Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07810
- Subject:
- NM_001286640.2
- Aligned Length:
- 1655
- Identities:
- 1180
- Gaps:
- 466
Alignment
Query 1 ATGGAGGTCGGAGGAGACACTGCTGCCCCGGCCCCCGGGGGCGCGGAGGACTTGGAGGACACGCAGTTCCCCAG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TGAGGAAGCTAGAGAAGGTGGAGGGGTTCACGCGGTCCCGCCGGATCCCGAAGACGAGGGCCTGGAGGAAACAG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 GATCCAAGGACAAGGACCAGCCACCCAGCCCATCACCACCGCCCCAGTCAGAGGCCCTGTCAAGCACCTCTCGG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 CTCTGGAGTCCTGCAGCCCCTGAGAATAGTCCCACATGTAGCCCTGAGAGTAGCTCTGGAGGCCAGGGCGGGGA 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 CCCCAGTGATGAGGAGTGGCGCAGCCAGCGGAAGCATGTGTTTGTGCTGAGTGAGGCTGGCAAGCCCATCTACT 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 CGCGGTATGGTAGTGTGGAGGCGCTGTCGGCTACCATGGGTGTAATGACCGCCCTGGTGTCCTTTGTGCAGAGT 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 GCGGGAGATGCCATCCGTGCCA--------------TCTACGCTGAGGACCACAAGCTGGTGTTCCTACAACAG 504
|||..||||| |||| |..|..|.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -------ATGGTATCCG-GCCAATTGAGATTCGGAGTTAAAACAGAGGACCACAAGCTGGTGTTCCTACAACAG 66
Query 505 GGCCCACTGTTGCTCGTGGCCATGTCACGGACTTCTCAGTCAGCAGCCCAGCTGCGGGGGGAGCTGCTAGCTGT 578
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 67 GGCCCACTGTTGCTCGTGGCCATGTCACGGACTTCTCAGTCAGCAGCCCAGCTGCGGGGGGAGCTGCTAGCTGT 140
Query 579 GCACGCACAGATCGTGAGCACACTTACACGTGCAAGTGTCGCCCGCATCTTCGCACACAAGCAGAACTATGACC 652
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 141 GCACGCACAGATCGTGAGCACACTTACACGTGCAAGTGTCGCCCGCATCTTCGCACACAAGCAGAACTATGACC 214
Query 653 TCCGCCGCCTGCTGGCTGGTTCAGAGCGCACACTGGACCGACTTCTGGACAGTATGGAGCAGGACCCAGGAGCC 726
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 215 TCCGCCGCCTGCTGGCTGGTTCAGAGCGCACACTGGACCGACTTCTGGACAGTATGGAGCAGGACCCAGGAGCC 288
Query 727 CTGCTCCTGGGTGCCGTGCGCTGTGTGCCCCTTGCCCGCCCGCTGCGAGACGCACTAGGTGCGCTCCTCCGACG 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 289 CTGCTCCTGGGTGCCGTGCGCTGTGTGCCCCTTGCCCGCCCGCTGCGAGACGCACTAGGTGCGCTCCTCCGACG 362
Query 801 TTGCACAGCGCCTGGCCTGGCGCTGTCAGTGCTGGCAGTAGGCGGTCGACTTATAACAGCAGCCCAGGAGCGGA 874
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 363 TTGCACAGCGCCTGGCCTGGCGCTGTCAGTGCTGGCAGTAGGCGGTCGACTTATAACAGCAGCCCAGGAGCGAA 436
Query 875 ATGTGCTGGCCGAGTGCCGGCTGGACCCAGCTGACCTGCAGTTGCTGCTCGACTGGGTGGGTGCACCAGCCTTT 948
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 437 ATGTGCTGGCCGAGTGCCGGCTGGACCCAGCTGACCTGCAGTTGCTGCTCGACTGGGTGGGTGCACCAGCCTTT 510
Query 949 GCGGCGGGTGAGGCTTGGGCACCTGTGTGCCTGCCCCGCTTCAACCCTGATGGTTTTTTCTACGCCTACGTGGC 1022
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 511 GCGGCGGGTGAGGCTTGGGCACCTGTGTGCCTGCCCCGCTTCAACCCTGATGGTTTTTTCTACGCCTACGTGGC 584
Query 1023 CCGCCTGGATGCTATGCCTGTCTGCCTGCTGCTGCTTGGCACCCAACGTGAAGCCTTCCATGCCATGGCCGCCT 1096
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 585 CCGCCTGGATGCTATGCCTGTCTGCCTGCTGCTGCTTGGCACCCAACGTGAAGCCTTCCATGCCATGGCCGCCT 658
Query 1097 GCCGGCGCCTGGTTGAAGATGGGATGCATGCCCTTGGTGCCATGCGTGCCCTTGGGGAGGCTGCCAGCTTCTCT 1170
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 659 GCCGGCGCCTGGTTGAAGATGGGATGCATGCCCTTGGTGCCATGCGTGCCCTTGGGGAGGCTGCCAGCTTCTCT 732
Query 1171 AATGCCTCATCAGCCAGTGCTCCTGCCTACAGCGTGCAGGCTGTCGGGGCGCCGGGCCTCCGGCACTTCCTGTA 1244
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 733 AATGCCTCATCAGCCAGTGCTCCTGCCTACAGCGTGCAGGCTGTCGGGGCGCCGGGCCTCCGGCACTTCCTGTA 806
Query 1245 TAAGCCGCTGGACATCCCTGACCACCACCACCAACTGCCCCAGTTTACCAGCCCTGAGCTAGAGGCCCCCTACA 1318
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 807 TAAGCCGCTGGACATCCCTGACCACCACCGCCAACTGCCCCAGTTTACCAGCCCTGAGCTAGAGGCCCCCTACA 880
Query 1319 GCAGAGAGGAGGAGCGGCAGCGGCTGTCGGACCTGTACCACCGCCTGCATGCTCGTCTCCACAGCACCTCCCGA 1392
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 881 GCAGAGAGGAGGAGCGGCAGCGGCTGTCGGACCTGTACCACCGCCTGCATGCTCGTCTCCACAGCACCTCCCGA 954
Query 1393 CCCCTGCGCCTCATTTACCACGTGGCTGAGAAGGAGACACTACTGGCCTGGGTGACCTCCAAATTCGAGCTCTA 1466
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 955 CCCCTGCGCCTCATTTACCACGTGGCTGAGAAGGAGACACTACTGGCCTGGGTGACCTCCAAATTCGAGCTCTA 1028
Query 1467 TACCTGCCTCAGCCCTCTGGTGACCAAGGCAGGTGCAATCTTGGTAGTGACCAAACTCCTGCGCTGGGTGAAGA 1540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1029 TACCTGCCTCAGCCCTCTGGTGACCAAGGCAGGTGCAATCTTGGTAGTGACCAAACTCCTGCGCTGGGTGAAGA 1102
Query 1541 AAGAGGAGGACCGGCTCTTCATTCGTTACCCACCCAAGTACTCCACACCACCAGCCACCTCTACGGACCAAGCT 1614
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1103 AAGAGGAGGACCGGCTCTTCATTCGTTACCCACCCAAGTACTCCACACCACCAGCCACCTCTACGGACCAAGCT 1176
Query 1615 GCCCATAATGGCTTGTTCACTGGACTC 1641
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1177 GCCCATAATGGCTTGTTCACTGGACTC 1203
