Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07831
- Subject:
- XM_006519627.2
- Aligned Length:
- 2307
- Identities:
- 1710
- Gaps:
- 444
Alignment
Query 1 ---ATGTTTCGCGACCAGGTCGGGGTGCTGGCGGGCTGGTTTAAGGGCTGGAACGAGTGCGAGCAGACTGTTGC 71
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGATGTTTCGCGACCAGGTCGGGGTGCTGGCGGGCTGGTTTAAGGGCTGGAACGAGTGCGAGCAGACTGTTGC 74
Query 72 GCTGCTGTCGCTGCTCAAGCGCGTGAGCCAGACCCAGGCCCGCTTCCTCCAGCTCTGCCTGGAGCACTCGCTGG 145
.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 ACTGCTGTCGCTGCTCAAGCGCGTAAGCCAGACCCAGGCCCGCTTCCTTCAGCTCTGCCTGGAGCACTCGCTGG 148
Query 146 CCGACTGCGCCGAGCTGCACGTCCTCGAACGCGAGGCCAACAGCCCCGGAATCATTAACCAATGGCAACAGGAA 219
|||||||||||||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CCGACTGCGCCGAGCTGCACGTCCTGGAAGGAGAGGCCAACAGCCCGGGAATCATTAACCAATGGCAACAGGAA 222
Query 220 TCCAAGGATAAAGTGATTTCCCTCCTGTTAACTCATCTGCCTTTGTTGAAGCCAGGAAACCTCGACGCGAAAGT 293
|||||||||||||||||||||||.|||.|||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 223 TCCAAGGATAAAGTGATTTCCCTTCTGCTAACTCACCTGCCTTTGCTGAAGCCAGGAAACCTCGACGCGAAAGC 296
Query 294 AGAATATATGAAACTGCTGCCCAAAATCCTGGCTCACTCTATTGAACACAACCAGCACATTGAGGAGAGCAGGC 367
|||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGAGTATATGAAACTGCTGCCCAAGATCCTGGCACACTCTATCGAACACAACCAGCACATTGAGGAGAGCAGGC 370
Query 368 AGCTGCTGTCCTATGCTTTGATACATCCAGCCACTTCGTTAGAAGACCGTAGTGCTTTAGCCATGTGGCTGAAT 441
||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||.||.||..|||||||||||||||||
Sbjct 371 AGCTGCTGTCCTATGCTTTGATCCACCCAGCCACTTCCTTGGAAGACCGCAGCGCACTAGCCATGTGGCTGAAT 444
Query 442 CACTTGGAGGACCGCACGTCGACCAGCTTTGGTGGCCAGAACCGAGGCCGCTCAGACTCTGTGGATTATGGACA 515
|||||||||||||||||.||.||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CACTTGGAGGACCGCACATCCACCAGCTTTGGTAGCCAGAACCGAGGCCGCTCGGACTCTGTGGATTATGGACA 518
Query 516 GACACACTACTATCACCAAAGACAGAACTCTGATGACAAGCTCAATGGGTGGCAGAACTCTCGGGATTCTGGGA 589
|||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GACGCATTACTATCACCAAAGACAGAACTCTGACGATAAGCTCAATGGCTGGCAGAACTCTCGGGATTCTGGGA 592
Query 590 TTTGCATCAATGCCTCCAACTGGCAGGACAAAAGCATGGGGTGTGAGAATGGCCATGTGCCCCTCTACTCCTCC 663
|||||||||.|||||||||||||||||||||.|||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 593 TTTGCATCAGTGCCTCCAACTGGCAGGACAAGAGCCTGGGCTGTGAGAATGGCCATGTGCCCCTCTACTCTTCC 666
Query 664 TCATCTGTCCCCACCACAATCAATACGATTGGAACC------AGCACAAGTAC--------------------- 710
||.||||||||..||||||||||.|||||||||||| |||||.|||||
Sbjct 667 TCGTCTGTCCCTGCCACAATCAACACGATTGGAACCGGCGCAAGCACGAGTACCACAGGTCCCACCTCCTCTGG 740
Query 711 -------------------------------------------------------------------------- 710
Sbjct 741 TCAATCCCTTTTTGGCAAGTCCTATTCTGTGGTTTCAAACTCACTTGAATTCCAGCTGTGCAGAGGGAGCCCCA 814
Query 711 -------------------------------------------------------------------------- 710
Sbjct 815 TCTGGAAATGTGGCCATACCTGGCCAGCACCATTTGAAGTCCCCACCAGAGTTCTCTCAGGCCAGGCACACCAC 888
Query 711 -------------------------------------------------------------------------- 710
Sbjct 889 AGCCCTTTGAAACGATCTGTGTCCCTTACCCCACCCATGAATGTGCCAAACCAGCCTCTAGGACATGGATGGAT 962
Query 711 -------------------------------------------------------------------------- 710
Sbjct 963 GTCTCATGAGGACTTACGAGCTAGAGGACCTCAGTGCCTCCCATCCGATCATGCCCCCCTGTCTCCACAAAGCA 1036
Query 711 -------------------------------------------------------------------------- 710
Sbjct 1037 GTGTAGCCTCTTCAGGAAGTGGTGGGAGTGAACACTTAGAAGATCAGACCACTGCTCGTAACACATTCCAAGAA 1110
Query 711 -----------------AAATGTTCCAGCCTGGCTGAAAAGCCTCCGCCTGCACAAATATGCCGCGCTTTTCTC 767
|.||||||||||.|||.|.||||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||
Sbjct 1111 GAAGGTAGTGGTATGAAAGATGTTCCAGCTTGGTTAAAAAGCCTCCGCCTGCACAAGTACGCTGCGCTCTTCTC 1184
Query 768 CCAGATGACCTATGAGGAGATGATGGCCCTCACCGAGTGCCAGCTGGAGGCGCAGAATGTTACCAAAGGTGCAA 841
.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 1185 GCAGATGACTTATGAGGAAATGATGGCCCTCACTGAGTGTCAACTGGAGGCTCAGAATGTTACCAAAGGCGCAA 1258
Query 842 GACACAAAATTGTCATCAGTATTCAGAAGCTCAAAGAAAGACAAAATCTCCTGAAGTCTTTGGAAAGGGACATC 915
|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GACACAAAATTGTAATCAGTATTCAGAAGCTCAAAGAAAGACAGAACCTCCTGAAGTCTTTGGAAAGGGACATC 1332
Query 916 ATCGAGGGGGGCAGCCTGCGCATCCCGCTCCAGGAACTGCACCAGATGATCCTGACTCCGATCAAGGCCTACAG 989
|||||.||||||||||||||||.|||.||||||||.||.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1333 ATCGAAGGGGGCAGCCTGCGCACCCCCCTCCAGGAGCTACATCAGATGATCCTGACACCCATCAAGGCCTACAG 1406
Query 990 CTCCCCGAGCACCACCCCCGAGGCTCGCCGCCGGGAGCCCCAGGCCCCGCGTCAGCCCTCACTGATGGGCCCCG 1063
|||.||.||.||||||||.||||..|||.|||||| |||||||||||||| |
Sbjct 1407 CTCTCCCAGTACCACCCCTGAGGTGCGCTGCCGGG------------------AGCCCTCACTGATG------G 1456
Query 1064 AGAGCCAGAGCCCCGACTGCAAAGATGGGGCCGCAGC---CACTGGCGCCACGGCCACCCCCTCGGCCGGGGCC 1134
||||||..|||||.|||||||||||..|.||.||||| |||..|||||||.||||...||||.|||||.|||
Sbjct 1457 AGAGCCCAAGCCCTGACTGCAAAGACAGCGCTGCAGCAGTCACCAGCGCCACAGCCAGTGCCTCAGCCGGTGCC 1530
Query 1135 AGCGGGGGGCTCCAGCCGCACCAGCTGAGCAGCTGCGATGGGGAGCTGGCCGTCGCCCCCCTGCCAGAGGGGGA 1208
|||||.||.||.||.||.|.||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1531 AGCGGTGGACTGCAACCACCCCAGCTGAGCAGCTGCGACGGAGAGCTGGCTGTCGCCCCTCTGCCGGAGGGGGA 1604
Query 1209 CCTCCCCGGGCAGTTCACACGCGTCATGGGGAAAGTGTGCACACAGCTCTTGGTCTCCAGACCTGATGAGGAAA 1282
||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 1605 CCTCCCGGGGCAGTTCACCCGAGTCATGGGGAAAGTGTGCACACAGCTCTTGGTCTCCAGACCCGATGAAGAAA 1678
Query 1283 ATATAAGTTCCTATTTACAGCTCATAGACAAGTGTCTAATTCATGAGGCATTTACAGAGACACAGAAAAAAAGA 1356
|||||||.||||||.||||||||.|||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1679 ATATAAGCTCCTATCTACAGCTCTTAGACAAGTGTCTTGTTCATGAGGCATTTACAGAGACACAGAAAAAAAGA 1752
Query 1357 TTGTTGTCATGGAAACAGCAGGTGCAGAAGCTCTTTCGGTCTTTCCCTCGGAAAACCCTTCTAGACATATCAGG 1430
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1753 TTGTTGTCATGGAAACAGCAGGTGCAGAAGCTCTTTCGGTCTTTCCCTCGGAAAACCCTTCTAGACATATCAGG 1826
Query 1431 ATATCGACAGCAAAGAAATCGAGGCTTTGGGCAATCCAACTCCCTCCCGACGGCTGGCTCTGTGGGCGGTGGCA 1504
|||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||..|||||||||||.|.||||
Sbjct 1827 ATATCGACAGCAAAGAAATCGTGGCTTTGGGCAGTCCAACTCCCTCCCAACAGCCAGCTCTGTGGGCAGCGGCA 1900
Query 1505 TGGGCAGACGGAACCCGCGCCAGTACCAGATCCCCTCTCGGAACGTCCCTTCCGCCCGCCTGGGCCTCTTGGGC 1578
||||||||||||||||.||.||||||||||||.|.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||.|||||
Sbjct 1901 TGGGCAGACGGAACCCACGACAGTACCAGATCGCATCTCGGAATGTCCCTTCCGCCCGCCTTGGTCTCCTGGGC 1974
Query 1579 ACCAGTGGATTCGTCAGCTCCAACCAGCGCAACACCACAGCTACCCCCACCATCATGAAACAAGGAAGACAGAA 1652
|||||||||||.||||||||||||||||||.|||||.|.||.|.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1975 ACCAGTGGATTTGTCAGCTCCAACCAGCGCCACACCGCTGCCAACCCCACCATCATGAAACAAGGAAGACAGAA 2048
Query 1653 CCTGTGGTTTGCCAACCCCGGGGGCAGCAATAGCATGCCAAGCCGCACCCACAGCTCAGTCCAGAGGACCCGCT 1726
|||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||.||||||||
Sbjct 2049 CCTCTGGTTTGCCAACCCTGGGGGCAGCAACAGCATGCCCAGCCGCACCCACAGCTCCGTCCAGAAGACCCGCT 2122
Query 1727 CGCTGCCCGTGCACACTTCCCCACAGAACATGCTGATGTTCCAGCAGCCAGAATTCCAGCTTCCCGTGACCGAA 1800
|||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct 2123 CGCTGCCCGTGCATACTTCCCCACAAAACATGCTGATGTTCCAGCAACCAGAATTTCAGCTTCCTGTGACTGAA 2196
Query 1801 CCTGACATCAACAACAGGCTGGAGTCGTTGTGCCTCAGTATGACCGAACACGCCCTGGGAGACGGGGTTGACCG 1874
||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 2197 CCTGACATCAACAATAGGCTGGAGTCCTTGTGCCTCAGTATGACGGAGCATGCCCTGGGAGACGGGGTTGACCG 2270
Query 1875 GACCTCCACCATC 1887
|||||||||.|||
Sbjct 2271 GACCTCCACAATC 2283
