Protein Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07957
- Subject:
- NM_001349330.1
- Aligned Length:
- 1652
- Identities:
- 1075
- Gaps:
- 577
Alignment
Query 1 MRGGKCNMLSSLGCLLLCGSITLALGNAQKLPKGKRPNLKVHINTTSDSILLKFLRPSPNVKLEGLLLGYGSNV 74
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Sbjct 1 MRGGKCNMLSSLGCLLLCGSITLALGNAQKLPKGKRPNLKVHINTTSDSILLKFLRPSPNVKLEGLLLGYGSNV 74
Query 75 SPNQYFPLPAEGKFTEAIVDAEPKYLIVVRPAPPPSQKKSCSGKTRSRKPLQLVVGTLTPSSVFLSWGFLINPH 148
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Sbjct 75 SPNQYFPLPAEGKFTEAIVDAEPKYLIVVRPAPPPSQKKSCSGKTRSRKPLQLVVGTLTPSSVFLSWGFLINPH 148
Query 149 HDWTLPSHCPNDRFYTIRYREKDKEKKWIFQICPATETIVENLKPNTVYEFGVKDNVEGGIWSKIFNHKTVVGS 222
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Sbjct 149 HDWTLPSHCPNDRFYTIRYREKDKEKKWIFQICPATETIVENLKPNTVYEFGVKDNVEGGIWSKIFNHKTVVGS 222
Query 223 KKVNGKIQSTYDQDHTVPAYVPRKLIPITIIKQVIQNVTHKDSAKSPEKAPLGGVILVHLIIPGLNETTVKLPA 296
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Sbjct 223 KKVNGKIQSTYDQDHTVPAYVPRKLIPITIIKQVIQNVTHKDSAKSPEKAPLGGVILVHLIIPGLNETTVKLPA 296
Query 297 SLMFEISDALKTQLAKNETLALPAESKTPEVEKISARPTTVTPETVPRSTKPTTSSALDVSETTLASSEKPWIV 370
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Sbjct 297 SLMFEISDALKTQLAKNETLALPAESKTPEVEKISARPTTVTPETVPRSTKPTTSSALDVSETTLASSEKPWIV 370
Query 371 PTAKISEDSKVLQPQTATYDVFSSPTTSDEPEISDSYTATSDRILDSIPPKTSRTLEQPRATLAPSETPFVPQK 444
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Sbjct 371 PTAKISEDSKVLQPQTATYDVFSSPTTSDEPEISDSYTATSDRILDSIPPKTSRTLEQPRATLAPSETPFVPQK 444
Query 445 LEIFTSPEMQPTTPAPQQTTSIPSTPKRRPRPKPPRTKPERTTSAGTITPKISKSPEPTWTTPAPGKTQFISLK 518
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Sbjct 445 LEIFTSPEMQPTTPAPQQTTSIPSTPKRRPRPKPPRTKPERTTSAGTITPKISKSPEPTWTTPAPGKTQFISLK 518
Query 519 PKIPLSPEVTHTK------------------------------------------------------------- 531
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Sbjct 519 PKIPLSPEVTHTKPAPEPQTLLPSQSTIGPETPGTKPSTTLASKPSERPKTTHRPDAPQIQPVSEPVPFETEAP 592
Query 532 -------------------------------------------------------------------------- 531
Sbjct 593 SMTIVPTTDIEPVTVRTEATVTTLAPKTSQRTRTRRPRPKHKTTPRPETLQTKLDFGPITPGTSSAPTTTTKRT 666
Query 532 -------------------------------------------------------------------------- 531
Sbjct 667 RRPHPKPKTTPHPEVPQTKLVPATILEPVLRTEASGTTAAPKVPQRTHRPHPKPKTTLSPEELQTELVPATIFE 740
Query 532 -------------------------------------------------------------------------- 531
Sbjct 741 PVSPIKEAPGTTFATKTSKRTRPPRPRPKTTPSPQAPETKPVPATVLEPVTLRPEASTTLASKTSQRTRRPRLR 814
Query 532 -------------------------------------------------------------------------- 531
Sbjct 815 TKTTPRPEAPESKPVPTAELKPVTLRTETWVTTQAPKTSQRTRRPRPKTKTTPSPEVPQTKLVPSTDLEPGTLR 888
Query 532 -------------------------------------------------------------------------- 531
Sbjct 889 TEAPKTMVVTTVLEPDTFRTKFPETTLAPKTQRTRRPRPRPKTTSSPEVPQNKSVSVTGFEPVVHSTDAPGTTF 962
Query 532 -------------------------------------------------------------------------- 531
Sbjct 963 ALTELQTLILKPVTSPSLEMTESQPVSDVLESVTLSTESPKETIAPAKTDYVYPTAKAPLWPEEPKTEVVESIT 1036
Query 532 -------------------------------PAPKQTPRAPPKPKTSPRPRIPQTQPVPKVPQRVTAKPKTSPS 574
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Sbjct 1037 YVSEPPETTLETSPLPSQSITLPSPDEPQTEPAPKQTPRAPPKPKTSPRPRIPQTQPVPKVPQRVTAKPKTSPS 1110
Query 575 PEVSYTTPAPKDVLLPHKPYPEVSQSEP----------------APLETRGIPFIPMISPSPSQEELQTTLEET 632
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Sbjct 1111 PEVSYTTPAPKDVLLPHKPYPEVSQSEPVLQPVTFRFEPPKTTIAPLETRGIPFIPMISPSPSQEELQTTLEET 1184
Query 633 DQSTQEPFTTKIPRTTELAKTTQAPHRFYTTVRPRTSDKPHIRP-------------------------GVKQA 681
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Sbjct 1185 DQSTQEPFTTKIPRTTELAKTTQAPHRFYTTVRPRTSDKPHIRPVLNRTTTRPTRPKPSGMPSGNGVGTGVKQA 1258
Query 682 PRPSGADRNVSVDSTHPTKKPGTRRPPLPPRPTHPRRKPLPPNNVTGKPGSAGIISSGPITTPPLRSTPRPTGT 755
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Sbjct 1259 PRPSGADRNVSVDSTHPTKKPGTRRPPLPPRPTHPRRKPLPPNNVTGKPGSAGIISSGPITTPPLRSTPRPTGT 1332
Query 756 PLERIETDIKQPTVPASGEELENITDFSSSPTRETDPLGKPRFKGPHVRYIQKPDNSPCSITDSVKRFPKEEAT 829
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Sbjct 1333 PLERIETDIKQPTVPASGEELENITDFSSSPTRETDPLGKPRFKGPHVRYIQKPDNSPCSITDSVKRFPKEEAT 1406
Query 830 EGNATSPPQNPPTNLTVVTVEGCPSFVILDWEKPLNDTVTEYEVISRENGSFSGKNKSIQMTNQTFSTVENLKP 903
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Sbjct 1407 EGNATSPPQNPPTNLTVVTVEGCPSFVILDWEKPLNDTVTEYEVISRENGSFSGKNKSIQMTNQTFSTVENLKP 1480
Query 904 NTSYEFQVKPKNPLGEGPVSNTVAFSTESADPRVSEPVSAGRDAIWTERPFNSDSYSECKGKQYVKRTWYKKFV 977
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Sbjct 1481 NTSYEFQVKPKNPLGEGPVSNTVAFSTESADPRVSEPVSAGRDAIWTERPFNSDSYSECKGKQYVKRTWYKKFV 1554
Query 978 GVQLCNSLRYKIYLSDSLTGKFYNIGDQRGHGEDHCQFVDSFLDGRTGQQLTSDQLPIKEGYFRAVRQEPVQFG 1051
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Sbjct 1555 GVQLCNSLRYKIYLSDSLTGKFYNIGDQRGHGEDHCQFVDSFLDGRTGQQLTSDQLPIKEGYFRAVRQEPVQFG 1628
Query 1052 EIGGHTQINYVQWYECGTTIPGKW 1075
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Sbjct 1629 EIGGHTQINYVQWYECGTTIPGKW 1652
