Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08060
• Subject: XM_011523000.1
• Aligned Length: 1785
• Identities: 1673
• Gaps: 111

Alignment

Query    1  ATGAGCGCGGGCTCGGAGCGCGGGGCGGCGGCAACCCCCGGGGGTTTGCCCGCGCCCTGCGCCTCGAAGGTGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGCGCGGGCTCGGAGCGCGGGGCGGCGGCAACCCCCGGGGGTTTGCCCGCGCCCTGCGCCTCGAAGGTGGA  74

Query   75  GCTGCGGCTCAGCTGCCGGCACCTGCTGGACCGCGACCCGCTCACCAAGTCCGACCCCAGCGTGGCGTTGCTGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCTGCGGCTCAGCTGCCGGCACCTGCTGGACCGCGACCCGCTCACCAAGTCCGACCCCAGCGTGGCGTTGCTGC  148

Query  149  AGCAGGCGCAGGGCCAGTGGGTGCAGGTGGGCAGAACCGAGGTGGTCCGGAGCAGCCTGCATCCCGTGTTCTCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGCAGGCGCAGGGCCAGTGGGTGCAGGTGGGCAGAACCGAGGTGGTCCGGAGCAGCCTGCATCCCGTGTTCTCC  222

Query  223  AAGGTCTTCACGGTGGACTACTACTTCGAGGAGGTGCAGAGGCTGCGCTTTGAGGTGTACGACACGCATGGGCC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAGGTCTTCACGGTGGACTACTACTTCGAGGAGGTGCAGAGGCTGCGCTTTGAGGTGTACGACACGCATGGGCC  296

Query  297  CAGCGGCTTCAGCTGTCAGGAGGACGATTTCCTGGGGGGCATGGAGTGCACCCTGGGGCAGATTGTGGCCCAGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAGCGGCTTCAGCTGTCAGGAGGACGATTTCCTGGGGGGCATGGAGTGCACCCTGGGGCAGATTGTGGCCCAGA  370

Query  371  AGAAGGTGACCCGCCCGCTGCTGCTCAAGTTTGGCAGGAACGCTGGCAAGTCCACCATCACGGTGATCGCCGAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGAAGGTGACCCGCCCGCTGCTGCTCAAGTTTGGCAGGAACGCTGGCAAGTCCACCATCACGGTGATCGCCGAG  444

Query  445  GACATCTCGGGGAACAACGGCTACGTGGAGCTCTCCTTCCGGGCCAGGAAGCTGGACGACAAGGACCTCTTCAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GACATCTCGGGGAACAACGGCTACGTGGAGCTCTCCTTCCGGGCCAGGAAGCTGGACGACAAGGACCTCTTCAG  518

Query  519  CAAGTCCGACCCCTTCCTGGAGCTCTACAGGGTCAACGACGACCAGGGCTTGCAGCTGGTGTACAGGACGGAGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAAGTCCGACCCCTTCCTGGAGCTCTACAGGGTCAACGACGACCAGGGCTTGCAGCTGGTGTACAGGACGGAGG  592

Query  593  TGGTGAAGAACAACCTGAACCCGGTGTGGGAGGCCTTCAAAGTCTCTCTGAGTTCCCTCTGCAGCTGCGAGGAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGGTGAAGAACAACCTGAACCCGGTGTGGGAGGCCTTCAAAGTCTCTCTGAGTTCCCTCTGCAGCTGCGAGGAG  666

Query  667  ACAAGGCCTCTAAAGTGCCTGGTCTGGGATTACGACTCTCGAGGAAAGCACGACTTCATCGGAGAATTCTCTAC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACAAGGCCTCTAAAGTGCCTGGTCTGGGATTACGACTCTCGAGGAAAGCACGACTTCATCGGAGAATTCTCTAC  740

Query  741  CACCTTCGAGGAGATGCAGAAGGCCTTTGAGGAGGGGCAGGCCCAGTGGGACTGTGTGAACCCCAAATACAAGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CACCTTCGAGGAGATGCAGAAGGCCTTTGAGGAGGGGCAGGCCCAGTGGGACTGTGTGAACCCCAAATACAAGC  814

Query  815  AGAAGAGACGCAGTTATAAGAACTCAGGAGTGGTCGTCCTGGCTGACCTCAAGTTCCACAGGGTGTACTCCTTC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGAAGAGACGCAGTTATAAGAACTCAGGAGTGGTCGTCCTGGCTGACCTCAAGTTCCACAGGGTGTACTCCTTC  888

Query  889  CTGGACTATATCATGGGCGGCTGCCAGATCCACTTCACCGTGGCCATTGACTTCACCGCCTCCAATGGAGACCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTGGACTATATCATGGGCGGCTGCCAGATCCACTTCACCGTGGCCATTGACTTCACCGCCTCCAATGGAGACCC  962

Query  963  GCGGAACAGCTGCTCCCTGCACTACATCAACCCCTACCAGCCGAACGAGTACCTGAAGGCACTGGTGTCCGTGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCGGAACAGCTGCTCCCTGCACTACATCAACCCCTACCAGCCGAACGAGTACCTGAAGGCACTGGTGTCCGTGG  1036

Query 1037  GCGAGATCTGCCAGGACTATGACAGTGACAAGAGGTTTTCCGCTTTGGGGTTTGGAGCCCGGATCCCTCCCAAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCGAGATCTGCCAGGACTATGACAGTGACAAGAGGTTTTCCGCTTTGGGGTTTGGAGCCCGGATCCCTCCCAAG  1110

Query 1111  TATGAGGTGTCCCATGACTTTGCCATCAATTTCAACCCTGAGGACGATGAGTGTGAAGGCATCCAGGGCGTGGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TATGAGGTGTCCCATGACTTTGCCATCAATTTCAACCCTGAGGACGATGAGTGTGAAGGCATCCAGGGCGTGGT  1184

Query 1185  GGAGGCCTACCAGAACTGCCTGCCCAGGGTCCAGCTCTACGGCCCCACCAACGTGGCGCCCATCATCTCCAAGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGAGGCCTACCAGAACTGCCTGCCCAGGGTCCAGCTCTACGGCCCCACCAACGTGGCGCCCATCATCTCCAAGG  1258

Query 1259  TGGCACGCGTGGCGGCGGCCGAGGAGAGCACCGGGAAAGCCTCTCAATACTACATCCTGCTGATCCTGACGGAC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGGCACGCGTGGCGGCGGCCGAGGAGAGCACCGGGAAAGCCTCTCAATACTACATCCTGCTGATCCTGACGGAC  1332

Query 1333  GGCGTGGTGACCGACATGGCCGACACACGGGAGGCCATTGTGCGTGCCTCACGCCTGCCCATGTCCATCATCAT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GGCGTGGTGACCGACATGGCCGACACACGGGAGGCCATTGTGCGTGCCTCACGCCTGCCCATGTCCATCATCAT  1406

Query 1407  CGTGGGCGTGGGCAACGCCGACTTCACCGACATGCAGGTCCTGGACGGCGACGACGGCGTCCTGCGCTCCCCAC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CGTGGGCGTGGGCAACGCCGACTTCACCGACATGCAGGTCCTGGACGGCGACGACGGCGTCCTGCGCTCCCCAC  1480

Query 1481  GGGGTGAGCCCGCGCTCCGGGACATCGTACAGTTCGTGCCCTTCCGGGAGCTCAAGA-----------------  1537
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 
Sbjct 1481  GGGGTGAGCCCGCGCTCCGGGACATCGTACAGTTCGTGCCCTTCCGGGAGCTCAAGAACCAGAGAACAGCACAA  1554

Query 1538  --------------------------------------------------------------------------  1537
                                                                                      
Sbjct 1555  GGGGCTCCTGGGATCCACCACGCGGCTTCCCCCGTTGCTGCCAACCTCTGCGACCCGGCGAGACACGCACAGCA  1628

Query 1538  ---ACGCATCCCCTGCGGCGCTGGCCAAGTGCGTGCTGGCCGAGGTCCCGAAGCAGGTGGTGGAGTACTACAGC  1608
               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CACACGCATCCCCTGCGGCGCTGGCCAAGTGCGTGCTGGCCGAGGTCCCGAAGCAGGTGGTGGAGTACTACAGC  1702

Query 1609  CACAGAGGCCTGCCCCCGAGAAGCCTGGGCGTCCCTGCCGGAGAGGCCAGCCCAGGCTGCACACCG--------  1674
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
Sbjct 1703  CACAGAGGCCTGCCCCCGAGAAGCCTGGGTGTCCCTGCCGGAGAGGCCAGCCCAGGCTGCACACCGTGAAGATG  1776

Query 1675  ---------  1674
                     
Sbjct 1777  TGGAGGGCG  1785