Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07831
• Subject: XM_024449519.1
• Aligned Length: 1995
• Identities: 1587
• Gaps: 408

Alignment

Query    1  ATGTTTCGCGACCAGGTCGGGGTGCTGGCGGGCTGGTTTAAGGGCTGGAACGAGTGCGAGCAGACTGTTGCGCT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GCTGTCGCTGCTCAAGCGCGTGAGCCAGACCCAGGCCCGCTTCCTCCAGCTCTGCCTGGAGCACTCGCTGGCCG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ACTGCGCCGAGCTGCACGTCCTCGAACGCGAGGCCAACAGCCCCGGAATCATTAACCAATGGCAACAGGAATCC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  AAGGATAAAGTGATTTCCCTCCTGTTAACTCATCTGCCTTTGTTGAAGCCAGGAAACCTCGACGCGAAAGTAGA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  ATATATGAAACTGCTGCCCAAAATCCTGGCTCACTCTATTGAACACAACCAGCACATTGAGGAGAGCAGGCAGC  370
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ----ATGAAACTGCTGCCCAAAATCCTGGCTCACTCTATTGAACACAACCAGCACATTGAGGAGAGCAGGCAGC  70

Query  371  TGCTGTCCTATGCTTTGATACATCCAGCCACTTCGTTAGAAGACCGTAGTGCTTTAGCCATGTGGCTGAATCAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   71  TGCTGTCCTATGCTTTGATACATCCAGCCACTTCGTTAGAAGACCGTAGTGCTTTAGCCATGTGGCTGAATCAC  144

Query  445  TTGGAGGACCGCACGTCGACCAGCTTTGGTGGCCAGAACCGAGGCCGCTCAGACTCTGTGGATTATGGACAGAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  145  TTGGAGGACCGCACGTCGACCAGCTTTGGTGGCCAGAACCGAGGCCGCTCAGACTCTGTGGATTATGGACAGAC  218

Query  519  ACACTACTATCACCAAAGACAGAACTCTGATGACAAGCTCAATGGGTGGCAGAACTCTCGGGATTCTGGGATTT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  219  ACACTACTATCACCAAAGACAGAACTCTGATGACAAGCTCAATGGGTGGCAGAACTCTCGGGATTCTGGGATTT  292

Query  593  GCATCAATGCCTCCAACTGGCAGGACAAAAGCATGGGGTGTGAGAATGGCCATGTGCCCCTCTACTCCTCCTCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  293  GCATCAATGCCTCCAACTGGCAGGACAAAAGCATGGGGTGTGAGAATGGCCATGTGCCCCTCTACTCCTCCTCA  366

Query  667  TCTGTCCCCACCACAATCAATACGATTGGAACCAGCACAAGTACAAATGTTCCAGCCTGGCTGAAAAGCCTCCG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  367  TCTGTCCCCACCACAATCAATACGATTGGAACCAGCACAAGTACAAATGTTCCAGCCTGGCTGAAAAGCCTCCG  440

Query  741  CCTGCACAAATATGCCGCGCTTTTCTCCCAGATGACCTATGAGGAGATGATGGCCCTCACCGAGTGCCAGCTGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  441  CCTGCACAAATATGCCGCGCTTTTCTCCCAGATGACCTATGAGGAGATGATGGCCCTCACCGAGTGCCAGCTGG  514

Query  815  AGGCGCAGAATGTTACCAAAGGTGCAAGACACAAAATTGTCATCAGTATTCAGAAGCTCAAAGAAAGACAAAAT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  515  AGGCGCAGAATGTTACCAAAGGTGCAAGACACAAAATTGTCATCAGTATTCAGAAGCTCAAAGAAAGACAAAAT  588

Query  889  CTCCTGAAGTCTTTGGAAAGGGACATCATCGAGGGGGGCAGCCTGCGCATCCCGCTCCAGGAACTGCACCAGAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  589  CTCCTGAAGTCTTTGGAAAGGGACATCATCGAGGGGGGCAGCCTGCGCATCCCGCTCCAGGAACTGCACCAGAT  662

Query  963  GATCCTGACTCCGATCAAGGCCTACAGCTCCCCGAGCACCACCCCCGAGGCTCGCCGCCGGGAGCCCCAGGCCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  663  GATCCTGACTCCGATCAAGGCCTACAGCTCCCCGAGCACCACCCCCGAGGCTCGCCGCCGGGAGCCCCAGGCCC  736

Query 1037  CGCGTCAGCCCTCACTGATGGGCCCCGAGAGCCAGAGCCCCGACTGCAAAGATGGGGCCGCAGCCACTGGCGCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  737  CGCGTCAGCCCTCACTGATGGGCCCCGAGAGCCAGAGCCCCGACTGCAAAGATGGGGCCGCAGCCACTGGCGCC  810

Query 1111  ACGGCCACCCCCTCGGCCGGGGCCAGCGGGGGGCTCCAGCCGCACCAGCTGAGCAGCTGCGATGGGGAGCTGGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  811  ACGGCCACCCCCTCGGCCGGGGCCAGCGGGGGGCTCCAGCCGCACCAGCTGAGCAGCTGCGATGGGGAGCTGGC  884

Query 1185  CGTCGCCCCCCTGCCAGAGGGGGACCTCCCCGGGCAGTTCACACGCGTCATGGGGAAAGTGTGCACACAGCTCT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  885  CGTCGCCCCCCTGCCAGAGGGGGACCTCCCCGGGCAGTTCACACGCGTCATGGGGAAAGTGTGCACACAGCTCT  958

Query 1259  TGGTCTCCAGACCTGATGAGGAAAATATAAGTTCCTATTTACAGCTCATAGACAAGTGTCTAATTCATGAGGCA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  959  TGGTCTCCAGACCTGATGAGGAAAATATAAGTTCCTATTTACAGCTCATAGACAAGTGTCTAATTCATGAGGCA  1032

Query 1333  TTTACAGAGACACAGAAAAAAAGATTGTTGTCATGGAAACAGCAGGTGCAGAAGCTCTTTCGGTCTTTCCCTCG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1033  TTTACAGAGACACAGAAAAAAAGATTGTTGTCATGGAAACAGCAGGTGCAGAAGCTCTTTCGGTCTTTCCCTCG  1106

Query 1407  GAAAACCCTTCTAGACATATCAGGATATCGACAGCAAAGAAATCGAGGCTTTGGGCAATCCAACTCCCTCCCGA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1107  GAAAACCCTTCTAGACATATCAGGATATCGACAGCAAAGAAATCGAGGCTTTGGGCAATCCAACTCCCTCCCGA  1180

Query 1481  CGGCTGGCTCTGTGGGCGGTGGCATGGGCAGACGGAACCCGCGCCAGTACCAGATCCCCTCTCGGAACGTCCCT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1181  CGGCTGGCTCTGTGGGCGGTGGCATGGGCAGACGGAACCCGCGCCAGTACCAGATCCCCTCTCGGAACGTCCCT  1254

Query 1555  TCCGCCCGCCTGGGCCTCTTGGGCACCAGTGGATTCGTCAGCTCCAACCAGCGCAACACCACAGCTACCCCCAC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1255  TCCGCCCGCCTGGGCCTCTTGGGCACCAGTGGATTCGTCAGCTCCAACCAGCGCAACACCACAGCTACCCCCAC  1328

Query 1629  CATCATGAAACAAGGAAGACAGAACCTGTGGTTTGCCAACCCCGGGGGCAGCAATAGCATGCCAAGCCGCACCC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1329  CATCATGAAACAAGGAAGACAGAACCTGTGGTTTGCCAACCCCGGGGGCAGCAATAGCATGCCAAGCCGCACCC  1402

Query 1703  ACAGCTCAGTCCAGAGGACCCGCTCGCTGCCCGTGCACACTTCCCCACAGAACATGCTGATGTTCCAGCAGCC-  1775
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct 1403  ACAGCTCAGTCCAGAGGACCCGCTCGCTGCCCGTGCACACTTCCCCACAGAACATGCTGATGTTCCAGCAGCCA  1476

Query 1776  --------------------------------------------------------------------------  1775
                                                                                      
Sbjct 1477  GGTTCCCAAGTTCACAGTGGACTGTGTTTAACAGACCTTAGAGGTTGGTTGAGCCTGAGTGGAGCCCCTTCCAT  1550

Query 1776  ---------------------------------AGAATTCCAGCTTCCCGTGACCGAACCTGACATCAACAACA  1816
                                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1551  GCCAGCGCTGACAGTCCCCAAGTCCTCCCAGGGAGAATTCCAGCTTCCCGTGACCGAACCTGACATCAACAACA  1624

Query 1817  GGCTGGAGTCGTTGTGCCTCAGTATGACCGAACACGCCCTGGGAGACGGGGTTGACCGGACCTCCACCATC  1887
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1625  GGCTGGAGTCGTTGTGCCTCAGTATGACCGAACACGCCCTGGGAGACGGGGTTGACCGGACCTCCACCATC  1695