Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07845
• Subject: NM_015130.3
• Aligned Length: 3798
• Identities: 3797
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGTGGGTGAACCCGGAGGAGGTGTTGCTGGCCAACGCGCTGTGGATCACCGAGAGGGCCAACCCATACTTCAT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTGGGTGAACCCGGAGGAGGTGTTGCTGGCCAACGCGCTGTGGATCACCGAGAGGGCCAACCCATACTTCAT  74

Query   75  CCTGCAGCGGAGGAAGGGCCACGCCGGCGATGGAGGCGGCGGCGGCGGACTGGCGGGCCTGCTGGTGGGTACCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTGCAGCGGAGGAAGGGCCACGCCGGCGATGGAGGCGGCGGCGGCGGACTGGCGGGCCTGCTGGTGGGTACCC  148

Query  149  TTGATGTTGTGTTGGACTCCAGCGCCCGGGTCGCTCCTTACCGAATCTTGTACCAGACTCCAGACTCCCTGGTC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTGATGTTGTGTTGGACTCCAGCGCCCGGGTCGCTCCTTACCGAATCTTGTACCAGACTCCAGACTCCCTGGTC  222

Query  223  TACTGGACCATCGCCTGTGGTGGTTCCAGGAAAGAAATCACTGAACACTGGGAATGGCTTGAGCAAAATCTCTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TACTGGACCATCGCCTGTGGTGGTTCCAGGAAAGAAATCACTGAACACTGGGAATGGCTTGAGCAAAATCTCTT  296

Query  297  GCAGACACTCTCCATCTTTGAAAATGAGAATGATATCACCACATTTGTGAGAGGAAAAATACAGGGCATCATTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCAGACACTCTCCATCTTTGAAAATGAGAATGATATCACCACATTTGTGAGAGGAAAAATACAGGGCATCATTG  370

Query  371  CAGAATACAACAAAATCAATGATGTAAAGGAAGATGATGACACGGAGAAGTTTAAAGAAGCCATTGTGAAATTT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CAGAATACAACAAAATCAATGATGTAAAGGAAGATGATGACACGGAGAAGTTTAAAGAAGCCATTGTGAAATTT  444

Query  445  CATAGGCTGTTTGGGATGCCAGAGGAAGAGAAACTCGTCAACTATTACTCTTGCAGCTATTGGAAGGGGAAGGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CATAGGCTGTTTGGGATGCCAGAGGAAGAGAAACTCGTCAACTATTACTCTTGCAGCTATTGGAAGGGGAAGGT  518

Query  519  CCCCCGTCAGGGTTGGATGTACCTCAGCATTAACCACCTTTGCTTTTATTCTTTTCTTATGGGAAGGGAAGCGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCCCCGTCAGGGTTGGATGTACCTCAGCATTAACCACCTTTGCTTTTATTCTTTTCTTATGGGAAGGGAAGCGA  592

Query  593  AACTGGTCATCCGGTGGGTAGACATCACTCAGCTTGAGAAGAATGCCACCCTGCTTCTGCCTGATGTGATCAAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AACTGGTCATCCGGTGGGTAGACATCACTCAGCTTGAGAAGAATGCCACCCTGCTTCTGCCTGATGTGATCAAA  666

Query  667  GTGAGCACACGGTCCAGTGAGCATTTCTTCTCTGTATTCCTCAACATCAACGAGACCTTCAAGTTAATGGAGCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTGAGCACACGGTCCAGTGAGCATTTCTTCTCTGTATTCCTCAACATCAACGAGACCTTCAAGTTAATGGAGCA  740

Query  741  GCTTGCCAACATAGCCATGAGGCAACTCTTAGACAATGAGGGATTTGAACAAGATCGATCCCTGCCCAAACTCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCTTGCCAACATAGCCATGAGGCAACTCTTAGACAATGAGGGATTTGAACAAGATCGATCCCTGCCCAAACTCA  814

Query  815  AAAGGAAATCTCCTAAAAAAGTGTCTGCTCTAAAACGTGATCTTGATGCCAGGGCAAAGAGTGAGAGATACCGT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAAGGAAATCTCCTAAAAAAGTGTCTGCTCTAAAACGTGATCTTGATGCCAGGGCAAAGAGTGAGAGATACCGT  888

Query  889  GCACTTTTCCGGCTGCCCAAAGATGAAAAATTAGATGGCCACACAGACTGCACTCTCTGGACTCCATTTAACAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCACTTTTCCGGCTGCCCAAAGATGAAAAATTAGATGGCCACACAGACTGCACTCTCTGGACTCCATTTAACAA  962

Query  963  AATGCACATTTTGGGGCAGATGTTTGTGTCCACAAATTACATCTGTTTTACCAGCAAGGAGGAGAACTTATGTA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AATGCACATTTTGGGGCAGATGTTTGTGTCCACAAATTACATCTGTTTTACCAGCAAGGAGGAGAACTTATGTA  1036

Query 1037  GCCTCATTATCCCGCTCCGTGAGGTGACAATTGTGGAAAAGGCAGACAGCTCCAGTGTGCTCCCCAGTCCCTTA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCCTCATTATCCCGCTCCGTGAGGTGACAATTGTGGAAAAGGCAGACAGCTCCAGTGTGCTCCCCAGTCCCTTA  1110

Query 1111  TCCATCAGCACCCGAAACAGGATGACCTTCCTATTTGCCAACTTGAAAGATAGAGACTTTCTAGTGCAGAGGAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TCCATCAGCACCCGAAACAGGATGACCTTCCTATTTGCCAACTTGAAAGATAGAGACTTTCTAGTGCAGAGGAT  1184

Query 1185  CTCAGATTTCCTGCAACAGACTACTTCCAAAATATATTCTGACAAGGAGTTTGCAGGAAGTTACAACAGTTCAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTCAGATTTCCTGCAACAGACTACTTCCAAAATATATTCTGACAAGGAGTTTGCAGGAAGTTACAACAGTTCAG  1258

Query 1259  ATGATGAGGTGTACTCTCGACCCAGCAGCCTCGTCTCCTCCAGCCCCCAGAGAAGCACGAGCTCTGATGCTGAT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATGATGAGGTGTACTCTCGACCCAGCAGCCTCGTCTCCTCCAGCCCCCAGAGAAGCACGAGCTCTGATGCTGAT  1332

Query 1333  GGAGAGCGCCAGTTTAACCTAAATGGCAACAGCGTCCCCACAGCCACACAGACCCTGATGACCATGTATCGGCG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GGAGAGCGCCAGTTTAACCTAAATGGCAACAGCGTCCCCACAGCCACACAGACCCTGATGACCATGTATCGGCG  1406

Query 1407  GCGGTCTCCCGAGGAGTTCAACCCGAAATTGGCCAAAGAGTTTCTGAAAGAGCAAGCCTGGAAGATTCACTTTG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GCGGTCTCCCGAGGAGTTCAACCCGAAATTGGCCAAAGAGTTTCTGAAAGAGCAAGCCTGGAAGATTCACTTTG  1480

Query 1481  CTGAGTATGGGCAAGGGATCTGCATGTACCGCACAGAGAAAACGCGGGAGCTGGTGTTGAAGGGCATCCCGGAG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CTGAGTATGGGCAAGGGATCTGCATGTACCGCACAGAGAAAACGCGGGAGCTGGTGTTGAAGGGCATCCCGGAG  1554

Query 1555  AGCATGCGTGGGGAGCTCTGGCTGCTGCTGTCAGGTGCCATCAATGAGAAGGCCACACATCCTGGGTACTATGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AGCATGCGTGGGGAGCTCTGGCTGCTGCTGTCAGGTGCCATCAATGAGAAGGCCACACATCCTGGGTACTATGA  1628

Query 1629  AGACCTAGTGGAGAAGTCCATGGGGAAGTATAATCTCGCCACGGAGGAGATTGAGAGGGATTTACACCGCTCCC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AGACCTAGTGGAGAAGTCCATGGGGAAGTATAATCTCGCCACGGAGGAGATTGAGAGGGATTTACACCGCTCCC  1702

Query 1703  TTCCAGAACACCCAGCTTTTCAGAATGAAATGGGCATTGCTGCACTAAGGAGAGTCTTAACAGCTTATGCTTTT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TTCCAGAACACCCAGCTTTTCAGAATGAAATGGGCATTGCTGCACTAAGGAGAGTCTTAACAGCTTATGCTTTT  1776

Query 1777  CGAAATCCCAACATAGGGTATTGCCAGGCCATGAATATTGTCACTTCAGTGCTGCTGCTTTATGCCAAAGAGGA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CGAAATCCCAACATAGGGTATTGCCAGGCCATGAATATTGTCACTTCAGTGCTGCTGCTTTATGCCAAAGAGGA  1850

Query 1851  GGAAGCTTTCTGGCTGCTTGTGGCTTTGTGTGAGCGCATGCTCCCAGATTACTACAACACCAGAGTTGTGGGTG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GGAAGCTTTCTGGCTGCTTGTGGCTTTGTGTGAGCGCATGCTCCCAGATTACTACAACACCAGAGTTGTGGGTG  1924

Query 1925  CACTGGTGGACCAAGGTGTCTTTGAGGAGCTAGCACGAGACTACGTCCCACAGCTGTACGACTGCATGCAAGAC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CACTGGTGGACCAAGGTGTCTTTGAGGAGCTAGCACGAGACTACGTCCCACAGCTGTACGACTGCATGCAAGAC  1998

Query 1999  CTGGGCGTGATTTCCACCATCTCCCTGTCTTGGTTCCTCACACTATTTCTCAGTGTGATGCCTTTTGAGAGTGC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CTGGGCGTGATTTCCACCATCTCCCTGTCTTGGTTCCTCACACTATTTCTCAGTGTGATGCCTTTTGAGAGTGC  2072

Query 2073  AGTTGTGGTTGTTGACTGTTTCTTCTATGAAGGAATTAAAGTGATATTCCAGTTGGCCCTAGCTGTGCTGGATG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  AGTTGTGGTTGTTGACTGTTTCTTCTATGAAGGAATTAAAGTGATATTCCAGTTGGCCCTAGCTGTGCTGGATG  2146

Query 2147  CAAATGTGGACAAACTGTTGAACTGCAAGGATGATGGGGAGGCCATGACCGTTTTGGGAAGGTATTTAGACAGT  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CAAATGTGGACAAACTGTTGAACTGCAAGGATGATGGGGAGGCCATGACCGTTTTGGGAAGGTATTTAGACAGT  2220

Query 2221  GTGACCAATAAAGACAGCACACTGCCTCCCATTCCTCACCTCCACTCCTTGCTCAGCGATGATGTGGAACCTTA  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  GTGACCAATAAAGACAGCACACTGCCTCCCATTCCTCACCTCCACTCCTTGCTCAGCGATGATGTGGAACCTTA  2294

Query 2295  CCCTGAGGTAGACATCTTTAGACTCATCAGAACTTCCTACGAGAAATTCGGAACTATCCGGGCAGATTTGATTG  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  CCCTGAGGTAGACATCTTTAGACTCATCAGAACTTCCTACGAGAAATTCGGAACTATCCGGGCAGATTTGATTG  2368

Query 2369  AACAGATGAGATTCAAACAGAGACTGAAAGTGATCCAGACGCTGGAGGATACTACGAAACGCAACGTGGTACGA  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  AACAGATGAGATTCAAACAGAGACTGAAAGTGATCCAGACGCTGGAGGATACTACGAAACGCAACGTGGTACGA  2442

Query 2443  ACCATTGTGACAGAAACTTCCTTTACCATTGATGAGCTGGAAGAACTTTATGCTCTTTTCAAGGCAGAACATCT  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  ACCATTGTGACAGAAACTTCCTTTACCATTGATGAGCTGGAAGAACTTTATGCTCTTTTCAAGGCAGAACATCT  2516

Query 2517  CACCAGCTGCTACTGGGGCGGGAGCAGCAACGCGCTGGACCGGCATGACCCCAGCCTGCCCTACCTGGAACAGT  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  CACCAGCTGCTACTGGGGCGGGAGCAGCAACGCGCTGGACCGGCATGACCCCAGCCTGCCCTACCTGGAACAGT  2590

Query 2591  ATCGCATTGACTTCGAGCAGTTCAAGGGAATGTTTGCTCTTCTCTTTCCTTGGGCATGTGGAACTCACTCTGAC  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  ATCGCATTGACTTCGAGCAGTTCAAGGGAATGTTTGCTCTTCTCTTTCCTTGGGCATGTGGAACTCACTCTGAC  2664

Query 2665  GTTCTGGCCTCCCGCTTGTTCCAGTTATTAGATGAAAATGGAGACTCTTTGATTAACTTCCGGGAGTTTGTCTC  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  GTTCTGGCCTCCCGCTTGTTCCAGTTATTAGATGAAAATGGAGACTCTTTGATTAACTTCCGGGAGTTTGTCTC  2738

Query 2739  TGGGCTAAGTGCTGCATGCCATGGGGACCTCACAGAGAAGCTCAAACTCCTGTACAAAATGCACGTCTTGCCTG  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  TGGGCTAAGTGCTGCATGCCATGGGGACCTCACAGAGAAGCTCAAACTCCTGTACAAAATGCACGTCTTGCCTG  2812

Query 2813  AGCCATCCTCTGATCAAGATGAACCAGATTCTGCTTTTGAAGCAACTCAGTACTTCTTTGAAGATATTACCCCA  2886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  AGCCATCCTCTGATCAAGATGAACCAGATTCTGCTTTTGAAGCAACTCAGTACTTCTTTGAAGATATTACCCCA  2886

Query 2887  GAATGTACACATGTTGTTGGATTGGATAGCAGAAGCAAACAGGGTGCAGATGATGGCTTTGTTACGGTGAGCCT  2960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  GAATGTACACATGTTGTTGGATTGGATAGCAGAAGCAAACAGGGTGCAGATGATGGCTTTGTTACGGTGAGCCT  2960

Query 2961  AAAGCCAGACAAAGGGAAGAGAGCAAATTCCCAAGAAAATCGTAATTATTTGAGACTGTGGACTCCAGAAAATA  3034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  AAAGCCAGACAAAGGGAAGAGAGCAAATTCCCAAGAAAATCGTAATTATTTGAGACTGTGGACTCCAGAAAATA  3034

Query 3035  AATCTAAGTCAAAGAATGCAAAGGATTTACCCAAATTAAATCAGGGGCAGTTCATTGAACTGTGTAAGACAATG  3108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  AATCTAAGTCAAAGAATGCAAAGGATTTACCCAAATTAAATCAGGGGCAGTTCATTGAACTGTGTAAGACAATG  3108

Query 3109  TATAACATGTTCAGCGAAGACCCCAATGAGCAGGAGCTGTACCATGCCACGGCAGCAGTGACCAGCCTCCTGCT  3182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109  TATAACATGTTCAGCGAAGACCCCAATGAGCAGGAGCTGTACCACGCCACGGCAGCAGTGACCAGCCTCCTGCT  3182

Query 3183  GGAGATTGGGGAGGTCGGCAAGTTGTTCGTGGCCCAGCCTGCAAAGGAGGGCGGGAGCGGAGGCAGTGGGCCGT  3256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183  GGAGATTGGGGAGGTCGGCAAGTTGTTCGTGGCCCAGCCTGCAAAGGAGGGCGGGAGCGGAGGCAGTGGGCCGT  3256

Query 3257  CCTGCCACCAGGGCATCCCAGGCGTGCTCTTCCCCAAGAAAGGGCCAGGCCAGCCTTACGTGGTGGAGTCTGTT  3330
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257  CCTGCCACCAGGGCATCCCAGGCGTGCTCTTCCCCAAGAAAGGGCCAGGCCAGCCTTACGTGGTGGAGTCTGTT  3330

Query 3331  GAGCCCCTGCCGGCCAGCCTGGCCCCCGACAGCGAGGAACACTCCCTTGGAGGACAAATGGAGGACATCAAGCT  3404
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331  GAGCCCCTGCCGGCCAGCCTGGCCCCCGACAGCGAGGAACACTCCCTTGGAGGACAAATGGAGGACATCAAGCT  3404

Query 3405  GGAGGACTCCTCGCCCCGGGACAACGGGGCCTGCTCCTCCATGCTGATCTCTGACGACGACACCAAGGACGACA  3478
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405  GGAGGACTCCTCGCCCCGGGACAACGGGGCCTGCTCCTCCATGCTGATCTCTGACGACGACACCAAGGACGACA  3478

Query 3479  GCTCCATGTCCTCATACTCGGTGCTGAGTGCCGGCTCCCACGAGGAGGACAAGCTGCACTGCGAGGACATCGGA  3552
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479  GCTCCATGTCCTCATACTCGGTGCTGAGTGCCGGCTCCCACGAGGAGGACAAGCTGCACTGCGAGGACATCGGA  3552

Query 3553  GAGGACACGGTCCTGGTGCGGAGCGGCCAGGGCACGGCGGCACTGCCCCGGAGCACCAGCCTGGACCGGGACTG  3626
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3553  GAGGACACGGTCCTGGTGCGGAGCGGCCAGGGCACGGCGGCACTGCCCCGGAGCACCAGCCTGGACCGGGACTG  3626

Query 3627  GGCCATCACCTTCGAGCAGTTCCTGGCCTCCCTCTTAACTGAGCCTGCCCTGGTCAAGTACTTTGACAAGCCCG  3700
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3627  GGCCATCACCTTCGAGCAGTTCCTGGCCTCCCTCTTAACTGAGCCTGCCCTGGTCAAGTACTTTGACAAGCCCG  3700

Query 3701  TGTGCATGATGGCCAGGATTACCAGTGCAAAAAACATCCGGATGATGGGCAAGCCCCTCACCTCGGCCAGTGAC  3774
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3701  TGTGCATGATGGCCAGGATTACCAGTGCAAAAAACATCCGGATGATGGGCAAGCCCCTCACCTCGGCCAGTGAC  3774

Query 3775  TATGAAATCTCGGCCATGTCCGGC  3798
            ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3775  TATGAAATCTCGGCCATGTCCGGC  3798