Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_07957
Subject:
XM_006522282.1
Aligned Length:
3538
Identities:
2659
Gaps:
464

Alignment

Query    1  ATGCGAGGTGGCAAATGCAACATGCTCTCCAGTTTGGGGTGTCTACTTCTCTGTGGAAGTATTACACTAGCCCT  74
                                 |||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||.||||.||.||
Sbjct    1  ---------------------ATGCTCTCCAGCCTGGGGTGTCTACTTCTCTGTGGAAGTATTGCACTTGCTCT  53

Query   75  GGGAAATGCACAGAAATTGCCAAAAGGTAAAAGGCCAAACCTCAAAGTCCACATCAATACCACAAGTGACTCCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|.|.|||||.||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct   54  GGGAAATGCACAGAAATTGCCAAAAGGTAAAAAGCCAAGCTTGAAAGTGCACATCAATACCACCAGCGACTCCA  127

Query  149  TCCTCTTGAAGTTCTTGCGTCCAAGTCCAAATGTAAAGCTTGAAGGTCTTCTCCTGGGATATGGCAGCAATGTA  222
            ||||||||||||||.|||||||||.|.||||.||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  128  TCCTCTTGAAGTTCCTGCGTCCAAATGCAAACGTAAAGCTGGAAGGTTTTCTCCTGGGATATGGCAGCAATGTG  201

Query  223  TCACCAAACCAGTACTTCCCTCTTCCCGCTGAAGGGAAATTCACAGAAGCTATAGTTGATGCAGAGCCGAAATA  296
            ||.||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||.||
Sbjct  202  TCTCCAAACCAGTACTTCCCTCTTCCCACAGAAGGGAAATTCACAGAGGCTGTAGTTGATGCAGAGCCGAAGTA  275

Query  297  TCTGATAGTTGTGCGACCTGCTCCACCTCCAAGTCAAAAGAAGTCATGTTCAGGTAAAACTCGTTCTCGCAAAC  370
            |||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.|||.||||..|||||||||
Sbjct  276  TCTGATAGTCGTACGACCTGCTCCTCCTCCCAGCCAGAAGAAGTCATGTTCAGGGAAATCTCGCCCTCGCAAAC  349

Query  371  CTCTGCAGCTGGTGGTTGGCACTCTGACACCGAGCTCAGTCTTCCTGTCCTGGGGTTTCCTCATCAACCCACAC  444
            |.||.|||||||||||.||.||..||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  350  CCCTCCAGCTGGTGGTGGGTACGTTGACACCGAGTTCTGTCTTCCTGTCCTGGGGATTCCTCATCAACCCACAC  423

Query  445  CATGACTGGACATTGCCAAGTCACTGTCCCAATGACAGATTTTATACAATTCGCTATCGAGAAAAGGATAAAGA  518
            ||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||.|||||||.||||||||
Sbjct  424  CATGACTGGACATTGCCAAGCCACTGTCCCAGTGACAGATTTTATACAATTCGATATAGAGAAAAAGATAAAGA  497

Query  519  AAAGAAGTGGATTTTTCAAATCTGTCCAGCCACTGAAACAATTGTGGAAAACCTAAAGCCCAACACAGTTTATG  592
            ||||||.||||||||||||.||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  498  AAAGAAATGGATTTTTCAACTCTGCCCAGCTACTGAAACAATTGTGGAAAATCTAAAGCCCAACACAGTTTATG  571

Query  593  AATTTGGAGTGAAAGACAATGTGGAAGGTGGAATTTGGAGTAAGATTTTCAATCACAAGACTGTTGTTGGAAGT  666
            |||||||.||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||
Sbjct  572  AATTTGGTGTGAAAGACAATATAGAAGGTGGAATTTGGAGTAAGATTTTCAATCATAAGACTATTGTTGGAAGT  645

Query  667  AAA---AAAGTAAATGGGAAAATCCAAAGTACCTATGACCAAGACCACACAGTGCCAGCATATGTCCCAAGGAA  737
            |||   ||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|.||||.||||||||      |||||.|||||
Sbjct  646  AAAAACAAAGTAAACGGGAAAATCCAAAGCACTTATGACCAGGTCCACTCAGTGCCA------GTCCCGAGGAA  713

Query  738  ACTAATCCCAATAACAATCATCAAGCAAGTGATTCAGAATGTTACTCACAAGGATTCAGCTAAATCCCCAGAAA  811
            .|||||||||.||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||.||.||||.|.|||||||||||.|
Sbjct  714  GCTAATCCCACTAACGATCATTAAGCAAGTGATTCAGAATGTTACTCACAGGGCTTCAACCAAATCCCCAGACA  787

Query  812  AAGCTCCACTGGGAGGAGTGATACTAGTCCACCTTATTATTCCAGGTCTTAATGAAACTACTGTAAAACTTCCT  885
            |..||||..|.||.|||...|||.||||.||.||.||||||||.||||||||||||.|.||||||||||||||.
Sbjct  788  AGACTCCTTTTGGGGGAACAATATTAGTTCATCTGATTATTCCGGGTCTTAATGAATCCACTGTAAAACTTCCC  861

Query  886  GCATCCCTAATGTTTGAGATTTCAGATGCACTCAAGACACAATTAGCTAAGAATGAAACCTTGGCATTACCTGC  959
            .|||||.|||||.||||||||||.|||||.||||||.||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||
Sbjct  862  ACATCCATAATGCTTGAGATTTCCGATGCTCTCAAGGCACAATTAGCTAAGAATGAAACATTGGCTTTACCAGC  935

Query  960  CGAATCTAAAACACCAGAGGTTGAAAAAATCTCAGCACGACCCA-CAACAGTGACTCCTGAAACAGTTCCAAGA  1032
            .||||||||||||||||||||.||||||.|..|||..| |.||| .||||||||||||.|||.|||||.|||||
Sbjct  936  AGAATCTAAAACACCAGAGGTCGAAAAATTGGCAGGGC-AGCCAGTAACAGTGACTCCGGAATCAGTTTCAAGA  1008

Query 1033  AGCACTAAACCCACTACGTCTAGTGCATTAGA-----------------TGTT----------------TCAGA  1073
            ||||||||.|||||...|||||||||.|||||                 ||.|                |||||
Sbjct 1009  AGCACTAAGCCCACCCTGTCTAGTGCTTTAGACACTGCAGAGACAGCACTGGTCCTCAGTGAGAAGACGTCAGA  1082

Query 1074  AAC----------------------------------------AACACT-------------------------  1082
            |||                                        |.||||                         
Sbjct 1083  AACAGCCCGCTCTGTTCTAATACCTGAGTTTGAATTGCCCTTGAGCACTTTAGCTCCAAAAAGGTTCCCAGAGT  1156

Query 1083  -------------------------------------------------GGCTTCAAGTGAAAAGCCATGGATT  1107
                                                             ||||||||||||..||||||||.|.
Sbjct 1157  TTCCTGAGGCAAAAACAGCCTTCCCATTGGAGAAACCTAGGGGTTCCTGGGCTTCAAGTGAGGAGCCATGGGTG  1230

Query 1108  GTGCCTACAGCTAAAATATCTGAAGATTCCAAAGTTCTGCAGCCTCAAACTGCAACTTATGATGTTTTCTCAAG  1181
            ||.|||..||||||||.||||||||||||||.|||..|.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1231  GTACCTGGAGCTAAAACATCTGAAGATTCCAGAGTCGTACAGCCTCAAACTGCAACTTATGATGTTATCTCAAG  1304

Query 1182  CCCTACAACATCAGATGAGCCTGAGATATCAGATTCCTACACAGCAACAAGTGATCGTATTCTGGATTCTATCC  1255
            |.|.|||||.||.||||||.||||.||| .||||||  |||||||||||||.||||.|||||||||.|||.|||
Sbjct 1305  CTCAACAACTTCTGATGAGACTGAAATA-GAGATTC--ACACAGCAACAAGAGATCCTATTCTGGACTCTGTCC  1375

Query 1256  CACCTAAAACTTCTAGAACTCTTGAACAGCCAAGGGCAACACTGGCTCCAAGTGAAACACCATTTG-TTCCTCA  1328
            ||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||..|||.|...||||| .||| |.
Sbjct 1376  CACCTAAAACTTCTAGAACTGCTGAACAGCCAAGGGCAACACTGGCTCCAATCGAAGCGTTATTTGAATCC-CG  1448

Query 1329  AAAACTGGAAATCTTTACCAGTCCAGAAATGCAGCCTACGACACCTGCTCCCCAGCAAACTACATCTATCCCTT  1402
            |||..||||||||||.||||||||.|||.|||..|||||.||..|||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1449  AAATGTGGAAATCTTCACCAGTCCTGAAGTGCGACCTACAACGGCTGCTCCTCAGCAAACTACATCTATCCCTT  1522

Query 1403  CTACACCTAAACGACGCCCCCGGCCCAAACCGCCAAGAACCAAACCTGAAAGAACCACAAGTGCCGGAACAATT  1476
            |.|||||.|||||||...|....|||||||||||||||..|||.||||                          
Sbjct 1523  CCACACCCAAACGACAATCAACACCCAAACCGCCAAGAGTCAAGCCTG--------------------------  1570

Query 1477  ACACCTAAAATTTCTAAAAGCCCTGAACCTACATGGACAACACCGGCTCCCGGTAAAACACAATTTATTTCTCT  1550
                               .|||.||||||     ||       |.|||                         
Sbjct 1571  -------------------CCCCAGAACCT-----GA-------GACTC-------------------------  1588

Query 1551  GAAACCTAAAATCCCTCTCAGCCCAGAAGTGACACACACCAAACCTGCTCCCAAGCAGAC-ACCA-CGTGCTCC  1622
            ||          ||.|||  ||||||         |||.||||  .||.||||.|||||| |||| |.||  ||
Sbjct 1589  GA----------CCATCT--GCCCAG---------ACAACAAA--GGCACCCAGGCAGACAACCAGCATG--CC  1637

Query 1623  TCCTAAGC-CAAAAACATCACCACGCCCAAGAATCCCA-CAAACACAACCAGTTCCTAAGGTGCCCCAGCGTGT  1694
            |||.|||| |||||    ||||||.|.||||.||.||| |||| |.|.|||||||||||||..||||.||.|..
Sbjct 1638  TCCCAAGCTCAAAA----CACCACACTCAAGGATGCCAGCAAA-AGAGCCAGTTCCTAAGGAACCCCTGCATAC  1706

Query 1695  TACTGCAAAACCAAAAACGTCACCAAGTCCAGAAGTGTCATACACCACACCTGCTCCAAAAGATGTGCTCCTTC  1768
            .|||.||||.|||||||.|.||||||||||.||||||.||.||||.|||.|||.|||||||||||..|..|||.
Sbjct 1707  GACTTCAAAGCCAAAAATGCCACCAAGTCCTGAAGTGGCAGACACTACATCTGTTCCAAAAGATGAACGACTTT  1780

Query 1769  CTCATAAACCATACCCTGAGGTCTCTCAGAGCGAACCT------------------------------------  1806
            |.|.|||||||.|.||.||||||.||||.||.|||.||                                    
Sbjct 1781  CCCTTAAACCAGATCCAGAGGTCACTCACAGTGAAACTGTTCTGCCTCCTGTCACCTTTAGAGTTGAGCCACCA  1854

Query 1807  ------------GCTCCTCTAGAGACACGAGGCATCCCTTTTATACCCATGATTTCCCCAAGTCCTAGTCAAGA  1868
                        ||.|||.||||||||||.|||||.|||.|.|||||..|||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1855  AAGACAACAATAGCACCTTTAGAGACACGGGGCATTCCTCTCATACCTGTGATTTCACCAAGACCTAGTCAAGA  1928

Query 1869  GGAACTACAGACCACTCTGGAAGAAACAGACCAATCCACCCAAGAACCTTTCACAACTAAGATTCCACGAACAA  1942
            |||||||||.|||.|..||||||||||||||||.||.||||||||.|..|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1929  GGAACTACAAACCGCCATGGAAGAAACAGACCAGTCTACCCAAGAGCTCTTCACGACTAAGATTCCACGAACAA  2002

Query 1943  CTGAACTAGCAAAGACAACTCAGGCGCCACACAGATTTTATA---CTACTGTGAGGCCCAGAACATCTGACAAG  2013
            |||||.|.|||||||||||||||||.|||||||||||..|||   ||.|||||||||||||||.|.|||.||.|
Sbjct 2003  CTGAATTGGCAAAGACAACTCAGGCACCACACAGATTGCATACAGCTCCTGTGAGGCCCAGAATACCTGGCAGG  2076

Query 2014  CCACACATCAGACCTG--------------------------------------------GGG-----------  2032
            |||||...|||.||||                                            |||           
Sbjct 2077  CCACATGGCAGGCCTGCTCTGAACAAAACAACTACAAGGCCTGATAAAACCAAACCCAGAGGGACGTCCCATAA  2150

Query 2033  --------------------TCAAGCAAGCACCCAGGCCATCAGGTGCTGATAGAAATGTATCAGTGGACTCTA  2086
                                .||||||||||||.|.||||.||.||.|||..|||||||..||||||||   |.
Sbjct 2151  AAACGGAGTAGGAACAGGAACCAAGCAAGCACCTAAGCCACCAAGTCCTGGGAGAAATGCGTCAGTGGA---TT  2221

Query 2087  CCCACCCCACTAAAAAGC------------CAGGGACTCGCCGCCCACCCTTGCCACCCAGAC---------CT  2139
            |.||..||||.|.|||.|            |||||||.||.||.||||||.|.||||..||.|         ||
Sbjct 2222  CACATGCCACAAGAAAACCAGGCTCAGTCTCAGGGACGCGTCGTCCACCCATACCACATAGGCATTCGTCCACT  2295

Query 2140  ACACAC-------CCACGA-AGAAAACCTTTACCACCAAATAATGTCACTGGAAAGCCAGGAAGTGCAGGAATC  2205
            |.|| |       ||| || ||||..||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||.||||.|||||.
Sbjct 2296  AGAC-CTGTGTCTCCA-GAGAGAAGGCCTTTACCCCCGAATAATGTCACCGGGAAGCCAGGACGTGCGGGAATT  2367

Query 2206  ATTTCATCAGGCCCAATAACTACACCACCCCTGAGGTCAACAC-CCAGGCCTACTGGAACTCCCTTGGAGAGAA  2278
            .||||.||..|||...||||..|.||||||||||.|.|||||| ||| .||||..|||||..||...|.||||.
Sbjct 2368  GTTTCCTCCAGCCGGGTAACGTCCCCACCCCTGAAGGCAACACTCCA-CCCTATCGGAACAGCCACAGCGAGAC  2440

Query 2279  TAGAGACAGATATAAAGCAACCAACAGTTCCTGCCTCTGGAGAAGAACTGGAAAATATAACTGACTTTAGCTCA  2352
            .||.|.||||...||||.|||||||.|.||||||.||.|.||||||..|.|..|.||.|||||||||.||.|||
Sbjct 2441  CAGGGGCAGAACAAAAGGAACCAACTGCTCCTGCTTCAGAAGAAGAGTTTGGTACTACAACTGACTTCAGTTCA  2514

Query 2353  AG-CCCAACAAGAGAAACTGATCCTCTTGGGAAGCCAAGATTCAAAGGACCTCATGTGCGATACATCCAAAAGC  2425
            || ||||.||| ||||||||||||.|||||||||||.||.||||.|||.||.|||||||||||.||||.|||||
Sbjct 2515  AGTCCCACCAA-AGAAACTGATCCCCTTGGGAAGCCCAGGTTCATAGGTCCCCATGTGCGATATATCCCAAAGC  2587

Query 2426  CTGACAACAGTCCCTGCTCCATTACTGACTCTGTCAAACGGTTCCCCAAAGAGGAGGCCACAGAGGGGAATGCC  2499
            ||||.||||..|||||.|||||.||||||||.||||.|||||||||.|.||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 2588  CTGAAAACAAGCCCTGTTCCATCACTGACTCAGTCAGACGGTTCCCTACAGAGGAAGCCACGGAGGGGAATGCC  2661

Query 2500  ACCAGCCCACCACAGAACCCACCCACCAACCTCACTGTGGTCACCGTGGAAGGGTGCCCCTCATTTGTCATCTT  2573
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 2662  ACCAGCCCACCACAGAACCCACCCACCAACCTCACTGTGGTCACTGTCGAAGGCTGCCCCTCATTTGTCATCTT  2735

Query 2574  GGACTGGGAAAAGCCACTAAATGACACTGTCACTGAATATGAAGTTATATCCAGAGAAAATGGGTCATTCAGTG  2647
            ||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2736  GGACTGGGAAAAACCTCTAAATGACACTGTCACTGAATATGAAGTCATATCCAGAGAAAATGGGTCATTCAGTG  2809

Query 2648  GGAAGAACAAGTCCATTCAAATGACAAATCAGACATTTTCCACAGTAGAAAATCTGAAACCAAACACGAGTTAT  2721
            ||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||.|||||||||||.|||||||||.|.||.||.|||
Sbjct 2810  GGAAGAACAAGTCCATTCAAATTACCAATCAAACGTTCTCTACAGTAGAAAACCTGAAACCAGATACAAGCTAT  2883

Query 2722  GAATTCCAGGTGAAACCCAAAAACCCGCTTGGTGAAGGCCCGGTCAGCAACACAGTGGCATTCAGTACTGAATC  2795
            |||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|.|||||||||.||.||.||||||||||||||
Sbjct 2884  GAATTCCAGGTGAAACCCAAAAATCCACTTGGTGAGGGCCCCGCCAGCAACACGGTAGCGTTCAGTACTGAATC  2957

Query 2796  AGCGGACCCAAGAGTGAGTGAGCCAGTTTCTGCAGGAAGAGATGCCATCTGGACTGAAAGACCCTTTAATTCAG  2869
            |||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 2958  AGCTGACCCAAGAGTGAGTGAGCCAATTTCTGCAGGAAGAGATGCCATCTGGACTGAAAGACCTTTTAACTCAG  3031

Query 2870  ACTCTTACTCAGAGTGTAAGGGCAAACAATATGTCAAAAGGACATGGTATAAAAAATTTGTAGGAGTGCAGCTG  2943
            |||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 3032  ACTCTTACTCAGAATGCAAAGGCAAACAGTATGTTAAAAGGACGTGGTATAAAAAATTTGTCGGAGTGCAGCTA  3105

Query 2944  TGCAACTCTCTCAGATACAAGATTTACTTGAGCGACTCCCTCACAGGAAAATTTTATAACATAGGTGATCAGAG  3017
            ||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||
Sbjct 3106  TGTAACTCTCTCAGATACAAGATTTATTTGAGCGATTCCCTCACAGGCAAGTTTTACAACATAGGAGATCAGAG  3179

Query 3018  GGGCCATGGAGAAGATCACTGCCAGTTTGTGGATTCATTTTTAGATGGACGCACTGGGCAGCAACTCACTTCTG  3091
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||||
Sbjct 3180  GGGCCACGGAGAAGATCACTGCCAGTTTGTGGATTCATTTTTAGATGGTCGCACAGGACAGCAACTCACCTCTG  3253

Query 3092  ACCAGTTACCAATCAAAGAAGGTTATTTCAGAGCAGTTCGCCAGGAACCTGTCCAATTTGGAGAAATAGGTGGT  3165
            |.||||||||.|.|||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3254  AACAGTTACCCACCAAAGAAGGCTATTTCAGAGCTGTTCGTCAGGAACCTGTCCAATTTGGAGAAATAGGTGGT  3327

Query 3166  CACACCCAAATCAATTATGTTCAGTGGTATGAATGTGGGACTACAATTCCTGGAAAATGG  3225
            ||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 3328  CATACCCAAATCAATTATGTCCAGTGGTATGAATGTGGGACCACAATACCTGGAAAATGG  3387