Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_07957
Subject:
XM_017317038.1
Aligned Length:
1594
Identities:
870
Gaps:
530

Alignment

Query    1  MRGGKCNMLSSLGCLLLCGSITLALGNAQKLPKGKRPNLKVHINTTSDSILLKFLRPSPNVKLEGLLLGYGSNV  74
                   ||||||||||||||.|||||||||||||.|.|||||||||||||||||||..||||||.||||||||
Sbjct    1  -------MLSSLGCLLLCGSIALALGNAQKLPKGKKPSLKVHINTTSDSILLKFLRPNANVKLEGFLLGYGSNV  67

Query   75  SPNQYFPLPAEGKFTEAIVDAEPKYLIVVRPAPPPSQKKSCSGKTRSRKPLQLVVGTLTPSSVFLSWGFLINPH  148
            |||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   68  SPNQYFPLPTEGKFTEAVVDAEPKYLIVVRPAPPPSQKKSCSGKSRPRKPLQLVVGTLTPSSVFLSWGFLINPH  141

Query  149  HDWTLPSHCPNDRFYTIRYREKDKEKKWIFQICPATETIVENLKPNTVYEFGVKDNVEGGIWSKIFNHKTVVGS  222
            ||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||
Sbjct  142  HDWTLPSHCPSDRFYTIRYREKDKEKKWIFQLCPATETIVENLKPNTVYEFGVKDNIEGGIWSKIFNHKTIVGS  215

Query  223  K-KVNGKIQSTYDQDHTVPAYVPRKLIPITIIKQVIQNVTHKDSAKSPEKAPLGGVILVHLIIPGLNETTVKLP  295
            | ||||||||||||.|.||  |||||||.||||||||||||..|.|||.|.|.||.||||||||||||.|||||
Sbjct  216  KNKVNGKIQSTYDQVHSVP--VPRKLIPLTIIKQVIQNVTHRASTKSPDKTPFGGTILVHLIIPGLNESTVKLP  287

Query  296  ASLMFEISDALKTQLAKNETLALPAESKTPEVEKISARPTTVTPETVPRSTKPTTSSALDVSETTL--------  361
            .|.|.|||||||.|||||||||||||||||||||....|.|||||.|.||||||.|||||..||.|        
Sbjct  288  TSIMLEISDALKAQLAKNETLALPAESKTPEVEKLAGQPVTVTPESVSRSTKPTLSSALDTAETALVLSEKTSE  361

Query  362  -----------------------------------------ASSEKPWIVPTAKISEDSKVLQPQTATYDVFSS  394
                                                     ||||.||.||.||.||||.|.|||||||||.||
Sbjct  362  TARSVLIPEFELPLSTLAPKRFPEFPEAKTAFPLEKPRGSWASSEEPWVVPGAKTSEDSRVVQPQTATYDVISS  435

Query  395  PTTSDEPEISDSYTATSDRILDSIPPKTSRTLEQPRATLAPSETPFVPQKLEIFTSPEMQPTTPAPQQTTSIPS  468
            .|||||.|| ...|||.|.||||.|||||||.|||||||||.|..|.....|||||||..|||.||||||||||
Sbjct  436  STTSDETEI-EIHTATRDPILDSVPPKTSRTAEQPRATLAPIEALFESRNVEIFTSPEVRPTTAAPQQTTSIPS  508

Query  469  TPKRRPRPKPPRTKP---------ERTTSA--------------------------------GTITPKI-----  496
            ||||...|||||.||         ..||.|                                .|.||.|     
Sbjct  509  TPKRQSTPKPPRVKPAPEPETRPSAQTTKAPRKTKKPGHHRLRRPKTTRSPEVPKSKPALEPATVTPEILVPKI  582

Query  497  -----------------------------SKSP-----------------------------------------  500
                                         |..|                                         
Sbjct  583  VPKPPQKPKATRRPEVPQVKPAHEPVTFGSEAPALAIVTTTDIEPVITRTKASVTTLAPKPPRPRTHRQRTKYK  656

Query  501  --------------------------------------------------------EPTWTTPAPGKT------  512
                                                                    ||...|.|||.|      
Sbjct  657  TTQSPKIPHSKPDLGPITSEPPLASTTKKVRRPRPKPQTTPHPEVPHTILVPATSLEPFIITEAPGTTLVPKLP  730

Query  513  --------------------------------------------------------------------------  512
                                                                                      
Sbjct  731  QQPDYPHPKPKTTRSPAASPTELVPTPVFEPVTPLKEDPVTTIVPITDLERVTDLETPVAFRTEAPGTTLVPAV  804

Query  513  --QFISLKPKIPL----------------------SPEVTHTKP-----------------------APKQTPR  539
              ....|.|....                      |||||..||                       .||.|.|
Sbjct  805  VLEPVTLRPEVQVTTLAPQKTQKKHRPSPKPKPVPSPEVTESKPVLPRVREPVTLRTETWVTTKAPKTPKRTRR  878

Query  540  APPKPKTSPRP---------------------------------------------------------------  550
            ..|||.|.|.|                                                               
Sbjct  879  PRPKPQTTPTPETPLTKPVAATDLEPSALSTEVPATVVLATALTPVTLRTKAPKTTTLAPNVQRTRRPHPRPKT  952

Query  551  ------------------------------------------------------------------------RI  552
                                                                                    |.
Sbjct  953  TASTGVSESKSAPTELQSLVLKPVTSPSLEIIQSQSVSDDLELVAFSTESPQKTIAPRQTTSMPPKLKTPHSRM  1026

Query  553  PQTQPVPKVPQRVTAKPKTSPSPEVSYTTPAPKDVLLPHKPYPEVSQSEPAPLETRGIPFIPMISPSPSQEELQ  626
            |...||||.|...|.|||..|||||..||..|||..|..||.|||..||.|||||||||.||.|||.|||||||
Sbjct 1027  PAKEPVPKEPLHTTSKPKMPPSPEVADTTSVPKDERLSLKPDPEVTHSETAPLETRGIPLIPVISPRPSQEELQ  1100

Query  627  TTLEETDQSTQEPFTTKIPRTTELAKTTQAPHRFYTT-VRPRTSDKPHIRP-----------------------  676
            |..|||||||||.||||||||||||||||||||..|. ||||....||.||                       
Sbjct 1101  TAMEETDQSTQELFTTKIPRTTELAKTTQAPHRLHTAPVRPRIPGRPHGRPALNKTTTRPDKTKPRGTSHKNGV  1174

Query  677  --GVKQAPRPSGADRNVSVDSTHPTKKP----GTRRPPLP-----PRPTHPRRKPLPPNNVTGKPGSAGIISSG  739
              |.||||.|....||.|||| |.|.||    ||||||.|     .||..|.|.||||||||||||.|||.||.
Sbjct 1175  GTGTKQAPKPPSPGRNASVDS-HATRKPGSVSGTRRPPIPHRHSSTRPVSPERRPLPPNNVTGKPGRAGIVSSS  1247

Query  740  PITTPPLRSTPRPTGTPLERIETDIKQPTVPASGEELENITDFSSSPTRETDPLGKPRFKGPHVRYIQKPDNSP  813
            ..|.|||..|..|.||...|.....|.||.|||.||....||||||||.||||||||||.|||||||.||.|.|
Sbjct 1248  RVTSPPLKATLHPIGTATARPGAEQKEPTAPASEEEFGTTTDFSSSPTKETDPLGKPRFIGPHVRYIPKPENKP  1321

Query  814  CSITDSVKRFPKEEATEGNATSPPQNPPTNLTVVTVEGCPSFVILDWEKPLNDTVTEYEVISRENGSFSGKNKS  887
            |||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1322  CSITDSVRRFPTEEATEGNATSPPQNPPTNLTVVTVEGCPSFVILDWEKPLNDTVTEYEVISRENGSFSGKNKS  1395

Query  888  IQMTNQTFSTVENLKPNTSYEFQVKPKNPLGEGPVSNTVAFSTESADPRVSEPVSAGRDAIWTERPFNSDSYSE  961
            ||.|||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1396  IQITNQTFSTVENLKPDTSYEFQVKPKNPLGEGPASNTVAFSTESADPRVSEPISAGRDAIWTERPFNSDSYSE  1469

Query  962  CKGKQYVKRTWYKKFVGVQLCNSLRYKIYLSDSLTGKFYNIGDQRGHGEDHCQFVDSFLDGRTGQQLTSDQLPI  1035
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.
Sbjct 1470  CKGKQYVKRTWYKKFVGVQLCNSLRYKIYLSDSLTGKFYNIGDQRGHGEDHCQFVDSFLDGRTGQQLTSEQLPT  1543

Query 1036  KEGYFRAVRQEPVQFGEIGGHTQINYVQWYECGTTIPGKW  1075
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1544  KEGYFRAVRQEPVQFGEIGGHTQINYVQWYECGTTIPGKW  1583