Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07990
• Subject: NM_001033520.1
• Aligned Length: 1320
• Identities: 1134
• Gaps: 180

Alignment

Query    1  ATGAACCTGGCGAGCCAGAGCGGGGAGGCCGGCGCCGGCCAGCTGCTCTTCGCCAACTTCAACCAGGACAACAC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GTCCCTAGCTGTTGGTAGTAAGTCCGGTTATAAATTTTTC-----------TCCCTTTCTTCTGTGGATAAGCT  137
                                              .|.|||           ||||||                 
Sbjct    1  ----------------------------------ATGTTCACGCATGTACTTCCCTT-----------------  23

Query  138  GGAACAGATCTATGAATGCA-CCGATACGGAAGATGTGTGCATTGTAGAGAGATTGTTCTCCAGCAGCCTAGTG  210
                      |.|||.|.|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   24  ----------TGTGATTTCAGCCGATACGGAAGATGTGTGCATTGTAGAGAGATTGTTCTCCAGCAGCCTAGTG  87

Query  211  GCCATCGTGAGCCTTAAAGCACCAAGGAAGCTAAAGGTTTGCCACTTTAAGAAGGGAACTGAGATCTGCAACTA  284
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   88  GCCATCGTCAGCCTTAAAGCACCAAGGAAGCTAAAGGTTTGCCACTTTAAGAAGGGAACTGAGATCTGCAACTA  161

Query  285  CAGCTACTCCAACACGATTCTGGCTGTGAAGCTCAACAGGCAGAGGCTGATAGTATGCCTGGAGGAGTCCCTGT  358
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  162  CAGCTACTCCAACACGATTCTGGCTGTGAAGCTCAACAGGCAGAGGCTGATAGTATGCCTGGAGGAGTCCCTGT  235

Query  359  ACATCCACAACATTCGGGACATGAAGGTGCTGCATACGATCAGGGAGACGCCTCCAAACCCTGCAGGCCTGTGT  432
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  236  ACATCCACAACATTCGGGACATGAAGGTGCTGCATACGATCAGGGAGACGCCTCCAAACCCTGCAGGCCTGTGT  309

Query  433  GCGCTGTCAATCAACAACGACAACTGCTACTTGGCGTACCCAGGGAGCGCGACCATCGGAGAGGTGCAGGTCTT  506
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  310  GCGCTGTCAATCAACAACGACAACTGCTACTTGGCGTACCCAGGGAGCGCGACCATCGGAGAGGTGCAGGTCTT  383

Query  507  CGATACCATTAATTTGAGAGCTGCAAACATGATTCCGGCTCACGACAGTCCTTTAGCGGCACTGGCCTTTGACG  580
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  384  CGATACCATTAATTTGAGAGCTGCAAACATGATTCCGGCTCACGACAGTCCTTTAGCGGCACTGGCCTTTGACG  457

Query  581  CAAGTGGAACTAAACTTGCCACGGCTTCGGAGAAGGGGACCGTGATTAGGGTATTTTCCATTCCAGAAGGACAA  654
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  458  CAAGTGGAACTAAACTTGCCACGGCTTCGGAGAAGGGGACCGTGATTAGGGTATTTTCCATTCCAGAAGGACAA  531

Query  655  AAACTCTTTGAGTTTCGGAGAGGAGTAAAGAGGTGCGTGAGCATCTGCTCCCTGGCCTTCAGCATGGACGGCAT  728
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  532  AAACTCTTTGAGTTTCGGAGAGGAGTAAAGAGGTGCGTGAGCATCTGCTCCCTGGCCTTCAGCATGGACGGCAT  605

Query  729  GTTCCTCTCCGCCTCCAGCAACACTGAGACCGTGCACATCTTCAAACTCGAGACTGTGAAAGAAAAACCCCCAG  802
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  606  GTTCCTCTCCGCCTCCAGCAACACTGAGACCGTGCACATCTTCAAACTCGAGACTGTGAAAGAAAAACCCCCAG  679

Query  803  AGGAGCCCACCACCTGGACCGGGTACTTCGGGAAAGTGCTCATGGCCTCCACCAGCTACCTGCCTTCCCAAGTG  876
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  680  AGGAGCCCACCACCTGGACCGGGTACTTCGGGAAAGTGCTCATGGCCTCCACCAGCTACCTGCCTTCCCAAGTG  753

Query  877  ACAGAAATGTTCAACCAGGGCAGAGCCTTCGCCACGGTCCGCCTGCCATTCTGCGGCCACAAAAACATCTGCTC  950
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  754  ACAGAAATGTTCAACCAGGGCAGAGCCTTCGCCACGGTCCGCCTGCCATTCTGCGGCCACAAAAACATCTGCTC  827

Query  951  GCTAGCCACAATTCAGAAGATCCCGCGGTTGTTGGTGGGTGCCGCCGACGGGTACCTGTACATGTACAACCTGG  1024
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  828  GCTAGCCACAATTCAGAAGATCCCGCGGTTGTTGGTGGGTGCCGCCGACGGGTACCTGTACATGTACAACCTGG  901

Query 1025  ACCCCCAGGAGGGCGGCGAGTGTGCCCTGATGAAGCAGCACCGGCTGGACGGCAGTCTGGAAACGACCAATGAG  1098
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  902  ACCCCCAGGAGGGCGGCGAGTGTGCCCTGATGAAGCAGCACCGGCTGGACGGCAGTCTGGAAACGACCAATGAG  975

Query 1099  ATCTTGGACTCTGCCTCTCACGACTGCCCCTTAGTCACTCAGACATACGGCGCAGCTGCAGGAAAAGGTACTTA  1172
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
Sbjct  976  ATCTTGGACTCTGCCTCTCACGACTGCCCCTTAGTCACTCAGACATACGGCGCAGCTGCAGGAAAA--------  1041

Query 1173  CGTGCCTTCATCCCCAACGAGACTTGCCTACACAGACGACCTGGGTGCTGTGGGTGGCGCCTGCCTGGAGGACG  1246
                                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1042  -------------------------GCCTACACAGACGACCTGGGTGCTGTGGGTGGCGCCTGCCTGGAGGACG  1090

Query 1247  AGGCCAGCGCCCTGCGCCTGGATGAGGACAGCGAGCACCCGCCCATGATTCTTCGGACTGAC  1308
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1091  AGGCCAGCGCCCTGCGCCTGGATGAGGACAGCGAGCACCCGCCCATGATTCTTCGGACTGAC  1152