Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07971
• Subject: NM_001039509.1
• Aligned Length: 1155
• Identities: 1043
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCGGCGGTGGTAGCTGCTACGGCGCTGAAGAGCCGGGGGGCGAGAAATGCCCGCGTCCTCCGGGGGATTCT  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct    1  ATGGCGGCGGTGGTAGCTGCTACGGCGCTGAAGGGCCGGGGGGCGAGAAATGCCCGCGTCCTCCGGGGGATCCT  74

Query   75  CGCAGGAGCCACAGCTAACAAGGTTTCTCATAACAGGACCCGGGCCCTGCAAAGCCACAGCTCCTCAGAGGGCA  148
            |.|.|||||||||||||||||||.|||.||.|||||||||.|.||.|||||.|||||||||||..||||..|||
Sbjct   75  CTCTGGAGCCACAGCTAACAAGGCTTCCCAGAACAGGACCAGAGCACTGCAGAGCCACAGCTCACCAGAATGCA  148

Query  149  AGGAGGAACCTGAACCCCTATCCCCGGAGCTGGAATACATTCCCAGAAAGAGGGGCAAGAACCCCATGAAAGCT  222
            |||||||.||.||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  149  AGGAGGAGCCCGAGCCCCTCTCCCCTGAGCTAGAATACATTCCCAGAAAGAGGGGCAAGAACCCCATGAAAGCC  222

Query  223  GTGGGACTGGCCTGGTACAGCCTGTACACCCGCACCTGGCTCGGGTACCTCTTCTACCGACAGCAGCTGCGCAG  296
            |||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct  223  GTGGGGCTAGCCTGGTATAGCCTGTACACCCGAACCTGGCTTGGGTACCTCTTCTACCGACAGCAGCTTCGGAG  296

Query  297  GGCTCGGAATCGCTACCCTAAAGGCCACTCGAAAACCCAGCCCCGCCTCTTCAATGGAGTGAAGGTGCTTCCCA  370
            |||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGCTCGGAATCGCTATCCCAAAGGCCACTCCAAAACTCAGCCCCGCCTCTTCAATGGAGTGAAGGTGCTTCCCA  370

Query  371  TCCCTGTCCTCTCGGACAACTACAGCTACCTCATCATCGACACCCAGGCCCAGCTGGCTGTGGCTGTGGACCCT  444
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||...||||||.||||||||||||||.
Sbjct  371  TCCCTGTCCTCTCGGACAACTACAGCTACCTCATCATCGACACCCAGGCTGGGCTGGCAGTGGCTGTGGACCCC  444

Query  445  TCAGACCCTCGGGCTGTGCAGGCTTCCATTGAAAAGGAAGGGGTCACCTTGGTCGCCATTCTGTGTACTCACAA  518
            ||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||.|.||.|.||||||.||||||||.||.||.|||||
Sbjct  445  TCAGACCCGAGGGCTGTGCAGGCTTCCATTGAAAAGGAAAGAGTTAACTTGGTTGCCATTCTCTGCACCCACAA  518

Query  519  GCACTGGGACCACAGTGGAGGGAACCGTGACCTCAGCCGGCGGCACCGGGACTGTCGGGTGTACGGGAGCCCTC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct  519  GCACTGGGACCACAGTGGAGGGAACCGTGACCTCAGCCGGCGGCACAGGGACTGTCGAGTGTATGGGAGCCCTC  592

Query  593  AGGACGGCATCCCCTACCTCACCCATCCCCTGTGTCATCAAGATGTGGTCAGCGTGGGACGGCTTCAGATCCGG  666
            ||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.
Sbjct  593  AGGATGGTATCCCCTACCTCACCCACCCCCTGTGTCATCAAGATGTGGTCAGCGTGGGACGACTTCAGATTCGA  666

Query  667  GCCCTGGCTACACCTGGCCACACACAAGGCCATCTGGTCTACCTACTGGATGGGGAGCCCTACAAGGGTCCCTC  740
            |||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct  667  GCCCTAGCCACCCCTGGCCACACTCAAGGCCATCTGGTCTACCTGCTGGATGGGGAGCCCTACAAAGGTCCTTC  740

Query  741  CTGCCTCTTCTCAGGGGACCTGCTCTTCCTCTCTGGCTGTGGGCGGACCTTTGAGGGCAATGCAGAGACCATGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||..||.||||||||||
Sbjct  741  CTGCCTCTTCTCAGGGGACCTGCTCTTCCTCTCTGGCTGTGGACGGACCTTCGAAGGCACAGCGGAGACCATGC  814

Query  815  TGAGCTCACTGGACACTGTGCTGGGGCTAGGGGATGACACCCTTCTGTGGCCTGGTCATGAGTATGCAGAGGAG  888
            ||||||||||||||||||||.|.|..||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.|||
Sbjct  815  TGAGCTCACTGGACACTGTGTTAGACCTGGGGGATGACACCCTGCTGTGGCCTGGGCATGAATACGCAGAAGAG  888

Query  889  AACCTGGGCTTTGCAGGTGTGGTGGAGCCCGAGAACCTGGCCCGGGAGAGGAAGATGCAGTGGGTGCAGCGGCA  962
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||.||.||||||||||||||||||||.|||.||||
Sbjct  889  AACCTGGGCTTTGCAGGCGTGGTGGAGCCCGAGAACTTGGCTCGTGAGAGGAAGATGCAGTGGGTACAGAGGCA  962

Query  963  GCGGCTGGAGCGCAAGGGCACGTGCCCATCTACCCTGGGAGAGGAGCGCTCCTACAACCCGTTCCTGAGAACCC  1036
            .|||.||||.||||||.||||.||||||||.||||||||||||||.|||.||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  963  ACGGATGGAACGCAAGAGCACATGCCCATCCACCCTGGGAGAGGAACGCGCCTACAACCCATTCCTGAGAACCC  1036

Query 1037  ACTGCCTGGCGCTACAGGAGGCTCTGGGGCCGGGGCCGGGCCCCACTGGGGATGATGACTACTCCCGGGCCCAG  1110
            |.|||||||..||||||||||||||||||||.|||||.||||||||..|.|||||.|.||.|||||||||||||
Sbjct 1037  ATTGCCTGGAACTACAGGAGGCTCTGGGGCCAGGGCCAGGCCCCACCAGTGATGACGGCTGCTCCCGGGCCCAG  1110

Query 1111  CTCCTGGAAGAGCTCCGCCGGCTGAAGGATATGCACAAGAGCAAG  1155
            ||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||.||.||||||
Sbjct 1111  CTCCTGGAGGAGCTGCGCCGCCTGAAGGACATGCATAAAAGCAAG  1155