Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07882
• Subject: NM_001277293.1
• Aligned Length: 1140
• Identities: 995
• Gaps: 91

Alignment

Query    1  ------MIAVSFKCRCQILRRLTKDESPYTKSASQTKPPDGALAVRRQSIPEEFKGSTVVELMKKEGTTLGLTV  68
                  .|..     |........||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  MPGWKKNIPI-----CLQAEEQERDESPYTKSASQTKPPDGALAVRRQSIPEEFKGSTVVELMKKEGTTLGLTV  69

Query   69  SGGIDKDGKPRVSNLRQGGIAARSDQLDVGDYIKAVNGINLAKFRHDEIISLLKNVGERVVLEVEYELPPVSVQ  142
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   70  SGGIDKDGKPRVSNLRQGGIAARSDQLDVGDYIKAVNGINLAKFRHDEIISLLKNVGERVVLEVEYELPPVSVQ  143

Query  143  GSSVIFRTVEVTLHKEGNTFGFVIRGGAHDDRNKSRPVVITCVRPGGPADREGTIKPGDRLLSVDGIRLLGTTH  216
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  144  GSSVMFRTVEVTLHKEGNTFGFVIRGGAHDDRNKSRPVVITCVRPGGPADREGTIKPGDRLLSVDGIRLLGTTH  217

Query  217  AEAMSILKQCGQEAALLIEYDVSVMDSVATASGPLLVEVAKTPGASLGVALTTSMCCNKQVIVIDKIKSASIAD  290
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  218  AEAMSILKQCGQEATLLIEYDVSVMDSVATASGPLLVEVAKTPGASLGVALTTSVCCNKQVIVIDKIKSASIAD  291

Query  291  RCGALHVGDHILSIDGTSMEYCTLAEATQFLANTTDQVKLEILPHHQTRLALKGPDHA----------------  348
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.                
Sbjct  292  RCGALHVGDHILSIDGTSMEYCTLAEATQFLANTTDQVKLEILPHHQTRLALKGPDHVKIQRSDRQHPWDAWAS  365

Query  349  ------------------------------------ALVSSSFSPTSMSAYSLSSLNMGTLPRSLYSTSPRGTM  386
                                                |.|.|| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  366  NQCGVHTNHHHNTYHPDHCRVPALTFPKALPPNSPPAMVPSS-SPTSMSAYSLSSLNMGTLPRSLYSTSPRGTM  438

Query  387  MRRRLKKKDFKSSLSLASSTVGLAGQVVHTETTEVVLTADPVTGFGIQLQGSVFATETLSSPPLISYIEADSPA  460
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  439  MRRRLKKKDFKSSLSLASSTVGLAGQVVHTETTEVVLTADPVTGFGIQLQGSVFATETLSSPPLISYIEADSPA  512

Query  461  ERCGVLQIGDRVMAINGIPTEDSTFEEASQLLRDSSITSKVTLEIEFDVAESVIPSSGTFHVKLPKKHNVELGI  534
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  513  ERCGVLQIGDRVMAINGIPTEDSTFEEANQLLRDSSITSKVTLEIEFDVAESVIPSSGTFHVKLPKKHSVELGI  586

Query  535  TISSPSSRKPGDPLVISDIKKGSVAHRTGTLELGDKLLAIDNIRLDNCSMEDAVQILQQCEDLVKLKIRKDEDN  608
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  587  TISSPSSRKPGDPLVISDIKKGSVAHRTGTLELGDKLLAIDNIRLDNCSMEDAVQILQQCEDLVKLKIRKDEDN  660

Query  609  SDEQESSGAIIYTVELKRYGGPLGITISGTEEPFDPIIISSLTKGGLAERTGAIHIGDRILAINSSSLKGKPLS  682
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  SDEQESSGAIIYTVELKRYGGPLGITISGTEEPFDPIIISSLTKGGLAERTGAIHIGDRILAINSSSLKGKPLS  734

Query  683  EAIHLLQMAGETVTLKIKKQTDAQSASSPKKFPISSHLSDLGDVEEDSSPAQKPGKLSDMYPSTVPSVDSAVDS  756
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||..|..||||.|||.||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct  735  EAIHLLQMAGETVTLKIKKQTDAQSASSPKKFPIPGHSGDLGDGEEDPSPIQKPGKLSDAYPSTVPSVDSAVDS  808

Query  757  WDGSAIDTSYGTEGTSFQASGYNFNTYDWRSPKQRGSLSPVTKPRSQTYPDVGLSYEDWDRSTASGFAGAADSA  830
            ||||.||.|||..|..||.||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||.|||||||||||.||.|||
Sbjct  809  WDGSGIDASYGSQGSTFQTSGYNYNTYDWRSPKQRTSLSPVPKPRSQTYPDVGLSNEDWDRSTASGFVGASDSA  882

Query  831  ETEQEENFWSQALEDLETCGQSGILRELEEKADRRVSLRNMTLLATIMSGSTMSLNHEAPTPRSQLGRQASFQE  904
            ..|||||||||||||||||||||||||||               ||||||||||||||||..||||||||||||
Sbjct  883  DAEQEENFWSQALEDLETCGQSGILRELE---------------ATIMSGSTMSLNHEAPMARSQLGRQASFQE  941

Query  905  RSSSRPHYSQTTRSNTLPSDVGRKSVTLRKMKQEIKEIMSPTPVELHKVTLYKDSDMEDFGFSVADGLLEKGVY  978
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  942  RSSSRPHYSQTTRSNTLPSDVGRKSVTLRKMKQEIKEIMSPTPVELHKVTLYKDSGMEDFGFSVADGLLEKGVY  1015

Query  979  VKNIRPAGPGDLGGLKPYDRLLQVNHVRTRDFDCCLVVPLIAESGNKLDLVISRNPLASQKSIDQQSLPGDWSE  1052
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|..||.||||
Sbjct 1016  VKNIRPAGPGDVGGLKPYDRLLQVNHVRTRDFDCCLVVPLIAESGNKLDLVISRNPLASQKSIEQPALPSDWSE  1089

Query 1053  QNSAFFQQPSHGGNLETREPTNTL------  1076
            ||||||||||||      .|..|.      
Sbjct 1090  QNSAFFQQPSHG------IPGDTVYFWQSL  1113