Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08018
• Subject: XM_006722278.4
• Aligned Length: 1368
• Identities: 1088
• Gaps: 279

Alignment

Query    1  ATGAAGTGTAAGCACTGCACGCGCAAGGAATGTAGTAAGAAAACAAAAACTGATGACCAAGAGAATGTGTCAGC  74
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAGTGTGAGCACTGCACGCGCAAGGAATGTAGTAAGAAAACAAAAACTGATGACCAAGAGAATGTGTCAGC  74

Query   75  CGATGCACCGAGTCCAGCCCAGGAAAATGGAG------------------------------------------  106
            ||||||||||||||||||||||||||||||||                                          
Sbjct   75  CGATGCACCGAGTCCAGCCCAGGAAAATGGAGAGAAGGGAGAATTCCACAAGTTGGCTGATGCCAAGATATTTT  148

Query  107  --------------------------------------------------------------------------  106
                                                                                      
Sbjct  149  TGAGCGACTGCCTGGCATGTGACAGCTGTATGACTGCAGAGGAAGGAGTCCAACTTTCCCAGCAAAATGCCAAG  222

Query  107  ----------------------------AGAAATGTGATACCTCAAAGCACAAAGTGCTGGTAGTGTCTGTGTG  152
                                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACTTCTTCCGCGTTCTGAACCTTAACAAGAAATGTGATACCTCAAAGCACAAAGTGCTGGTAGTGTCTGTGTG  296

Query  153  TCCTCAATCTTTGCCTTATTTTGCTGCTAAATTCAACCTCAGTGTAACTGATGCATCCAGAAGACTCTGTGGTT  226
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCCTCAATCTTTGCCTTATTTTGCTGCTAAATTCAACCTCAGTGTAACTGATGCATCCAGAAGACTCTGTGGTT  370

Query  227  TCCTCAAAAGTCTTGGGGTGCACTATGTATTTGATACGACGATAGCTGCGGATTTTAGTATCCTGGAGAGTCAA  300
            |||||||||||||                                                             
Sbjct  371  TCCTCAAAAGTCT-------------------------------------------------------------  383

Query  301  AAAGAATTCGTGCGTCGCTATCGCCAGCACAGTGAGGAGGAACGCACCCTGCCCATGCTGACCTCTGCCTGTCC  374
                                                                                      
Sbjct  384  --------------------------------------------------------------------------  383

Query  375  TGGCTGGGTCCGATACGCCGAGCGGGTGCTGGGTCGCCCCATCACTGCCCACCTCTGCACCGCCAAGTCCCCCC  448
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  384  TGGCTGGGTCCGATACGCCGAGCGGGTGCTGGGTCGCCCCATCACTGCCCACCTCTGCACCGCCAAGTCCCCCC  457

Query  449  AGCAGGTCATGGGCTCTTTGGTGAAGGATTATTTCGCCAGACAGCAGAACCTGTCTCCAGAGAAGATTTTCCAC  522
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  458  AGCAGGTCATGGGCTCTTTGGTGAAGGATTATTTCGCCAGACAGCAGAACCTGTCTCCAGAGAAGATTTTCCAC  531

Query  523  GTCATTGTGGCCCCTTGTTATGACAAGAAGCTGGAGGCTCTTCAGGAAAGCCTTCCCCCTGCTTTGCATGGCTC  596
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  532  GTCATTGTGGCCCCTTGTTATGACAAGAAGCTGGAGGCTCTTCAGGAAAGCCTTCCCCCTGCTTTGCATGGCTC  605

Query  597  CCGGGGCGCTGACTGCGTGTTAACATCAGGTGAAATTGCTCAAATAATGGAGCAAGGTGACCTCTCAGTGAGAG  670
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  606  CCGGGGCGCTGACTGCGTGTTAACATCAGGTGAAATTGCTCAAATAATGGAGCAAGGTGACCTCTCAGTGAGAG  679

Query  671  ATGCTGCCGTCGACACTCTGTTTGGAGACTTGAAGGAGGACAAAGTGACGCGTCATGATGGAGCCAGCTCAGAC  744
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  680  ATGCTGCCGTCGACACTCTGTTTGGAGACTTGAAGGAGGACAAAGTGACGCGTCATGATGGAGCCAGCTCAGAC  753

Query  745  GGGCACCTGGCACACATCTTCAGACATGCGGCCAAGGAGCTGTTCAACGAGGATGTGGAGGAGGTCACTTACCG  818
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  754  GGGCACCTGGCACACATCTTCAGACATGCGGCCAAGGAGCTGTTCAACGAGGATGTGGAGGAGGTCACTTACCG  827

Query  819  AGCCCTGAGAAACAAAGACTTCCAAGAGGTCACCCTTGAGAAGAACGGAGAGGTGGTGTTACGCTTTGCTGCAG  892
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  828  AGCCCTGAGAAACAAAGACTTCCAAGAGGTCACCCTTGAGAAGAACGGAGAGGTGGTGTTACGCTTTGCTGCAG  901

Query  893  CCTATGGCTTTCGAAACATCCAGAACATGATCCTGAAGCTTAAGAAGGGCAAGTTCCCATTCCACTTTGTGGAG  966
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  902  CCTATGGCTTTCGAAACATCCAGAACATGATCCTGAAGCTTAAGAAGGGCAAGTTCCCATTCCACTTTGTGGAG  975

Query  967  GTCCTCGCCTGTGCTGGAGGATGCTTAAATGGCAGAGGCCAAGCCCAGACTCCAGACGGACATGCGGATAAGGC  1040
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  976  GTCCTCGCCTGTGCTGGAGGATGCTTAAATGGCAGAGGCCAAGCCCAGACTCCAGACGGACATGCGGATAAGGC  1049

Query 1041  CCTGCTGCGGCAGATGGAAGGCATTTACGCTGACATCCCTGTGCGGCGTCCGGAGTCCAGTGCACACGTGCAGG  1114
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1050  CCTGCTGCGGCAGATGGAAGGCATTTACGCTGACATCCCTGTGCGGCGTCCGGAGTCCAGTGCACACGTGCAGG  1123

Query 1115  AGCTGTACCAGGAGTGGCTGGAGGGGATCAACTCCCCCAAGGCCCGAGAGGTGCTGCATACCACGTACCAGAGC  1188
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1124  AGCTGTACCAGGAGTGGCTGGAGGGGATCAACTCCCCCAAGGCCCGAGAGGTGCTGCATACCACGTACCAGAGC  1197

Query 1189  CAGGAGCGTGGCACACACAGCCTGGACATCAAGTGG  1224
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1198  CAGGAGCGTGGCACACACAGCCTGGACATCAAGTGG  1233