Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07831
- Subject:
- XM_024449517.1
- Aligned Length:
- 1998
- Identities:
- 1886
- Gaps:
- 111
Alignment
Query 1 ---ATGTTTCGCGACCAGGTCGGGGTGCTGGCGGGCTGGTTTAAGGGCTGGAACGAGTGCGAGCAGACTGTTGC 71
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGATGTTTCGCGACCAGGTCGGGGTGCTGGCGGGCTGGTTTAAGGGCTGGAACGAGTGCGAGCAGACTGTTGC 74
Query 72 GCTGCTGTCGCTGCTCAAGCGCGTGAGCCAGACCCAGGCCCGCTTCCTCCAGCTCTGCCTGGAGCACTCGCTGG 145
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GCTGCTGTCGCTGCTCAAGCGCGTGAGCCAGACCCAGGCCCGCTTCCTCCAGCTCTGCCTGGAGCACTCGCTGG 148
Query 146 CCGACTGCGCCGAGCTGCACGTCCTCGAACGCGAGGCCAACAGCCCCGGAATCATTAACCAATGGCAACAGGAA 219
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CCGACTGCGCCGAGCTGCACGTCCTCGAACGCGAGGCCAACAGCCCCGGAATCATTAACCAATGGCAACAGGAA 222
Query 220 TCCAAGGATAAAGTGATTTCCCTCCTGTTAACTCATCTGCCTTTGTTGAAGCCAGGAAACCTCGACGCGAAAGT 293
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TCCAAGGATAAAGTGATTTCCCTCCTGTTAACTCATCTGCCTTTGCTGAAGCCAGGAAACCTCGACGCGAAAGT 296
Query 294 AGAATATATGAAACTGCTGCCCAAAATCCTGGCTCACTCTATTGAACACAACCAGCACATTGAGGAGAGCAGGC 367
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGAATATATGAAACTGCTGCCCAAAATCCTGGCTCACTCTATTGAACACAACCAGCACATTGAGGAGAGCAGGC 370
Query 368 AGCTGCTGTCCTATGCTTTGATACATCCAGCCACTTCGTTAGAAGACCGTAGTGCTTTAGCCATGTGGCTGAAT 441
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGCTGCTGTCCTATGCTTTGATACATCCAGCCACTTCGTTAGAAGACCGTAGTGCTTTAGCCATGTGGCTGAAT 444
Query 442 CACTTGGAGGACCGCACGTCGACCAGCTTTGGTGGCCAGAACCGAGGCCGCTCAGACTCTGTGGATTATGGACA 515
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CACTTGGAGGACCGCACGTCGACCAGCTTTGGTGGCCAGAACCGAGGCCGCTCAGACTCTGTGGATTATGGACA 518
Query 516 GACACACTACTATCACCAAAGACAGAACTCTGATGACAAGCTCAATGGGTGGCAGAACTCTCGGGATTCTGGGA 589
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GACACACTACTATCACCAAAGACAGAACTCTGATGACAAGCTCAATGGGTGGCAGAACTCTCGGGATTCTGGGA 592
Query 590 TTTGCATCAATGCCTCCAACTGGCAGGACAAAAGCATGGGGTGTGAGAATGGCCATGTGCCCCTCTACTCCTCC 663
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TTTGCATCAATGCCTCCAACTGGCAGGACAAAAGCATGGGGTGTGAGAATGGCCATGTGCCCCTCTACTCCTCC 666
Query 664 TCATCTGTCCCCACCACAATCAATACGATTGGAACCAGCACAAGTACAAATGTTCCAGCCTGGCTGAAAAGCCT 737
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TCATCTGTCCCCACCACAATCAATACGATTGGAACCAGCACAAGTACAAATGTTCCAGCCTGGCTGAAAAGCCT 740
Query 738 CCGCCTGCACAAATATGCCGCGCTTTTCTCCCAGATGACCTATGAGGAGATGATGGCCCTCACCGAGTGCCAGC 811
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CCGCCTGCACAAATATGCCGCGCTTTTCTCCCAGATGACCTATGAGGAGATGATGGCCCTCACCGAGTGCCAGC 814
Query 812 TGGAGGCGCAGAATGTTACCAAAGGTGCAAGACACAAAATTGTCATCAGTATTCAGAAGCTCAAAGAAAGACAA 885
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGGAGGCGCAGAATGTTACCAAAGGTGCAAGACACAAAATTGTCATCAGTATTCAGAAGCTCAAAGAAAGACAA 888
Query 886 AATCTCCTGAAGTCTTTGGAAAGGGACATCATCGAGGGGGGCAGCCTGCGCATCCCGCTCCAGGAACTGCACCA 959
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AATCTCCTGAAGTCTTTGGAAAGGGACATCATCGAGGGGGGCAGCCTGCGCATCCCGCTCCAGGAACTGCACCA 962
Query 960 GATGATCCTGACTCCGATCAAGGCCTACAGCTCCCCGAGCACCACCCCCGAGGCTCGCCGCCGGGAGCCCCAGG 1033
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GATGATCCTGACTCCGATCAAGGCCTACAGCTCCCCGAGCACCACCCCCGAGGCTCGCCGCCGGGAGCCCCAGG 1036
Query 1034 CCCCGCGTCAGCCCTCACTGATGGGCCCCGAGAGCCAGAGCCCCGACTGCAAAGATGGGGCCGCAGCCACTGGC 1107
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CCCCGCGTCAGCCCTCACTGATGGGCCCCGAGAGCCAGAGCCCCGACTGCAAAGATGGGGCCGCAGCCACTGGC 1110
Query 1108 GCCACGGCCACCCCCTCGGCCGGGGCCAGCGGGGGGCTCCAGCCGCACCAGCTGAGCAGCTGCGATGGGGAGCT 1181
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GCCACGGCCACCCCCTCGGCCGGGGCCAGCGGGGGGCTCCAGCCGCACCAGCTGAGCAGCTGCGATGGGGAGCT 1184
Query 1182 GGCCGTCGCCCCCCTGCCAGAGGGGGACCTCCCCGGGCAGTTCACACGCGTCATGGGGAAAGTGTGCACACAGC 1255
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GGCCGTCGCCCCCCTGCCAGAGGGGGACCTCCCCGGGCAGTTCACACGCGTCATGGGGAAAGTGTGCACACAGC 1258
Query 1256 TCTTGGTCTCCAGACCTGATGAGGAAAATATAAGTTCCTATTTACAGCTCATAGACAAGTGTCTAATTCATGAG 1329
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TCTTGGTCTCCAGACCTGATGAGGAAAATATAAGTTCCTATTTACAGCTCATAGACAAGTGTCTAATTCATGAG 1332
Query 1330 GCATTTACAGAGACACAGAAAAAAAGATTGTTGTCATGGAAACAGCAGGTGCAGAAGCTCTTTCGGTCTTTCCC 1403
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GCATTTACAGAGACACAGAAAAAAAGATTGTTGTCATGGAAACAGCAGGTGCAGAAGCTCTTTCGGTCTTTCCC 1406
Query 1404 TCGGAAAACCCTTCTAGACATATCAGGATATCGACAGCAAAGAAATCGAGGCTTTGGGCAATCCAACTCCCTCC 1477
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TCGGAAAACCCTTCTAGACATATCAGGATATCGACAGCAAAGAAATCGAGGCTTTGGGCAATCCAACTCCCTCC 1480
Query 1478 CGACGGCTGGCTCTGTGGGCGGTGGCATGGGCAGACGGAACCCGCGCCAGTACCAGATCCCCTCTCGGAACGTC 1551
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CGACGGCTGGCTCTGTGGGCGGTGGCATGGGCAGACGGAACCCGCGCCAGTACCAGATCCCCTCTCGGAACGTC 1554
Query 1552 CCTTCCGCCCGCCTGGGCCTCTTGGGCACCAGTGGATTCGTCAGCTCCAACCAGCGCAACACCACAGCTACCCC 1625
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CCTTCCGCCCGCCTGGGCCTCTTGGGCACCAGTGGATTCGTCAGCTCCAACCAGCGCAACACCACAGCTACCCC 1628
Query 1626 CACCATCATGAAACAAGGAAGACAGAACCTGTGGTTTGCCAACCCCGGGGGCAGCAATAGCATGCCAAGCCGCA 1699
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CACCATCATGAAACAAGGAAGACAGAACCTGTGGTTTGCCAACCCCGGGGGCAGCAATAGCATGCCAAGCCGCA 1702
Query 1700 CCCACAGCTCAGTCCAGAGGACCCGCTCGCTGCCCGTGCACACTTCCCCACAGAACATGCTGATGTTCCAGCAG 1773
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CCCACAGCTCAGTCCAGAGGACCCGCTCGCTGCCCGTGCACACTTCCCCACAGAACATGCTGATGTTCCAGCAG 1776
Query 1774 CC------------------------------------------------------------------------ 1775
||
Sbjct 1777 CCAGGTTCCCAAGTTCACAGTGGACTGTGTTTAACAGACCTTAGAGGTTGGTTGAGCCTGAGTGGAGCCCCTTC 1850
Query 1776 ------------------------------------AGAATTCCAGCTTCCCGTGACCGAACCTGACATCAACA 1813
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CATGCCAGCGCTGACAGTCCCCAAGTCCTCCCAGGGAGAATTCCAGCTTCCCGTGACCGAACCTGACATCAACA 1924
Query 1814 ACAGGCTGGAGTCGTTGTGCCTCAGTATGACCGAACACGCCCTGGGAGACGGGGTTGACCGGACCTCCACCATC 1887
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 ACAGGCTGGAGTCGTTGTGCCTCAGTATGACCGAACACGCCCTGGGAGACGGGGTTGACCGGACCTCCACCATC 1998