Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_08064
Subject:
NM_001144026.3
Aligned Length:
606
Identities:
596
Gaps:
9

Alignment

Query   1  MPSPQLLVLFGSQTGTAQDVSERLGREARRRRLGCRVQALDSYPVVNLINEPLVIFVCATTGQGDPPDNMKNFW  74
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Sbjct   1  MPSPQLLVLFGSQTGTAQDVSERLGREARRRRLGCRVQALDSYPVVNLINEPLVIFVCATTGQGDPPDNMKNFW  74

Query  75  RFIFRKNLPSTALCQMDFAVLGLGDSSYAKFNFVAKKLHRRLLQLGGSALLPVCLGDDQHELGPDAAVDPWLRD  148
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Sbjct  75  RFIFRKNLPSTALCQMDFAVLGLGDSSYAKFNFVAKKLHRRLLQLGGSALLPVCLGDDQHELGPDAAVDPWLRD  148

Query 149  LWDRVLGLYPPPPGLTEIPPGVPLPSKFTLLFLQEAPSTGSEGQRVAHPGSQEPPSESKPFLAPMISNQRVTGP  222
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Sbjct 149  LWDRVLGLYPPPPGLTEIPPGVPLPSKFTLLFLQEAPSTGSEGQRVAHPGSQEPPSESKPFLAPMISNQRVTGP  222

Query 223  SHFQDVRLIEFDILGSGISFAAGDVVLIQPSNSAAHVQRFCQVLGLDPDQLFMLQPREPDVSSPTRLPQPCSMR  296
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Sbjct 223  SHFQDVRLIEFDILGSGISFAAGDVVLIQPSNSAAHVQRFCQVLGLDPDQLFMLQPREPDVSSPTRLPQPCSMR  296

Query 297  HLVSHYLDIASVPRRSFFELLACLSLHELEREKLLEFSSAQGQEELFEYCNRPRRTILEVLCDFPHTAAAIPPD  370
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Sbjct 297  HLVSHYLDIASVPRRSFFELLACLSLHELEREKLLEFSSAQGQEELFEYCNRPRRTILEVLCDFPHTAAAIPPD  370

Query 371  YLLDLIPVIRPRAFSIASSLLTHPSRLQILVAVVQFQTRLKEPRRGLCSSWLASLDPGQGPVRVPLWVRPGSLA  444
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Sbjct 371  YLLDLIPVIRPRAFSIASSLLTHPSRLQILVAVVQFQTRLKEPRRGLCSSWLASLDPGQGPVRVPLWVRPGSLA  444

Query 445  FPETPDTPVIMVGPGTGVAPFRAAIQERVAQGQTGNFLFFGCRWRDQDFYWEAEWQELEKRDCLTLIPAFSRE-  517
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Sbjct 445  FPETPDTPVIMVGPGTGVAPFRAAIQERVAQGQTGNFLFFGCRWRDQDFYWEAEWQELEKRDCLTLIPAFSREQ  518

Query 518  --------QEQKIYVQHRLRELGSLVWELLDRQGAYFYLAGNAKSMPADVSEALMSIFQEEGGLCSPDAAAYLA  583
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Sbjct 519  PPALFSALQEQKVYVQHRLRELGSLVWELLDRQGAYFYLAGNAKSMPADVSEALMSIFQEEGGLCSPDAAAYLA  592

Query 584  RLQQTRRFQTETWA  597
           ||||||||||||||
Sbjct 593  RLQQTRRFQTETWA  606