Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08060
• Subject: XM_017023140.2
• Aligned Length: 1797
• Identities: 1673
• Gaps: 123

Alignment

Query    1  ATGAGCGCGGGCTCGGAGCGCGGGGCGGCGGCAACCCCCGGGGGTTTGCCCGCGCCCTGCGCCTCGAAGGTGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGCGCGGGCTCGGAGCGCGGGGCGGCGGCAACCCCCGGGGGTTTGCCCGCGCCCTGCGCCTCGAAGGTGGA  74

Query   75  GCTGCGGCTCAGCTGCCGGCACCTGCTGGACCGCGACCCGCTCACCAAGTCCGACCCCAGCGTGGCGTTGCTGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCTGCGGCTCAGCTGCCGGCACCTGCTGGACCGCGACCCGCTCACCAAGTCCGACCCCAGCGTGGCGTTGCTGC  148

Query  149  AGCAGGCGCAGGGCCAGTGGG------------TGCAGGTGGGCAGAACCGAGGTGGTCCGGAGCAGCCTGCAT  210
            |||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGCAGGCGCAGGGCCAGTGGGTGCAGGTGCACTTGCAGGTGGGCAGAACCGAGGTGGTCCGGAGCAGCCTGCAT  222

Query  211  CCCGTGTTCTCCAAGGTCTTCACGGTGGACTACTACTTCGAGGAGGTGCAGAGGCTGCGCTTTGAGGTGTACGA  284
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCCGTGTTCTCCAAGGTCTTCACGGTGGACTACTACTTCGAGGAGGTGCAGAGGCTGCGCTTTGAGGTGTACGA  296

Query  285  CACGCATGGGCCCAGCGGCTTCAGCTGTCAGGAGGACGATTTCCTGGGGGGCATGGAGTGCACCCTGGGGCAGA  358
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CACGCATGGGCCCAGCGGCTTCAGCTGTCAGGAGGACGATTTCCTGGGGGGCATGGAGTGCACCCTGGGGCAGA  370

Query  359  TTGTGGCCCAGAAGAAGGTGACCCGCCCGCTGCTGCTCAAGTTTGGCAGGAACGCTGGCAAGTCCACCATCACG  432
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTGTGGCCCAGAAGAAGGTGACCCGCCCGCTGCTGCTCAAGTTTGGCAGGAACGCTGGCAAGTCCACCATCACG  444

Query  433  GTGATCGCCGAGGACATCTCGGGGAACAACGGCTACGTGGAGCTCTCCTTCCGGGCCAGGAAGCTGGACGACAA  506
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTGATCGCCGAGGACATCTCGGGGAACAACGGCTACGTGGAGCTCTCCTTCCGGGCCAGGAAGCTGGACGACAA  518

Query  507  GGACCTCTTCAGCAAGTCCGACCCCTTCCTGGAGCTCTACAGGGTCAACGACGACCAGGGCTTGCAGCTGGTGT  580
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGACCTCTTCAGCAAGTCCGACCCCTTCCTGGAGCTCTACAGGGTCAACGACGACCAGGGCTTGCAGCTGGTGT  592

Query  581  ACAGGACGGAGGTGGTGAAGAACAACCTGAACCCGGTGTGGGAGGCCTTCAAAGTCTCTCTGAGTTCCCTCTGC  654
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACAGGACGGAGGTGGTGAAGAACAACCTGAACCCGGTGTGGGAGGCCTTCAAAGTCTCTCTGAGTTCCCTCTGC  666

Query  655  AGCTGCGAGGAGACAAGGCCTCTAAAGTGCCTGGTCTGGGATTACGACTCTCGAGGAAAGCACGACTTCATCGG  728
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGCTGCGAGGAGACAAGGCCTCTAAAGTGCCTGGTCTGGGATTACGACTCTCGAGGAAAGCACGACTTCATCGG  740

Query  729  AGAATTCTCTACCACCTTCGAGGAGATGCAGAAGGCCTTTGAGGAGGGGCAGGCCCAGTGGGACTGTGTGAACC  802
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGAATTCTCTACCACCTTCGAGGAGATGCAGAAGGCCTTTGAGGAGGGGCAGGCCCAGTGGGACTGTGTGAACC  814

Query  803  CCAAATACAAGCAGAAGAGACGCAGTTATAAGAACTCAGGAGTGGTCGTCCTGGCTGACCTCAAGTTCCACAGG  876
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCAAATACAAGCAGAAGAGACGCAGTTATAAGAACTCAGGAGTGGTCGTCCTGGCTGACCTCAAGTTCCACAGG  888

Query  877  GTGTACTCCTTCCTGGACTATATCATGGGCGGCTGCCAGATCCACTTCACCGTGGCCATTGACTTCACCGCCTC  950
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTGTACTCCTTCCTGGACTATATCATGGGCGGCTGCCAGATCCACTTCACCGTGGCCATTGACTTCACCGCCTC  962

Query  951  CAATGGAGACCCGCGGAACAGCTGCTCCCTGCACTACATCAACCCCTACCAGCCGAACGAGTACCTGAAGGCAC  1024
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAATGGAGACCCGCGGAACAGCTGCTCCCTGCACTACATCAACCCCTACCAGCCGAACGAGTACCTGAAGGCAC  1036

Query 1025  TGGTGTCCGTGGGCGAGATCTGCCAGGACTATGACAGTGACAAGAGGTTTTCCGCTTTGGGGTTTGGAGCCCGG  1098
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGGTGTCCGTGGGCGAGATCTGCCAGGACTATGACAGTGACAAGAGGTTTTCCGCTTTGGGGTTTGGAGCCCGG  1110

Query 1099  ATCCCTCCCAAGTATGAGGTGTCCCATGACTTTGCCATCAATTTCAACCCTGAGGACGATGAGTGTGAAGGCAT  1172
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATCCCTCCCAAGTATGAGGTGTCCCATGACTTTGCCATCAATTTCAACCCTGAGGACGATGAGTGTGAAGGCAT  1184

Query 1173  CCAGGGCGTGGTGGAGGCCTACCAGAACTGCCTGCCCAGGGTCCAGCTCTACGGCCCCACCAACGTGGCGCCCA  1246
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCAGGGCGTGGTGGAGGCCTACCAGAACTGCCTGCCCAGGGTCCAGCTCTACGGCCCCACCAACGTGGCGCCCA  1258

Query 1247  TCATCTCCAAGGTGGCACGCGTGGCGGCGGCCGAGGAGAGCACCGGGAAAGCCTCTCAATACTACATCCTGCTG  1320
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCATCTCCAAGGTGGCACGCGTGGCGGCGGCCGAGGAGAGCACCGGGAAAGCCTCTCAATACTACATCCTGCTG  1332

Query 1321  ATCCTGACGGACGGCGTGGTGACCGACATGGCCGACACACGGGAGGCCATTGTGCGTGCCTCACGCCTGCCCAT  1394
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATCCTGACGGACGGCGTGGTGACCGACATGGCCGACACACGGGAGGCCATTGTGCGTGCCTCACGCCTGCCCAT  1406

Query 1395  GTCCATCATCATCGTGGGCGTGGGCAACGCCGACTTCACCGACATGCAGGTCCTGGACGGCGACGACGGCGTCC  1468
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GTCCATCATCATCGTGGGCGTGGGCAACGCCGACTTCACCGACATGCAGGTCCTGGACGGCGACGACGGCGTCC  1480

Query 1469  TGCGCTCCCCACGGGGTGAGCCCGCGCTCCGGGACATCGTACAGTTCGTGCCCTTCCGGGAGCTCAAGA-----  1537
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
Sbjct 1481  TGCGCTCCCCACGGGGTGAGCCCGCGCTCCGGGACATCGTACAGTTCGTGCCCTTCCGGGAGCTCAAGAACCAG  1554

Query 1538  --------------------------------------------------------------------------  1537
                                                                                      
Sbjct 1555  AGAACAGCACAAGGGGCTCCTGGGATCCACCACGCGGCTTCCCCCGTTGCTGCCAACCTCTGCGACCCGGCGAG  1628

Query 1538  ---------------ACGCATCCCCTGCGGCGCTGGCCAAGTGCGTGCTGGCCGAGGTCCCGAAGCAGGTGGTG  1596
                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  ACACGCACAGCACACACGCATCCCCTGCGGCGCTGGCCAAGTGCGTGCTGGCCGAGGTCCCGAAGCAGGTGGTG  1702

Query 1597  GAGTACTACAGCCACAGAGGCCTGCCCCCGAGAAGCCTGGGCGTCCCTGCCGGAGAGGCCAGCCCAGGCTGCAC  1670
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GAGTACTACAGCCACAGAGGCCTGCCCCCGAGAAGCCTGGGTGTCCCTGCCGGAGAGGCCAGCCCAGGCTGCAC  1776

Query 1671  ACCG-----------------  1674
            ||||                 
Sbjct 1777  ACCGTGAAGATGTGGAGGGCG  1797