Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_08009
- Subject:
- NM_028049.2
- Aligned Length:
- 1214
- Identities:
- 1070
- Gaps:
- 13
Alignment
Query 1 ATGGAGCCGGTAGGCTGCTGCGGCGAGTGCCGCGGCTCCTCCGT----AGACCCGCGGAGCACCTTCGTGTTGA 70
||||||||||.||||.||.|.|||| |||.||||||| | |||.|||||.|||||||.||||.|||
Sbjct 1 ATGGAGCCGGCAGGCGGCGGTGGCG------GCGTCTCCTCC-TCCACAGATCCGCGAAGCACCTACGTGCTGA 67
Query 71 GTAACCTGGCGGAGGTGGTGGAGCGTGTGCTCACCTTCCTGCCCGCCAAGGCGTTGCTGCGGGTGGCCTGCGTG 144
|||||||.|||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.|||||.|||.||||.|||||.|||.|.||.
Sbjct 68 GTAACCTTGCGGAGGTGGTGGAGCGTGTGTTTACCTTCCTGCCGGCCAAAGCGCTGCTTCGGGTAGCCGGAGTA 141
Query 145 TGCCGCTTATGGAGGGAGTGTGTGCGCAGAGTATTGCGGACCCATCGGAGCGTAACCTGGATCTCCGCAGGCCT 218
||||||.|.||||||||||||||.||||||||..|||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||..|
Sbjct 142 TGCCGCCTGTGGAGGGAGTGTGTACGCAGAGTGCTGCGGACCCATCGCAGCGTGACCTGGATCTCCGCGGGTGT 215
Query 219 GGCGGAGGCCGGCCACCTGGAGGGGCATTGCTTGGTTCGCGTGGTAGCAGAGGAGCTTGAGAATGTTCGCATCT 292
|||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||.|||||||||||||||.||||
Sbjct 216 GGCTGAAGCGGGCCACCTGGAGGGACATTGCTTGGTGCGCGTGGTAGCTGAGGCGCTTGAGAATGTTCGAATCT 289
Query 293 TACCACATACAGTTCTTTACATGGCTGATTCAGAAACTTTCATTAGTCTGGAAGAGTGTCGTGGCCATAAGAGA 366
|||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 290 TACCACAGACAGTTCTCTACATGGCAGATTCTGAAACTTTCATCAGCCTGGAAGAGTGTCGTGGCCATAAAAGA 363
Query 367 GCAAGGAAAAGAACTAGTATGGAAACAGCACTTGCCCTTGAGAAGCTATTCCCCAAACAATGCCAAGTCCTTGG 440
||.|||||.|||||||.||||||.||||||..||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 364 GCGAGGAAGAGAACTACTATGGAGACAGCATGTGCCCTGGAGAAGCTTTTCCCCAAGCAGTGCCAAGTCCTTGG 437
Query 441 GATTGTGACCCCAGGAATTGTAGTGACTCCAATGGGATCAGGTAGCAATCGACCTCAGGAAATAGAAATTGGAG 514
||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 438 GATTGTGACCCCGGGAATTGTGGTGACTCCAATGGGATCAGGTAGCAATCGACCTCAGGAAATAGAAATTGGAG 511
Query 515 AATCTGGTTTTGCTTTATTATTCCCTCAAATTGAAGGAATAAAAATACAACCCTTTCATTTTATTAAGGA-TCC 587
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 512 AATCTGGTTTTGCTTTATTATTCCCTCAAATTGAAGGAATAAAAATTCAACCCTTTCATTTTATTAAGGACTCC 585
Query 588 AAAGAATTTAACATTAGAAAGACATCAACTCACTGAAGTAGGTCTTTTAGATAACCCTGAACTTCGTGTGGTCC 661
||||||||||||.|.||||||||.||.||.|||||||||||||||.|.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 586 -AAGAATTTAACACTCGAAAGACACCAGCTTACTGAAGTAGGTCTTCTGGACAACCCTGAACTTCGTGTGGTCC 658
Query 662 TTGTCTTTGGTTATAATTGCTGTAAGGTGGGAGCCAGTAATTATCTGCAGCAAGTAGTCAGCACTTTCAGTGAT 735
||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|..|||||||||||||||||.|||
Sbjct 659 TTGTCTTTGGCTATAACTGCTGTAAGGTGGGAGCCAGTAATTACCTGCATCGGGTAGTCAGCACTTTCAGCGAT 732
Query 736 ATGAATATCATCTTGGCTGGAGGCCAGGTGGACAACCTGTCATCACTGACTTCTGAAAAGAACCCTCTGGATAT 809
|||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||.|||||.||||.|||.|||||||||||||||||
Sbjct 733 ATGAATATCATCTTGGCTGGAGGCCAGGTGGACAATTTGTCTTCACTTACTTGTGAGAAGAACCCTCTGGATAT 806
Query 810 TGATGCCTCGGGTGTGGTTGGACTGTCATTTAGTGGACACCGAATCCAGAGTGCCACTGTGCTCCTCAACGAGG 883
|||||||.|.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||..||||
Sbjct 807 TGATGCCACAGGTGTGGTTGGACTGTCATTTAGTGGGCACCGAATCCAGAGTGCCACAGTTCTCCTCACTGAGG 880
Query 884 ACGTCAGTGATGAGAAGACTGCTGAGGCTGCGATGCAGCGCCTCAAAGCGGCCAACATTCCAGAGCATAACACC 957
|.||.|.|||||..|||||.|..||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.||||||
Sbjct 881 ATGTAAATGATGCCAAGACCGTCGAGGCTGCTATGCAGCGCCTCAAAGCAGCCAACATCCCTGAACAGAACACC 954
Query 958 ATTGGCTTCATGTTTGCATGCGTTGGCAGGGGCTTTCAGTATTACAGAGCCAAGGGGAATGTTGAGGCTGATGC 1031
|||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 955 ATTGGCTTCATGTTTGCATGCGTTGGCCGAGGCTTTCAGTACTACAGAGCCAAGGGGAATGTTGAAGCTGATGC 1028
Query 1032 ATTTAGAAAGTTTTTTCCTAGTGTTCCCTTATTCGGCTTCTTTGGAAATGGAGAAATTGGATGTGATCGGATAG 1105
||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.||.|||||||
Sbjct 1029 ATTTAGAAAGTTCTTTCCCAGTGTCCCCTTATTTGGCTTCTTTGGAAATGGGGAGATTGGCTGCGACCGGATAG 1102
Query 1106 TCACTGGGAACTTTATATTGAGGAAATGTAATGAGGTAAAAGATGATGATCTGTTTCATAGCTATACAACAATA 1179
|||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||.||.||.||.|||||.||||||||.|||||.||.
Sbjct 1103 TCACTGGGAACTTTATACTGAGGAGATGTAATGAGGTAAAGGAAGAGGACCTGTTCCATAGCTACACAACCATC 1176
Query 1180 ATGGCACTCATACATCTGGGGTCATTTAAA 1209
|||||.|||.|.||.|||||..|.|.||||
Sbjct 1177 ATGGCTCTCGTTCACCTGGGAACCTCTAAA 1206