Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07902
• Subject: NM_176787.5
• Aligned Length: 2793
• Identities: 2791
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGCTGCTGTTCTTTACTTTGGGATTGCTTATACATTTTGTGTTCTTCGCCTCCATCTTTGACATTTATTTTAC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCTGCTGTTCTTTACTTTGGGATTGCTTATACATTTTGTGTTCTTCGCCTCCATCTTTGACATTTATTTTAC  74

Query   75  ATCTCCTTTGGTTCATGGAATGACTCCTCAGTTTACACCATTGCCTCCTCCAGCGAGAAGATTAGTGTTGTTTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ATCTCCTTTGGTTCATGGAATGACTCCTCAGTTTACACCATTGCCTCCTCCAGCGAGAAGATTAGTGTTGTTTG  148

Query  149  TTGCTGATGGCCTTCGAGCAGATGCACTTTACGAATTAGATGAAAATGGAAACTCTAGAGCACCGTTTATTAGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTGCTGATGGCCTTCGAGCAGATGCACTTTACGAATTAGATGAAAATGGAAACTCTAGAGCACCGTTTATTAGG  222

Query  223  AATATCATAATGCATGAAGGCAGCTGGGGCATATCTCATACACGTGTGCCAACAGAATCTCGGCCAGGTCATGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AATATCATAATGCATGAAGGCAGCTGGGGCATATCTCATACACGTGTGCCAACAGAATCTCGGCCAGGTCATGT  296

Query  297  AGCTCTGATAGCTGGGTTTTATGAAGATGTCAGTGCAGTTGCCAAAGGATGGAAGGAAAATCCTGTAGAGTTTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGCTCTGATAGCTGGGTTTTATGAAGATGTCAGTGCAGTTGCCAAAGGATGGAAGGAAAATCCTGTAGAGTTTG  370

Query  371  ATTCTCTTTTTAATGAAAGTAAATACACATGGAGCTGGGGAAGCCCAGATATCCTGCCTATGTTTGCCAAAGGT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATTCTCTTTTTAATGAAAGTAAATACACATGGAGCTGGGGAAGCCCAGATATCCTGCCTATGTTTGCCAAAGGT  444

Query  445  GCTAGTGGAGACCACGTTTATACATATAGTTATGATGCTAAAAGAGAGGATTTTGGTGCTCAAGATGCAACAAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCTAGTGGAGACCACGTTTATACATATAGTTATGATGCTAAAAGAGAGGATTTTGGTGCTCAAGATGCAACAAA  518

Query  519  ACTGGATACGTGGGTTTTTGATAATGTTAAGGACTTCTTTCATCATGCCAGAAACAACCAGTCTTTGTTTTCTA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ACTGGATACGTGGGTTTTTGATAATGTTAAGGACTTCTTTCATCATGCCAGAAACAACCAGTCTTTGTTTTCTA  592

Query  593  AAATAAATGAAGAGAAAATAGTTTTTTTCTTACATTTATTAGGAATAGATACAAACGGACATGCTCATCGACCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAATAAATGAAGAGAAAATAGTTTTTTTCTTACATTTATTAGGAATAGATACAAACGGACATGCTCATCGACCA  666

Query  667  TCCTCGAGAGACTACAAGGACAATATTAAAAAAGTTGATGATGGAGTTAAAGAAATCGTGTCTATGTTTAACCA  740
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCCTCGAGAGACTACAAGCACAATATTAAAAAAGTTGATGATGGAGTTAAAGAAATCGTGTCTATGTTTAACCA  740

Query  741  TTTCTATGGAAATGATGGGAAAACAACATTTATCTTTACCTCTGACCATGGAATGACAGACTGGGGTTCCCATG  814
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTTCTATGGAAATGATGGGAAAACAACATTTATCTTTACCTCTGACCATGGAATGACAGACTGGGGTTCCCATG  814

Query  815  GGGCTGGTCATCCTTCAGAGACTTTAACTCCTTTAGTCACTTGGGGAGCTGGAATCAAGTATCCCCAAAGAGTA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGGCTGGTCATCCTTCAGAGACTTTAACTCCTTTAGTCACTTGGGGAGCTGGAATCAAGTATCCCCAAAGAGTA  888

Query  889  TCAGCTCAGCAATTTGATGATGCATTTTTGAAAGAGTGGAGATTGGAGAATTGGAAGAGGCTAGATGTCAATCA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCAGCTCAGCAATTTGATGATGCATTTTTGAAAGAGTGGAGATTGGAGAATTGGAAGAGGCTAGATGTCAATCA  962

Query  963  GGCTGATATTGCACCATTGATGACTTCCCTTATTGGAGTTCCCTTTCCTCTTAACTCAGTGGGAATCCTTCCTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGCTGATATTGCACCATTGATGACTTCCCTTATTGGAGTTCCCTTTCCTCTTAACTCAGTGGGAATCCTTCCTG  1036

Query 1037  TGGATTATCTTAACAACACTGATCTCTTCAAAGCAGAGAGCATGTTTACAAATGCAGTACAGATTCTTGAACAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGGATTATCTTAACAACACTGATCTCTTCAAAGCAGAGAGCATGTTTACAAATGCAGTACAGATTCTTGAACAG  1110

Query 1111  TTCAAGGTGAAAATGACTCAGAAGAAAGAAGTTACTTTACCATTTTTGTTTACACCATTTAAACTGCTTTCTGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTCAAGGTGAAAATGACTCAGAAGAAAGAAGTTACTTTACCATTTTTGTTTACACCATTTAAACTGCTTTCTGA  1184

Query 1185  TTCCAAACAGTTCAACATTTTAAGAAAAGCAAGATCTTATATAAAACACAGAAAGTTTGATGAAGTGGTCTCCC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TTCCAAACAGTTCAACATTTTAAGAAAAGCAAGATCTTATATAAAACACAGAAAGTTTGATGAAGTGGTCTCCC  1258

Query 1259  TTTGCAAGGAGCTAATTCATCTTGCATTGAAAGGATTGTCCTATTATCACACATATGACAGATTCTTTTTGGGC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TTTGCAAGGAGCTAATTCATCTTGCATTGAAAGGATTGTCCTATTATCACACATATGACAGATTCTTTTTGGGC  1332

Query 1333  GTCAATGTTGTTATTGGTTTTGTGGGATGGATATCTTATGCCTCTTTGTTGATCATCAAGTCTCATTCCAACCT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GTCAATGTTGTTATTGGTTTTGTGGGATGGATATCTTATGCCTCTTTGTTGATCATCAAGTCTCATTCCAACCT  1406

Query 1407  TATAAAAGGTGTTAGTAAAGAAGTGAAGAAACCAAGCCATCTCCTGCCTTGTAGTTTTGTAGCTATTGGCATTT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TATAAAAGGTGTTAGTAAAGAAGTGAAGAAACCAAGCCATCTCCTGCCTTGTAGTTTTGTAGCTATTGGCATTT  1480

Query 1481  TAGTAGCATTTTTTCTGCTGATTCAAGCCTGTCCCTGGACATATTATGTATATGGTTTGTTGCCACTGCCAATA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TAGTAGCATTTTTTCTGCTGATTCAAGCCTGTCCCTGGACATATTATGTATATGGTTTGTTGCCACTGCCAATA  1554

Query 1555  TGGTATGCGGTTCTAAGAGAATTTCAAGTTATTCAGGACCTTGTTGTATCAGTGTTGACCTATCCTCTGAGCCA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TGGTATGCGGTTCTAAGAGAATTTCAAGTTATTCAGGACCTTGTTGTATCAGTGTTGACCTATCCTCTGAGCCA  1628

Query 1629  TTTTGTTGGGTACCTGTTAGCCTTTACCCTGGGAATTGAAGTATTAGTTCTCAGTTTTTTCTACCGCTATATGC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TTTTGTTGGGTACCTGTTAGCCTTTACCCTGGGAATTGAAGTATTAGTTCTCAGTTTTTTCTACCGCTATATGC  1702

Query 1703  TTACCGCTGGACTTACTGCCTTTGCAGCTTGGCCATTTCTCACTCGGCTGTGGACTCGAGCAAAGATGACCTCA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TTACCGCTGGACTTACTGCCTTTGCAGCTTGGCCATTTCTCACTCGGCTGTGGACTCGAGCAAAGATGACCTCA  1776

Query 1777  CTGAGTTGGACTTTCTTCTCTTTGCTCCTGGCAGTGTTCCCACTGATGCCGGTTGTAGGTCGAAAGCCAGACAT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CTGAGTTGGACTTTCTTCTCTTTGCTCCTGGCAGTGTTCCCACTGATGCCGGTTGTAGGTCGAAAGCCAGACAT  1850

Query 1851  CTCTCTAGTGATGGGTGCAGGCTTGCTGGTTCTTCTGTTATCCCTGTGTGTTGTAACATCTCTCATGAAAAGAA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CTCTCTAGTGATGGGTGCAGGCTTGCTGGTTCTTCTGTTATCCCTGTGTGTTGTAACATCTCTCATGAAAAGAA  1924

Query 1925  AAGATAGCTTTATAAAGGAAGAGCTATTGGTACATCTGTTACAGGTGCTGAGCACAGTGCTCTCCATGTATGTT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AAGATAGCTTTATAAAGGAAGAGCTATTGGTACATCTGTTACAGGTGCTGAGCACAGTGCTCTCCATGTATGTT  1998

Query 1999  GTGTATAGCACTCAGAGTAGTCTACTCAGGAAGCAAGGACTGCCTCTCATGAATCAAATTATTAGCTGGGCAAC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GTGTATAGCACTCAGAGTAGTCTACTCAGGAAGCAAGGACTGCCTCTCATGAATCAAATTATTAGCTGGGCAAC  2072

Query 2073  ATTAGCCTCTTCCTTGGTTGTGCCACTACTGAGTTCTCCAGTTCTCTTTCAGCGATTGTTCAGCATACTTCTTT  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  ATTAGCCTCTTCCTTGGTTGTGCCACTACTGAGTTCTCCAGTTCTCTTTCAGCGATTGTTCAGCATACTTCTTT  2146

Query 2147  CATTGATGTCAACCTACCTACTTCTAAGCACAGGGTATGAAGCTCTCTTTCCACTAGTGTTGTCTTGTTTGATG  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CATTGATGTCAACCTACCTACTTCTAAGCACAGGGTATGAAGCTCTCTTTCCACTAGTGTTGTCTTGTTTGATG  2220

Query 2221  TTTGTCTGGATAAACATAGAACAAGAAACTCTACAACAATCTGGTGTTTGCTGTAAACAAAAGCTCACCAGTAT  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  TTTGTCTGGATAAACATAGAACAAGAAACTCTACAACAATCTGGTGTTTGCTGTAAACAAAAGCTCACCAGTAT  2294

Query 2295  CCAGTTCTCTTATAATACTGATATAACTCAGTTTCGACAGCTATATCTGGATGACATCCGTAGGGCCTTTTTCC  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  CCAGTTCTCTTATAATACTGATATAACTCAGTTTCGACAGCTATATCTGGATGACATCCGTAGGGCCTTTTTCC  2368

Query 2369  TTGTTTTCTTCTTAGTGACAGCATTTTTTGGAACTGGAAATATAGCTTCTATTAACAGCTTTGATCTTGCCTCT  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  TTGTTTTCTTCTTAGTGACAGCATTTTTTGGAACTGGAAATATAGCTTCTATTAACAGCTTTGATCTTGCCTCT  2442

Query 2443  GTCTATTGCTTTCTGACTGTGTTCAGTCCTTTTATGATGGGAGCCCTGATGATGTGGAAGATTTTAATCCCCTT  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  GTCTATTGCTTTCTGACTGTGTTCAGTCCTTTTATGATGGGAGCCCTGATGATGTGGAAGATTTTAATCCCCTT  2516

Query 2517  TGTTCTTGTTATGTGTGCTTTTGAAGCAGTTCAGTTGACTACTCAGTTATCGTCAAAAAGCCTTTTTCTCATTG  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  TGTTCTTGTTATGTGTGCTTTTGAAGCAGTTCAGTTGACTACTCAGTTATCGTCAAAAAGCCTTTTTCTCATTG  2590

Query 2591  TTCTCGTCATATCAGACATTATGGCTTTGCATTTTTTCTTCTTGGTCAAGGATTATGGCAGCTGGCTTGATATT  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  TTCTCGTCATATCAGACATTATGGCTTTGCATTTTTTCTTCTTGGTCAAGGATTATGGCAGCTGGCTTGATATT  2664

Query 2665  GGGACAAGCATCAGCCACTATGTGATTGTCATGTCCATGACCATCTTTTTGGTGTTCCTCAATGGCCTGGCCCA  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  GGGACAAGCATCAGCCACTATGTGATTGTCATGTCCATGACCATCTTTTTGGTGTTCCTCAATGGCCTGGCCCA  2738

Query 2739  GCTGCTCACAACGAAGAAACTCAGACTATGTGGCAAACCCAAAAGTCACTTCATG  2793
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  GCTGCTCACAACGAAGAAACTCAGACTATGTGGCAAACCCAAAAGTCACTTCATG  2793