Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07957
• Subject: XM_006522286.3
• Aligned Length: 1588
• Identities: 871
• Gaps: 524

Alignment

Query    1  MRGGKCNMLSSLGCLLLCGSITLALGNAQKLPKGKRPNLKVHINTTSDSILLKFLRPSPNVKLEGLLLGYGSNV  74
                   ||||||||||||||.|||||||||||||.|.|||||||||||||||||||..||||||.||||||||
Sbjct    1  -------MLSSLGCLLLCGSIALALGNAQKLPKGKKPSLKVHINTTSDSILLKFLRPNANVKLEGFLLGYGSNV  67

Query   75  SPNQYFPLPAEGKFTEAIVDAEPKYLIVVRPAPPPSQKKSCSGKTRSRKPLQLVVGTLTPSSVFLSWGFLINPH  148
            |||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   68  SPNQYFPLPTEGKFTEAVVDAEPKYLIVVRPAPPPSQKKSCSGKSRPRKPLQLVVGTLTPSSVFLSWGFLINPH  141

Query  149  HDWTLPSHCPNDRFYTIRYREKDKEKKWIFQICPATETIVENLKPNTVYEFGVKDNVEGGIWSKIFNHKTVVGS  222
            ||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||
Sbjct  142  HDWTLPSHCPSDRFYTIRYREKDKEKKWIFQLCPATETIVENLKPNTVYEFGVKDNIEGGIWSKIFNHKTIVGS  215

Query  223  K-KVNGKIQSTYDQDHTVPAYVPRKLIPITIIKQVIQNVTHKDSAKSPEKAPLGGVILVHLIIPGLNETTVKLP  295
            | ||||||||||||.|.||  |||||||.||||||||||||..|.|||.|.|.||.||||||||||||.|||||
Sbjct  216  KNKVNGKIQSTYDQVHSVP--VPRKLIPLTIIKQVIQNVTHRASTKSPDKTPFGGTILVHLIIPGLNESTVKLP  287

Query  296  ASLMFEISDALKTQLAKNETLALPAESKTPEVEKISARPTTVTPETVPRSTKPTTSSALDVSETTL--------  361
            .|.|.|||||||.|||||||||||||||||||||....|.|||||.|.||||||.|||||..||.|        
Sbjct  288  TSIMLEISDALKAQLAKNETLALPAESKTPEVEKLAGQPVTVTPESVSRSTKPTLSSALDTAETALVLSEKTSE  361

Query  362  -----------------------------------------ASSEKPWIVPTAKISEDSKVLQPQTATYDVFSS  394
                                                     ||||.||.||.||.||||.|.|||||||||.||
Sbjct  362  TARSVLIPEFELPLSTLAPKRFPEFPEAKTAFPLEKPRGSWASSEEPWVVPGAKTSEDSRVVQPQTATYDVISS  435

Query  395  PTTSDEPEISDSYTATSDRILDSIPPKTSRTLEQPRATLAPSETPFVPQKLEIFTSPEMQPTTPAPQQTTSIPS  468
            .|||||.|| ...|||.|.||||.|||||||.|||||||||.|..|.....|||||||..|||.||||||||||
Sbjct  436  STTSDETEI-EIHTATRDPILDSVPPKTSRTAEQPRATLAPIEALFESRNVEIFTSPEVRPTTAAPQQTTSIPS  508

Query  469  TPKRRPRPKPPRTKP---------ERTTSA--------------------------------GTITPKI-----  496
            ||||...|||||.||         ..||.|                                .|.||.|     
Sbjct  509  TPKRQSTPKPPRVKPAPEPETRPSAQTTKAPRKTKKPGHHRLRRPKTTRSPEVPKSKPALEPATVTPEILVPKI  582

Query  497  -----------------------------SKSP-----------------------------------------  500
                                         |..|                                         
Sbjct  583  VPKPPQKPKATRRPEVPQVKPAHEPVTFGSEAPALAIVTTTDIEPVITRTKASVTTLAPKPPRPRTHRQRTKYK  656

Query  501  ---------------------------------------------------------EPTWTTPAPGKT-----  512
                                                                     ||...|.|||.|     
Sbjct  657  TTQSPKIPHSKPADLGPITSEPPLASTTKKVRRPRPKPQTTPHPEVPHTILVPATSLEPFIITEAPGTTLVPKL  730

Query  513  --------------------------------------------------------------------------  512
                                                                                      
Sbjct  731  PQQPDYPHPKPKTTRSPAASPTELVPTPVFEPVTPLKEDPVTTIVPITDLERVTDLETPVAFRTEAPGTTLASK  804

Query  513  -----------------------------------------QFISLKPKIPL----------------------  523
                                                     ....|.|....                      
Sbjct  805  ISQRTHRPRPRPRPRPRPRPRPKATLSPQAPETKTVPAVVLEPVTLRPEVQVTTLAPQKTQKKHRPSPKPKPVP  878

Query  524  SPEVTHTKPA---PKQTPRAPPKPKTSPRP--------------------------------------------  550
            |||||..|||   ||.|.|..|||.|.|.|                                            
Sbjct  879  SPEVTESKPAPKTPKRTRRPRPKPQTTPTPETPLTKPVAATDLEPSALSTEVPATVVLATALTPVTLRTKAPKT  952

Query  551  --------------------------------------------------------------------------  550
                                                                                      
Sbjct  953  TTLAPNVQRTRRPHPRPKTTASTGVSESKSAPTELQSLVLKPVTSPSLEIIQSQSVSDDLELVAFSTESPQKTI  1026

Query  551  -----------------RIPQTQPVPKVPQRVTAKPKTSPSPEVSYTTPAPKDVLLPHKPYPEVSQSEPAPLET  607
                             |.|...||||.|...|.|||..|||||..||..|||..|..||.|||..||.|||||
Sbjct 1027  APRQTTSMPPKLKTPHSRMPAKEPVPKEPLHTTSKPKMPPSPEVADTTSVPKDERLSLKPDPEVTHSETAPLET  1100

Query  608  RGIPFIPMISPSPSQEELQTTLEETDQSTQEPFTTKIPRTTELAKTTQAPHRFYTT-VRPRTSDKPHIRPGVKQ  680
            ||||.||.|||.||||||||..|||||||||.||||||||||||||||||||..|. ||||....||.|||.||
Sbjct 1101  RGIPLIPVISPRPSQEELQTAMEETDQSTQELFTTKIPRTTELAKTTQAPHRLHTAPVRPRIPGRPHGRPGTKQ  1174

Query  681  APRPSGADRNVSVDSTHPTKKP----GTRRPPLP-----PRPTHPRRKPLPPNNVTGKPGSAGIISSGPITTPP  745
            ||.|....||.|||| |.|.||    ||||||.|     .||..|.|.||||||||||||.|||.||...|.||
Sbjct 1175  APKPPSPGRNASVDS-HATRKPGSVSGTRRPPIPHRHSSTRPVSPERRPLPPNNVTGKPGRAGIVSSSRVTSPP  1247

Query  746  LRSTPRPTGTPLERIETDIKQPTVPASGEELENITDFSSSPTRETDPLGKPRFKGPHVRYIQKPDNSPCSITDS  819
            |..|..|.||...|.....|.||.|||.||....||||||||.||||||||||.|||||||.||.|.|||||||
Sbjct 1248  LKATLHPIGTATARPGAEQKEPTAPASEEEFGTTTDFSSSPTKETDPLGKPRFIGPHVRYIPKPENKPCSITDS  1321

Query  820  VKRFPKEEATEGNATSPPQNPPTNLTVVTVEGCPSFVILDWEKPLNDTVTEYEVISRENGSFSGKNKSIQMTNQ  893
            |.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1322  VRRFPTEEATEGNATSPPQNPPTNLTVVTVEGCPSFVILDWEKPLNDTVTEYEVISRENGSFSGKNKSIQITNQ  1395

Query  894  TFSTVENLKPNTSYEFQVKPKNPLGEGPVSNTVAFSTESADPRVSEPVSAGRDAIWTERPFNSDSYSECKGKQY  967
            ||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1396  TFSTVENLKPDTSYEFQVKPKNPLGEGPASNTVAFSTESADPRVSEPISAGRDAIWTERPFNSDSYSECKGKQY  1469

Query  968  VKRTWYKKFVGVQLCNSLRYKIYLSDSLTGKFYNIGDQRGHGEDHCQFVDSFLDGRTGQQLTSDQLPIKEGYFR  1041
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||
Sbjct 1470  VKRTWYKKFVGVQLCNSLRYKIYLSDSLTGKFYNIGDQRGHGEDHCQFVDSFLDGRTGQQLTSEQLPTKEGYFR  1543

Query 1042  AVRQEPVQFGEIGGHTQINYVQWYECGTTIPGKW  1075
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1544  AVRQEPVQFGEIGGHTQINYVQWYECGTTIPGKW  1577