Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_07951
Subject:
NM_145353.2
Aligned Length:
1050
Identities:
932
Gaps:
9

Alignment

Query    1  ATGGCAACTACAGCTGCGCCGGCGGGCGGCGCCCGAAATGGAGCTGGCCCGGAATGGGGAGGGTTCGAAGAAAA  74
            |||||.|||.|.||.||||||||..||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGACTCCGGCGGCGCCGGCCAGCGGCGTCCGAAATGGTGCTGGCCCGGAATGGGGAGGCTTCGAAGAAAA  74

Query   75  CATCCAGGGCGGAGGCTCAGCTGTGATTGACATGGAGAACATGGATGATACCTCAGGCTCTAGCTTCGAGGATA  148
            |||||||||.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct   75  CATCCAGGGTGGGGGTTCGGCTGTGATTGATATGGAGAACATGGACGATACCTCAGGCTCCAGCTTCGAGGACA  148

Query  149  TGGGTGAGCTGCATCAGCGCCTGCGCGAGGAAGAAGTAGACGCTGATGCAGCTGATGCAGCTGCTGCTGAAGAG  222
            |||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||         .|||||||||||||||||.|||||.
Sbjct  149  TGGGTGAGCTGCACCAGCGCCTGCGGGAGGAAGAAGTAGA---------TGCTGATGCAGCTGCTGCAGAAGAA  213

Query  223  GAGGATGGAGAGTTCCTGGGCATGAAGGGCTTTAAGGGACAGCTGAGCCGGCAGGTGGCAGATCAGATGTGGCA  296
            ||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  214  GAGGATGGGGAGTTTCTTGGCATGAAAGGCTTTAAAGGACAACTGAGCCGGCAGGTAGCAGATCAGATGTGGCA  287

Query  297  GGCTGGGAAAAGACAAGCCTCCAGGGCCTTCAGCTTGTACGCCAACATCGACATCCTCAGACCCTACTTTGATG  370
            |||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  288  GGCAGGGAAGAGACAGGCTTCCAGGGCCTTCAGCTTGTATGCCAACATTGACATCCTCAGACCCTACTTTGATG  361

Query  371  TGGAGCCTGCTCAGGTGCGAAGCAGGCTCCTGGAGTCCATGATCCCTATCAAGATGGTCAACTTCCCCCAGAAA  444
            ||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  362  TGGAGCCTGCCCAGGTCCGAAGCAGGCTCCTGGAGTCCATGATCCCTATCAAGATGGTCAACTTCCCCCAGAAA  435

Query  445  ATTGCAGGTGAACTCTATGGACCTCTCATGCTGGTCTTCACTCTGGTTGCTATCCTACTCCATGGGATGAAGAC  518
            .|.||.||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||.||||||||
Sbjct  436  GTCGCGGGCGAGCTCTACGGACCGCTCATGCTGGTCTTCACACTGGTGGCCATCCTCCTGCATGGAATGAAGAC  509

Query  519  GTCTGACACTATTATCCGGGAGGGCACCCTGATGGGCACAGCCATTGGCACCTGCTTCGGCTACTGGCTGGGAG  592
            .||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|
Sbjct  510  TTCTGACACCATTATCCGGGAGGGCACCCTCATGGGCACAGCCATAGGCACCTGCTTTGGATACTGGCTGGGTG  583

Query  593  TCTCATCCTTCATTTACTTCCTTGCCTACCTGTGCAACGCCCAGATCACCATGCTGCAGATGTTGGCACTGCTG  666
            ||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  584  TCTCGTCCTTCATTTATTTCCTTGCCTACCTGTGTAACGCCCAGATCACCATGCTACAGATGTTGGCACTGCTG  657

Query  667  GGCTATGGCCTCTTTGGGCATTGCATTGTCCTGTTCATCACCTATAATATCCACCTCCACGCCCTCTTCTACCT  740
            |||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct  658  GGCTACGGCCTCTTCGGGCACTGCATAGTCCTGTTCATCACCTATAACATCCACCTTCATGCCCTCTTCTACCT  731

Query  741  CTTCTGGCTGTTGGTGGGTGGACTGTCCACACTGCGCATGGTAGCAGTGTTGGTGTCTCGGACCGTGGGCCCCA  814
            ||||||||||.||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|
Sbjct  732  CTTCTGGCTGCTGGTGGGTGGGCTCTCTACCCTGCGCATGGTGGCAGTGTTGGTGTCGCGGACTGTGGGCCCTA  805

Query  815  CACAGCGGCTGCTCCTCTGTGGCACCCTGGCTGCCCTACACATGCTCTTCCTGCTCTATCTGCATTTTGCCTAC  888
            |.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct  806  CTCAGCGGCTGCTGCTCTGTGGCACGCTGGCTGCCCTGCACATGCTCTTCCTGCTCTATCTGCACTTCGCCTAC  879

Query  889  CACAAAGTGGTAGAGGGGATCCTGGACACACTGGAGGGCCCCAACATCCCGCCCATCCAGAGGGTCCCCAGAGA  962
            |||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct  880  CACAAAGTGGTGGAGGGGATCCTGGACACCCTGGAGGGCCCCAACATCCCACCCATGCAGAGGGTCCCCAGAGA  953

Query  963  CATCCCTGCCATGCTCCCTGCTGCTCGGCTTCCCACCACCGTCCTCAACGCCACAGCCAAAGCTGTTGCGGTGA  1036
            ||||||.||..|||||||||||||..||||.|||..|.|.||..||||.||.||.|||||.||..|.||.||||
Sbjct  954  CATCCCCGCTGTGCTCCCTGCTGCCAGGCTGCCCGTCGCTGTGATCAATGCTACCGCCAAGGCAATAGCAGTGA  1027

Query 1037  CCCTGCAGTCACAC  1050
            |.|||||||||||.
Sbjct 1028  CTCTGCAGTCACAT  1041