Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07957
- Subject:
- XM_006522284.1
- Aligned Length:
- 3389
- Identities:
- 2259
- Gaps:
- 793
Alignment
Query 1 ATGCGAGGTGGCAAATGCAACATGCTCTCCAGTTTGGGGTGTCTACTTCTCTGTGGAAGTATTACACTAGCCCT 74
|||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||.||||.||.||
Sbjct 1 ---------------------ATGCTCTCCAGCCTGGGGTGTCTACTTCTCTGTGGAAGTATTGCACTTGCTCT 53
Query 75 GGGAAATGCACAGAAATTGCCAAAAGGTAAAAGGCCAAACCTCAAAGTCCACATCAATACCACAAGTGACTCCA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|.|.|||||.||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 54 GGGAAATGCACAGAAATTGCCAAAAGGTAAAAAGCCAAGCTTGAAAGTGCACATCAATACCACCAGCGACTCCA 127
Query 149 TCCTCTTGAAGTTCTTGCGTCCAAGTCCAAATGTAAAGCTTGAAGGTCTTCTCCTGGGATATGGCAGCAATGTA 222
||||||||||||||.|||||||||.|.||||.||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 128 TCCTCTTGAAGTTCCTGCGTCCAAATGCAAACGTAAAGCTGGAAGGTTTTCTCCTGGGATATGGCAGCAATGTG 201
Query 223 TCACCAAACCAGTACTTCCCTCTTCCCGCTGAAGGGAAATTCACAGAAGCTATAGTTGATGCAGAGCCGAAATA 296
||.||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||.||
Sbjct 202 TCTCCAAACCAGTACTTCCCTCTTCCCACAGAAGGGAAATTCACAGAGGCTGTAGTTGATGCAGAGCCGAAGTA 275
Query 297 TCTGATAGTTGTGCGACCTGCTCCACCTCCAAGTCAAAAGAAGTCATGTTCAGGTAAAACTCGTTCTCGCAAAC 370
|||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.|||.||||..|||||||||
Sbjct 276 TCTGATAGTCGTACGACCTGCTCCTCCTCCCAGCCAGAAGAAGTCATGTTCAGGGAAATCTCGCCCTCGCAAAC 349
Query 371 CTCTGCAGCTGGTGGTTGGCACTCTGACACCGAGCTCAGTCTTCCTGTCCTGGGGTTTCCTCATCAACCCACAC 444
|.||.|||||||||||.||.||..||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 350 CCCTCCAGCTGGTGGTGGGTACGTTGACACCGAGTTCTGTCTTCCTGTCCTGGGGATTCCTCATCAACCCACAC 423
Query 445 CATGACTGGACATTGCCAAGTCACTGTCCCAATGACAGATTTTATACAATTCGCTATCGAGAAAAGGATAAAGA 518
||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||.|||||||.||||||||
Sbjct 424 CATGACTGGACATTGCCAAGCCACTGTCCCAGTGACAGATTTTATACAATTCGATATAGAGAAAAAGATAAAGA 497
Query 519 AAAGAAGTGGATTTTTCAAATCTGTCCAGCCACTGAAACAATTGTGGAAAACCTAAAGCCCAACACAGTTTATG 592
||||||.||||||||||||.||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 498 AAAGAAATGGATTTTTCAACTCTGCCCAGCTACTGAAACAATTGTGGAAAATCTAAAGCCCAACACAGTTTATG 571
Query 593 AATTTGGAGTGAAAGACAATGTGGAAGGTGGAATTTGGAGTAAGATTTTCAATCACAAGACTGTTGTTGGAAGT 666
|||||||.||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||
Sbjct 572 AATTTGGTGTGAAAGACAATATAGAAGGTGGAATTTGGAGTAAGATTTTCAATCATAAGACTATTGTTGGAAGT 645
Query 667 AAA---AAAGTAAATGGGAAAATCCAAAGTACCTATGACCAAGACCACACAGTGCCAGCATATGTCCCAAGGAA 737
||| ||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|.||||.|||||||| |||||.|||||
Sbjct 646 AAAAACAAAGTAAACGGGAAAATCCAAAGCACTTATGACCAGGTCCACTCAGTGCCA------GTCCCGAGGAA 713
Query 738 ACTAATCCCAATAACAATCATCAAGCAAGTGATTCAGAATGTTACTCACAAGGATTCAGCTAAATCCCCAGAAA 811
.|||||||||.||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||.||.||||.|.|||||||||||.|
Sbjct 714 GCTAATCCCACTAACGATCATTAAGCAAGTGATTCAGAATGTTACTCACAGGGCTTCAACCAAATCCCCAGACA 787
Query 812 AAGCTCCACTGGGAGGAGTGATACTAGTCCACCTTATTATTCCAGGTCTTAATGAAACTACTGTAAAACTTCCT 885
|..||||..|.||.|||...|||.||||.||.||.||||||||.||||||||||||.|.||||||||||||||.
Sbjct 788 AGACTCCTTTTGGGGGAACAATATTAGTTCATCTGATTATTCCGGGTCTTAATGAATCCACTGTAAAACTTCCC 861
Query 886 GCATCCCTAATGTTTGAGATTTCAGATGCACTCAAGACACAATTAGCTAAGAATGAAACCTTGGCATTACCTGC 959
.|||||.|||||.||||||||||.|||||.||||||.||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||
Sbjct 862 ACATCCATAATGCTTGAGATTTCCGATGCTCTCAAGGCACAATTAGCTAAGAATGAAACATTGGCTTTACCAGC 935
Query 960 CGAATCTAAAACACCAGAGGTTGAAAAAATCTCAGCACGACCCACAACAGTGACTCCTGAAACAGTTCCAAGAA 1033
.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 936 AGAATCTAAAACACCAGAGGTCGAAAA----------------------------------------------- 962
Query 1034 GCACTAAACCCACTACGTCTAGTGCATTAGATGTTTCAGAAACAACACTGGCTTCAAGTGAAAAGCCATGGATT 1107
|.||||
Sbjct 963 ----------------------------------------------ATTGGC---------------------- 968
Query 1108 GTGCCTACAGCTAAAATATCTGAAGATTCCAAAGTTCTGCAGCCTCAAACTGCAACTTATGATGTTTTCTCAAG 1181
Sbjct 969 -------------------------------------------------------------------------- 968
Query 1182 CCCTACAACATCAGATGAGCCTGAGATATCAGATTCCTACACAGCAACAAGTGATCGTATTCTGGATTCTATCC 1255
Sbjct 969 -------------------------------------------------------------------------- 968
Query 1256 CACCTAAAACTTCTAGAACTCTTGAACAGCCAAGGGCAACACTGGCTCCAAGTGAAACACCATTTGTTCCTCAA 1329
||||||
Sbjct 969 --------------------------------AGGGCA------------------------------------ 974
Query 1330 AAACTGGAAATCTTTACCAGTCCAGAAATGCAGCCTACGACACCTGCTCCCCAGCAAACTACATCTATCCCTTC 1403
Sbjct 975 -------------------------------------------------------------------------- 974
Query 1404 TACACCTAAACGACGCCCCCGGCCCAAACCGCCAAGAACCAAACCTGAAAGAACCACAAGTGCCGGAACAATTA 1477
||||
Sbjct 975 ------------------------------GCCA---------------------------------------- 978
Query 1478 CACCTAAAATTTCTAAAAGCCCTGAACCTACATGGACAACACCGGCTCCCGGTAAAACACAATTTATTTCTCTG 1551
||||
Sbjct 979 ---------------------------------------------------GTAA------------------- 982
Query 1552 AAACCTAAAATCCCTCTCAGCCCAGAAGTGACACACACCAAACCTGCTCCCAAGCAGAC-ACCA-CGTGCTCCT 1623
|.||.||||.|||||| |||| |.|| |||
Sbjct 983 -------------------------------------------CAGCACCCAGGCAGACAACCAGCATG--CCT 1011
Query 1624 CCTAAGC-CAAAAACATCACCACGCCCAAGAATCCCA-CAAACACAACCAGTTCCTAAGGTGCCCCAGCGTGTT 1695
||.|||| ||||| ||||||.|.||||.||.||| |||| |.|.|||||||||||||..||||.||.|...
Sbjct 1012 CCCAAGCTCAAAA----CACCACACTCAAGGATGCCAGCAAA-AGAGCCAGTTCCTAAGGAACCCCTGCATACG 1080
Query 1696 ACTGCAAAACCAAAAACGTCACCAAGTCCAGAAGTGTCATACACCACACCTGCTCCAAAAGATGTGCTCCTTCC 1769
|||.||||.|||||||.|.||||||||||.||||||.||.||||.|||.|||.|||||||||||..|..|||.|
Sbjct 1081 ACTTCAAAGCCAAAAATGCCACCAAGTCCTGAAGTGGCAGACACTACATCTGTTCCAAAAGATGAACGACTTTC 1154
Query 1770 TCATAAACCATACCCTGAGGTCTCTCAGAGCGAACCT------------------------------------- 1806
.|.|||||||.|.||.||||||.||||.||.|||.||
Sbjct 1155 CCTTAAACCAGATCCAGAGGTCACTCACAGTGAAACTGTTCTGCCTCCTGTCACCTTTAGAGTTGAGCCACCAA 1228
Query 1807 -----------GCTCCTCTAGAGACACGAGGCATCCCTTTTATACCCATGATTTCCCCAAGTCCTAGTCAAGAG 1869
||.|||.||||||||||.|||||.|||.|.|||||..|||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1229 AGACAACAATAGCACCTTTAGAGACACGGGGCATTCCTCTCATACCTGTGATTTCACCAAGACCTAGTCAAGAG 1302
Query 1870 GAACTACAGACCACTCTGGAAGAAACAGACCAATCCACCCAAGAACCTTTCACAACTAAGATTCCACGAACAAC 1943
||||||||.|||.|..||||||||||||||||.||.||||||||.|..|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1303 GAACTACAAACCGCCATGGAAGAAACAGACCAGTCTACCCAAGAGCTCTTCACGACTAAGATTCCACGAACAAC 1376
Query 1944 TGAACTAGCAAAGACAACTCAGGCGCCACACAGATTTTATA---CTACTGTGAGGCCCAGAACATCTGACAAGC 2014
||||.|.|||||||||||||||||.|||||||||||..||| ||.|||||||||||||||.|.|||.||.||
Sbjct 1377 TGAATTGGCAAAGACAACTCAGGCACCACACAGATTGCATACAGCTCCTGTGAGGCCCAGAATACCTGGCAGGC 1450
Query 2015 CACACATCAGACCTG--------------------------------------------GGG------------ 2032
||||...|||.|||| |||
Sbjct 1451 CACATGGCAGGCCTGCTCTGAACAAAACAACTACAAGGCCTGATAAAACCAAACCCAGAGGGACGTCCCATAAA 1524
Query 2033 -------------------TCAAGCAAGCACCCAGGCCATCAGGTGCTGATAGAAATGTATCAGTGGACTCTAC 2087
.||||||||||||.|.||||.||.||.|||..|||||||..|||||||| |.|
Sbjct 1525 AACGGAGTAGGAACAGGAACCAAGCAAGCACCTAAGCCACCAAGTCCTGGGAGAAATGCGTCAGTGGA---TTC 1595
Query 2088 CCACCCCACTAAAAAGC------------CAGGGACTCGCCGCCCACCCTTGCCACCCAGAC---------CTA 2140
.||..||||.|.|||.| |||||||.||.||.||||||.|.||||..||.| |||
Sbjct 1596 ACATGCCACAAGAAAACCAGGCTCAGTCTCAGGGACGCGTCGTCCACCCATACCACATAGGCATTCGTCCACTA 1669
Query 2141 CACAC-------CCACGA-AGAAAACCTTTACCACCAAATAATGTCACTGGAAAGCCAGGAAGTGCAGGAATCA 2206
.|| | ||| || ||||..||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||.||||.|||||..
Sbjct 1670 GAC-CTGTGTCTCCA-GAGAGAAGGCCTTTACCCCCGAATAATGTCACCGGGAAGCCAGGACGTGCGGGAATTG 1741
Query 2207 TTTCATCAGGCCCAATAACTACACCACCCCTGAGGTCAACAC-CCAGGCCTACTGGAACTCCCTTGGAGAGAAT 2279
||||.||..|||...||||..|.||||||||||.|.|||||| ||| .||||..|||||..||...|.||||..
Sbjct 1742 TTTCCTCCAGCCGGGTAACGTCCCCACCCCTGAAGGCAACACTCCA-CCCTATCGGAACAGCCACAGCGAGACC 1814
Query 2280 AGAGACAGATATAAAGCAACCAACAGTTCCTGCCTCTGGAGAAGAACTGGAAAATATAACTGACTTTAGCTCAA 2353
||.|.||||...||||.|||||||.|.||||||.||.|.||||||..|.|..|.||.|||||||||.||.||||
Sbjct 1815 AGGGGCAGAACAAAAGGAACCAACTGCTCCTGCTTCAGAAGAAGAGTTTGGTACTACAACTGACTTCAGTTCAA 1888
Query 2354 G-CCCAACAAGAGAAACTGATCCTCTTGGGAAGCCAAGATTCAAAGGACCTCATGTGCGATACATCCAAAAGCC 2426
| ||||.||| ||||||||||||.|||||||||||.||.||||.|||.||.|||||||||||.||||.||||||
Sbjct 1889 GTCCCACCAA-AGAAACTGATCCCCTTGGGAAGCCCAGGTTCATAGGTCCCCATGTGCGATATATCCCAAAGCC 1961
Query 2427 TGACAACAGTCCCTGCTCCATTACTGACTCTGTCAAACGGTTCCCCAAAGAGGAGGCCACAGAGGGGAATGCCA 2500
|||.||||..|||||.|||||.||||||||.||||.|||||||||.|.||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 1962 TGAAAACAAGCCCTGTTCCATCACTGACTCAGTCAGACGGTTCCCTACAGAGGAAGCCACGGAGGGGAATGCCA 2035
Query 2501 CCAGCCCACCACAGAACCCACCCACCAACCTCACTGTGGTCACCGTGGAAGGGTGCCCCTCATTTGTCATCTTG 2574
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 2036 CCAGCCCACCACAGAACCCACCCACCAACCTCACTGTGGTCACTGTCGAAGGCTGCCCCTCATTTGTCATCTTG 2109
Query 2575 GACTGGGAAAAGCCACTAAATGACACTGTCACTGAATATGAAGTTATATCCAGAGAAAATGGGTCATTCAGTGG 2648
|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2110 GACTGGGAAAAACCTCTAAATGACACTGTCACTGAATATGAAGTCATATCCAGAGAAAATGGGTCATTCAGTGG 2183
Query 2649 GAAGAACAAGTCCATTCAAATGACAAATCAGACATTTTCCACAGTAGAAAATCTGAAACCAAACACGAGTTATG 2722
|||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||.|||||||||||.|||||||||.|.||.||.||||
Sbjct 2184 GAAGAACAAGTCCATTCAAATTACCAATCAAACGTTCTCTACAGTAGAAAACCTGAAACCAGATACAAGCTATG 2257
Query 2723 AATTCCAGGTGAAACCCAAAAACCCGCTTGGTGAAGGCCCGGTCAGCAACACAGTGGCATTCAGTACTGAATCA 2796
||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|.|||||||||.||.||.|||||||||||||||
Sbjct 2258 AATTCCAGGTGAAACCCAAAAATCCACTTGGTGAGGGCCCCGCCAGCAACACGGTAGCGTTCAGTACTGAATCA 2331
Query 2797 GCGGACCCAAGAGTGAGTGAGCCAGTTTCTGCAGGAAGAGATGCCATCTGGACTGAAAGACCCTTTAATTCAGA 2870
||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 2332 GCTGACCCAAGAGTGAGTGAGCCAATTTCTGCAGGAAGAGATGCCATCTGGACTGAAAGACCTTTTAACTCAGA 2405
Query 2871 CTCTTACTCAGAGTGTAAGGGCAAACAATATGTCAAAAGGACATGGTATAAAAAATTTGTAGGAGTGCAGCTGT 2944
||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 2406 CTCTTACTCAGAATGCAAAGGCAAACAGTATGTTAAAAGGACGTGGTATAAAAAATTTGTCGGAGTGCAGCTAT 2479
Query 2945 GCAACTCTCTCAGATACAAGATTTACTTGAGCGACTCCCTCACAGGAAAATTTTATAACATAGGTGATCAGAGG 3018
|.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 2480 GTAACTCTCTCAGATACAAGATTTATTTGAGCGATTCCCTCACAGGCAAGTTTTACAACATAGGAGATCAGAGG 2553
Query 3019 GGCCATGGAGAAGATCACTGCCAGTTTGTGGATTCATTTTTAGATGGACGCACTGGGCAGCAACTCACTTCTGA 3092
|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||
Sbjct 2554 GGCCACGGAGAAGATCACTGCCAGTTTGTGGATTCATTTTTAGATGGTCGCACAGGACAGCAACTCACCTCTGA 2627
Query 3093 CCAGTTACCAATCAAAGAAGGTTATTTCAGAGCAGTTCGCCAGGAACCTGTCCAATTTGGAGAAATAGGTGGTC 3166
.||||||||.|.|||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2628 ACAGTTACCCACCAAAGAAGGCTATTTCAGAGCTGTTCGTCAGGAACCTGTCCAATTTGGAGAAATAGGTGGTC 2701
Query 3167 ACACCCAAATCAATTATGTTCAGTGGTATGAATGTGGGACTACAATTCCTGGAAAATGG 3225
|.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 2702 ATACCCAAATCAATTATGTCCAGTGGTATGAATGTGGGACCACAATACCTGGAAAATGG 2760