Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07957
• Subject: XM_006522274.1
• Aligned Length: 1491
• Identities: 870
• Gaps: 428

Alignment

Query    1  MRGGKCNMLSSLGCLLLCGSITLALGNAQKLPKGKRPNLKVHINTTSDSILLKFLRPSPNVKLEGLLLGYGSNV  74
                   ||||||||||||||.|||||||||||||.|.|||||||||||||||||||..||||||.||||||||
Sbjct    1  -------MLSSLGCLLLCGSIALALGNAQKLPKGKKPSLKVHINTTSDSILLKFLRPNANVKLEGFLLGYGSNV  67

Query   75  SPNQYFPLPAEGKFTEAIVDAEPKYLIVVRPAPPPSQKKSCSGKTRSRKPLQLVVGTLTPSSVFLSWGFLINPH  148
            |||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   68  SPNQYFPLPTEGKFTEAVVDAEPKYLIVVRPAPPPSQKKSCSGKSRPRKPLQLVVGTLTPSSVFLSWGFLINPH  141

Query  149  HDWTLPSHCPNDRFYTIRYREKDKEKKWIFQICPATETIVENLKPNTVYEFGVKDNVEGGIWSKIFNHKTVVGS  222
            ||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||
Sbjct  142  HDWTLPSHCPSDRFYTIRYREKDKEKKWIFQLCPATETIVENLKPNTVYEFGVKDNIEGGIWSKIFNHKTIVGS  215

Query  223  K-KVNGKIQSTYDQDHTVPAYVPRKLIPITIIKQVIQNVTHKDSAKSPEKAPLGGVILVHLIIPGLNETTVKLP  295
            | ||||||||||||.|.||  |||||||.||||||||||||..|.|||.|.|.||.||||||||||||.|||||
Sbjct  216  KNKVNGKIQSTYDQVHSVP--VPRKLIPLTIIKQVIQNVTHRASTKSPDKTPFGGTILVHLIIPGLNESTVKLP  287

Query  296  ASLMFEISDALKTQLAKNETLALPAESKTPEVEKISARPTTVTPETVPRSTKPTTSSALDVSETTL--------  361
            .|.|.|||||||.|||||||||||||||||||||....|.|||||.|.||||||.|||||..||.|        
Sbjct  288  TSIMLEISDALKAQLAKNETLALPAESKTPEVEKLAGQPVTVTPESVSRSTKPTLSSALDTAETALVLSEKTSE  361

Query  362  -----------------------------------------ASSEKPWIVPTAKISEDSKVLQPQTATYDVFSS  394
                                                     ||||.||.||.||.||||.|.|||||||||.||
Sbjct  362  TARSVLIPEFELPLSTLAPKRFPEFPEAKTAFPLEKPRGSWASSEEPWVVPGAKTSEDSRVVQPQTATYDVISS  435

Query  395  PTTSDEPEISDSYTATSDRILDSIPPKTSRTLEQPRATLAPSETPFVPQKLEIFTSPEMQPTTPAPQQTTSIPS  468
            .|||||.|| ...|||.|.||||.|||||||.|||||||||.|..|.....|||||||..|||.||||||||||
Sbjct  436  STTSDETEI-EIHTATRDPILDSVPPKTSRTAEQPRATLAPIEALFESRNVEIFTSPEVRPTTAAPQQTTSIPS  508

Query  469  TPKRRPRPKPPRTKP---------ERTTSA--------------------------------GTITPKI-----  496
            ||||...|||||.||         ..||.|                                .|.||.|     
Sbjct  509  TPKRQSTPKPPRVKPAPEPETRPSAQTTKAPRKTKKPGHHRLRRPKTTRSPEVPKSKPALEPATVTPEILVPKI  582

Query  497  -----------------------------SKSP-----------------------------------------  500
                                         |..|                                         
Sbjct  583  VPKPPQKPKATRRPEVPQVKPAHEPVTFGSEAPALAIVTTTDIEPVITRTKASVTTLAPKPPRPRTHRQRTKYK  656

Query  501  ---------------------------------------------------------EPTWTTPAPGKT-----  512
                                                                     ||...|.|||.|     
Sbjct  657  TTQSPKIPHSKPADLGPITSEPPLASTTKKVRRPRPKPQTTPHPEVPHTILVPATSLEPFIITEAPGTTLVPKL  730

Query  513  --------------------------------------------------------------------------  512
                                                                                      
Sbjct  731  PQQPDYPHPKPKTTRSPAASPTELVPTPVFEPVTPLKEDPVTTIVPITDLERVTDLETPVAFRTEAPGTTLASK  804

Query  513  -----------------------------------------QFISLKPKIPL----------------------  523
                                                     ....|.|....                      
Sbjct  805  ISQRTHRPRPRPRPRPRPRPRPKATLSPQAPETKTVPAVVLEPVTLRPEVQVTTLAPQKTQKKHRPSPKPKPVP  878

Query  524  SPEVTHTKPAPKQTPRAPPKPKTSPRPRIPQTQPVPKVPQRVTAKPKTSPSPEVSYTTPAPKDVLLPHKPYPEV  597
            |||||..||||.||...|||.|| |..|.|...||||.|...|.|||..|||||..||..|||..|..||.|||
Sbjct  879  SPEVTESKPAPRQTTSMPPKLKT-PHSRMPAKEPVPKEPLHTTSKPKMPPSPEVADTTSVPKDERLSLKPDPEV  951

Query  598  SQSEP----------------APLETRGIPFIPMISPSPSQEELQTTLEETDQSTQEPFTTKIPRTTELAKTTQ  655
            ..||.                |||||||||.||.|||.||||||||..|||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  952  THSETVLPPVTFRVEPPKTTIAPLETRGIPLIPVISPRPSQEELQTAMEETDQSTQELFTTKIPRTTELAKTTQ  1025

Query  656  APHRFYTT-VRPRTSDKPHIRP-------------------------GVKQAPRPSGADRNVSVDSTHPTKKP-  702
            ||||..|. ||||....||.||                         |.||||.|....||.|||| |.|.|| 
Sbjct 1026  APHRLHTAPVRPRIPGRPHGRPALNKTTTRPDKTKPRGTSHKNGVGTGTKQAPKPPSPGRNASVDS-HATRKPG  1098

Query  703  ---GTRRPPLP-----PRPTHPRRKPLPPNNVTGKPGSAGIISSGPITTPPLRSTPRPTGTPLERIETDIKQPT  768
               ||||||.|     .||..|.|.||||||||||||.|||.||...|.|||..|..|.||...|.....|.||
Sbjct 1099  SVSGTRRPPIPHRHSSTRPVSPERRPLPPNNVTGKPGRAGIVSSSRVTSPPLKATLHPIGTATARPGAEQKEPT  1172

Query  769  VPASGEELENITDFSSSPTRETDPLGKPRFKGPHVRYIQKPDNSPCSITDSVKRFPKEEATEGNATSPPQNPPT  842
            .|||.||....||||||||.||||||||||.|||||||.||.|.||||||||.|||.|||||||||||||||||
Sbjct 1173  APASEEEFGTTTDFSSSPTKETDPLGKPRFIGPHVRYIPKPENKPCSITDSVRRFPTEEATEGNATSPPQNPPT  1246

Query  843  NLTVVTVEGCPSFVILDWEKPLNDTVTEYEVISRENGSFSGKNKSIQMTNQTFSTVENLKPNTSYEFQVKPKNP  916
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1247  NLTVVTVEGCPSFVILDWEKPLNDTVTEYEVISRENGSFSGKNKSIQITNQTFSTVENLKPDTSYEFQVKPKNP  1320

Query  917  LGEGPVSNTVAFSTESADPRVSEPVSAGRDAIWTERPFNSDSYSECKGKQYVKRTWYKKFVGVQLCNSLRYKIY  990
            |||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321  LGEGPASNTVAFSTESADPRVSEPISAGRDAIWTERPFNSDSYSECKGKQYVKRTWYKKFVGVQLCNSLRYKIY  1394

Query  991  LSDSLTGKFYNIGDQRGHGEDHCQFVDSFLDGRTGQQLTSDQLPIKEGYFRAVRQEPVQFGEIGGHTQINYVQW  1064
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1395  LSDSLTGKFYNIGDQRGHGEDHCQFVDSFLDGRTGQQLTSEQLPTKEGYFRAVRQEPVQFGEIGGHTQINYVQW  1468

Query 1065  YECGTTIPGKW  1075
            |||||||||||
Sbjct 1469  YECGTTIPGKW  1479