Protein Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07957
- Subject:
- NM_001014399.2
- Aligned Length:
- 1111
- Identities:
- 746
- Gaps:
- 238
Alignment
Query 1 MRGGKCNMLSSLGCLLLCGSITLALGNAQKLPKGKRPNLKVHINTTSDSILLKFLRPSPNVKLEGLLLGYGSNV 74
||||||||||||||.|||||||||||||.|.|||||||||||||||||||..||||||.||||||||
Sbjct 1 -------MLSSLGCLLLCGSIALALGNAQKLPKGKKPSLKVHINTTSDSILLKFLRPNANVKLEGFLLGYGSNV 67
Query 75 SPNQYFPLPAEGKFTEAIVDAEPKYLIVVRPAPPPSQKKSCSGKTRSRKPLQLVVGTLTPSSVFLSWGFLINPH 148
|||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 68 SPNQYFPLPTEGKFTEAVVDAEPKYLIVVRPAPPPSQKKSCSGKSRPRKPLQLVVGTLTPSSVFLSWGFLINPH 141
Query 149 HDWTLPSHCPNDRFYTIRYREKDKEKKWIFQICPATETIVENLKPNTVYEFGVKDNVEGGIWSKIFNHKTVVGS 222
||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||
Sbjct 142 HDWTLPSHCPSDRFYTIRYREKDKEKKWIFQLCPATETIVENLKPNTVYEFGVKDNIEGGIWSKIFNHKTIVGS 215
Query 223 K-KVNGKIQSTYDQDHTVPAYVPRKLIPITIIKQVIQNVTHKDSAKSPEKAPLGGVILVHLIIPGLNETTVKLP 295
| ||||||||||||.|.|| |||||||.||||||||||||..|.|||.|.|.||.||||||||||||.|||||
Sbjct 216 KNKVNGKIQSTYDQVHSVP--VPRKLIPLTIIKQVIQNVTHRASTKSPDKTPFGGTILVHLIIPGLNESTVKLP 287
Query 296 ASLMFEISDALKTQLAKNETLALPAESKTPEVEKISARPTTVTPETVPRSTKPTTSSALDVSETTLASSEKPWI 369
.|.|.|||||||.|||||||||||||||||||||....|.|||||.|.||||||.|||||..||.|
Sbjct 288 TSIMLEISDALKAQLAKNETLALPAESKTPEVEKLAGQPVTVTPESVSRSTKPTLSSALDTAETAL-------- 353
Query 370 VPTAKISEDSKVLQPQTATYDVFSSPTTSDEPEISDSYTATSDRILDSIPPKTSRTLEQPRATLAPSETPFVPQ 443
Sbjct 354 -------------------------------------------------------------------------- 353
Query 444 KLEIFTSPEMQPTTPAPQQTTSIPSTPKRRPRPKPPRTKPERTTSAGTITPKISKSPEPTWTTPAPGKTQFISL 517
||.||||.
Sbjct 354 ---------------APRQTTSM--------------------------------------------------- 361
Query 518 KPKIPLSPEVTHTKPAPKQTPRAPPKPKTSPRPRIPQTQPVPKVPQRVTAKPKTSPSPEVSYTTPAPKDVLLPH 591
|||.|| |..|.|...||||.|...|.|||..|||||..||
Sbjct 362 -----------------------PPKLKT-PHSRMPAKEPVPKEPLHTTSKPKMPPSPEVADTT---------- 401
Query 592 KPYPEVSQSEPAPLETRGIPFIPMISPSPSQEELQTTLEETDQSTQEPFTTKIPRTTELAKTTQAPHRFYTT-V 664
.|||||||||.||.|||.||||||||..|||||||||.||||||||||||||||||||..|. |
Sbjct 402 ----------SAPLETRGIPLIPVISPRPSQEELQTAMEETDQSTQELFTTKIPRTTELAKTTQAPHRLHTAPV 465
Query 665 RPRTSDKPHIRP-------------------------GVKQAPRPSGADRNVSVDSTHPTKKP----GTRRPPL 709
|||....||.|| |.||||.|....||.|||| |.|.|| ||||||.
Sbjct 466 RPRIPGRPHGRPALNKTTTRPDKTKPRGTSHKNGVGTGTKQAPKPPSPGRNASVDS-HATRKPGSVSGTRRPPI 538
Query 710 P-----PRPTHPRRKPLPPNNVTGKPGSAGIISSGPITTPPLRSTPRPTGTPLERIETDIKQPTVPASGEELEN 778
| .||..|.|.||||||||||||.|||.||...|.|||..|..|.||...|.....|.||.|||.||...
Sbjct 539 PHRHSSTRPVSPERRPLPPNNVTGKPGRAGIVSSSRVTSPPLKATLHPIGTATARPGAEQKEPTAPASEEEFGT 612
Query 779 ITDFSSSPTRETDPLGKPRFKGPHVRYIQKPDNSPCSITDSVKRFPKEEATEGNATSPPQNPPTNLTVVTVEGC 852
.||||||||.||||||||||.|||||||.||.|.||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 613 TTDFSSSPTKETDPLGKPRFIGPHVRYIPKPENKPCSITDSVRRFPTEEATEGNATSPPQNPPTNLTVVTVEGC 686
Query 853 PSFVILDWEKPLNDTVTEYEVISRENGSFSGKNKSIQMTNQTFSTVENLKPNTSYEFQVKPKNPLGEGPVSNTV 926
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 687 PSFVILDWEKPLNDTVTEYEVISRENGSFSGKNKSIQITNQTFSTVENLKPDTSYEFQVKPKNPLGEGPASNTV 760
Query 927 AFSTESADPRVSEPVSAGRDAIWTERPFNSDSYSECKGKQYVKRTWYKKFVGVQLCNSLRYKIYLSDSLTGKFY 1000
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 761 AFSTESADPRVSEPISAGRDAIWTERPFNSDSYSECKGKQYVKRTWYKKFVGVQLCNSLRYKIYLSDSLTGKFY 834
Query 1001 NIGDQRGHGEDHCQFVDSFLDGRTGQQLTSDQLPIKEGYFRAVRQEPVQFGEIGGHTQINYVQWYECGTTIPGK 1074
||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 835 NIGDQRGHGEDHCQFVDSFLDGRTGQQLTSEQLPTKEGYFRAVRQEPVQFGEIGGHTQINYVQWYECGTTIPGK 908
Query 1075 W 1075
|
Sbjct 909 W 909