Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07957
- Subject:
- NM_001014424.2
- Aligned Length:
- 3538
- Identities:
- 2630
- Gaps:
- 506
Alignment
Query 1 ATGCGAGGTGGCAAATGCAACATGCTCTCCAGTTTGGGGTGTCTACTTCTCTGTGGAAGTATTACACTAGCCCT 74
|||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||.||||.||.||
Sbjct 1 ---------------------ATGCTCTCCAGCCTGGGGTGTCTACTTCTCTGTGGAAGTATTGCACTTGCTCT 53
Query 75 GGGAAATGCACAGAAATTGCCAAAAGGTAAAAGGCCAAACCTCAAAGTCCACATCAATACCACAAGTGACTCCA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|.|.|||||.||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 54 GGGAAATGCACAGAAATTGCCAAAAGGTAAAAAGCCAAGCTTGAAAGTGCACATCAATACCACCAGCGACTCCA 127
Query 149 TCCTCTTGAAGTTCTTGCGTCCAAGTCCAAATGTAAAGCTTGAAGGTCTTCTCCTGGGATATGGCAGCAATGTA 222
||||||||||||||.|||||||||.|.||||.||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 128 TCCTCTTGAAGTTCCTGCGTCCAAATGCAAACGTAAAGCTGGAAGGTTTTCTCCTGGGATATGGCAGCAATGTG 201
Query 223 TCACCAAACCAGTACTTCCCTCTTCCCGCTGAAGGGAAATTCACAGAAGCTATAGTTGATGCAGAGCCGAAATA 296
||.||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||.||
Sbjct 202 TCTCCAAACCAGTACTTCCCTCTTCCCACAGAAGGGAAATTCACAGAGGCTGTAGTTGATGCAGAGCCGAAGTA 275
Query 297 TCTGATAGTTGTGCGACCTGCTCCACCTCCAAGTCAAAAGAAGTCATGTTCAGGTAAAACTCGTTCTCGCAAAC 370
|||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.|||.||||..|||||||||
Sbjct 276 TCTGATAGTCGTACGACCTGCTCCTCCTCCCAGCCAGAAGAAGTCATGTTCAGGGAAATCTCGCCCTCGCAAAC 349
Query 371 CTCTGCAGCTGGTGGTTGGCACTCTGACACCGAGCTCAGTCTTCCTGTCCTGGGGTTTCCTCATCAACCCACAC 444
|.||.|||||||||||.||.||..||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 350 CCCTCCAGCTGGTGGTGGGTACGTTGACACCGAGTTCTGTCTTCCTGTCCTGGGGATTCCTCATCAACCCACAC 423
Query 445 CATGACTGGACATTGCCAAGTCACTGTCCCAATGACAGATTTTATACAATTCGCTATCGAGAAAAGGATAAAGA 518
||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||.|||||||.||||||||
Sbjct 424 CATGACTGGACATTGCCAAGCCACTGTCCCAGTGACAGATTTTATACAATTCGATATAGAGAAAAAGATAAAGA 497
Query 519 AAAGAAGTGGATTTTTCAAATCTGTCCAGCCACTGAAACAATTGTGGAAAACCTAAAGCCCAACACAGTTTATG 592
||||||.||||||||||||.||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 498 AAAGAAATGGATTTTTCAACTCTGCCCAGCTACTGAAACAATTGTGGAAAATCTAAAGCCCAACACAGTTTATG 571
Query 593 AATTTGGAGTGAAAGACAATGTGGAAGGTGGAATTTGGAGTAAGATTTTCAATCACAAGACTGTTGTTGGAAGT 666
|||||||.||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||
Sbjct 572 AATTTGGTGTGAAAGACAATATAGAAGGTGGAATTTGGAGTAAGATTTTCAATCATAAGACTATTGTTGGAAGT 645
Query 667 AAA---AAAGTAAATGGGAAAATCCAAAGTACCTATGACCAAGACCACACAGTGCCAGCATATGTCCCAAGGAA 737
||| ||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|.||||.|||||||| |||||.|||||
Sbjct 646 AAAAACAAAGTAAACGGGAAAATCCAAAGCACTTATGACCAGGTCCACTCAGTGCCA------GTCCCGAGGAA 713
Query 738 ACTAATCCCAATAACAATCATCAAGCAAGTGATTCAGAATGTTACTCACAAGGATTCAGCTAAATCCCCAGAAA 811
.|||||||||.||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||.||.||||.|.|||||||||||.|
Sbjct 714 GCTAATCCCACTAACGATCATTAAGCAAGTGATTCAGAATGTTACTCACAGGGCTTCAACCAAATCCCCAGACA 787
Query 812 AAGCTCCACTGGGAGGAGTGATACTAGTCCACCTTATTATTCCAGGTCTTAATGAAACTACTGTAAAACTTCCT 885
|..||||..|.||.|||...|||.||||.||.||.||||||||.||||||||||||.|.||||||||||||||.
Sbjct 788 AGACTCCTTTTGGGGGAACAATATTAGTTCATCTGATTATTCCGGGTCTTAATGAATCCACTGTAAAACTTCCC 861
Query 886 GCATCCCTAATGTTTGAGATTTCAGATGCACTCAAGACACAATTAGCTAAGAATGAAACCTTGGCATTACCTGC 959
.|||||.|||||.||||||||||.|||||.||||||.||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||
Sbjct 862 ACATCCATAATGCTTGAGATTTCCGATGCTCTCAAGGCACAATTAGCTAAGAATGAAACATTGGCTTTACCAGC 935
Query 960 CGAATCTAAAACACCAGAGGTTGAAAAAATCTCAGCACGACCCA-CAACAGTGACTCCTGAAACAGTTCCAAGA 1032
.||||||||||||||||||||.||||||.|..|||..| |.||| .||||||||||||.|||.|||||.|||||
Sbjct 936 AGAATCTAAAACACCAGAGGTCGAAAAATTGGCAGGGC-AGCCAGTAACAGTGACTCCGGAATCAGTTTCAAGA 1008
Query 1033 AGCACTAAACCCACTACGTCTAGTGCATTAGA-----------------TGTT----------------TCAGA 1073
||||||||.|||||...|||||||||.||||| ||.| |||||
Sbjct 1009 AGCACTAAGCCCACCCTGTCTAGTGCTTTAGACACTGCAGAGACAGCACTGGTCCTCAGTGAGAAGACGTCAGA 1082
Query 1074 AAC----------------------------------------AACACT------------------------- 1082
||| |.||||
Sbjct 1083 AACAGCCCGCTCTGTTCTAATACCTGAGTTTGAATTGCCCTTGAGCACTTTAGCTCCAAAAAGGTTCCCAGAGT 1156
Query 1083 -------------------------------------------------GGCTTCAAGTGAAAAGCCATGGATT 1107
||||||||||||..||||||||.|.
Sbjct 1157 TTCCTGAGGCAAAAACAGCCTTCCCATTGGAGAAACCTAGGGGTTCCTGGGCTTCAAGTGAGGAGCCATGGGTG 1230
Query 1108 GTGCCTACAGCTAAAATATCTGAAGATTCCAAAGTTCTGCAGCCTCAAACTGCAACTTATGATGTTTTCTCAAG 1181
||.|||..||||||||.||||||||||||||.|||..|.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1231 GTACCTGGAGCTAAAACATCTGAAGATTCCAGAGTCGTACAGCCTCAAACTGCAACTTATGATGTTATCTCAAG 1304
Query 1182 CCCTACAACATCAGATGAGCCTGAGATATCAGATTCCTACACAGCAACAAGTGATCGTATTCTGGATTCTATCC 1255
|.|.|||||.||.||||||.||||.||| .|||||| |||||||||||||.||||.|||||||||.|||.|||
Sbjct 1305 CTCAACAACTTCTGATGAGACTGAAATA-GAGATTC--ACACAGCAACAAGAGATCCTATTCTGGACTCTGTCC 1375
Query 1256 CACCTAAAACTTCTAGAACTCTTGAACAGCCAAGGGCAACACTGGCTCCAAGTGAAACACCATTTG-TTCCTCA 1328
||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||..|||.|...||||| .||| |.
Sbjct 1376 CACCTAAAACTTCTAGAACTGCTGAACAGCCAAGGGCAACACTGGCTCCAATCGAAGCGTTATTTGAATCC-CG 1448
Query 1329 AAAACTGGAAATCTTTACCAGTCCAGAAATGCAGCCTACGACACCTGCTCCCCAGCAAACTACATCTATCCCTT 1402
|||..||||||||||.||||||||.|||.|||..|||||.||..|||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1449 AAATGTGGAAATCTTCACCAGTCCTGAAGTGCGACCTACAACGGCTGCTCCTCAGCAAACTACATCTATCCCTT 1522
Query 1403 CTACACCTAAACGACGCCCCCGGCCCAAACCGCCAAGAACCAAACCTGAAAGAACCACAAGTGCCGGAACAATT 1476
|.|||||.||||| |||||
Sbjct 1523 CCACACCCAAACG-------------------------------------------------------ACAAT- 1540
Query 1477 ACACCTAAAATTTCTAAAAGCCCTGAACCTACATGGACAACACCGGCTCCCGGTAAAACACAATTTATTTCTCT 1550
|||||||
Sbjct 1541 -------------------------------------CAACACC------------------------------ 1547
Query 1551 GAAACCTAAAATCCCTCTCAGCCCAGAAGTGACACACACCAAACCTGCTCCCAAGCAGAC-ACCA-CGTGCTCC 1622
.||||| |||.|| ||| |||.|||||.||||.|||||| |||| |.|| ||
Sbjct 1548 CAAACC--------------GCCAAG-AGT---------CAAGCCTGCACCCAGGCAGACAACCAGCATG--CC 1595
Query 1623 TCCTAAGC-CAAAAACATCACCACGCCCAAGAATCCCA-CAAACACAACCAGTTCCTAAGGTGCCCCAGCGTGT 1694
|||.|||| ||||| ||||||.|.||||.||.||| |||| |.|.|||||||||||||..||||.||.|..
Sbjct 1596 TCCCAAGCTCAAAA----CACCACACTCAAGGATGCCAGCAAA-AGAGCCAGTTCCTAAGGAACCCCTGCATAC 1664
Query 1695 TACTGCAAAACCAAAAACGTCACCAAGTCCAGAAGTGTCATACACCACACCTGCTCCAAAAGATGTGCTCCTTC 1768
.|||.||||.|||||||.|.||||||||||.||||||.||.||||.|||.|||.|||||||||||..|..|||.
Sbjct 1665 GACTTCAAAGCCAAAAATGCCACCAAGTCCTGAAGTGGCAGACACTACATCTGTTCCAAAAGATGAACGACTTT 1738
Query 1769 CTCATAAACCATACCCTGAGGTCTCTCAGAGCGAACCT------------------------------------ 1806
|.|.|||||||.|.||.||||||.||||.||.|||.||
Sbjct 1739 CCCTTAAACCAGATCCAGAGGTCACTCACAGTGAAACTGTTCTGCCTCCTGTCACCTTTAGAGTTGAGCCACCA 1812
Query 1807 ------------GCTCCTCTAGAGACACGAGGCATCCCTTTTATACCCATGATTTCCCCAAGTCCTAGTCAAGA 1868
||.|||.||||||||||.|||||.|||.|.|||||..|||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1813 AAGACAACAATAGCACCTTTAGAGACACGGGGCATTCCTCTCATACCTGTGATTTCACCAAGACCTAGTCAAGA 1886
Query 1869 GGAACTACAGACCACTCTGGAAGAAACAGACCAATCCACCCAAGAACCTTTCACAACTAAGATTCCACGAACAA 1942
|||||||||.|||.|..||||||||||||||||.||.||||||||.|..|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1887 GGAACTACAAACCGCCATGGAAGAAACAGACCAGTCTACCCAAGAGCTCTTCACGACTAAGATTCCACGAACAA 1960
Query 1943 CTGAACTAGCAAAGACAACTCAGGCGCCACACAGATTTTATA---CTACTGTGAGGCCCAGAACATCTGACAAG 2013
|||||.|.|||||||||||||||||.|||||||||||..||| ||.|||||||||||||||.|.|||.||.|
Sbjct 1961 CTGAATTGGCAAAGACAACTCAGGCACCACACAGATTGCATACAGCTCCTGTGAGGCCCAGAATACCTGGCAGG 2034
Query 2014 CCACACATCAGACCTG--------------------------------------------GGG----------- 2032
|||||...|||.|||| |||
Sbjct 2035 CCACATGGCAGGCCTGCTCTGAACAAAACAACTACAAGGCCTGATAAAACCAAACCCAGAGGGACGTCCCATAA 2108
Query 2033 --------------------TCAAGCAAGCACCCAGGCCATCAGGTGCTGATAGAAATGTATCAGTGGACTCTA 2086
.||||||||||||.|.||||.||.||.|||..|||||||..|||||||| |.
Sbjct 2109 AAACGGAGTAGGAACAGGAACCAAGCAAGCACCTAAGCCACCAAGTCCTGGGAGAAATGCGTCAGTGGA---TT 2179
Query 2087 CCCACCCCACTAAAAAGC------------CAGGGACTCGCCGCCCACCCTTGCCACCCAGAC---------CT 2139
|.||..||||.|.|||.| |||||||.||.||.||||||.|.||||..||.| ||
Sbjct 2180 CACATGCCACAAGAAAACCAGGCTCAGTCTCAGGGACGCGTCGTCCACCCATACCACATAGGCATTCGTCCACT 2253
Query 2140 ACACAC-------CCACGA-AGAAAACCTTTACCACCAAATAATGTCACTGGAAAGCCAGGAAGTGCAGGAATC 2205
|.|| | ||| || ||||..||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||.||||.|||||.
Sbjct 2254 AGAC-CTGTGTCTCCA-GAGAGAAGGCCTTTACCCCCGAATAATGTCACCGGGAAGCCAGGACGTGCGGGAATT 2325
Query 2206 ATTTCATCAGGCCCAATAACTACACCACCCCTGAGGTCAACAC-CCAGGCCTACTGGAACTCCCTTGGAGAGAA 2278
.||||.||..|||...||||..|.||||||||||.|.|||||| ||| .||||..|||||..||...|.||||.
Sbjct 2326 GTTTCCTCCAGCCGGGTAACGTCCCCACCCCTGAAGGCAACACTCCA-CCCTATCGGAACAGCCACAGCGAGAC 2398
Query 2279 TAGAGACAGATATAAAGCAACCAACAGTTCCTGCCTCTGGAGAAGAACTGGAAAATATAACTGACTTTAGCTCA 2352
.||.|.||||...||||.|||||||.|.||||||.||.|.||||||..|.|..|.||.|||||||||.||.|||
Sbjct 2399 CAGGGGCAGAACAAAAGGAACCAACTGCTCCTGCTTCAGAAGAAGAGTTTGGTACTACAACTGACTTCAGTTCA 2472
Query 2353 AG-CCCAACAAGAGAAACTGATCCTCTTGGGAAGCCAAGATTCAAAGGACCTCATGTGCGATACATCCAAAAGC 2425
|| ||||.||| ||||||||||||.|||||||||||.||.||||.|||.||.|||||||||||.||||.|||||
Sbjct 2473 AGTCCCACCAA-AGAAACTGATCCCCTTGGGAAGCCCAGGTTCATAGGTCCCCATGTGCGATATATCCCAAAGC 2545
Query 2426 CTGACAACAGTCCCTGCTCCATTACTGACTCTGTCAAACGGTTCCCCAAAGAGGAGGCCACAGAGGGGAATGCC 2499
||||.||||..|||||.|||||.||||||||.||||.|||||||||.|.||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 2546 CTGAAAACAAGCCCTGTTCCATCACTGACTCAGTCAGACGGTTCCCTACAGAGGAAGCCACGGAGGGGAATGCC 2619
Query 2500 ACCAGCCCACCACAGAACCCACCCACCAACCTCACTGTGGTCACCGTGGAAGGGTGCCCCTCATTTGTCATCTT 2573
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 2620 ACCAGCCCACCACAGAACCCACCCACCAACCTCACTGTGGTCACTGTCGAAGGCTGCCCCTCATTTGTCATCTT 2693
Query 2574 GGACTGGGAAAAGCCACTAAATGACACTGTCACTGAATATGAAGTTATATCCAGAGAAAATGGGTCATTCAGTG 2647
||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2694 GGACTGGGAAAAACCTCTAAATGACACTGTCACTGAATATGAAGTCATATCCAGAGAAAATGGGTCATTCAGTG 2767
Query 2648 GGAAGAACAAGTCCATTCAAATGACAAATCAGACATTTTCCACAGTAGAAAATCTGAAACCAAACACGAGTTAT 2721
||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||.|||||||||||.|||||||||.|.||.||.|||
Sbjct 2768 GGAAGAACAAGTCCATTCAAATTACCAATCAAACGTTCTCTACAGTAGAAAACCTGAAACCAGATACAAGCTAT 2841
Query 2722 GAATTCCAGGTGAAACCCAAAAACCCGCTTGGTGAAGGCCCGGTCAGCAACACAGTGGCATTCAGTACTGAATC 2795
|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|.|||||||||.||.||.||||||||||||||
Sbjct 2842 GAATTCCAGGTGAAACCCAAAAATCCACTTGGTGAGGGCCCCGCCAGCAACACGGTAGCGTTCAGTACTGAATC 2915
Query 2796 AGCGGACCCAAGAGTGAGTGAGCCAGTTTCTGCAGGAAGAGATGCCATCTGGACTGAAAGACCCTTTAATTCAG 2869
|||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 2916 AGCTGACCCAAGAGTGAGTGAGCCAATTTCTGCAGGAAGAGATGCCATCTGGACTGAAAGACCTTTTAACTCAG 2989
Query 2870 ACTCTTACTCAGAGTGTAAGGGCAAACAATATGTCAAAAGGACATGGTATAAAAAATTTGTAGGAGTGCAGCTG 2943
|||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 2990 ACTCTTACTCAGAATGCAAAGGCAAACAGTATGTTAAAAGGACGTGGTATAAAAAATTTGTCGGAGTGCAGCTA 3063
Query 2944 TGCAACTCTCTCAGATACAAGATTTACTTGAGCGACTCCCTCACAGGAAAATTTTATAACATAGGTGATCAGAG 3017
||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||
Sbjct 3064 TGTAACTCTCTCAGATACAAGATTTATTTGAGCGATTCCCTCACAGGCAAGTTTTACAACATAGGAGATCAGAG 3137
Query 3018 GGGCCATGGAGAAGATCACTGCCAGTTTGTGGATTCATTTTTAGATGGACGCACTGGGCAGCAACTCACTTCTG 3091
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||||
Sbjct 3138 GGGCCACGGAGAAGATCACTGCCAGTTTGTGGATTCATTTTTAGATGGTCGCACAGGACAGCAACTCACCTCTG 3211
Query 3092 ACCAGTTACCAATCAAAGAAGGTTATTTCAGAGCAGTTCGCCAGGAACCTGTCCAATTTGGAGAAATAGGTGGT 3165
|.||||||||.|.|||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3212 AACAGTTACCCACCAAAGAAGGCTATTTCAGAGCTGTTCGTCAGGAACCTGTCCAATTTGGAGAAATAGGTGGT 3285
Query 3166 CACACCCAAATCAATTATGTTCAGTGGTATGAATGTGGGACTACAATTCCTGGAAAATGG 3225
||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 3286 CATACCCAAATCAATTATGTCCAGTGGTATGAATGTGGGACCACAATACCTGGAAAATGG 3345