Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_08154
- Subject:
- NM_001113420.1
- Aligned Length:
- 776
- Identities:
- 663
- Gaps:
- 52
Alignment
Query 1 --------------------------------ATGGTACAT------CAGG-----ATAACTGCTCGTATCAG- 30
.|||.|| | |||| | |.||| .|||
Sbjct 1 ATGGAGAGGTCTGAGCAGCGCGTAAGGGCCGCGTGGGAC-TGCGACCCAGGCAAGCA-AGCTG------ACAGA 66
Query 31 GCACAGAAAAATGAGAGAGAGTCTATCAGACAGAAGTTGGCACTTGGAAGCTTCTTTGATGATGGCCCAGGAAT 104
||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 67 GCACAGAAGAATGAGAGAGAGTCTATCAGACAGAAGTTGGCACTCGGAAGCTTCTTTGACGATGGCCCAGGAAT 140
Query 105 TTATACCAGCTGTAGCAAAAGTGGGAAGCCAAGCCTTTCCTCCCGACTGCAGAGTGGGATGAACTTGCAGATAT 178
.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||..|..||||.|||||.|||||||||.|.|||||||
Sbjct 141 CTATACCAGCTGCAGCAAAAGTGGGAAGCCAAGCCTTTCTGCAAGACTACAGAGCGGGATGAACCTCCAGATAT 214
Query 179 GCTTTGTCAACGACAGTGGCAGTGATAAGGACAGTGATGCTGATGACAGTAAGACTGAAACCAGCTTGGACACC 252
||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 215 GCTTTGTCAATGACAGCGGCAGTGACAAGGACAGCGATGCAGATGACAGTAAGACGGAAACCAGCTTGGACACG 288
Query 253 CCCTTGTCTCCCATGAGCAAACAGAGTTCTTCCTATTCTGATAGAGACACTACTGAAGAGGAGTCTGAATCCTT 326
||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||.|
Sbjct 289 CCCTTGTCCCCCATGAGCAAGCAGAGTTCTTCCTATTCGGATAGAGACACAACTGAGGAGGAGTCTGAATCCCT 362
Query 327 GGATGACATGGACTTCCTTACAAGGCAAAAGAAATTGCAAGCTGAAGCCAAAATGGCCCTTGCCATGGCCAAAC 400
||||||||||||||||||.||||||||||||||..|.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 363 GGATGACATGGACTTCCTCACAAGGCAAAAGAAGCTACAAGCTGAAGCCAAAATGGCTCTGGCCATGGCCAAAC 436
Query 401 CAATGGCCAAAATGCAAGTAGAAGTGGAGAAACAGAACAGGAAAAAGTCTCCCGTCGCTGATCTTCTGCCACAC 474
||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 437 CAATGGCCAAAATGCAAGTAGAAGTGGAAAAACAGAACAGGAAAAAGTCTCCCGTCGCTGATCTTCTCCCACAC 510
Query 475 ATGCCTCATATAAGTGAATGCTTGATGAAAAGAAGTTTAAAACCCACCGACCTGAGAGACATGACTATTGGGCA 548
||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 511 ATGCCTCACATAAGCGAATGTTTGATGAAAAGAAGCTTAAAGCCCACCGACCTGAGAGACATGACTATCGGGCA 584
Query 549 GCTACAAGTGATAGTCAATGATCTCCATTCCCAGATAGAAAGCTTGAATGAAGAGTTGGTCCAGCTGCTTCTCA 622
||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 585 GCTACAAGTGATCGTCAATGACCTCCACTCCCAGATTGAAAGTTTGAATGAAGAGTTGGTCCAGCTGCTCCTTA 658
Query 623 TCCGAGATGAGCTGCACACAGAGCAGGATGCCATGCTGGTGGACATTGAAGACTTGACCAGACATGCTGAAAGT 696
|.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||
Sbjct 659 TTCGAGATGAGCTGCACACAGAACAAGATGCCATGCTGGTGGACATTGAAGACTTGACTAGACACGCTGAGAGT 732
Query 697 CAGCAGAAGCACATGGTAGAGAAAATGCCTGCAAAG 732
||||||||||||||||..|||||||||||.||.|||
Sbjct 733 CAGCAGAAGCACATGGCTGAGAAAATGCCCGCGAAG 768