Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07808
- Subject:
- XM_017015926.1
- Aligned Length:
- 1542
- Identities:
- 1286
- Gaps:
- 249
Alignment
Query 1 ATGATGCTGTCCGAGCAAGCCCAAAAGTGGTTTCCAACCCACGTGCAGGTCACAGTGCTCCAAGCCAAAGATCT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGATGCTGTCCGAGCAAGCCCAAAAGTGGTTTCCAACCCACGTGCAGGTCACAGTGCTCCAAGCCAAAGATCT 74
Query 75 GAAGCCAAAAGGCAAAAGTGGTACCAATGACACATACACTATAATTCAGCTGGGCAAGGAAAAGTACTCCACCT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GAAGCCAAAAGGCAAAAGTGGTACCAATGACACATACACTATAATTCAGCTGGGCAAGGAAAAGTACTCCACCT 148
Query 149 CTGTAGCTGAGAAAACCCTTGAGCCAGTTTGGAAGGAGGAGGCCTCTTTCGAGCTACCTGGATTGCTAATTCAG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CTGTAGCTGAGAAAACCCTTGAGCCAGTTTGGAAGGAGGAGGCCTCTTTCGAGCTACCTGGATTGCTAATTCAG 222
Query 223 GGAAGTCCAGAGAAATACATTCTTTTCCTTATAGTTATGCACAGGTCCCTGGTGGGTCTGGATAAATTTTTAGG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GGAAGTCCAGAGAAATACATTCTTTTCCTTATAGTTATGCACAGGTCCCTGGTGGGTCTGGATAAATTTTTAGG 296
Query 297 GCAGGTGGCAATCAATCTCAATGACATCTTTGAGGACAAACAAAGAAGGAAAACAGAGTGGTTTAGATTAGAAT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GCAGGTGGCAATCAATCTCAATGACATCTTTGAGGACAAACAAAGAAGGAAAACAGAGTGGTTTAGATTAGAAT 370
Query 371 CCAAACAAGGAAAACGAATCAAAAACAGGGGTGAGATAAAGGTCAATATTCAGTTTATGAGGAACAATATGACC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CCAAACAAGGAAAACGAATCAAAAACAGGGGTGAGATAAAGGTCAATATTCAGTTTATGAGGAACAATATGACC 444
Query 445 GCAAGTATGTTTGACTTATCAATGAAGGACAAAACCAGATCTCCTTTTGCAAAGTTAAAAGATAAGATGAAGGG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GCAAGTATGTTTGACTTATCAATGAAGGACAAAACCAGATCTCCTTTTGCAAAGTTAAAAGATAAGATGAAGGG 518
Query 519 TAGAAAAAATGATGGAACATTTTCTGATACGTCTTCTGCAATCATTCCAAGTACTCACATGCCCGATGCCAATA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TAGAAAAAATGATGGAACATTTTCTGATACGTCTTCTGCAATCATTCCAAGTACTCACATGCCCGATGCCAATA 592
Query 593 GTGAATTTTCAAGTGGTGAAATACAGATGAAATCCAAACCAAAAAAGCCTTTTCTCTTGGGTCCTCAGCGACTC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GTGAATTTTCAAGTGGTGAAATACAGATGAAATCCAAACCAAAAAAGCCTTTTCTCTTGGGTCCTCAGCGACTC 666
Query 667 TCGTCAGCGCATTCAATGTCTGATTTATCTGGGTCCCATATGTCTTCTGAGAAACTGAAGGCTGGCACCATAGG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TCGTCAGCGCATTCAATGTCTGATTTATCTGGGTCCCATATGTCTTCTGAGAAACTGAAGGCTGGCACCATAGG 740
Query 741 TCAAACACATCTTCTCGGACACCAGTTAGATTCCTTTGGAACAGTTCCAGAAAGTGGAAGTCTCAAATCTCCAC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TCAAACACATCTTCTCGGACACCAGTTAGATTCCTTTGGAACAGTTCCAGAAAGTGGAAGTCTCAAATCTCCAC 814
Query 815 ACAGAAGAACATTAAGCTTTGATACTTCTAAAATGAACCAACCTGACAGCATTGTGGATGAAGGTGAATTGTGT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ACAGAAGAACATTAAGCTTTGATACTTCTAAAATGAACCAACCTGACAGCATTGTGGATGAAGGTGAATTGTGT 888
Query 889 TTCGGAAGACAAAATGACCCATTTACAAATGTGACTGCTTCATTACCCCAAAAATTTGCAACACTGCCAAGGAA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TTCGGAAGACAAAATGACCCATTTACAAATGTGACTGCTTCATTACCCCAAAAATTTGCAACACTGCCAAGGAA 962
Query 963 GAAAAATCCATTTGAAGAAAGCAGCGAAACATGGGACAGCAGCATGAATTTATTTTCAAAACCAATTGAAATAA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GAAAAATCCATTTGAAGAAAGCAGCGAAACATGGGACAGCAGCATGAATTTATTTTCAAAACCAATTGAAATAA 1036
Query 1037 GAAAAGAAAATAAAAGAGAGAAAAGGGAGAAAGTTAGCCTGTTTGAAAGAGTGACTGGAAAAAAAGATAGCAGA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GAAAAGAAAATAAAAGAGAGAAAAGGGAGAAAGTTAGCCTGTTTGAAAGAGTGACTGGAAAAAAAGATAGCAGA 1110
Query 1111 AGATCTGATAAACTTAACAATGGGGGATCTGATAGCCCTTGTGACTTGAAATCACCTAATGCATTTAGTGAAAA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AGATCTGATAAACTTAACAATGGGGGATCTGATAGCCCTTGTGACTTGAAATCACCTAATGCATTTAGTGAAAA 1184
Query 1185 TCGCCAGGACTATTTTGATTATGAGTCAACCAATCCATTTACAGCAAAATTCAGGGCTTCAAATATAATGCCAT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TCGCCAGGACTATTTTGATTATGAGTCAACCAATCCATTTACAGCAAAATTCAGGGCTTCAAATATAATGCCAT 1258
Query 1259 CTTCAAGTTTTCATATGAGTCCAACAAGCAATGAAGACCT------CAGGAAAATCCCGGACAGCAACCCCTTT 1326
||||||||| .||||| ||| ||.|| .|.|..|.||||
Sbjct 1259 CTTCAAGTT------GGAGTC---------ATG--GAGCTATATTCTATGTCATTCCC---------------- 1299
Query 1327 GATGCCACTGCAGGGTATCGTAGTCTGACCTATGAAGAGGTTCTACAGGAGCTGGTGAAACACAAAGAACTCCT 1400
Sbjct 1300 -------------------------------------------------------------------------- 1299
Query 1401 TAGGAGGAAAGACACCCACATCCGGGAACTCGAGGACTACATCGACAACCTCCTTGTAAGGGTAATGGAAGAAA 1474
Sbjct 1300 -------------------------------------------------------------------------- 1299
Query 1475 CGCCCAGTATTCTCAGAGTGCCATATGAACCATCCAGGAAAGCTGGCAAATTCTCTAACAGT 1536
Sbjct 1300 -------------------------------------------------------------- 1299