Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07810
• Subject: NM_001286639.2
• Aligned Length: 1641
• Identities: 1312
• Gaps: 327

Alignment

Query    1  ATGGAGGTCGGAGGAGACACTGCTGCCCCGGCCCCCGGGGGCGCGGAGGACTTGGAGGACACGCAGTTCCCCAG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGGTCGGAGGAGACACTGCTGCCCCGGCCCCCGGGGGCGCGGAGGACTTGGAGGACACGCAGTTCCCCAG  74

Query   75  TGAGGAAGCTAGAGAAGGTGGAGGGGTTCACGCGGTCCCGCCGGATCCCGAAGACGAGGGCCTGGAGGAAACAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct   75  TGAGGAAGCTAGAGAAGGTGGAGGGGTTCACGCGGTCCCGCCGGATCCCGAAGACGAGGGCCTGGAGGAAACA-  147

Query  149  GATCCAAGGACAAGGACCAGCCACCCAGCCCATCACCACCGCCCCAGTCAGAGGCCCTGTCAAGCACCTCTCGG  222
                                                                                      
Sbjct  148  --------------------------------------------------------------------------  147

Query  223  CTCTGGAGTCCTGCAGCCCCTGAGAATAGTCCCACATGTAGCCCTGAGAGTAGCTCTGGAGGCCAGGGCGGGGA  296
                                                                                      
Sbjct  148  --------------------------------------------------------------------------  147

Query  297  CCCCAGTGATGAGGAGTGGCGCAGCCAGCGGAAGCATGTGTTTGTGCTGAGTGAGGCTGGCAAGCCCATCTACT  370
                                                                                      
Sbjct  148  --------------------------------------------------------------------------  147

Query  371  CGCGGTATGGTAGTGTGGAGGCGCTGTCGGCTACCATGGGTGTAATGACCGCCCTGGTGTCCTTTGTGCAGAGT  444
                                                                                      
Sbjct  148  --------------------------------------------------------------------------  147

Query  445  GCGGGAGATGCCATCCGTGCCATCTACGCTGAGGACCACAAGCTGGTGTTCCTACAACAGGGCCCACTGTTGCT  518
                                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  148  ------------------------------GAGGACCACAAGCTGGTGTTCCTACAACAGGGCCCACTGTTGCT  191

Query  519  CGTGGCCATGTCACGGACTTCTCAGTCAGCAGCCCAGCTGCGGGGGGAGCTGCTAGCTGTGCACGCACAGATCG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  192  CGTGGCCATGTCACGGACTTCTCAGTCAGCAGCCCAGCTGCGGGGGGAGCTGCTAGCTGTGCACGCACAGATCG  265

Query  593  TGAGCACACTTACACGTGCAAGTGTCGCCCGCATCTTCGCACACAAGCAGAACTATGACCTCCGCCGCCTGCTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  266  TGAGCACACTTACACGTGCAAGTGTCGCCCGCATCTTCGCACACAAGCAGAACTATGACCTCCGCCGCCTGCTG  339

Query  667  GCTGGTTCAGAGCGCACACTGGACCGACTTCTGGACAGTATGGAGCAGGACCCAGGAGCCCTGCTCCTGGGTGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  340  GCTGGTTCAGAGCGCACACTGGACCGACTTCTGGACAGTATGGAGCAGGACCCAGGAGCCCTGCTCCTGGGTGC  413

Query  741  CGTGCGCTGTGTGCCCCTTGCCCGCCCGCTGCGAGACGCACTAGGTGCGCTCCTCCGACGTTGCACAGCGCCTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  414  CGTGCGCTGTGTGCCCCTTGCCCGCCCGCTGCGAGACGCACTAGGTGCGCTCCTCCGACGTTGCACAGCGCCTG  487

Query  815  GCCTGGCGCTGTCAGTGCTGGCAGTAGGCGGTCGACTTATAACAGCAGCCCAGGAGCGGAATGTGCTGGCCGAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  488  GCCTGGCGCTGTCAGTGCTGGCAGTAGGCGGTCGACTTATAACAGCAGCCCAGGAGCGAAATGTGCTGGCCGAG  561

Query  889  TGCCGGCTGGACCCAGCTGACCTGCAGTTGCTGCTCGACTGGGTGGGTGCACCAGCCTTTGCGGCGGGTGAGGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  562  TGCCGGCTGGACCCAGCTGACCTGCAGTTGCTGCTCGACTGGGTGGGTGCACCAGCCTTTGCGGCGGGTGAGGC  635

Query  963  TTGGGCACCTGTGTGCCTGCCCCGCTTCAACCCTGATGGTTTTTTCTACGCCTACGTGGCCCGCCTGGATGCTA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  636  TTGGGCACCTGTGTGCCTGCCCCGCTTCAACCCTGATGGTTTTTTCTACGCCTACGTGGCCCGCCTGGATGCTA  709

Query 1037  TGCCTGTCTGCCTGCTGCTGCTTGGCACCCAACGTGAAGCCTTCCATGCCATGGCCGCCTGCCGGCGCCTGGTT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  710  TGCCTGTCTGCCTGCTGCTGCTTGGCACCCAACGTGAAGCCTTCCATGCCATGGCCGCCTGCCGGCGCCTGGTT  783

Query 1111  GAAGATGGGATGCATGCCCTTGGTGCCATGCGTGCCCTTGGGGAGGCTGCCAGCTTCTCTAATGCCTCATCAGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  784  GAAGATGGGATGCATGCCCTTGGTGCCATGCGTGCCCTTGGGGAGGCTGCCAGCTTCTCTAATGCCTCATCAGC  857

Query 1185  CAGTGCTCCTGCCTACAGCGTGCAGGCTGTCGGGGCGCCGGGCCTCCGGCACTTCCTGTATAAGCCGCTGGACA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  858  CAGTGCTCCTGCCTACAGCGTGCAGGCTGTCGGGGCGCCGGGCCTCCGGCACTTCCTGTATAAGCCGCTGGACA  931

Query 1259  TCCCTGACCACCACCACCAACTGCCCCAGTTTACCAGCCCTGAGCTAGAGGCCCCCTACAGCAGAGAGGAGGAG  1332
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  932  TCCCTGACCACCACCGCCAACTGCCCCAGTTTACCAGCCCTGAGCTAGAGGCCCCCTACAGCAGAGAGGAGGAG  1005

Query 1333  CGGCAGCGGCTGTCGGACCTGTACCACCGCCTGCATGCTCGTCTCCACAGCACCTCCCGACCCCTGCGCCTCAT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1006  CGGCAGCGGCTGTCGGACCTGTACCACCGCCTGCATGCTCGTCTCCACAGCACCTCCCGACCCCTGCGCCTCAT  1079

Query 1407  TTACCACGTGGCTGAGAAGGAGACACTACTGGCCTGGGTGACCTCCAAATTCGAGCTCTATACCTGCCTCAGCC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080  TTACCACGTGGCTGAGAAGGAGACACTACTGGCCTGGGTGACCTCCAAATTCGAGCTCTATACCTGCCTCAGCC  1153

Query 1481  CTCTGGTGACCAAGGCAGGTGCAATCTTGGTAGTGACCAAACTCCTGCGCTGGGTGAAGAAAGAGGAGGACCGG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1154  CTCTGGTGACCAAGGCAGGTGCAATCTTGGTAGTGACCAAACTCCTGCGCTGGGTGAAGAAAGAGGAGGACCGG  1227

Query 1555  CTCTTCATTCGTTACCCACCCAAGTACTCCACACCACCAGCCACCTCTACGGACCAAGCTGCCCATAATGGCTT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1228  CTCTTCATTCGTTACCCACCCAAGTACTCCACACCACCAGCCACCTCTACGGACCAAGCTGCCCATAATGGCTT  1301

Query 1629  GTTCACTGGACTC  1641
            |||||||||||||
Sbjct 1302  GTTCACTGGACTC  1314