Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07990
- Subject:
- NM_178398.4
- Aligned Length:
- 1335
- Identities:
- 1152
- Gaps:
- 27
Alignment
Query 1 ATGAACCTGGCGAGCCAGAGCGGGGAGGCCGGCGCCGGCCAGCTGCTCTTCGCCAACTTCAACCAGGACAACAC 74
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1 ATGAACCTGGCGAGCCAGAGCGGAGAGGCCGGCGCCGGCCAGCTGCTGTTCGCCAACTTCAACCAGGATAACAC 74
Query 75 GTCCCTAGCTGTTGGTAGTAAGTCCGGTTATAAATTTTTCTCCCTTTCTTCTGTGGATAAGCTGGAACAGATCT 148
|||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GTCCCTAGCTGTTGGTAGTAAGTCCGGGTATAAGTTTTTCTCCCTTTCTTCTGTGGATAAGCTGGAACAGATCT 148
Query 149 ATGAATGCACCGATACGGAAGATGTGTGCATTGTAGAGAGATTGTTCTCCAGCAGCCTAGTGGCCATCGTGAGC 222
||||||||||.||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||.|.||||||||.||.|||
Sbjct 149 ATGAATGCACTGACACTGAAGATGTCTGCATTGTGGAGAGATTGTTCTCAAGCAGCTTGGTGGCCATTGTCAGC 222
Query 223 CTTAAAGCACCAAGGAAGCTAAAGGTTTGCCACTTTAAGAAGGGAACTGAGATCTGCAACTACAGCTACTCCAA 296
||.|||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CTCAAAGCTCCCAGGAAGCTGAAGGTTTGCCATTTTAAGAAGGGAACTGAGATATGCAACTACAGCTACTCCAA 296
Query 297 CACGATTCTGGCTGTGAAGCTCAACAGGCAGAGGCTGATAGTATGCCTGGAGGAGTCCCTGTACATCCACAACA 370
|||.||.||||||||||||||.|||||||||.||||.||.||.||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||
Sbjct 297 CACTATCCTGGCTGTGAAGCTGAACAGGCAGCGGCTCATTGTGTGTCTGGAAGAGTCGCTCTACATACACAACA 370
Query 371 TTCGGGACATGAAGGTGCTGCATACGATCAGGGAGACGCCTCCAAACCCTGCAGGCCTGTGTGCGCTGTCAATC 444
|.||||||||||||||.||.|||||.|||.|.|||||.||.|||||||||||||||.|||||||.||||||||.
Sbjct 371 TCCGGGACATGAAGGTACTTCATACCATCCGAGAGACACCCCCAAACCCTGCAGGCTTGTGTGCACTGTCAATA 444
Query 445 AACAACGACAACTGCTACTTGGCGTACCCAGGGAGCGCGACCATCGGAGAGGTGCAGGTCTTCGATACCATTAA 518
|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||.|||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 445 AACAATGACAACTGCTACTTGGCGTATCCAGGGAGTGCGAGCATTGGAGAGGTGCAGGTCTTCGACACCATTAA 518
Query 519 TTTGAGAGCTGCAAACATGATTCCGGCTCACGACAGTCCTTTAGCGGCACTGGCCTTTGACGCAAGTGGAACTA 592
.||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||.||.|
Sbjct 519 CTTGAGAGCTGCAAACATGATCCCAGCTCATGATAGTCCCTTAGCAGCCCTGGCTTTTGATGCAAGTGGGACCA 592
Query 593 AACTTGCCACGGCTTCGGAGAAGGGGACCGTGATTAGGGTATTTTCCATTCCAGAAGGACAAAAACTCTTTGAG 666
|.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||.||||.||||||||||||||.|||||.||.||.||||||
Sbjct 593 AGCTTGCCACTGCTTCTGAGAAGGGGACTGTGATTCGGGTGTTTTCCATTCCAGAGGGACAGAAGCTGTTTGAG 666
Query 667 TTTCGGAGAGGAGTAAAGAGGTGCGTGAGCATCTGCTCCCTGGCCTTCAGCATGGACGGCATGTTCCTCTCCGC 740
||..||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TTCAGGAGAGGAGTGAAGAGGTGTGTGAGCATCTGCTCCCTGGCCTTCAGCATGGACGGCATGTTCCTCTCCGC 740
Query 741 CTCCAGCAACACTGAGACCGTGCACATCTTCAAACTCGAGACTGTGAAAGAAAAACCCCCAGAGGAGCCCACCA 814
.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||.||||||..||||||||.||.||.||||||||||
Sbjct 741 ATCCAGCAACACCGAAACAGTGCACATCTTCAAACTTGAGGCTGTGAGGGAAAAACCTCCGGAAGAGCCCACCA 814
Query 815 CCTGGACCGGGTACTTCGGGAAAGTGCTCATGGCCTCCACCAGCTACCTGCCTTCCCAAGTGACAGAAATGTTC 888
|||||||.||.|||||.|||||.||.||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 815 CCTGGACTGGCTACTTTGGGAAGGTTCTCATGGCATCTACCAGCTACCTGCCCTCACAAGTGACAGAAATGTTC 888
Query 889 AACCAGGGCAGAGCCTTCGCCACGGTCCGCCTGCCATTCTGCGGCCACAAAAACATCTGCTCGCTAGCCACAAT 962
|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||.|||||||
Sbjct 889 AACCAGGGCAGGGCCTTCGCCACTGTCCGCCTGCCATTCTGTGGCCACAAAAACATCTGCTCACTAACCACAAT 962
Query 963 TCAGAAGATCCCGCGGTTGTTGGTGGGTGCCGCCGACGGGTACCTGTACATGTACAACCTGGACCCCCAGGAGG 1036
||||||||||||.||||||.||||.||.||..|.||.||.||..||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TCAGAAGATCCCACGGTTGCTGGTAGGAGCATCAGATGGCTATTTGTACATGTACAACCTGGACCCCCAGGAGG 1036
Query 1037 GCGGCGAGTGTGCCCTGATGAAGCAGCACCGGCTGGACGGCAGTCTGGAAACGACCAATGAGATCTTGGACTCT 1110
|.|||||||||||.||||||...||||||.||||.||.||||||.||||.|||||||.|||.|||.|.||||||
Sbjct 1037 GAGGCGAGTGTGCGCTGATGCGTCAGCACAGGCTTGATGGCAGTATGGAGACGACCAGTGAAATCGTAGACTCT 1110
Query 1111 GCCTCTCACGACTGCCCCTTAGTCACTCAGACATACGGCGCAGCTGCAGGAAAAGGTACTTACGTGCCTTCATC 1184
||.|||||.|||||||||||||..||.|||||.||||||.||||.||.|..||||||.|.||.|||||.||.||
Sbjct 1111 GCATCTCATGACTGCCCCTTAGCAACACAGACGTACGGCACAGCAGCTGCCAAAGGTGCCTATGTGCCCTCGTC 1184
Query 1185 CCCAACGAGACTT---------------------------GCCTACACAGACGACCTGGGTGCTGTGGGTGGCG 1231
|||.||.|||||| |||||||||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1185 CCCCACAAGACTTGGGAAAGGGCAGGACGCCAACTTAGAAGCCTACACAGATGACCTGGGTGCTGTGGGTGGTG 1258
Query 1232 CCTGCCTGGAGGACGAGGCCAGCGCCCTGCGCCTGGATGAGGACAGCGAGCACCCGCCCATGATTCTTCGGACT 1305
|.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1259 CATGCCTAGAGGATGAAGCCAGCGCTCTGCGCCTGGATGAAGACAGCGAACATCCTCCCATGATTCTCCGGACT 1332
Query 1306 GAC 1308
|||
Sbjct 1333 GAC 1335