTCCTCCTGGATTCAGTCCAATCCCTCCACCTCCTTTTTTAAGAGCAAGTTTTAACCCTTCACA  2294

Query 2061  ACCACCACCTGGTTTCATGCCGCCTCCAGTTCCCCCACCTGTTGTGCCACCCCCTACGATTCCACCAGTAGTAC  2134
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  ACCACCACCTGGTTTCATGCCGCCTCCAGTTCCCCCACCTGTTGTGCCACCCCCTACGATTCCACCAGTAGTAC  2368

Query 2135  CAACATCTTTAGTGCAGCCGTCATTATCCATGACACCGGAAACTGTGAAAGATGTTGGATTTGGTAGCCTTGTT  2208
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  CAACATCTTTAGTGCAGCCGTCATTATCCATGACACCGGAAACTGTGAAAGATGTTGGATTTGGTAGCCTTGTT  2442

Query 2209  ATACCAGGCGGTTCTGTTGCCAGCAATCTTGCTACTTCCGCTCTGCCAGCTGGAAATGTTTTTAATGCTCCAAC  2282
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  ATACCAGGCGGTTCTGTTGCCAGCAATCTTGCTACTTCCGCTCTGCCAGCTGGAAATGTTTTTAATGCTCCAAC  2516

Query 2283  TAAACAGGCAGAGCCTGAAGAAAAAGTACCTCATCTTATAGACCACCAGATTTCTTCTGGTGAAAACACCAGAT  2356
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  TAAACAGGCAGAGCCTGAAGAAAAAGTACCTCATCTTATAGACCACCAGATTTCTTCTGGTGAAAACACCAGAT  2590

Query 2357  CAGTGATTCCAAATGATATTTCAAGTAATGCTGCAATTTTAGGAGGACAGCCGCCAAATGTGACAAGCAATTCT  2430
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  CAGTGATTCCAAATGATATTTCAAGTAATGCTGCAATTTTAGGAGGACAGCCGCCAAATGTGACAAGCAATTCT  2664

Query 2431  GGAATTCTGGGAGTCCAAAGACCAAATGTATCAAGTAATTCTGAAATTCTTGGGGTCCGGCCATCTAATGTTTC  2504
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  GGAATTCTGGGAGTCCAAAGACCAAATGTATCAAGTAATTCTGAAATTCTTGGGGTCCGGCCATCTAATGTTTC  2738

Query 2505  CAGTAGTTCTGGGATTATTGCAGCCCAACCACCAAATATTCTAAATAACTCTGGAATATTGGGAATACAGCCAC  2578
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  CAGTAGTTCTGGGATTATTGCAGCCCAACCACCAAATATTCTAAATAACTCTGGAATATTGGGAATACAGCCAC  2812

Query 2579  CCAGTGTGTCAAATAGTTCTGGACTTTTGGGAGTGCTACCCCCAAATATACCTAACAATTCTGGACTTGTAGGA  2652
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  CCAGTGTGTCAAATAGTTCTGGACTTTTGGGAGTGCTACCCCCAAATATACCTAACAATTCTGGACTTGTAGGA  2886

Query 2653  GTACAGCCACCAAATGTTCCAAATACTCCTGGACTTCTGGGAACACAGCCACCAGCTGGACCTCAAAACTTACC  2726
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  GTACAGCCACCAAATGTTCCAAATACTCCTGGACTTCTGGGAACACAGCCACCAGCTGGACCTCAAAACTTACC  2960

Query 2727  CCCTTTAAGTATCCCTAATCAAAGGATGCCCACAATGCCAATGTTAGACATTCGTCCGGGACTAATACCACAGG  2800
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  CCCTTTAAGTATCCCTAATCAAAGGATGCCCACAATGCCAATGTTAGACATTCGTCCGGGACTAATACCACAGG  3034

Query 2801  CACCTGGGCCAAGATTCCCTTTAATACAGCCTGGAATTCCACCCCAACGGGGAATCCCACCCCCATCGGTACTT  2874
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  CACCTGGGCCAAGATTCCCTTTAATACAGCCTGGAATTCCACCCCAACGGGGAATCCCACCCCCATCGGTACTT  3108

Query 2875  GATTCAGCTCTTCATCCACCACCCCGTGGACCTTTTCCTCCAGGAGATATTTTTAGTCAACCAGAAAGACCTTT  2948
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109  GATTCAGCTCTTCATCCACCACCCCGTGGACCTTTTCCTCCAGGAGATATTTTTAGTCAACCAGAAAGACCTTT  3182

Query 2949  TTTAGCTCCTGGAAGACAAAGCGTAGACAATGTTACTAACCCAGAAAAAAGGATACCACTTGGGAATGATAACA  3022
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183  TTTAGCTCCTGGAAGACAAAGCGTAGACAATGTTACTAACCCAGAAAAAAGGATACCACTTGGGAATGATAACA  3256

Query 3023  TTCAACAGGAAGGAGATAGAGATTATCGGTTTCCTCCTATAGAAACCAGGGAAAGCATTAGTAGACCTCCCCCT  3096
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257  TTCAACAGGAAGGAGATAGAGATTACCGGTTTCCTCCTATAGAAACCAGGGAAAGCATTAGTAGACCTCCCCCT  3330

Query 3097  GTGGATGTTAGAGATGTGGTTGGGCGGCCTATAGATCCAAGAGAAGGTCCTGGACGGCCTCCACTAGATGGTAG  3170
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331  GTGGATGTTAGAGATGTGGTTGGGCGGCCTATAGATCCAAGAGAAGGTCCTGGACGGCCTCCACTAGATGGTAG  3404

Query 3171  GGATCATTTTGGAAGACCTCCTGTAGATATAAGAGAGAATCTTGTGAGGCCAGGTATAGATCATCTTGGTCGAA  3244
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405  GGATCATTTTGGAAGACCTCCTGTAGATATAAGAGAGAATCTTGTGAGGCCAGGTATAGATCATCTTGGTCGAA  3478

Query 3245  GAGACCACTTTGGCTTTAATCCAGAGAAGCCCTGGGGGCATAGAGGAGATTTTGATGAGAGAGAGCATCGGGTT  3318
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479  GAGACCACTTTGGCTTTAATCCAGAGAAGCCCTGGGGGCATAGAGGAGATTTTGATGAGAGAGAGCATCGGGTT  3552

Query 3319  CTACCGGTCTATGGTGGTCCAAAAGGCTTACATGAAGAAAGAGGTAGATTTCGGTCTGGAAACTATCGATTTGA  3392
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3553  CTACCGGTCTATGGTGGTCCAAAAGGCTTACATGAAGAAAGAGGTAGATTTCGGTCTGGAAACTATCGATTTGA  3626

Query 3393  TCCTAGAAGTGGTCCTTGGAACCGAGGATTTGGACAAGAAGTTCACAGAGATTTTGATGACCGCAGAAGACCCT  3466
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3627  TCCTAGAAGTGGTCCTTGGAACCGAGGATTTGGACAAGAAGTTCACAGAGATTTTGATGACCGCAGAAGACCCT  3700

Query 3467  GGGAGAGGCAAAGGGATAGGGATGACAGAGATTTTGATTTCTGCAGAGAAATGAATGGAAATCGTCTTGGACGA  3540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3701  GGGAGAGGCAAAGGGATAGGGATGACAGAGATTTTGATTTCTGCAGAGAAATGAATGGAAATCGTCTTGGACGA  3774

Query 3541  GACAGAATTCAAAACACTTGGGTTCCCCCTCCTCATGCTCGGGTTTTTGATTATTTTGAAGGGGCCACTTCTCA  3614
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3775  GACAGAATTCAAAACACTTGGGTTCCCCCTCCTCATGCTCGGGTTTTTGATTATTTTGAAGGGGCCACTTCTCA  3848

Query 3615  ACGAAAAGGTGATAATGTGCCTCAGGTTAATGGTGAAAATACAGAGAGACATGCTCAGCCACCACCTATACCAG  3688
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3849  ACGAAAAGGTGATAATGTGCCTCAGGTTAATGGTGAAAATACAGAGAGACATGCTCAGCCACCACCTATACCAG  3922

Query 3689  TACAGAATGATCCTGAACTTTATGAAAAACTGACATCTTCAAATGAAATAAACAAGGAGAAGAGTGACACAGTT  3762
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3923  TACAGAATGATCCTGAACTTTATGAAAAACTGACATCTTCAAATGAAATAAACAAGGAGAAGAGTGACACAGTT  3996

Query 3763  GCTGATATAGAAAGTGAACCAGTGGTAGAAAGCACAGAAACTGAGGGGACA  3813
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3997  GCTGATATAGAAAGTGAACCAGTGGTAGAAAGCACAGAAACTGAGGGGACA  4047