Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_07957
Subject:
XM_006522251.1
Aligned Length:
1649
Identities:
870
Gaps:
585

Alignment

Query    1  MRGGKCNMLSSLGCLLLCGSITLALGNAQKLPKGKRPNLKVHINTTSDSILLKFLRPSPNVKLEGLLLGYGSNV  74
                   ||||||||||||||.|||||||||||||.|.|||||||||||||||||||..||||||.||||||||
Sbjct    1  -------MLSSLGCLLLCGSIALALGNAQKLPKGKKPSLKVHINTTSDSILLKFLRPNANVKLEGFLLGYGSNV  67

Query   75  SPNQYFPLPAEGKFTEAIVDAEPKYLIVVRPAPPPSQKKSCSGKTRSRKPLQLVVGTLTPSSVFLSWGFLINPH  148
            |||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   68  SPNQYFPLPTEGKFTEAVVDAEPKYLIVVRPAPPPSQKKSCSGKSRPRKPLQLVVGTLTPSSVFLSWGFLINPH  141

Query  149  HDWTLPSHCPNDRFYTIRYREKDKEKKWIFQICPATETIVENLKPNTVYEFGVKDNVEGGIWSKIFNHKTVVGS  222
            ||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||
Sbjct  142  HDWTLPSHCPSDRFYTIRYREKDKEKKWIFQLCPATETIVENLKPNTVYEFGVKDNIEGGIWSKIFNHKTIVGS  215

Query  223  K-KVNGKIQSTYDQDHTVPAYVPRKLIPITIIKQVIQNVTHKDSAKSPEKAPLGGVILVHLIIPGLNETTVKLP  295
            | ||||||||||||.|.||  |||||||.||||||||||||..|.|||.|.|.||.||||||||||||.|||||
Sbjct  216  KNKVNGKIQSTYDQVHSVP--VPRKLIPLTIIKQVIQNVTHRASTKSPDKTPFGGTILVHLIIPGLNESTVKLP  287

Query  296  ASLMFEISDALKTQLAKNETLALPAESKTPEVEKISARPTTVTPETVPRSTKPTTSSALDVSETTL--------  361
            .|.|.|||||||.|||||||||||||||||||||....|.|||||.|.||||||.|||||..||.|        
Sbjct  288  TSIMLEISDALKAQLAKNETLALPAESKTPEVEKLAGQPVTVTPESVSRSTKPTLSSALDTAETALVLSEKTSE  361

Query  362  -----------------------------------------ASSEKPWIVPTAKISEDSKVLQPQTATYDVFSS  394
                                                     ||||.||.||.||.||||.|.|||||||||.||
Sbjct  362  TARSVLIPEFELPLSTLAPKRFPEFPEAKTAFPLEKPRGSWASSEEPWVVPGAKTSEDSRVVQPQTATYDVISS  435

Query  395  PTTSDEPEISDSYTATSDRILDSIPPKTSRTLEQPRATLAPSETPFVPQKLEIFTSPEMQPTTPAPQQTTSIPS  468
            .|||||.|| ...|||.|.||||.|||||||.|||||||||.|..|.....|||||||..|||.||||||||||
Sbjct  436  STTSDETEI-EIHTATRDPILDSVPPKTSRTAEQPRATLAPIEALFESRNVEIFTSPEVRPTTAAPQQTTSIPS  508

Query  469  TPKRRPRPKPPRTKP---------ERTTSA--------------------------------GTITPKI-----  496
            ||||...|||||.||         ..||.|                                .|.||.|     
Sbjct  509  TPKRQSTPKPPRVKPAPEPETRPSAQTTKAPRKTKKPGHHRLRRPKTTRSPEVPKSKPALEPATVTPEILVPKI  582

Query  497  -----------------------------SKSP-----------------------------------------  500
                                         |..|                                         
Sbjct  583  VPKPPQKPKATRRPEVPQVKPAHEPVTFGSEAPALAIVTTTDIEPVITRTKASVTTLAPKPPRPRTHRQRTKYK  656

Query  501  ---------------------------------------------------------EPTWTTPAPGKT-----  512
                                                                     ||...|.|||.|     
Sbjct  657  TTQSPKIPHSKPADLGPITSEPPLASTTKKVRRPRPKPQTTPHPEVPHTILVPATSLEPFIITEAPGTTLVPKL  730

Query  513  --------------------------------------------------------------------------  512
                                                                                      
Sbjct  731  PQQPDYPHPKPKTTRSPAASPTELVPTPVFEPVTPLKEDPVTTIVPITDLERVTDLETPVAFRTEAPGTTLASK  804

Query  513  -----------------------------------------QFISLKPKIPL----------------------  523
                                                     ....|.|....                      
Sbjct  805  ISQRTHRPRPRPRPRPRPRPRPKATLSPQAPETKTVPAVVLEPVTLRPEVQVTTLAPQKTQKKHRPSPKPKPVP  878

Query  524  SPEVTHTKP-----------------------APKQTPRAPPKPKTSPRP------------------------  550
            |||||..||                       .||.|.|..|||.|.|.|                        
Sbjct  879  SPEVTESKPVLPRVREPVTLRTETWVTTKAPKTPKRTRRPRPKPQTTPTPETPLTKPVAATDLEPSALSTEVPA  952

Query  551  --------------------------------------------------------------------------  550
                                                                                      
Sbjct  953  TVVLATALTPVTLRTKAPKTTTLAPNVQRTRRPHPRPKTTASTGVSESKSAPTELQSLVLKPVTSPSLEIIQSQ  1026

Query  551  -------------------------------------RIPQTQPVPKVPQRVTAKPKTSPSPEVSYTTPAPKDV  587
                                                 |.|...||||.|...|.|||..|||||..||..|||.
Sbjct 1027  SVSDDLELVAFSTESPQKTIAPRQTTSMPPKLKTPHSRMPAKEPVPKEPLHTTSKPKMPPSPEVADTTSVPKDE  1100

Query  588  LLPHKPYPEVSQSEP----------------APLETRGIPFIPMISPSPSQEELQTTLEETDQSTQEPFTTKIP  645
            .|..||.|||..||.                |||||||||.||.|||.||||||||..|||||||||.||||||
Sbjct 1101  RLSLKPDPEVTHSETVLPPVTFRVEPPKTTIAPLETRGIPLIPVISPRPSQEELQTAMEETDQSTQELFTTKIP  1174

Query  646  RTTELAKTTQAPHRFYTT-VRPRTSDKPHIRP-------------------------GVKQAPRPSGADRNVSV  693
            ||||||||||||||..|. ||||....||.||                         |.||||.|....||.||
Sbjct 1175  RTTELAKTTQAPHRLHTAPVRPRIPGRPHGRPALNKTTTRPDKTKPRGTSHKNGVGTGTKQAPKPPSPGRNASV  1248

Query  694  DSTHPTKKP----GTRRPPLP-----PRPTHPRRKPLPPNNVTGKPGSAGIISSGPITTPPLRSTPRPTGTPLE  758
            || |.|.||    ||||||.|     .||..|.|.||||||||||||.|||.||...|.|||..|..|.||...
Sbjct 1249  DS-HATRKPGSVSGTRRPPIPHRHSSTRPVSPERRPLPPNNVTGKPGRAGIVSSSRVTSPPLKATLHPIGTATA  1321

Query  759  RIETDIKQPTVPASGEELENITDFSSSPTRETDPLGKPRFKGPHVRYIQKPDNSPCSITDSVKRFPKEEATEGN  832
            |.....|.||.|||.||....||||||||.||||||||||.|||||||.||.|.||||||||.|||.|||||||
Sbjct 1322  RPGAEQKEPTAPASEEEFGTTTDFSSSPTKETDPLGKPRFIGPHVRYIPKPENKPCSITDSVRRFPTEEATEGN  1395

Query  833  ATSPPQNPPTNLTVVTVEGCPSFVILDWEKPLNDTVTEYEVISRENGSFSGKNKSIQMTNQTFSTVENLKPNTS  906
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||
Sbjct 1396  ATSPPQNPPTNLTVVTVEGCPSFVILDWEKPLNDTVTEYEVISRENGSFSGKNKSIQITNQTFSTVENLKPDTS  1469

Query  907  YEFQVKPKNPLGEGPVSNTVAFSTESADPRVSEPVSAGRDAIWTERPFNSDSYSECKGKQYVKRTWYKKFVGVQ  980
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1470  YEFQVKPKNPLGEGPASNTVAFSTESADPRVSEPISAGRDAIWTERPFNSDSYSECKGKQYVKRTWYKKFVGVQ  1543

Query  981  LCNSLRYKIYLSDSLTGKFYNIGDQRGHGEDHCQFVDSFLDGRTGQQLTSDQLPIKEGYFRAVRQEPVQFGEIG  1054
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1544  LCNSLRYKIYLSDSLTGKFYNIGDQRGHGEDHCQFVDSFLDGRTGQQLTSEQLPTKEGYFRAVRQEPVQFGEIG  1617

Query 1055  GHTQINYVQWYECGTTIPGKW  1075
            |||||||||||||||||||||
Sbjct 1618  GHTQINYVQWYECGTTIPGKW  1638