Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08064
• Subject: NM_001144026.3
• Aligned Length: 1818
• Identities: 1790
• Gaps: 27

Alignment

Query    1  ATGCCGAGCCCGCAGCTTCTGGTGCTCTTCGGCAGCCAGACAGGCACGGCTCAGGATGTGTCGGAGAGACTGGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCGAGCCCGCAGCTTCTGGTGCTCTTCGGCAGCCAGACAGGCACGGCTCAGGATGTGTCGGAGAGACTGGG  74

Query   75  TCGCGAGGCCCGGCGCCGGCGGCTTGGCTGCCGGGTGCAGGCCCTGGACTCCTACCCGGTGGTGAATCTGATTA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCGCGAGGCCCGGCGCCGGCGGCTTGGCTGCCGGGTGCAGGCCCTGGACTCCTACCCGGTGGTGAATCTGATTA  148

Query  149  ACGAGCCCCTGGTGATATTTGTTTGTGCAACTACAGGCCAAGGAGACCCCCCTGACAACATGAAGAACTTCTGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACGAGCCCCTGGTGATATTTGTTTGTGCAACTACAGGCCAAGGAGACCCCCCTGACAACATGAAGAACTTCTGG  222

Query  223  AGGTTTATATTCCGGAAGAACCTGCCCTCCACTGCCCTCTGTCAGATGGACTTTGCCGTCCTGGGCCTCGGGGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGGTTTATATTCCGGAAGAACCTGCCCTCCACTGCCCTCTGTCAGATGGACTTTGCCGTCCTGGGCCTCGGGGA  296

Query  297  CTCCTCATACGCCAAGTTCAACTTCGTGGCCAAGAAGCTGCACCGACGGCTACTGCAGCTTGGGGGCAGCGCCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTCCTCATACGCCAAGTTCAACTTCGTGGCCAAGAAGCTGCACCGACGGCTACTGCAGCTTGGGGGCAGCGCCC  370

Query  371  TCCTGCCCGTGTGCCTGGGCGATGACCAGCATGAGCTGGGGCCCGACGCTGCTGTGGACCCCTGGCTGCGAGAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCCTGCCCGTGTGCCTGGGCGATGACCAGCATGAGCTGGGGCCCGACGCTGCTGTGGACCCCTGGCTGCGAGAC  444

Query  445  TTGTGGGACAGGGTTCTGGGGCTGTACCCGCCGCCTCCGGGCCTCACTGAGATCCCTCCCGGAGTCCCCCTGCC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTGTGGGACAGGGTTCTGGGGCTGTACCCGCCGCCTCCGGGCCTCACTGAGATCCCTCCCGGAGTCCCCCTGCC  518

Query  519  CTCCAAGTTCACCCTGCTGTTCCTCCAAGAGGCACCCAGCACGGGCTCTGAGGGGCAGCGGGTAGCTCACCCCG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTCCAAGTTCACCCTGCTGTTCCTCCAAGAGGCACCCAGCACGGGCTCTGAGGGGCAGCGGGTAGCTCACCCCG  592

Query  593  GCTCTCAGGAGCCCCCGTCAGAGTCGAAGCCCTTCCTAGCACCCATGATCTCCAACCAGAGAGTCACCGGCCCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCTCTCAGGAGCCCCCGTCAGAGTCGAAGCCCTTCCTAGCACCCATGATCTCCAACCAGAGAGTCACCGGCCCC  666

Query  667  TCCCACTTCCAGGACGTTCGGCTGATTGAGTTTGACATCTTGGGCTCTGGCATCAGCTTTGCTGCTGGTGATGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCCCACTTCCAGGACGTTCGGCTGATTGAGTTTGACATCTTGGGCTCTGGCATCAGCTTTGCTGCTGGTGATGT  740

Query  741  GGTGCTGATTCAGCCCTCCAACTCGGCTGCCCATGTCCAGCGGTTCTGCCAGGTGCTGGGCCTGGACCCTGACC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGTGCTGATTCAGCCCTCCAACTCGGCTGCCCATGTCCAGCGGTTCTGCCAGGTGCTGGGCCTGGACCCTGACC  814

Query  815  AGCTCTTCATGCTGCAGCCGCGGGAGCCAGATGTCTCCTCCCCCACGAGGCTGCCCCAGCCCTGCTCCATGCGG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGCTCTTCATGCTGCAGCCGCGGGAGCCAGATGTCTCCTCCCCCACGAGGCTGCCCCAGCCCTGCTCCATGCGG  888

Query  889  CACCTCGTGTCCCACTACCTGGACATCGCCAGCGTGCCTCGCCGCTCCTTCTTCGAACTCCTGGCCTGTCTATC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CACCTCGTGTCCCACTACCTGGACATCGCCAGCGTGCCTCGCCGCTCCTTCTTCGAACTCCTGGCCTGTCTATC  962

Query  963  CCTCCATGAGCTGGAGCGGGAGAAGCTGCTGGAGTTCAGTTCTGCCCAAGGCCAGGAGGAGCTCTTTGAATACT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCTCCATGAGCTGGAGCGGGAGAAGCTGCTGGAGTTCAGTTCTGCCCAAGGCCAGGAGGAGCTCTTTGAATACT  1036

Query 1037  GCAACCGGCCCCGCAGGACCATCCTGGAGGTGCTCTGTGACTTCCCGCACACAGCTGCCGCCATCCCTCCCGAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCAACCGGCCCCGCAGGACCATCCTGGAGGTGCTCTGTGACTTCCCGCACACAGCTGCCGCCATCCCTCCCGAC  1110

Query 1111  TACCTGTTGGACCTCATCCCCGTTATCCGGCCGAGGGCCTTCTCCATCGCCTCCTCGCTGCTGACTCACCCCTC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TACCTGTTGGACCTCATCCCCGTTATCCGGCCGAGGGCCTTCTCCATCGCCTCCTCGCTGCTGACTCACCCCTC  1184

Query 1185  ACGGCTGCAGATCCTCGTGGCTGTAGTGCAGTTCCAGACTCGCCTCAAGGAGCCCCGCCGGGGCCTCTGCTCCT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ACGGCTGCAGATCCTCGTGGCTGTAGTGCAGTTCCAGACTCGCCTCAAGGAGCCCCGCCGGGGCCTCTGCTCCT  1258

Query 1259  CCTGGCTGGCATCCCTGGACCCTGGGCAAGGACCTGTCCGGGTGCCCCTCTGGGTGCGGCCTGGGAGTCTGGCC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCTGGCTGGCATCCCTGGACCCTGGGCAAGGACCTGTCCGGGTGCCCCTCTGGGTGCGGCCTGGGAGTCTGGCC  1332

Query 1333  TTCCCAGAGACACCAGACACACCTGTGATCATGGTGGGGCCTGGCACTGGGGTAGCCCCCTTCCGAGCAGCCAT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TTCCCAGAGACACCAGACACACCTGTGATCATGGTGGGGCCTGGCACTGGGGTAGCCCCCTTCCGAGCAGCCAT  1406

Query 1407  CCAGGAGCGTGTGGCCCAGGGCCAGACTGGAAACTTCTTGTTTTTTGGCTGCCGCTGGCGGGACCAAGACTTCT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CCAGGAGCGTGTGGCCCAGGGCCAGACTGGAAACTTCTTGTTTTTTGGCTGCCGCTGGCGGGACCAAGACTTCT  1480

Query 1481  ACTGGGAGGCTGAGTGGCAGGAGCTGGAGAAGCGGGACTGTCTGACCCTCATCCCTGCCTTCTCCCGGGA----  1550
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
Sbjct 1481  ACTGGGAGGCTGAGTGGCAGGAGCTGGAGAAGCGGGACTGTCTGACCCTCATCCCTGCCTTCTCCCGGGAACAG  1554

Query 1551  -----------------------ACAGGAGCAGAAAATATATGTGCAGCACCGGCTCCGGGAGCTGGGGTCGCT  1601
                                   |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CCCCCAGCCCTGTTCTCTGCCCTACAGGAGCAGAAAGTATATGTGCAGCACCGGCTCCGGGAGCTGGGGTCGCT  1628

Query 1602  TGTGTGGGAACTGCTGGACCGCCAGGGTGCATACTTCTACCTGGCAGGCAACGCCAAGTCCATGCCAGCGGACG  1675
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TGTGTGGGAACTGCTGGACCGCCAGGGTGCATACTTCTACCTGGCAGGCAACGCCAAGTCCATGCCAGCGGACG  1702

Query 1676  TCTCGGAAGCCCTGATGTCCATCTTCCAGGAGGAGGGTGGACTCTGCAGCCCGGACGCAGCCGCGTATCTAGCC  1749
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TCTCGGAAGCCCTGATGTCCATCTTCCAGGAGGAGGGTGGACTCTGCAGCCCGGACGCAGCCGCGTATCTAGCC  1776

Query 1750  AGGCTCCAGCAGACACGGCGCTTCCAGACAGAGACGTGGGCC  1791
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  AGGCTCCAGCAGACACGGCGCTTCCAGACAGAGACGTGGGCC  1818