Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07957
• Subject: NM_001349332.1
• Aligned Length: 1100
• Identities: 1075
• Gaps: 25

Alignment

Query    1  MRGGKCNMLSSLGCLLLCGSITLALGNAQKLPKGKRPNLKVHINTTSDSILLKFLRPSPNVKLEGLLLGYGSNV  74
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Sbjct    1  MRGGKCNMLSSLGCLLLCGSITLALGNAQKLPKGKRPNLKVHINTTSDSILLKFLRPSPNVKLEGLLLGYGSNV  74

Query   75  SPNQYFPLPAEGKFTEAIVDAEPKYLIVVRPAPPPSQKKSCSGKTRSRKPLQLVVGTLTPSSVFLSWGFLINPH  148
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Sbjct   75  SPNQYFPLPAEGKFTEAIVDAEPKYLIVVRPAPPPSQKKSCSGKTRSRKPLQLVVGTLTPSSVFLSWGFLINPH  148

Query  149  HDWTLPSHCPNDRFYTIRYREKDKEKKWIFQICPATETIVENLKPNTVYEFGVKDNVEGGIWSKIFNHKTVVGS  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  HDWTLPSHCPNDRFYTIRYREKDKEKKWIFQICPATETIVENLKPNTVYEFGVKDNVEGGIWSKIFNHKTVVGS  222

Query  223  KKVNGKIQSTYDQDHTVPAYVPRKLIPITIIKQVIQNVTHKDSAKSPEKAPLGGVILVHLIIPGLNETTVKLPA  296
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Sbjct  223  KKVNGKIQSTYDQDHTVPAYVPRKLIPITIIKQVIQNVTHKDSAKSPEKAPLGGVILVHLIIPGLNETTVKLPA  296

Query  297  SLMFEISDALKTQLAKNETLALPAESKTPEVEKISARPTTVTPETVPRSTKPTTSSALDVSETTLASSEKPWIV  370
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Sbjct  297  SLMFEISDALKTQLAKNETLALPAESKTPEVEKISARPTTVTPETVPRSTKPTTSSALDVSETTLASSEKPWIV  370

Query  371  PTAKISEDSKVLQPQTATYDVFSSPTTSDEPEISDSYTATSDRILDSIPPKTSRTLEQPRATLAPSETPFVPQK  444
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Sbjct  371  PTAKISEDSKVLQPQTATYDVFSSPTTSDEPEISDSYTATSDRILDSIPPKTSRTLEQPRATLAPSETPFVPQK  444

Query  445  LEIFTSPEMQPTTPAPQQTTSIPSTPKRRPRPKPPRTKPERTTSAGTITPKISKSPEPTWTTPAPGKTQFISLK  518
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Sbjct  445  LEIFTSPEMQPTTPAPQQTTSIPSTPKRRPRPKPPRTKPERTTSAGTITPKISKSPEPTWTTPAPGKTQFISLK  518

Query  519  PKIPLSPEVTHTKPAPKQTPRAPPKPKTSPRPRIPQTQPVPKVPQRVTAKPKTSPSPEVSYTTPAPKDVLLPHK  592
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Sbjct  519  PKIPLSPEVTHTKPAPKQTPRAPPKPKTSPRPRIPQTQPVPKVPQRVTAKPKTSPSPEVSYTTPAPKDVLLPHK  592

Query  593  PYPEVSQSEPAPLETRGIPFIPMISPSPSQEELQTTLEETDQSTQEPFTTKIPRTTELAKTTQAPHRFYTTVRP  666
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Sbjct  593  PYPEVSQSEPAPLETRGIPFIPMISPSPSQEELQTTLEETDQSTQEPFTTKIPRTTELAKTTQAPHRFYTTVRP  666

Query  667  RTSDKPHIRP-------------------------GVKQAPRPSGADRNVSVDSTHPTKKPGTRRPPLPPRPTH  715
            ||||||||||                         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  RTSDKPHIRPVLNRTTTRPTRPKPSGMPSGNGVGTGVKQAPRPSGADRNVSVDSTHPTKKPGTRRPPLPPRPTH  740

Query  716  PRRKPLPPNNVTGKPGSAGIISSGPITTPPLRSTPRPTGTPLERIETDIKQPTVPASGEELENITDFSSSPTRE  789
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Sbjct  741  PRRKPLPPNNVTGKPGSAGIISSGPITTPPLRSTPRPTGTPLERIETDIKQPTVPASGEELENITDFSSSPTRE  814

Query  790  TDPLGKPRFKGPHVRYIQKPDNSPCSITDSVKRFPKEEATEGNATSPPQNPPTNLTVVTVEGCPSFVILDWEKP  863
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Sbjct  815  TDPLGKPRFKGPHVRYIQKPDNSPCSITDSVKRFPKEEATEGNATSPPQNPPTNLTVVTVEGCPSFVILDWEKP  888

Query  864  LNDTVTEYEVISRENGSFSGKNKSIQMTNQTFSTVENLKPNTSYEFQVKPKNPLGEGPVSNTVAFSTESADPRV  937
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Sbjct  889  LNDTVTEYEVISRENGSFSGKNKSIQMTNQTFSTVENLKPNTSYEFQVKPKNPLGEGPVSNTVAFSTESADPRV  962

Query  938  SEPVSAGRDAIWTERPFNSDSYSECKGKQYVKRTWYKKFVGVQLCNSLRYKIYLSDSLTGKFYNIGDQRGHGED  1011
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Sbjct  963  SEPVSAGRDAIWTERPFNSDSYSECKGKQYVKRTWYKKFVGVQLCNSLRYKIYLSDSLTGKFYNIGDQRGHGED  1036

Query 1012  HCQFVDSFLDGRTGQQLTSDQLPIKEGYFRAVRQEPVQFGEIGGHTQINYVQWYECGTTIPGKW  1075
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Sbjct 1037  HCQFVDSFLDGRTGQQLTSDQLPIKEGYFRAVRQEPVQFGEIGGHTQINYVQWYECGTTIPGKW  1100