Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07836
• Subject: NM_015071.6
• Aligned Length: 814
• Identities: 759
• Gaps: 55

Alignment

Query   1  MGLPALEFSDCCLDSPHFRETLKSHEAELDKTNKFIKELIKDGKSLISALKNLSSAKRKFADSLNEFKFQCIGD  74
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Sbjct   1  MGLPALEFSDCCLDSPHFRETLKSHEAELDKTNKFIKELIKDGKSLISALKNLSSAKRKFADSLNEFKFQCIGD  74

Query  75  AETDDEMCIARSLQEFATVLRNLEDERIRMIENASEVLITPLEKFRKEQIGAAKEAKKKYDKETEKYCGILEKH  148
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Sbjct  75  AETDDEMCIARSLQEFATVLRNLEDERIRMIENASEVLITPLEKFRKEQIGAAKEAKKKYDKETEKYCGILEKH  148

Query 149  LNLSSKKKESQLQEADSQVDLVRQHFYEVSLEYVFKVQEVQERKMFEFVEPLLAFLQGLFTFYHHGYELAKDFG  222
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Sbjct 149  LNLSSKKKESQLQEADSQVDLVRQHFYEVSLEYVFKVQEVQERKMFEFVEPLLAFLQGLFTFYHHGYELAKDFG  222

Query 223  DFKTQLTISIQNTRNRFEGTRSEVESLMKKMKENPLEHKTISPYTMEGYLYVQEKRHFGTSWVKHYCTYQRDSK  296
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Sbjct 223  DFKTQLTISIQNTRNRFEGTRSEVESLMKKMKENPLEHKTISPYTMEGYLYVQEKRHFGTSWVKHYCTYQRDSK  296

Query 297  QITMVPFDQKSGGKGGEDESVILKSCTRRKTDSIEKRFCFDVEAVDRPGVITMQALSEEDRRLWMEAMDGREPV  370
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Sbjct 297  QITMVPFDQKSGGKGGEDESVILKSCTRRKTDSIEKRFCFDVEAVDRPGVITMQALSEEDRRLWMEAMDGREPV  370

Query 371  YNSNKDSQSEGTAQLDSIGFSIIRKCIHAVETRGINEQGLYRIVGVNSRVQKLLSVLMDPKTASETETDICAEW  444
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Sbjct 371  YNSNKDSQSEGTAQLDSIGFSIIRKCIHAVETRGINEQGLYRIVGVNSRVQKLLSVLMDPKTASETETDICAEW  444

Query 445  EIKTITSALKTYLRMLPGPLMMYQFQRSFIKAAKLENQESRVSEIHSLVHRLPEKNRQMLQLLMNHLANVANNH  518
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Sbjct 445  EIKTITSALKTYLRMLPGPLMMYQFQRSFIKAAKLENQESRVSEIHSLVHRLPEKNRQMLQLLMNHLANVANNH  518

Query 519  KQNLMTVANLGVVFGPTLLRPQEETVAAIMDIKFQNIVIEILIENHEKIFNTVPDMPLTNAQLHLSRKKSSDSK  592
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Sbjct 519  KQNLMTVANLGVVFGPTLLRPQEETVAAIMDIKFQNIVIEILIENHEKIFNTVPDMPLTNAQLHLSRKKSSDSK  592

Query 593  PPSCSERPLTLFHTVQSTEKQEQRNSIINSSLESVSSNPNSILNSSSSLQPNMNSSDPDLAVVKPTRPNSLPPN  666
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Sbjct 593  PPSCSERPLTLFHTVQSTEKQEQRNSIINSSLESVSSNPNSILNSSSSLQPNMNSSDPDLAVVKPTRPNSLPPN  666

Query 667  PSPTSPLSPSWPMFSAPSSPMPTSSTSSDSSPV-----------------------------------------  699
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Sbjct 667  PSPTSPLSPSWPMFSAPSSPMPTSSTSSDSSPVRSVAGFVWFSVAAVVLSLARSSLHAVFSLLVNFVPCHPNLH  740

Query 700  --------------STPFRKAKALYACKAEHDSELSFTAGTVFDNVHPSQEPGWLEGTLNGKTGLIPENYVEFL  759
                         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741  LLFDRPEEAVHEDSSTPFRKAKALYACKAEHDSELSFTAGTVFDNVHPSQEPGWLEGTLNGKTGLIPENYVEFL  814