Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07805
- Subject:
- NM_001286189.1
- Aligned Length:
- 4011
- Identities:
- 3811
- Gaps:
- 198
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCCGCAGCCGCTGCTGCCAGCGCTTCCTCCTCTGTCTTCGCCGAGCGGGGCTGGTTCCTGCGGCCCGAGCGG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------ATGGAGGCCGTGA 13
|||||||||||||
Sbjct 75 CGGGGAGTGCAGTGGCCGCCGCCTCTTCCGCCGCCGGGCTCGGGGCCTCCGCAGCGACAACATGGAGGCCGTGA 148
Query 14 AGACCTTCAATAGCGAG--------------------------------------------------------- 30
|||||||||||||||||
Sbjct 149 AGACCTTCAATAGCGAGGATTGTGCCTCTACTCCTGCTTGTACAGACTGCTTTTCCAGCAGCATGGACACAAGA 222
Query 31 ------TTGTATTCCCTGAATGACTATAAACCACCCATTTCGAAAGCGAAAATGACCCAAATTACTAAGGCAGC 98
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AGCATATTGTATTCCCTGAATGACTATAAACCACCCATTTCGAAAGCGAAAATGACCCAAATTACTAAGGCAGC 296
Query 99 CATCAAAGCTATTAAGTTCTATAAACATGTGGTACAGAGTGTTGAGAAGTTTATTCAGAAATGTAAACCAGAAT 172
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CATCAAAGCTATTAAGTTCTATAAACATGTGGTACAGAGTGTTGAGAAGTTTATTCAGAAATGTAAACCAGAAT 370
Query 173 ACAAAGTACCTGGACTTTATGTTATTGACTCCATTGTGCGACAATCCCGACATCAGTTTGGTCAAGAAAAGGAT 246
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ACAAAGTACCTGGACTTTATGTTATTGACTCCATTGTGCGACAATCCCGACATCAGTTTGGTCAAGAAAAGGAT 444
Query 247 GTGTTTGCACCCAGATTTAGTAATAACATCATTAGCACTTTCCAGAATTTATATCGTTGCCCTGGGGATGACAA 320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GTGTTTGCACCCAGATTTAGTAATAACATCATTAGCACTTTCCAGAATTTATATCGTTGCCCTGGGGATGACAA 518
Query 321 GAGTAAAATAGTGAGAGTACTAAACTTATGGCAGAAGAATAATGTATTTAAGAGTGAGATTATTCAGCCCCTTT 394
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GAGTAAAATAGTGAGAGTACTAAACTTATGGCAGAAGAATAATGTATTTAAGAGTGAGATTATTCAGCCCCTTT 592
Query 395 TGGATATGGCAGCCGGGATTCCGCCTCCAGTTGTCACACCTGTTTTGGCCAGCACTACCACTGCTATGAGCAAT 468
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGGATATGGCAGCCGGGATTCCGCCTCCAGTTGTCACACCTGTTTTGGCCAGCACTACCACTGCTATGAGCAAT 666
Query 469 ACTCCAGGAACTCCTGTGACACCTGTTACTCCGGCCAATGTGGTCCAAGGCTTACCTGATCCGTGGGTATCTCA 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ACTCCAGGAACTCCTGTGACACCTGTTACTCCGGCCAATGTGGTCCAAGGCTTACCTGATCCGTGGGTATCTCA 740
Query 543 GATAACAAATACAGATACACTTGCGGCTGTAGCTCAGATCTTGCAAAGTCCTCAAGGCCAGCAGCTTCAACAAT 616
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GATAACAAATACAGATACACTTGCGGCTGTAGCTCAGATCTTGCAAAGTCCTCAAGGCCAGCAGCTTCAACAAT 814
Query 617 TAATACAAACCTTACAGATACAACAACAGAAGCCCCAGCCTTCCATTCTGCAGGCCCTAGATGCTGGTCTTGTT 690
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TAATACAAACCTTACAGATACAACAACAGAAGCCCCAGCCTTCCATTCTGCAGGCCCTAGATGCTGGTCTTGTT 888
Query 691 GTTCAGTTGCAAGCTCTTACGGCACAACTTACAGCTGCAGCTGCAGCTGCCAACACTCTTACTCCCTTAGAACA 764
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GTTCAGTTGCAAGCTCTTACGGCACAACTTACAGCTGCAGCTGCAGCTGCCAACACTCTTACTCCCTTAGAACA 962
Query 765 GGGAGTCTCCTTTAACAAGAAGTTGATGGATAGGTTTGATTTTGGGGAAGACTCTGAGCATAGTGAAGAACCCA 838
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GGGAGTCTCCTTTAACAAGAAGTTGATGGATAGGTTTGATTTTGGGGAAGACTCTGAGCATAGTGAAGAACCCA 1036
Query 839 AAAAGGAAATTCCAGCTTCACAACTTTCTCACGTTTCAGAATCTGTGAACATTTCCATTTTTCATCAGATAGCA 912
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AAAAGGAAATTCCAGCTTCACAACTTTCTCACGTTTCAGAATCTGTGAACAATTCCATTTTTCATCAGATAGCA 1110
Query 913 GAACAACTACAACAGCAAAACCTAGAACATCTCAGACAGCAGCTCTTGGAGCAGCAACAGCCTCAAAAGGCCAC 986
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GAACAACTACAACAGCAAAACCTAGAACATCTCAGACAGCAGCTCTTGGAGCAGCAACAGCCTCAAAAGGCCAC 1184
Query 987 TCCTCAGGATAGTCAGGAAGGAACCTTTGGGTCAGAGCATTCAGCGTCACCATCACAAGGGAGTAGTCAGCAGC 1060
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TCCTCAGGATAGTCAGGAAGGAACCTTTGGGTCAGAGCATTCAGCGTCACCATCACAAGGGAGTAGTCAGCAGC 1258
Query 1061 ATTTTCTTGAACCTGAAGTCAATTTGGATGATTCCATAGATATTCAGCAACAGGATATGGATATAGATGAAGGG 1134
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 ATTTTCTTGAACCTGAAGTCAATTTGGATGATTCCATAGATATTCAGCAACAGGATATGGATATAGATGAAGGG 1332
Query 1135 CAAGATGGAGTGGAAGAGGAGGTCTTTGAACAAGAAGCTAAGAAAGTGGCGGTTCGCTCAAGATCAAGAACACA 1208
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CAAGATGGAGTGGAAGAGGAGGTCTTTGAACAAGAAGCTAAGAAAGTGGCGGTTCGCTCAAGATCAAGAACACA 1406
Query 1209 TTCACGATCTCGTTCAAGATCACCAAGAAAACGAAGGTCTAGGTCACGGTCTGGCTCTAGAAAGCGTAAACACA 1282
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TTCACGATCTCGTTCAAGATCACCAAGAAAACGAAGGTCTAGGTCACGGTCTGGCTCTAGAAAGCGTAAACACA 1480
Query 1283 GAAAGCGATCACGCTCCCGCTCAAGAGAAAGAAAGAGGAAATCATCACGGTCGTATTCAAGTGAAAGGAGAGCC 1356
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 GAAAGCGATCACGCTCCCGCTCAAGAGAAAGAAAGAGGAAATCATCACGGTCGTATTCAAGTGAAAGGAGAGCC 1554
Query 1357 AGAGAAAGGGAGAAAGAACGACAGAAAAAGGGATTACCTCCAATTAGATCTAAAACACTAAGTGTATGTAGTAC 1430
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AGAGAAAGGGAGAAAGAACGACAGAAAAAGGGATTACCTCCAATTAGATCTAAAACACTAAGTGTATGTAGTAC 1628
Query 1431 TACTCTCTGGGTTGGGCAAGTGGACAAGAAGGCAACACAGCAAGACTTAACCAACCTGTTTGAAGAGTTTGGAC 1504
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TACTCTCTGGGTTGGGCAAGTGGACAAGAAGGCAACACAGCAAGACTTAACCAACCTGTTTGAAGAGTTTGGAC 1702
Query 1505 AGATTGAATCCATTAATATGATTCCTCCCCGGGGCTGTGCTTATGTCTGCATGGTTCATCGACAAGATGCATTT 1578
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 AGATTGAATCCATTAATATGATTCCTCCCCGGGGCTGTGCTTATGTCTGCATGGTTCATCGACAAGATGCATTT 1776
Query 1579 CGAGCTCTTCAGAAACTCAGTTCTGGATCATATAAAATTGGGTCCAAGGTCATTAAGATCGCTTGGGCTTTAAA 1652
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 CGAGCTCTTCAGAAACTCAGTTCTGGATCATATAAAATTGGGTCCAAGGTCATTAAGATCGCTTGGGCTTTAAA 1850
Query 1653 CAAAGGTGTAAAAACAGAATACAAACAATTCTGGGATGTGGATCTTGGAGTTACATATATACCATGGGAAAAAG 1726
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CAAAGGTGTAAAAACAGAATACAAACAATTCTGGGATGTGGATCTTGGAGTTACATATATACCATGGGAAAAAG 1924
Query 1727 TTAAAGTGGATGACTTGGAAGGTTTTGCAGAAGGAGGCATGATTGATCAGGAGACTGTAAATACTGAGTGGGAA 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 TTAAAGTGGATGACTTGGAAGGTTTTGCAGAAGGAGGCATGATTGATCAGGAGACTGTAAATACTGAGTGGGAA 1998
Query 1801 ACTGTGAAAAGCTCAGAACCTGTTAAAGAGACGGTCCAGACAACTCAGAGCCCAACTCCAGTTGAAAAGGAGAC 1874
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 ACTGTGAAAAGCTCAGAACCTGTTAAAGAGACGGTCCAGACAACTCAGAGCCCAACTCCAGTTGAAAAGGAGAC 2072
Query 1875 AGTGGTCACAACCCAGGCAGAGGTTTTCCCTCCTCCTGTTGCTATGTTGCAGATTCCAGTGGCGCCAGCCGTGC 1948
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 AGTGGTCACAACCCAGGCAGAGGTTTTCCCTCCTCCTGTTGCTATGTTGCAGATTCCAGTGGCGCCAGCCGTGC 2146
Query 1949 CTACAGTTAGTTTAGTCCCACCAGCATTTCCTGTGTCGATGCCGGTTCCTCCTCCTGGATTCAGTCCAATCCCT 2022
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 CTACAGTTAGTTTAGTCCCACCAGCATTTCCTGTGTCGATGCCGGTTCCTCCTCCTGGATTCAGTCCAATCCCT 2220
Query 2023 CCACCTCCTTTTTTAAGAGCAAGTTTTAACCCTTCACAACCACCACCTGGTTTCATGCCGCCTCCAGTTCCCCC 2096
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 CCACCTCCTTTTTTAAGAGCAAGTTTTAACCCTTCACAACCACCACCTGGTTTCATGCCGCCTCCAGTTCCCCC 2294
Query 2097 ACCTGTTGTGCCACCCCCTACGATTCCACCAGTAGTACCAACATCTTTAGTGCAGCCGTCATTATCCATGACAC 2170
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 ACCTGTTGTGCCACCCCCTACGATTCCACCAGTAGTACCAACATCTTTAGTGCAGCCGTCATTATCCATGACAC 2368
Query 2171 CGGAAACTGTGAAAGATGTTGGATTTGGTAGCCTTGTTATACCAGGCGGTTCTGTTGCCAGCAATCTTGCTACT 2244
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 CGGAAACTGTGAAAGATGTTGGATTTGGTAGCCTTGTTATACCAGGCGGTTCTGTTGCCAGCAATCTTGCTACT 2442
Query 2245 TCCGCTCTGCCAGCTGGAAATGTTTTTAATGCTCCAACTAAACAGGCAGAGCCTGAAGAAAAAGTACCTCATCT 2318
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 TCCGCTCTGCCAGCTGGAAATGTTTTTAATGCTCCAACTAAACAGGCAGAGCCTGAAGAAAAAGTACCTCATCT 2516
Query 2319 TATAGACCACCAGATTTCTTCTGGTGAAAACACCAGATCAGTGATTCCAAATGATATTTCAAGTAATGCTGCAA 2392
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 TATAGACCACCAGATTTCTTCTGGTGAAAACACCAGATCAGTGATTCCAAATGATATTTCAAGTAATGCTGCAA 2590
Query 2393 TTTTAGGAGGACAGCCGCCAAATGTGACAAGCAATTCTGGAATTCTGGGAGTCCAAAGACCAAATGTATCAAGT 2466
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 TTTTAGGAGGACAGCCGCCAAATGTGACAAGCAATTCTGGAATTCTGGGAGTCCAAAGACCAAATGTATCAAGT 2664
Query 2467 AATTCTGAAATTCTTGGGGTCCGGCCATCTAATGTTTCCAGTAGTTCTGGGATTATTGCAGCCCAACCACCAAA 2540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 AATTCTGAAATTCTTGGGGTCCGGCCATCTAATGTTTCCAGTAGTTCTGGGATTATTGCAGCCCAACCACCAAA 2738
Query 2541 TATTCTAAATAACTCTGGAATATTGGGAATACAGCCACCCAGTGTGTCAAATAGTTCTGGACTTTTGGGAGTGC 2614
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 TATTCTAAATAACTCTGGAATATTGGGAATACAGCCACCCAGTGTGTCAAATAGTTCTGGACTTTTGGGAGTGC 2812
Query 2615 TACCCCCAAATATACCTAACAATTCTGGACTTGTAGGAGTACAGCCACCAAATGTTCCAAATACTCCTGGACTT 2688
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 TACCCCCAAATATACCTAACAATTCTGGACTTGTAGGAGTACAGCCACCAAATGTTCCAAATACTCCTGGACTT 2886
Query 2689 CTGGGAACACAGCCACCAGCTGGACCTCAAAACTTACCCCCTTTAAGTATCCCTAATCAAAGGATGCCCACAAT 2762
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 CTGGGAACACAGCCACCAGCTGGACCTCAAAACTTACCCCCTTTAAGTATCCCTAATCAAAGGATGCCCACAAT 2960
Query 2763 GCCAATGTTAGACATTCGTCCGGGACTAATACCACAGGCACCTGGGCCAAGATTCCCTTTAATACAGCCTGGAA 2836
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 GCCAATGTTAGACATTCGTCCGGGACTAATACCACAGGCACCTGGGCCAAGATTCCCTTTAATACAGCCTGGAA 3034
Query 2837 TTCCACCCCAACGGGGAATCCCACCCCCATCGGTACTTGATTCAGCTCTTCATCCACCACCCCGTGGACCTTTT 2910
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 TTCCACCCCAACGGGGAATCCCACCCCCATCGGTACTTGATTCAGCTCTTCATCCACCACCCCGTGGACCTTTT 3108
Query 2911 CCTCCAGGAGATATTTTTAGTCAACCAGAAAGACCTTTTTTAGCTCCTGGAAGACAAAGCGTAGACAATGTTAC 2984
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 CCTCCAGGAGATATTTTTAGTCAACCAGAAAGACCTTTTTTAGCTCCTGGAAGACAAAGCGTAGACAATGTTAC 3182
Query 2985 TAACCCAGAAAAAAGGATACCACTTGGGAATGATAACATTCAACAGGAAGGAGATAGAGATTATCGGTTTCCTC 3058
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 3183 TAACCCAGAAAAAAGGATACCACTTGGGAATGATAACATTCAACAGGAAGGAGATAGAGATTACCGGTTTCCTC 3256
Query 3059 CTATAGAAACCAGGGAAAGCATTAGTAGACCTCCCCCTGTGGATGTTAGAGATGTGGTTGGGCGGCCTATAGAT 3132
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257 CTATAGAAACCAGGGAAAGCATTAGTAGACCTCCCCCTGTGGATGTTAGAGATGTGGTTGGGCGGCCTATAGAT 3330
Query 3133 CCAAGAGAAGGTCCTGGACGGCCTCCACTAGATGGTAGGGATCATTTTGGAAGACCTCCTGTAGATATAAGAGA 3206
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331 CCAAGAGAAGGTCCTGGACGGCCTCCACTAGATGGTAGGGATCATTTTGGAAGACCTCCTGTAGATATAAGAGA 3404
Query 3207 GAATCTTGTGAGGCCAGGTATAGATCATCTTGGTCGAAGAGACCACTTTGGCTTTAATCCAGAGAAGCCCTGGG 3280
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405 GAATCTTGTGAGGCCAGGTATAGATCATCTTGGTCGAAGAGACCACTTTGGCTTTAATCCAGAGAAGCCCTGGG 3478
Query 3281 GGCATAGAGGAGATTTTGATGAGAGAGAGCATCGGGTTCTACCGGTCTATGGTGGTCCAAAAGGCTTACATGAA 3354
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479 GGCATAGAGGAGATTTTGATGAGAGAGAGCATCGGGTTCTACCGGTCTATGGTGGTCCAAAAGGCTTACATGAA 3552
Query 3355 GAAAGAGGTAGATTTCGGTCTGGAAACTATCGATTTGATCCTAGAAGTGGTCCTTGGAACCGAGGATTTGGACA 3428
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3553 GAAAGAGGTAGATTTCGGTCTGGAAACTATCGATTTGATCCTAGAAGTGGTCCTTGGAACCGAGGATTTGGACA 3626
Query 3429 AGAAGTTCACAGAGATTTTGATGACCGCAGAAGACCCTGGGAGAGGCAAAGGGATAGGGATGACAGAGATTTTG 3502
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3627 AGAAGTTCACAGAGATTTTGATGACCGCAGAAGACCCTGGGAGAGGCAAAGGGATAGGGATGACAGAGATTTTG 3700
Query 3503 ATTTCTGCAGAGAAATGAATGGAAATCGTCTTGGACGAGACAGAATTCAAAACACTTGGGTTCCCCCTCCTCAT 3576
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3701 ATTTCTGCAGAGAAATGAATGGAAATCGTCTTGGACGAGACAGAATTCAAAACACTTGGGTTCCCCCTCCTCAT 3774
Query 3577 GCTCGGGTTTTTGATTATTTTGAAGGGGCCACTTCTCAACGAAAAGGTGATAATGTGCCTCAGGTTAATGGTGA 3650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3775 GCTCGGGTTTTTGATTATTTTGAAGGGGCCACTTCTCAACGAAAAGGTGATAATGTGCCTCAGGTTAATGGTGA 3848
Query 3651 AAATACAGAGAGACATGCTCAGCCACCACCTATACCAGTACAGAATGATCCTGAACTTTATGAAAAACTGACAT 3724
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3849 AAATACAGAGAGACATGCTCAGCCACCACCTATACCAGTACAGAATGATCCTGAACTTTATGAAAAACTGACAT 3922
Query 3725 CTTCAAATGAAATAAACAAGGAGAAGAGTGACACAGTTGCTGATATAGAAAGTGAACCAGTGGTAGAAAGCACA 3798
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3923 CTTCAAATGAAATAAACAAGGAGAAGAGTGACACAGTTGCTGATATAGAAAGTGAACCAGTGGTAGAAAGCACA 3996
Query 3799 GAAACTGAGGGGACA 3813
|||||||||||||||
Sbjct 3997 GAAACTGAGGGGACA 4011