Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07957
• Subject: NM_001014422.2
• Aligned Length: 1160
• Identities: 845
• Gaps: 146

Alignment

Query    1  MRGGKCNMLSSLGCLLLCGSITLALGNAQKLPKGKRPNLKVHINTTSDSILLKFLRPSPNVKLEGLLLGYGSNV  74
                   ||||||||||||||.|||||||||||||.|.|||||||||||||||||||..||||||.||||||||
Sbjct    1  -------MLSSLGCLLLCGSIALALGNAQKLPKGKKPSLKVHINTTSDSILLKFLRPNANVKLEGFLLGYGSNV  67

Query   75  SPNQYFPLPAEGKFTEAIVDAEPKYLIVVRPAPPPSQKKSCSGKTRSRKPLQLVVGTLTPSSVFLSWGFLINPH  148
            |||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   68  SPNQYFPLPTEGKFTEAVVDAEPKYLIVVRPAPPPSQKKSCSGKSRPRKPLQLVVGTLTPSSVFLSWGFLINPH  141

Query  149  HDWTLPSHCPNDRFYTIRYREKDKEKKWIFQICPATETIVENLKPNTVYEFGVKDNVEGGIWSKIFNHKTVVGS  222
            ||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||
Sbjct  142  HDWTLPSHCPSDRFYTIRYREKDKEKKWIFQLCPATETIVENLKPNTVYEFGVKDNIEGGIWSKIFNHKTIVGS  215

Query  223  K-KVNGKIQSTYDQDHTVPAYVPRKLIPITIIKQVIQNVTHKDSAKSPEKAPLGGVILVHLIIPGLNETTVKLP  295
            | ||||||||||||.|.||  |||||||.||||||||||||..|.|||.|.|.||.||||||||||||.|||||
Sbjct  216  KNKVNGKIQSTYDQVHSVP--VPRKLIPLTIIKQVIQNVTHRASTKSPDKTPFGGTILVHLIIPGLNESTVKLP  287

Query  296  ASLMFEISDALKTQLAKNETLALPAESKTPEVEKISARPTTVTPETVPRSTKPTTSSALDVSETTL--------  361
            .|.|.|||||||.|||||||||||||||||||||....|.|||||.|.||||||.|||||..||.|        
Sbjct  288  TSIMLEISDALKAQLAKNETLALPAESKTPEVEKLAGQPVTVTPESVSRSTKPTLSSALDTAETALVLSEKTSE  361

Query  362  -----------------------------------------ASSEKPWIVPTAKISEDSKVLQPQTATYDVFSS  394
                                                     ||||.||.||.||.||||.|.|||||||||.||
Sbjct  362  TARSVLIPEFELPLSTLAPKRFPEFPEAKTAFPLEKPRGSWASSEEPWVVPGAKTSEDSRVVQPQTATYDVISS  435

Query  395  PTTSDEPEISDSYTATSDRILDSIPPKTSRTLEQPRATLAPSETPFVPQKLEIFTSPEMQPTTPAPQQTTSIPS  468
            .|||||.|| ...|||.|.||||.|||||||.|||||||||.|..|.....|||||||..|||.||||||||||
Sbjct  436  STTSDETEI-EIHTATRDPILDSVPPKTSRTAEQPRATLAPIEALFESRNVEIFTSPEVRPTTAAPQQTTSIPS  508

Query  469  TPKRRPRPKPPRTKPERTTSAGTITPKISKSPEPTWTTPAPGKTQFISLKPKIPLSPEVTHTKPAPKQTPRAPP  542
            ||||...|||||                                                 .||||.||...||
Sbjct  509  TPKRQSTPKPPR-------------------------------------------------VKPAPRQTTSMPP  533

Query  543  KPKTSPRPRIPQTQPVPKVPQRVTAKPKTSPSPEVSYTTPAPKDVLLPHKPYPEVSQSEPAPLETRGIPFIPMI  616
            |.|| |..|.|...||||.|...|.|||..|||||..||..|||..|..||.|||..||.|||||||||.||.|
Sbjct  534  KLKT-PHSRMPAKEPVPKEPLHTTSKPKMPPSPEVADTTSVPKDERLSLKPDPEVTHSETAPLETRGIPLIPVI  606

Query  617  SPSPSQEELQTTLEETDQSTQEPFTTKIPRTTELAKTTQAPHRFYTT-VRPRTSDKPHIRP-------------  676
            ||.||||||||..|||||||||.||||||||||||||||||||..|. ||||....||.||             
Sbjct  607  SPRPSQEELQTAMEETDQSTQELFTTKIPRTTELAKTTQAPHRLHTAPVRPRIPGRPHGRPALNKTTTRPDKTK  680

Query  677  ------------GVKQAPRPSGADRNVSVDSTHPTKKP----GTRRPPLP-----PRPTHPRRKPLPPNNVTGK  729
                        |.||||.|....||.|||| |.|.||    ||||||.|     .||..|.|.||||||||||
Sbjct  681  PRGTSHKNGVGTGTKQAPKPPSPGRNASVDS-HATRKPGSVSGTRRPPIPHRHSSTRPVSPERRPLPPNNVTGK  753

Query  730  PGSAGIISSGPITTPPLRSTPRPTGTPLERIETDIKQPTVPASGEELENITDFSSSPTRETDPLGKPRFKGPHV  803
            ||.|||.||...|.|||..|..|.||...|.....|.||.|||.||....||||||||.||||||||||.||||
Sbjct  754  PGRAGIVSSSRVTSPPLKATLHPIGTATARPGAEQKEPTAPASEEEFGTTTDFSSSPTKETDPLGKPRFIGPHV  827

Query  804  RYIQKPDNSPCSITDSVKRFPKEEATEGNATSPPQNPPTNLTVVTVEGCPSFVILDWEKPLNDTVTEYEVISRE  877
            |||.||.|.||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  828  RYIPKPENKPCSITDSVRRFPTEEATEGNATSPPQNPPTNLTVVTVEGCPSFVILDWEKPLNDTVTEYEVISRE  901

Query  878  NGSFSGKNKSIQMTNQTFSTVENLKPNTSYEFQVKPKNPLGEGPVSNTVAFSTESADPRVSEPVSAGRDAIWTE  951
            ||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  902  NGSFSGKNKSIQITNQTFSTVENLKPDTSYEFQVKPKNPLGEGPASNTVAFSTESADPRVSEPISAGRDAIWTE  975

Query  952  RPFNSDSYSECKGKQYVKRTWYKKFVGVQLCNSLRYKIYLSDSLTGKFYNIGDQRGHGEDHCQFVDSFLDGRTG  1025
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  976  RPFNSDSYSECKGKQYVKRTWYKKFVGVQLCNSLRYKIYLSDSLTGKFYNIGDQRGHGEDHCQFVDSFLDGRTG  1049

Query 1026  QQLTSDQLPIKEGYFRAVRQEPVQFGEIGGHTQINYVQWYECGTTIPGKW  1075
            |||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1050  QQLTSEQLPTKEGYFRAVRQEPVQFGEIGGHTQINYVQWYECGTTIPGKW  1099