Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08018
• Subject: XM_005256340.4
• Aligned Length: 1258
• Identities: 1151
• Gaps: 101

Alignment

Query    1  ATGAAGTGTAAGCACTGCACGCGCAAGGAATGTAGTAAGAAAACAAAAACTGATGACCAAGAGAATGTGTCAGC  74
                                                                |||||        ||   |||.
Sbjct    1  ----------------------------------------------------ATGAC--------TG---CAGA  11

Query   75  CGATGCACCGAGTCCA----GCCCAGGAAAAT-----GGA-------------------------GAGAAATGT  114
            .||.|    |||||||    .|||||.|||||     |||                         .||||||||
Sbjct   12  GGAAG----GAGTCCAACTTTCCCAGCAAAATGCCAAGGACTTCTTCCGCGTTCTGAACCTTAACAAGAAATGT  81

Query  115  GATACCTCAAAGCACAAAGTGCTGGTAGTGTCTGTGTGTCCTCAATCTTTGCCTTATTTTGCTGCTAAATTCAA  188
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   82  GATACCTCAAAGCACAAAGTGCTGGTAGTGTCTGTGTGTCCTCAATCTTTGCCTTATTTTGCTGCTAAATTCAA  155

Query  189  CCTCAGTGTAACTGATGCATCCAGAAGACTCTGTGGTTTCCTCAAAAGTCTTGGGGTGCACTATGTATTTGATA  262
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  156  CCTCAGTGTAACTGATGCATCCAGAAGACTCTGTGGTTTCCTCAAAAGTCTTGGGGTGCACTATGTATTTGATA  229

Query  263  CGACGATAGCTGCGGATTTTAGTATCCTGGAGAGTCAAAAAGAATTCGTGCGTCGCTATCGCCAGCACAGTGAG  336
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  230  CGACGATAGCTGCGGATTTTAGTATCCTGGAGAGTCAAAAAGAATTCGTGCGTCGCTATCGCCAGCACAGTGAG  303

Query  337  GAGGAACGCACCCTGCCCATGCTGACCTCTGCCTGTCCTGGCTGGGTCCGATACGCCGAGCGGGTGCTGGGTCG  410
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  304  GAGGAACGCACCCTGCCCATGCTGACCTCTGCCTGTCCTGGCTGGGTCCGATACGCCGAGCGGGTGCTGGGTCG  377

Query  411  CCCCATCACTGCCCACCTCTGCACCGCCAAGTCCCCCCAGCAGGTCATGGGCTCTTTGGTGAAGGATTATTTCG  484
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  378  CCCCATCACTGCCCACCTCTGCACCGCCAAGTCCCCCCAGCAGGTCATGGGCTCTTTGGTGAAGGATTATTTCG  451

Query  485  CCAGACAGCAGAACCTGTCTCCAGAGAAGATTTTCCACGTCATTGTGGCCCCTTGTTATGACAAGAAGCTGGAG  558
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  452  CCAGACAGCAGAACCTGTCTCCAGAGAAGATTTTCCACGTCATTGTGGCCCCTTGTTATGACAAGAAGCTGGAG  525

Query  559  GCTCTTCAGGAAAGCCTTCCCCCTGCTTTGCATGGCTCCCGGGGCGCTGACTGCGTGTTAACATCAGGTGAAAT  632
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  526  GCTCTTCAGGAAAGCCTTCCCCCTGCTTTGCATGGCTCCCGGGGCGCTGACTGCGTGTTAACATCAGGTGAAAT  599

Query  633  TGCTCAAATAATGGAGCAAGGTGACCTCTCAGTGAGAGATGCTGCCGTCGACACTCTGTTTGGAGACTTGAAGG  706
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  600  TGCTCAAATAATGGAGCAAGGTGACCTCTCAGTGAGAGATGCTGCCGTCGACACTCTGTTTGGAGACTTGAAGG  673

Query  707  AGGACAAAGTGACGCGTCATGATGGAGCCAGCTCAGACGGGCACCTGGCACACATCTTCAGACATGCGGCCAAG  780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  674  AGGACAAAGTGACGCGTCATGATGGAGCCAGCTCAGACGGGCACCTGGCACACATCTTCAGACATGCGGCCAAG  747

Query  781  GAGCTGTTCAACGAGGATGTGGAGGAGGTCACTTACCGAGCCCTGAGAAACAAAGACTTCCAAGAGGTCACCCT  854
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  748  GAGCTGTTCAACGAGGATGTGGAGGAGGTCACTTACCGAGCCCTGAGAAACAAAGACTTCCAAGAGGTCACCCT  821

Query  855  TGAGAAGAACGGAGAGGTGGTGTTACGCTTTGCTGCAGCCTATGGCTTTCGAAACATCCAGAACATGATCCTGA  928
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  822  TGAGAAGAACGGAGAGGTGGTGTTACGCTTTGCTGCAGCCTATGGCTTTCGAAACATCCAGAACATGATCCTGA  895

Query  929  AGCTTAAGAAGGGCAAGTTCCCATTCCACTTTGTGGAGGTCCTCGCCTGTGCTGGAGGATGCTTAAATGGCAGA  1002
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  896  AGCTTAAGAAGGGCAAGTTCCCATTCCACTTTGTGGAGGTCCTCGCCTGTGCTGGAGGATGCTTAAATGGCAGA  969

Query 1003  GGCCAAGCCCAGACTCCAGACGGACATGCGGATAAGGCCCTGCTGCGGCAGATGGAAGGCATTTACGCTGACAT  1076
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  970  GGCCAAGCCCAGACTCCAGACGGACATGCGGATAAGGCCCTGCTGCGGCAGATGGAAGGCATTTACGCTGACAT  1043

Query 1077  CCCTGTGCGGCGTCCGGAGTCCAGTGCACACGTGCAGGAGCTGTACCAGGAGTGGCTGGAGGGGATCAACTCCC  1150
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1044  CCCTGTGCGGCGTCCGGAGTCCAGTGCACACGTGCAGGAGCTGTACCAGGAGTGGCTGGAGGGGATCAACTCCC  1117

Query 1151  CCAAGGCCCGAGAGGTGCTGCATACCACGTACCAGAGCCAGGAGCGTGGCACACACAGCCTGGACATCAAGTGG  1224
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1118  CCAAGGCCCGAGAGGTGCTGCATACCACGTACCAGAGCCAGGAGCGTGGCACACACAGCCTGGACATCAAGTGG  1191