Protein Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07805
- Subject:
- NM_001286194.1
- Aligned Length:
- 1316
- Identities:
- 1270
- Gaps:
- 45
Alignment
Query 1 ---------------------------------------------MEAVKTFNSELYSLNDYKPPISKAKMTQI 29
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Sbjct 1 MPQPLLPALPPLSSPSGAGSCGPSGGECSGRRLFRRRARGLRSDNMEAVKTFNSELYSLNDYKPPISKAKMTQI 74
Query 30 TKAAIKAIKFYKHVVQSVEKFIQKCKPEYKVPGLYVIDSIVRQSRHQFGQEKDVFAPRFSNNIISTFQNLYRCP 103
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Sbjct 75 TKAAIKAIKFYKHVVQSVEKFIQKCKPEYKVPGLYVIDSIVRQSRHQFGQEKDVFAPRFSNNIISTFQNLYRCP 148
Query 104 GDDKSKIVRVLNLWQKNNVFKSEIIQPLLDMAAGIPPPVVTPVLASTTTAMSNTPGTPVTPVTPANVVQGLPDP 177
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Sbjct 149 GDDKSKIVRVLNLWQKNNVFKSEIIQPLLDMAAGIPPPVVTPVLASTTTAMSNTPGTPVTPVTPANVVQGLPDP 222
Query 178 WVSQITNTDTLAAVAQILQSPQGQQLQQLIQTLQIQQQKPQPSILQALDAGLVVQLQALTAQLTAAAAAANTLT 251
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Sbjct 223 WVSQITNTDTLAAVAQILQSPQGQQLQQLIQTLQIQQQKPQPSILQALDAGLVVQLQALTAQLTAAAAAANTLT 296
Query 252 PLEQGVSFNKKLMDRFDFGEDSEHSEEPKKEIPASQLSHVSESVNISIFHQIAEQLQQQNLEHLRQQLLEQQQP 325
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Sbjct 297 PLEQGVSFNKKLMDRFDFGEDSEHSEEPKKEIPASQLSHVSESVNNSIFHQIAEQLQQQNLEHLRQQLLEQQQP 370
Query 326 QKATPQDSQEGTFGSEHSASPSQGSSQQHFLEPEVNLDDSIDIQQQDMDIDEGQDGVEEEVFEQEAKKVAVRSR 399
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Sbjct 371 QKATPQDSQEGTFGSEHSASPSQGSSQQHFLEPEVNLDDSIDIQQQDMDIDEGQDGVEEEVFEQEAKKVAVRSR 444
Query 400 SRTHSRSRSRSPRKRRSRSRSGSRKRKHRKRSRSRSRERKRKSSRSYSSERRAREREKERQKKGLPPIRSKTLS 473
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Sbjct 445 SRTHSRSRSRSPRKRRSRSRSGSRKRKHRKRSRSRSRERKRKSSRSYSSERRAREREKERQKKGLPPIRSKTLS 518
Query 474 VCSTTLWVGQVDKKATQQDLTNLFEEFGQIESINMIPPRGCAYVCMVHRQDAFRALQKLSSGSYKIGSKVIKIA 547
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Sbjct 519 VCSTTLWVGQVDKKATQQDLTNLFEEFGQIESINMIPPRGCAYVCMVHRQDAFRALQKLSSGSYKIGSKVIKIA 592
Query 548 WALNKGVKTEYKQFWDVDLGVTYIPWEKVKVDDLEGFAEGGMIDQETVNTEWETVKSSEPVKETVQTTQSPTPV 621
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Sbjct 593 WALNKGVKTEYKQFWDVDLGVTYIPWEKVKVDDLEGFAEGGMIDQETVNTEWETVKSSEPVKETVQTTQSPTPV 666
Query 622 EKETVVTTQAEVFPPPVAMLQIPVAPAVPTVSLVPPAFPVSMPVPPPGFSPIPPPPFLRASFNPSQPPPGFMPP 695
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Sbjct 667 EKETVVTTQAEVFPPPVAMLQIPVAPAVPTVSLVPPAFPVSMPVPPPGFSPIPPPPFLRASFNPSQPPPGFMPP 740
Query 696 PVPPPVVPPPTIPPVVPTSLVQPSLSMTPETVKDVGFGSLVIPGGSVASNLATSALPAGNVFNAPTKQAEPEEK 769
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Sbjct 741 PVPPPVVPPPTIPPVVPTSLVQPSLSMTPETVKDVGFGSLVIPGGSVASNLATSALPAGNVFNAPTKQAEPEEK 814
Query 770 VPHLIDHQISSGENTRSVIPNDISSNAAILGGQPPNVTSNSGILGVQRPNVSSNSEILGVRPSNVSSSSGIIAA 843
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Sbjct 815 VPHLIDHQISSGENTRSVIPNDISSNAAILGGQPPNVTSNSGILGVQRPNVSSNSEILGVRPSNVSSSSGIIAA 888
Query 844 QPPNILNNSGILGIQPPSVSNSSGLLGVLPPNIPNNSGLVGVQPPNVPNTPGLLGTQPPAGPQNLPPLSIPNQR 917
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Sbjct 889 QPPNILNNSGILGIQPPSVSNSSGLLGVLPPNIPNNSGLVGVQPPNVPNTPGLLGTQPPAGPQNLPPLSIPNQR 962
Query 918 MPTMPMLDIRPGLIPQAPGPRFPLIQPGIPPQRGIPPPSVLDSALHPPPRGPFPPGDIFSQPERPFLAPGRQSV 991
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Sbjct 963 MPTMPMLDIRPGLIPQAPGPRFPLIQPGIPPQRGIPPPSVLDSALHPPPRGPFPPGDIFSQPERPFLAPGRQSV 1036
Query 992 DNVTNPEKRIPLGNDNIQQEGDRDYRFPPIETRESISRPPPVDVRDVVGRPIDPREGPGRPPLDGRDHFGRPPV 1065
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Sbjct 1037 DNVTNPEKRIPLGNDNIQQEGDRDYRFPPIETRESISRPPPVDVRDVVGRPIDPREGPGRPPLDGRDHFGRPPV 1110
Query 1066 DIRENLVRPGIDHLGRRDHFGFNPEKPWGHRGDFDEREHRVLPVYGGPKGLHEERGRFRSGNYRFDPRSGPWNR 1139
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Sbjct 1111 DIRENLVRPGIDHLGRRDHFGFNPEKPWGHRGDFDEREHRVLPVYGGPKGLHEERGRFRSGNYRFDPRSGPWNR 1184
Query 1140 GFGQEVHRDFDDRRRPWERQRDRDDRDFDFCREMNGNRLGRDRIQNTWVPPPHARVFDYFEGATSQRKGDNVPQ 1213
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Sbjct 1185 GFGQEVHRDFDDRRRPWERQRDRDDRDFDFCREMNGNRLGRDRIQNTWVPPPHARVFDYFEGATSQRKGDNVPQ 1258
Query 1214 VNGENTERHAQPPPIPVQNDPELYEKLTSSNEINKEKSDTVADIESEPVVESTETEGT 1271
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Sbjct 1259 VNGENTERHAQPPPIPVQNDPELYEKLTSSNEINKEKSDTVADIESEPVVESTETEGT 1316