Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07971
• Subject: XM_006496167.3
• Aligned Length: 1214
• Identities: 1016
• Gaps: 79

Alignment

Query    1  ATGGCGGCG----------------------------------------GTGGTAGCT----GCTACGGCGCTG  30
            || ||||||                                        |.|..||||    ||.|||.|||.|
Sbjct    1  AT-GCGGCGAAAGCTACCGATCCACTTCTCTGGGCCCAAACGCCTCCCAGAGTCAGCTCTGCGCGACGACGCGG  73

Query   31  AA---GAGCCGGGGGGCGAGAAATGCCCGCGTCCTCC------------GGGGGATTCTCGCAGGAGCCACAGC  89
            ||   |||||                   |.||||||            ||.||||.|||.|.|||||||||||
Sbjct   74  AACTCGAGCC-------------------CCTCCTCCCGGGAGGAAGTAGGCGGATCCTCTCTGGAGCCACAGC  128

Query   90  TAACAAGGTTTCTCATAACAGGACCCGGGCCCTGCAAAGCCACAGCTCCTCAGAGGGCAAGGAGGAACCTGAAC  163
            ||||||||.|||.||.|||||||||.|.||.|||||.|||||||||||..||||..||||||||||.||.||.|
Sbjct  129  TAACAAGGCTTCCCAGAACAGGACCAGAGCACTGCAGAGCCACAGCTCACCAGAATGCAAGGAGGAGCCCGAGC  202

Query  164  CCCTATCCCCGGAGCTGGAATACATTCCCAGAAAGAGGGGCAAGAACCCCATGAAAGCTGTGGGACTGGCCTGG  237
            ||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||
Sbjct  203  CCCTCTCCCCTGAGCTAGAATACATTCCCAGAAAGAGGGGCAAGAACCCCATGAAAGCCGTGGGGCTAGCCTGG  276

Query  238  TACAGCCTGTACACCCGCACCTGGCTCGGGTACCTCTTCTACCGACAGCAGCTGCGCAGGGCTCGGAATCGCTA  311
            ||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  277  TATAGCCTGTACACCCGAACCTGGCTTGGGTACCTCTTCTACCGACAGCAGCTTCGGAGGGCTCGGAATCGCTA  350

Query  312  CCCTAAAGGCCACTCGAAAACCCAGCCCCGCCTCTTCAATGGAGTGAAGGTGCTTCCCATCCCTGTCCTCTCGG  385
            .||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  351  TCCCAAAGGCCACTCCAAAACTCAGCCCCGCCTCTTCAATGGAGTGAAGGTGCTTCCCATCCCTGTCCTCTCGG  424

Query  386  ACAACTACAGCTACCTCATCATCGACACCCAGGCCCAGCTGGCTGTGGCTGTGGACCCTTCAGACCCTCGGGCT  459
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||...||||||.||||||||||||||.||||||||..|||||
Sbjct  425  ACAACTACAGCTACCTCATCATCGACACCCAGGCTGGGCTGGCAGTGGCTGTGGACCCCTCAGACCCGAGGGCT  498

Query  460  GTGCAGGCTTCCATTGAAAAGGAAGGGGTCACCTTGGTCGCCATTCTGTGTACTCACAAGCACTGGGACCACAG  533
            ||||||||||||||||||||||||.|.||.|.||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct  499  GTGCAGGCTTCCATTGAAAAGGAAAGAGTTAACTTGGTTGCCATTCTCTGCACCCACAAGCACTGGGACCACAG  572

Query  534  TGGAGGGAACCGTGACCTCAGCCGGCGGCACCGGGACTGTCGGGTGTACGGGAGCCCTCAGGACGGCATCCCCT  607
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct  573  TGGAGGGAACCGTGACCTCAGCCGGCGGCACAGGGACTGTCGAGTGTATGGGAGCCCTCAGGATGGTATCCCCT  646

Query  608  ACCTCACCCATCCCCTGTGTCATCAAGATGTGGTCAGCGTGGGACGGCTTCAGATCCGGGCCCTGGCTACACCT  681
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||.||.|||
Sbjct  647  ACCTCACCCACCCCCTGTGTCATCAAGATGTGGTCAGCGTGGGACGACTTCAGATTCGAGCCCTAGCCACCCCT  720

Query  682  GGCCACACACAAGGCCATCTGGTCTACCTACTGGATGGGGAGCCCTACAAGGGTCCCTCCTGCCTCTTCTCAGG  755
            ||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct  721  GGCCACACTCAAGGCCATCTGGTCTACCTGCTGGATGGGGAGCCCTACAAAGGTCCTTCCTGCCTCTTCTCAGG  794

Query  756  GGACCTGCTCTTCCTCTCTGGCTGTGGGCGGACCTTTGAGGGCAATGCAGAGACCATGCTGAGCTCACTGGACA  829
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||..||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  795  GGACCTGCTCTTCCTCTCTGGCTGTGGACGGACCTTCGAAGGCACAGCGGAGACCATGCTGAGCTCACTGGACA  868

Query  830  CTGTGCTGGGGCTAGGGGATGACACCCTTCTGTGGCCTGGTCATGAGTATGCAGAGGAGAACCTGGGCTTTGCA  903
            |||||.|.|..||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct  869  CTGTGTTAGACCTGGGGGATGACACCCTGCTGTGGCCTGGGCATGAATACGCAGAAGAGAACCTGGGCTTTGCA  942

Query  904  GGTGTGGTGGAGCCCGAGAACCTGGCCCGGGAGAGGAAGATGCAGTGGGTGCAGCGGCAGCGGCTGGAGCGCAA  977
            ||.||||||||||||||||||.||||.||.||||||||||||||||||||.|||.||||.|||.||||.|||||
Sbjct  943  GGCGTGGTGGAGCCCGAGAACTTGGCTCGTGAGAGGAAGATGCAGTGGGTACAGAGGCAACGGATGGAACGCAA  1016

Query  978  GGGCACGTGCCCATCTACCCTGGGAGAGGAGCGCTCCTACAACCCGTTCCTGAGAACCCACTGCCTGGCGCTAC  1051
            |.||||.||||||||.||||||||||||||.|||.||||||||||.||||||||||||||.|||||||..||||
Sbjct 1017  GAGCACATGCCCATCCACCCTGGGAGAGGAACGCGCCTACAACCCATTCCTGAGAACCCATTGCCTGGAACTAC  1090

Query 1052  AGGAGGCTCTGGGGCCGGGGCCGGGCCCCACTGGGGATGATGACTACTCCCGGGCCCAGCTCCTGGAAGAGCTC  1125
            ||||||||||||||||.|||||.||||||||..|.|||||.|.||.|||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1091  AGGAGGCTCTGGGGCCAGGGCCAGGCCCCACCAGTGATGACGGCTGCTCCCGGGCCCAGCTCCTGGAGGAGCTG  1164

Query 1126  CGCCGGCTGAAGGATATGCACAAGAGCAAG  1155
            |||||.||||||||.|||||.||.||||||
Sbjct 1165  CGCCGCCTGAAGGACATGCATAAAAGCAAG  1194